Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_259446 (1412 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_259446

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_41553 1 155 bp None Available Available None
MLOC_41552 1 179 bp MLOC_41552.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_41553






CDS Structure of MLOC_41552






Contig Sequence (1412 bp)

>contig_259446 1412 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATTATATGTTGAACTTGATGCATCTCACAGACAAACATTGGTATATCTATAATTTTGGG
GACTGCACACACATACAATCACACAACTAGATTTTGCCATGGTAATATTTAAAAAAAATC
ATGTTTAATAGTCCAGAATGTTAATTGAAAATGAAAGTAAGTAATAATTATTTAAGACGC
TTGAGAGCTTGAACTATACATTTTTTTGCTGGAATGAGGATTAAAATATATTATTATGTG
AAAGTTTGAATGATAGCTTCCACTAAGATTTACTTTTTCACGTCGTTTTCTTAAGTTTTA
CTTCTTTCATTTTAGGTGCTTTCAAATATTGTGTTACTTATAACTTAAGCAGAGCCACTA
CATAGCCTGAATGTCTGCAGGTATATATGTAGTTAAAATAATTATATTACGAATTTATTT
CAGCCCTTCACTCCAAAACCCATTACATGATTCTGTCTTAACACAAGATCAAGCAGAGAT
GCAACAACCATGACGCCCATCCCATTGGTTGAGTGTGTAGAGCTGCAAATAGTTTGTTCA
CATGTGTTAACTAAGTTTGTATGTGGGGTACCGTGTAACTCCGTTGTTGTACAAAGACTC
TTGTTTGATGTGATTAAAACCCAACTTTCTCTCTACGAACATAACTAAGTACTATTTTCG
GCTTCATATATATTCAACCTTATTTTACATGGTTTCGTAGCGTTGCATTACTAAGTTCCA
TGCTCTCTCTTTTCTCATTTTGTGAGATGACTATGAATTACACTAATTTTTAGGAAGCTA
CAAACAGATCATAATAACAATAAGGATCGATAAAAAACAAATTAGATTGATTTCTTCCTC
TGTTTGGTAGTCTTTGCCATTTGCTATCACTGGGATAGTGGGTTAATCCTCCCTTACTCT
TCTCTATTTTTTATTGAATCCATAAGTTTTTGTATTCATATGGTAGCAAACAATGGCGAT
GCTAGAAGCCAAGAAGCTAGACTATGTGAAACCCTTGAAACAAACTTCATTACTGCCTTG
ATGTCTTATTCAATTTTAATATTACCTGACTTCTTGATATCGTTTTATTTCGCTCATTGT
AGTGGAGGTGAAGAATTTTGTAGTATTGTCTTACTGGAAATATGTGTACACAGAAATGCA
ATCTCAAGGAGCGATGGAGTGAAGGTTTTGTGTGTTTCTTTAAGATTACTAATAGATGTT
ATATTATCTTTGCTTCAGATTTAGTAGTGTTTGATCTGCTACATAGTGCATTGTGCTGTC
TCAAAATTTCAGTGTTATTACTAGCATATTCTCTACTTTTTGGTATTATTATTGTCGCAT
TTGTACAACTAATATTATTACTCTACATATTCATTTCGGAGCTGTATGTTATGCAGTGTA
ATTCTTTGTGTTTTGGATTCTTTGCAGGTTTG