Map Locations of contig_2553479 (3559 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2553479

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_39451 2 1242 bp AK357838 Available Available None
MLOC_39452 1 234 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_39451






CDS Structure of MLOC_39452






Contig Sequence (3559 bp)

>contig_2553479 3559 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGACCGCGCGCCGCGTGGGTCGCCGCCCCCCCCCCTGCCGCCGGGTCCCCTGCGCGCG
GCTGCCGCCGGCGGCGGCGGAGGCAAGGACGACGCCGCCAAGCCGAACGGGACCCCCGTC
GTCAAGGTAACGAACAGTGCCTGCACGCTTACGTGATGCGGTGTAAGAAGTGACGAAGAT
TTTGGTCGGGTGGTGGTTGCTGGGGTATGTTTGTGGTGTGGCAGTGTAGAACATGCTGGG
TTTAGGGATTTCTTTCAGATGCGAGGCCCTGGGCCTACCTAGACCTGGGTTGTTCCATTA
TGTTCTAGGTTTTGAAGCTTGATATCTTTGAAATCGGTCGGGAAGTTTTGTGGATGCCAT
GAAAGTGAACTTCCTTTAGTACCAAATCAACCTAGAACTTCGGAACGATGAACTAGTTGG
GAATCATATCTATGCGTATGGGTTCACAAAGATACTTATTATTTAGCTTCTTGTTGGAAT
CACAATTAAGGTGATCCTGTATTTATTTTTAACAACTCAGGAGTGAATCAGGTCATTTTC
TTTTAGTTTGCCTTTAGTAGGTCACATATCTTTGGTTTGTACTAAATTGCCTGACAGTCG
AAGGTTGATCCAAGTCAAAATGGAGCTCTTGGTCCGGTCACAACTGAGAAGTCACGCACG
ACCTCATCAACCAATACGACTCCTGACTCAAGTGGATCCAGAGCTGGCTTGTTCAGAACC
CCTATATCAGGTGGTGTGCAGAGCGCGACTTTTGCCCATGGTTTACCTCCACCGGCTTTG
GCTGTTCGCAATTTAATGGAACAGGTAGCTTCTGTTAATTATCTCCTGGCCTTTGGGCTA
TTTTCTAGCCGGCTGGATGCTTATTCCTGTCTTACTGTGCTCATTAGGCGCGATTTGCTC
ATCTATGCACTGTCATGTCTGGCATGCATCATCGACGTGCTGGATATCCATTTGGTTCAC
TTGTTGACTTTGCTAATGACTCAATGGGCCGTAAGATAGCTACTTGGTTACATTTTGGAT
ATAACTTGTACGCTCTGTTTGGCCTCCTTGGGTAATTATTTTGTGTTGATGTCTTGTGCA
GACCCTATATTTTCTCTGTCTCCCTTAGCAATCCACACTAGGAACTTGCTCTCTGATCCA
AGATGCACACTTGTTGTCCAGGTATGAAGTTTATCAGCATGTCTTACTGGAGTCTAAAGT
TTCCTTGCTTGCTAGTAACTGGATAACAGCATCTAGTCCTTCATTACAGGTACCTGGATG
GAGTGGATTGTCTAATGCCCGTGTCACGATATTTGGTGATGTCTACCCTTTGCCAGCTGA
ACAACAGGTTCCTATTTAGCTTCCTTTGTTGCTTGATAATTGATAGTGCAGACAGCTAGG
TAATTACTTTTCTGTGGATAAATTTTTTTGAAAGAAAATGGTAGGGAAAGCCCAACAATA
TGAATAGGAACCTAAATACACGTGTCCACGGGGATCTAAATGGGATTGTACATCCTCTAA
AACCCAAGTGAGCTAGGGGCACTTTCCTTTTCTCTTTTCTATGGATAGCTGGCATGTCAG
TCATTATGAGGCTTCTCCCATTGTGTGGAAATCATTGTGGACTAAGATATCAAATTAATA
AATTCTCCGAGTTAGATTTTTTTTTTTGGGTTTGTTTTTGGTGTTCCCCTTTTTTTGGCT
GCACTTTTCTTATGGTATGAGCTAAGCGAATAGATGTTCTGCCATGGCTGTTACAGAATA
CATGAATGAAATGCATGACCATTGAGACTGAATGCAGATTTATAATTCCATTGGTGGGTT
TGAAAGATTTCATAAACTGACAGTGAATACATGTATCCGCCAGGAATGGGCTCATAAGCA
ATACGTTGCAAAACATCAACAATGGGCGTCTCAACAGTGGGGAAATTTTTACTACTACAG
GATGCAGAATATCAGGTCTGTGATTTAATTTGATGAGTTATACTCTTCTATCATTTCAGG
TTGATGAATCCATTTATCGTTTACACAGATGCACATCTCTTCCCCCTTCCGTTACAGAGA
ATATTTTCTTCACATGGATGCTTGTGTAACTTATGATTTGTGACAAACTATTTGCGATGA
TGACAGTGACATATATTTTATTGGAGGCTTTGGCACTGTTGCATGGGTAGATGTGAAACA
GTATGAAACTATTCAACCTGACAAGATAGCAGTTGATGGGGGCGAACAAAGCTTAAAGGT
AAACTATGAATGCCATTATCAGCAGATTTGCTAGGTCATCATACTAGTTATGTGCCCGCC
CGTACATGTAATATGTGAGTACAGTAAAACCTTGACCGCTTTTGATGGATGCTCTGCATG
ACTGCATGTAGGAGTTGAACGCGATTTTCTCTAAACCACTTAGAGAGTTCATGTCTGCTG
AAGGGGAGGTTGATGATGCTGCTCTTATATCCGTAGACAGCAAAGGGATAGACATTCGAG
TTCGCCAGGGTGCACAGGTAAACTTTATTCAGCTTGCCATCACTAGTAGAGGTGCTATTA
TCCGAGGAAGAAAATCTTCTCTCCACTGCCTTCAGTTTGCAATTTATTCTGTGCAGTTCA
ACATCCAGAGACTTGCATTTGACGTACCATACAAGGTGGAGACTCTAGAGGAGGCCAAGA
GAGCACTCCATAAGATAATCAAGACAAGCAGCAAATAAAGCGAAGGTCGCACACGCCCTG
CACTTGGTTTCACCAGCCCTACAAGCCCGCTTTGTGAGTCGACAAAAATAACGAAGGATC
ATGTAATTTAGCGTACACAGATGCAAAATAAGATGATTTCTCTTTAATAATGAGAAGCTC
TCTGGCAAGCCCCCATATAGTGTGTACCCATTTGCTTGTATCGCTTGAAATGTAGTGAAG
CTATGTTGTGCAGCCTGGTGCTTATGGAAGCCGGATGCTTTTGTTGGACAAGTTAGTTGT
TGGATTCTGTGTCCCGGCATAGTTATTTTCACTGAAGCATTAGCATCTGGACTCAGCTAC
AACTTTGAATGTGCTTGTGATGATTTTGACGCTAAATTGTGTGGAGTATTTTTATTGCCA
TGTCGTTCGGTTTGCCGTACACCTGGAATTGGATTTATGGTGCAAAATGCAGGAACTTTT
GAGGACGTGCATTTTTTCTAAGTAAGAGAGTATAGACACTTGGAGCATCTCCAACGGCCG
CGCTATATAAGCGTTGGGTTGCAAAAAACGAATTTATAGCGTGCGCGTAGCTGCCGCTGC
TTCCTCTATCTCCCTCTAGTCGTCGTCGCCCTTCGCGCACGCCATTTCTGTGCCAAAGAG
CGCTCGATCGCATGTTGTCGTCTGGCGCTCACAACGTGTTCGACAAAATGCTTGCAAGGT
CTGTATTACTTCAACTTCGCATTTTTTACATGAATTTGATGCATGTTTTCTGTAGTTTTT
ATAGACTAGTTTAAATTTAATATTGTAGATGAGTTCGTCATATGATTCTTCTTAAGAAGA
ATTTGATATTGAAGAGAAGGAGGACCTTGCAATGATCCTAGCTATGCACATCAATAAAAA
ACCGAAGCACGGTGGTTCG