Map Locations of contig_266467 (5817 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_266467

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_42821 4 1782 bp MLOC_42821.1 Available Available LOC_Os02g27060.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13102.m02940 protein high mobility group, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_42821






Contig Sequence (5817 bp)

>contig_266467 5817 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCCGTTGTGGAGACGACCGGCGATGGTGATGATGATTATGGCTTGGTCGTTTGTGCGCA
GGGGATATGAGGGCAGCGTCGGAGATGTTCGTTGTGGATGCTGCCGCTGCGGCGGATAAA
GGTAAGGAGAAGGTGGAGGAACCGGTGCCAGCGGCGAGAGCGGCGGGGTGCGGAAATGGG
AGGTTCATGGCGTACCCGGCGCGGATGGCGGAGCACAAAGGCGTGGTGACGGACGCCGCC
ATCTTCAGGGCTGAGCTCGAGAAGCTGCACGCGCACATGGGCACAAAGCTCAAGTAAGGG
ATCGGTGGCAACCTTCCTCCCCCTCGATACATCACCGTTTCACCCTTCATGCTCCTGCAA
TATAATTTCGAGCTGTTCTATATGATGTTTTAATTATCGTTGTTGTTGCATTTATTTTTG
TTTTCCTTCAAGTTGGAGATAAAGATGGGAGGGGAGAAAGGGAGGTTTGGTCAGACGCGG
CAATCTTGATAACGAATTCTGCAAATGCCTGCATTTTCTTTTGACCCGCCTTCGTTTAGT
TTATTAATCTCCCTCTCTTTATATTTTGTGGCCCTAATTGGCCAACATGTCTCGAGCCAT
AATCCTGTTGGTACCGATTGCGTAGCTAGTTTGTCATATGCTTTGGTCTATCTGGTAGCT
GGCTACGCCTCTGAATATGGGACTACTGTTTCATTCAAATTGGATATTGTCCTTCCGGAT
AATTATTTTACCAGTCTACCAAGTGGTCTTTGAAACACACCAGCTTGTGTTGTCATTTAC
ATCACCTCATATCATTTTGTGGGTATTCTTTTTTTCCCCTTATTTCTGTCACGTGGGACA
CCAACCTGTTTGCCAGCTTTGCTTATAATTCTGTACCAGTATCATTGAGCATACTTTATT
TGGTGTATCTCACTTTTTTTCACTGTAAGGGTGCCAATTATTGGTGGAAAAGACCTGGAT
CTTCATCAACTATTTAAGGAAGTTACGTCACGAGGTGGCATTGATAAGGCAAGAAATTAA
TAGAATTACTTACATTCAGTGGTTTAAAGTTTCTTTCAGAAGTAGTTTGTCTGGCCATAT
TGTTACATTGTGCTGCAATTGTACTACTCCGAAAAGGTAATATGACATTTAGGCTCGTGG
ATATCGCCCCTCCAACTATGTTCTGTTAGGTACTGTTGAATGCCACAAAGTAATTTGGAG
TCGCAATCATGTAGTCTGTCTTGTGGATCCCGTAAAAAAATACGATGTAAAAAATCAATA
CTGTCAGGTCTCATTCAATAGCTGAACTCTGCAGCTAATCATTTAGCCATATGCCACTCG
ACAATTAACTAACCTACAAATTCTTGAAATAAAAATTTGGCCTACATGAATTGCTGTTAC
ATTCGGGTTAAATCAAACTTTGTCTCCATGTAGCAATGACTCTAAAAAATTTGTTCGAAC
GGAAAATGGGCATGCAACTGCAGTTCATATGGATTCCATTGTTATTGCTTTGGTAGGTCT
TCATCTTATTTTCACTCAATTTATCCTACGGGGTAACGAAATTCTCACGCATGATTTCCT
AGTGCTACCTTTCTCTTGCCACAGTCCAGATATAGTTAGAGCACTTCCAATTTAGATGCT
TTAAAGTTATGCAAGATGCCAATTGTTGGGGAAACATCAGTGCTCATCATACGAGTAGCC
CACAAGCAATTCCATTTAGGCAAGAATAAATTTCACAAAAATCCTTCAAAAACATCAATG
ATATAAATGTGTTAAAACATGTGGACTGGCTAATGTACCATTTGATTATGTAACTTGTAT
AGCATAGAACTTGTTTTAGAAATAAAAAACAGAATTGTGAACACTTTAACTGGAACCTGG
ATTCAGCTAATTGTAAACCGACCTTGCTTGGTGCAGCTGCGTAGGACTTGGTTGGTATAA
ATTTCATATCTGAATCTTTACTACATTTTTGGCATGCAGAGATTGTTGTCAAAGAAAAGC
AAGTTAAAGACATGACACATCAAAATTTGTGGTGTTTTTTTGAATTTGTTGTTAGTCATC
ATTTGATCTGTAAATATGCAAAGTCAAAAGGTCAGATTGATAACTGAATCGTGTTGCTGC
CTCGCACAGGTCAAGGCAGAAAACAGATGGAGAGAAGTAACCGCGTCATTTCTTTTCCCT
GCCACTGCAACAAATGCTTCTTTTATGTTGAAGAAATACTATATGTCGCTGTTATACCAT
TTTGAACAACTATACTTCTTTGGAGCACAGGGCTGGTATCAACAAGAAACTGGTGTGTGC
AATCTACAGAGTTCCTTGTTCTAGATCTGACTGTCACTTTGTTGCCATTACTCAGACCAT
GTTTTTACCGCAGATAACAGATCACTGCCTTGCATAGAAGTGAGAGCTGAAACAGAAAAC
ACCGTCAAAAGAAAAAGGGCCACCAGTGCCTCTTCAGGTCAGTTTCAGTCAATTCATCTT
CTTTAGGCCTCTCCCTCTCCAGTGTAGCGTTATCTCTTAACCCTCCGTCTCAGATTTTTG
TCCATGGCATAGAGTCTGGGGATGAAACCATCTCTTATGCTGAATACCATCTCTTCACAA
AATCCAACACATCCATCATTAATTTTTTTACTCACTATCCGATTAGACCCATATAATCTT
AACAAAAGTGGGTTCTAGTGTTAAATAGTTGCCCTATACGATTCAACCCATTGAGATGGT
GAGTAAATTGACATGGCAAGCTTGTATACAGCTAATAAGAGACGATCACTGTGACTGGAC
GTAGCAGTCATCAGATATGGATGGGTATGCACGTTTCTCTTAGTTTTTAGAAGCCTTGTA
TTATCATGAGTTCATGATATTGTTACTTACATGATTCACTAATCTTTTTCTAGTTTAGTA
TGGTTTGTTTGGCATTAGTTAGATCTATATATCGCTCAGTAGAAGTTCAGTACAAACAGC
CACACATATTGTGTTCAAATTATATGGAGCTTCCTTAACGACAAACATAGCTAACAAATT
GTAACGACTTGGAGGTGATTTATTACTCTCGAGGAAAGGTATTAACGTTTATATGACTAA
TTCCTTTTTTTCCTTAAACTGTTTTAGACCCAGCTTTGGCTTCTGATAATGCTGATGTGG
ATGTAATAATTGATGGCAAGTTTGAATATGGTTACATTGTAACTGTTGTTATGGGATCAA
AATCCACAAAAGCAATCCTTTATAATTACAGTGAGGAACCTGCTCTTACAACTCTGGCAC
CTACTATGCCCGTAAACAACACTGGTTCGAAGGGTGGACATAGGCGGAGGCAACGCAGGA
AGAAACTAAGTACAACAGACCCCAGACATCCCAAACCGAACAGGAGCGGCTATAATTTCT
TTTTCCAGGACCAGCACAGAAAGCTAAAGCCAGAGTATCCTAGCCAGGATAGGCTGATCA
GTAAAATGATTGGTGAACGGTGGAACAATCTAAGCCCTGAAGACAAAGCTGTAAGAAAGA
AAACATCTATTAAAATCTCAGCTCTACGAATCATCAGCTATTTTGTCATGCGATATGTGC
CTTCTGTTATTTTTAATAGGTGTACCAAGAAAGAGGTGTACAGGACAAGGAGAGATACCA
GTCTCAGTTGGCTGCTTATAGAGAAGAACTGAGAACAGGCCAGCCTATCAGCAATTCTAT
GCCTATTATCGGCAATGATGCACCTATCCAGCAGACATTTCCCCAGACAGAAGTAACTAT
TGATGAAGTGGACTCCAAGGTCAGTAAAGGAGATATGTTGCTGTCCAATCAAAGGTACAA
CAACAGCGACGAAGGTGTTGATTCAGGTGGGAAACTTGTTGAAGATGAAGAGTTCAACAC
TGATACATCTCCTGAGCCTAGCATGGATACCACTGATTCTCCTGGGCCGCTTGATCCTTC
TGCTGATGGTGACCGATTTGAACTTCGCAGGAGGGAGAACCCCAACAAAAATGAGAAACA
GAGCACTGCACCTAAATAATGATTGAAAATGACTTAATGGTGCATTCTTCTGGTACAAGA
TTAAAAGTAATAAGCTGAAGTGAGTGGTAGATTATGCCTCCTGCCTTGGTTGTAGGATCA
GGTCGATGTATCATTTTTATTCCTTTTATATATCAGCATTGTTTTAGAAACTGCAACGCG
CTGATTTATGTGGGTAATGCTCTATTAGCACATGAAATGCTGTGGATTTTCTTTAGTTTG
GAACTTCCCAAGTTGAGATGTTGAATTGGTTGGATGGACGATAAATGGCTTTGTGTAATT
TTGATTTCTTGCTGACATTAGTTTTGGGCTGTTAGTGCCACCGTAACGCCGTTGTAACAT
GGCTCGATGAACTTGAATTCAGAGGAAATGAACACGAGAGAGAACTGTTGGCTTAGGCAG
AACCACCAAGCGGTGGCTACCGATTAGCATGGTTGCATCAATAATGTCTAGAATGAAGGG
TGAACTTGGATTTATCTTGTATGTCTAGAATGAAGGGTGAACTTGGATTTATCTTGTATG
TCTAGAATGAAGGGTGAACTTGGATTTATCATCATTACAAGACAAAAGCAAGTGAAAAAT
AAAATTGCCTTCAGGCTGTTGTAAGCAGGAAAAATAAATAACATTTGAAGTCTTGAGTCA
AAGGATATAGGAGTTCCAATGCAAGTTGTCCACATCATTAGTTGTTGTGTGAGGCTTCAT
GTGTTTGCCCCCTTTGACAGCTGGTTGCCAATATGTGCCCTTTTTTTTGAACTGGTTTCA
CACCTATGCTAGGAGGATTGATTCTAGTATAAATACCCCTTCTCCCACTTCGTCCACAAC
TCTTTTGCAATTTGATTTCAGCATAGATTAGATAAGTGCGACTAGAATCTGGTTTGAGAG
TTCATTTCCTTCTTAGTTCTTGTAAACTTGCCTTGTGAGAGGGTAAAACTTGGGTCTGAG
TTGAAGGGGATCATAAGAAAGTGCATGTTTGTGGTGAATGCGTCACTCATTCGTTGGTCC
CCGTTAGTTCATGTTTTGCATGCATTAAACTTATCATTAACCGAGTTGATGAATAGTCGA
TACTAAAAATTTGTTCGCCCCAATTGCAAGGGTTTACTGCACAAAAATCCGAACTATCAT
ATGGCAAACTCTTTCTAACAAAATACGTTGTGTTTCACACATACTTCTGATTTTGGCTTT
GAAATGAACACAACATGTTTTTTTTCTGGGAGTAGGAATGATGTGAATGATTCTGGTATG
TCCCTCACTATATTTGCAAAACCAGACGCAATTTTGTCAAGCCCAAAAGTTGAGAATATG
GTTTGTTGCTATGAAGACTATTTTCTAGAATTTGAGATGCGCAAAATCTTGGTAACAACA
AAAGATGTGACATATTCATATACCGTGCATATACATAGTTTGTTTCCCTTAGTGCACCAA
GGACGACTTTTCTTGAAGGAACAAAGGATTGTGAGGGTCATCCTAGTAAACTAAGGGTTG
CTTACTTGGAGCGAAAGACTAAGCTTCATTCATAAACATCACGACAAAGTGAGAAGTGTG
TTCCATATTGAGATGCATCAACGCCAACTTGAGAAGTCCATTGATACGTCTCCAACGTAT
GTANNNNNNNNNNNNNNNNCATGCTATTATATTATCATCCTAGGGTACATTTTGGTCATA
ATTCACCAATTTATATTATTTTTAAGCACTAACCTATTAACCTTGTGCCGATGTACACTT
GCTGTTTTCTGCATGTTTTTTTGTTTTTCAGGTTTTCAATATCAAACGAAGTCCAATTGC
CACGAAACATTTTTATGATTTTTTCTGGACGAAAAGAAGACCTGGAAGCTTAGAGAG