Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_2553797 (2097 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2553797

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_39539 1 734 bp AK376680 Available Available None





CDS Structure of MLOC_39539






Contig Sequence (2097 bp)

>contig_2553797 2097 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGGCCACCGCACCAGCCACCTCCGCGGCCGCAACGGGCTCGCGCTCGCCCTCGCCGGG
ACCGGGACCGGGCCGGAGCAGAAGAAGGCCACCGACCAGAAGCAGGCGCACCAGTGCCAC
GTCTGCGGGCAAGGGTTCGAGATGGGGCAGGCGCTCGGGGGCCACATGCGCCGCCACCGC
GAGCAGGAGGCCGCCTCCGCCGCGGTGGCGCAGCCGCCGCCCGTCCTGCTCGAGCTGTTC
GTCTAGGTTGATGATTAGCTAACTTTACTTATGCTACAGAGTTCGTGATCGACCTGTGTA
GATTTGTACGTCGCTGCACACAGACACACATACTCGTAGCTTAGCTAGGTATTGATCGTT
AGTTGGTTCATTCATTCGTGTACTTTTGTGGACATATTTGGTGACTTGATTCATTCATTC
ATTCATTGGTTCGGAGATTATGTATACACGTTAACTGATTGGGTTGCTCGTCTCTTTTGA
TCCAACTAGCCCGGTGTACAATTTTAACTCGGAGGAACAAGTGTGATGCTTTTCTTGTTT
ACAAATATCTTCAAATATATGGCCTTTTCGTTCCATTTTTCTTTCCACTTTATTGATTGT
TTTTTAGCATCTTGTGGGATGACTGCGAGCCACTGTTGTCAAACCGTTGCCGCATCAATG
TCAAATGCATTTAGTGGGGGCGAGAATTAAAGCAAATCTTGCTAGTTTGATATTCTTGTT
TTTTACTGGAAGGCAACTTGATATTCGAAGACCAAAGTAAATTTGGATTTTGAGATATCA
AAATATGGAATGTGTTTCTGTCCGCCTAGCATGCATTTGTCTCCAGTGGATCTCATGGGA
TTCGATCGGCATTTGTCTTTGATGGATCCACGTGCATCCGGTCTCCGTTAGATTGTGGGC
TACATGTTTTATCCCTCTAATTTAAGCTTTTCTTCATTTGTGACGATTGTTGCTCGAGTG
CCTGGCCTTGTAGGGTCTTACACTCTTATCACGACTACTTTTTGATTGTGGTTCGGGTGA
GGGTGAGGCGAGAACGGCGGCACACCTTTGGCTTGCTCTAGTGCTTGTAGTCGTCGTTAG
TTGGTAAACGGACCTATATGTTTTTTTTTCATTGTTGATGGAATCGTTAACTGGTAACTG
CTCAGTTAATAGGCTAATCGGTAAGTTAATCAGTCATTTAATCCATTAATCGGGTTATTT
ATCAGTTAATCCACTACTCGGTGACCCTACGAGTAGGAATTAATCGACAGGTTAACTGGT
CGACTGGACTAATTTTTGAACATGAATTTTTTACTTTTGATGTTGTTTGTACTGCCTTGA
TAGTTGATGAATAGATTGAAAGATTTCTTGCAAAAAAGGGATATCAAAATATTGATCGGT
CATTTCTATAGTTAAGTGGAAAACAATCATTTTTTATTTTAATTCTGTTGTTCAGATTTT
TTAAAAGGGTATTATATTATTATCAAGCTGATTTAAATTACACACAACCTTTTCAACAAC
ATGATATCCATAGATGTCGAGACATCTAAGATGAACACAACCAAAAACAAAAAGGAAAGA
AAGAGAGACCTGACAAAGTAAGACGAGGGAAACAAACTGTTGTAGCACAACAATAAAAAC
TACTACCACCATACGAAACGCCATAACTCCAAGAAGGTCCCCCAATAGCGACACCAACTG
GAAAGTAATCATGCATGAACGTCATATTGGACATATCCAATCATATACTGCGTTCGTCTC
AAAAATAGTGTCTCAAATTTAATACAATTTTGACTAAATCTAGTATAAAGTTAAGACATT
TATTTTAAAACGGAAGGAGTAGTACAGATCATTGATTTTTCACCTTTCTAAGAAGGTCTG
AGCAGACTCCGGCTAGTGTCTTCTACAAGGGAGCATAGCCCCCTCTACCAAGTACAACTA
AGAGCATGGTTAATAGTACCCCTCTACCAAGTACAACTAAGAGCATGGTTAATAGTATAG
TCAACTGCTGGCTATAAGCCATCTTATAGCCCATCTTACAGTTATCTTGTACAATGGTTA
GCTATAAAAGAATACTATTTTTATTATATATGGCCCACCTTTCATTCTCACAAAGCA