Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_2557048 (2668 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_2557048

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_40210 1 955 bp AK367093 Available Available None
MLOC_40211 1 559 bp MLOC_40211.1 Available Available LOC_Os02g47605.1, FRAME:-3, EVALUE:2e-44, 13102.m05366 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_40210






CDS Structure of MLOC_40211






Contig Sequence (2668 bp)

>contig_2557048 2668 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCATGGTTTGCGGACACTGGATTTGGAAACCGGAATTGTAGGAGGTGAATCAGACACTGA
TGACTCTTTTGTTCCAATGGAACGGAGTGAGGTCTTTGCATCAAGAATTTCAGAATCCTC
TGCAGCCCAACCAGTGGAAGAAGAAAACAGAATTGCTGGCTGTGATTTTGAATATACCAT
TGATGACTTCGGTGAATCAGACACTGATGAGTTTTTTGCTCCGATGGAACGGAATGAGGT
TTGTGGATCAAGAATTTCAGAATCCTCTCTGGCCCAACCAGTGGAAGAAGAAACCAGAAT
CGCTGACTCTGATGTTGAATATCCCATTGATGACTTCGGTTACATGGAATGGAGCGGAAT
TCACGAAACACCGGAGCTGCACGTGTCTAGAACACCACCTGGATGTTCCTCGAGCTCGTG
CAGCAATGATGCTGCTGGAAGATCAGTAAATTGTGTGACAGGGCAAGCATCTCCAGTGTT
GAAGGCAGGTTCAGACGATGGTAACCTTTTCTTCCATGAAATTGATGTGGTAGACTTGGT
TACACCAGTCGCCCGGTTTGCTAGAGATTGCAGCAAAGCGGCCAGCATTTGCCCCAAGAT
TATTGATCTGACAAACTCCCCTATTGTCATTGAGTTGTAATGCTTTGCTGGACTAACCCA
GTACAAAATCTTGTTGTAGTAAAATGTTATCATAGAATAACAGCCCAGATGGGACAAGCG
TATACAGTAGGCGAATTTGTAAAAGACTGGGTGTTGAGACTCGCAGTACTCTTTTCTTGA
GACAGAATTGTTCACACACAAAAAAAGTATTCTTGTTGTTTTATGATAAATAATGTATTG
GAGTTCTACTAATATATATTGAAATATGTCATCGTTATCTTGGTTGGATTGTAATGCAAT
CATTCTTCTCTTCAACTGTGTTGAGGTTATGAGACTGGGCTGTAATAATTTGACGTCACA
TTATGCTTAGTACAGTCTAAACACTTTGTCATGCAGTGTGCATACCAGGCAGACCTGGAT
CACATCATGGAACATTTGAAGTTCCAACAGTATGTTAGGTTTACCTTTACCATGGTTGCC
CGATCTTACAACAGTGACTATTAGAGGCACTTTAAAGCATCTCTAGCAGACTAGCAATAC
CCTATAAATAGAGAAAAAGACATCAACCCCATCAGTGACCCATTTTGTTATGACATATGG
GACCCCGGCAGTCATCAATCTTAATAGTTCTCGGAACAAACTGCAGTGTTAGTGTTATAT
CTCATTTCTGTGTTTTTAAATTGGGGACTTAGCTAGTTGGTAAGAAGTTAATATGTATTG
TATTCACTGGAATTCTGTAAATCACAAGTATGCATTAGATACTTGTTTTGCAATCTGCAT
AGACAACCAATCCGTCTAATGAAAAGGACAACAAAAAATCGAGAAAATTCACCTCACGTG
TATTTGGCACACCAATGCTAATAAGCTTGCAACGGCTTGTAATAGAATCAAGAAGATTGG
GGCCATCTTGGCAAGTCATTATTATCTTGCATGCATCAGAGGAGGAATCAATTATCCATT
TTATCAAACGCTGATTATTCTCACTAACTTTGTCAACATCATACAGAACAAGAACTGGAA
TCAACAAATAAGCATGTTAGGAAGATCTCAAAAGAAGAGATTTAAAAAATGGCACTCGGG
AAGATGCAAGTATACCTTTGAAGTTGTTTGTTGCAGATATCTCAGTGATTTTATGCTTAC
TTGACATTTCATTTGCCAGAGCTGTCAAAGCATATCTAGCATGCTTGGATTGAGACCTCA
TATTGAGTTCGACATGGTGATCACTTGATGACAATGGGACAAAAATGGGCGCAGATGCAG
GTCCCTGCCAAAATCAGGGGAACCCATCCTCACTTTAAATTCCTATAACATAATTACCAC
ATGTGGTGTTTTTTTTTTGAGGGAACATGTGGTGTTCTTTTAATATGCATAATATGATGA
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CCACATGGTATGCAATATGCACACATTTAAAAGTTGAATGTTGTGCAATGAAGAATTTAT
GTTATTATTCCGCTCCAAGACGAAAAGTGTTTAGATGAAATGATGGTTCGAATTTATATT
ATCTCGGAGAAAACAAATATGCTAACCTGGCATGGAAATTAATTAGAAAAGAGATTGCAA
ACATCAACATTGCAGAAATTACGTAATTTCTTTTAAAATGCTGAACAACACAAGACATGA
GTCACAAACTAGACCTCTATGGACTTACAGATGCATTTTGACATGAAGTACATATTTAAC
ATTTTACAAAGTTTATTTGAGAAGTAATATGATTTTGGCTCAATACTTGCAGTGGTCCCT
GTAAATGGCTTTCCTATCCTTTAGCTAAAATGACGAGCAGCTAGCAAGCAAGACCGCACA
AAACTAAGTAAAGCAAATTTCGTCTTCCCCCTAGGCGCGGGCGCTCTGCTTCGTCAGTGC
CATGCAAGGCCGTCGGTCCACCCACGGCCGAGCGGCGTGCGCAAGTCCACATCCAGCGCA
CATTGGGAATCGTCGGGATCCATCAGAGGATCACCGATGCCGAGATGCAAACCTACGACG
GGCTCTTCGCCACCCCGCTCCCCACAAC