| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
 |
Predicted Genes from contig_2552040
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_39013 |
1 |
1245 bp |
AK363877 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_39013
Contig Sequence (2951 bp)
>contig_2552040 2951 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTAGGAACGGAGGGAGTAGAATAATATATCCAAAACTAATAATAGCTCTGGTAACTAAG
ACTGAAAAATTACATCATTAAGCAAATAATAAATGCAAACCTGGGAGAATATAAGCACAC
GGTGGTTAGTCTCCCGCAGTCTCAACAGTAGCTTGTCCAACAAAACCAACTTCCCACTAC
TCATAACAATGCGTTCAACTTTATTGCGATCACCAATGCTATCTCCACCATAACCATGAT
CAGCACTTTCAAACAAGAATGGATGGTTGCAACACTTCTTTAACTCAACGACAACATTCA
AAAGTGAGACCTGCATATAACATAATCCAGCCAGCCACATAAATCAATATAAATAGCAAC
TCAAATATGCTGAACAAAAAGAGCAATTGTTTACAGAACAAATGATGAACAGAAAAAAAA
TAAAAAATAACAGTACACGATATCCAAGCAACTAGAGCTATCTAAAAAGGATTATGTTTT
GCAAATATGCTGAATAAGAAAAAATGCCTCTTAAAAAACACACAACAACATAGATTGCTA
GATAACAAGAGGCTGATATTCATAGATTGCCCCTCTTTGGCCGACACCGTGACGCCTGAT
GATAGACACTTGGTGCTCAGTAATTCCACAGCATAAAATAAAACACTAATTGAGTTAAGT
TCTGTCTATAAGAGGGGCAATATAATGCACAGTGGGGTCAAGCTTTCCTTTTGATATTGC
AGCGGATTTTTTAAAGGTCTATTATTTGCTAAATTTTAAATATATAAACAACCACCCTAC
CAAGATGTGGTTCTCATAATAATCCAGCATTACAGCATTGCTCAAGAAACAATGGTCCAA
GACCCCTAAACAGAGCCACTATCTATCAAATATTTCTCATTTCGCAGATACAGGATCTTC
AACATTGGCCAACCTACATGTAAGACTAACATAATGAGCAACCTATGCAAACAGTTCTGG
GAAGAAGTGGCGGTTCTTCACAAAATATATTGAAACAAACCCGTCTGTTTTAACACTTTA
ACAGCACAAACTGACAGAAAAACGAATTGCTGATACCAGCTGATATAAAATTCACACTCA
AGATGAATTAATACCTGATTCCCGCGAACTCCTTTATTCAGATTCTGAAAATTCCGCTCT
AGAATCCACTTGTAATATCTAGCAAAAAAATAAAAAGGTTAATTTCAAGGAGGAATGAAA
TGTATTATTGAACTTACGTTAATACAAGAACATACTGTTTCTGTAGAGGAGACATTTCGA
TACGAAGAATTCGCTCAATTTTTGGAGGTAAAGACTTCTCGACATCTTTAATAACTCGCC
TTAAAATATGGGGCCTCAATTCCATGTGAAGATTTGCAAGCTAAAAAAGAGAGTTAATGG
TCATCAAATAGTGTTGGGCAATTGTGAACACAATCCAGGTCAATACGAATCCATCGTTCA
CAAATTAATACCTCAGTTTCATTAAACGAACTCAAATTTTTGTATCTCTCAACAAAAGTA
TCCTTGCTGTTAAATTTGACTGGATCAAGGAAATGAAGTAGTGCCCTGCAAACAACAAAA
AGAGGAGAAAATAATGAGCATACTTGGAACCAGAATTTTGCCCACATGGTTGTGCGCAAG
CTATGTTTTCTCTCTTTTTCATCCACTTCAAGAAGTTGATTTTCTAAATAAAAAAACATG
GCTAGTCATGATATGACATGCACGTTCAAATTTGGTGAAAAAGTAACATGTGTCTTGCAC
CAAAACAAGACATATTCTGCACCTGAAAAATCATATTATTCACCAAGCAGGCTGAATCAG
TTTTTTTGTGCTGGATGCATGGTCACATTTTTATCCCAAACTTTACAACTGTGCATTTTA
TGTTACGTCAAACATCAATGTTTCTTCTCGAAAAAGTTAACAATTTTTCAAGTGGCTGCA
GAGAGAGGAAAAGGGTAGTTAAAGCAACCCACTTCACTTCTGAATTACACACTCGCATTT
GCAGTTTCAAATTACGAGTACCTAGCAACAATGGAAAACATATAGTAAAAAAATGCCTAG
CTCAAATCTGCATAAGAAAAGGACATACCAAAGCTCTTCAACACTGTTCTGCAAAGGGGT
CCCAGTTATTAGCAGCTTATTTTTGGTGCTGAACTCCTGAGAGAGAATAAACACAGTTTT
ATCTTTTTGCGGTAATTACCCAATACATAGGCTGTTATGATTAGTTCAAGAGAATGTCCG
TACCAAAAGAGCAATATACAGTGATGCTTCAGAATTCTTCAAACGGTGGGCTTCATCAAC
CATAAGATAACTCCATTTGATTTTTGAAAGGACGGCTTTGTCCTTAAGTATCACCTCATA
AGTAGTTATCAAAGTATGGAATTTTACATGCCGTCCACCCTTCTTATTTGTAAAGAACTC
ATGCTGCTGACACATCTGCCACAAATGGATTAGGAAGAATGTCAAGCGCAAAAGCAAGGT
GAACACAACTCATTAGGAAGTGTGGAACTAAGAACATGCCCTTCAATACAGCAATATATA
TTGATAATTGACATTTGAATGGAAAGTCCAGAAAATAGGAAGAAAAGCAGGAACCAAATG
AGCAGATATATATAAACAACCTGGCAGATATATATAAACATAGAGGCAAAACATGATGTG
CAACGGTCACTAAATTATGCAGAGCTCTGATCAAGATCCATGATTAGCAGACGAATTCAT
CCCATGATATAGAGGGTGTTTGGTTGGGCTGTGGGCTGTGGAGAAGCTGCTGTGAGCTGT
GGGCTGTGGGAAAACTGCTGTGTCAGGAAAGCTGCTGTGAGCAGTGTTGTCGTTTCGTAA
ACTAGCTGTCTGAGCTGTGGCTTTCGAGTAAATGTCTGGAATACCCCTGAGATGCTGAGA
CGGTGTATATGTACTGATATTATGGTAATAATCTANTTTTTGACATGTTTCACTAATTTT
TAGTTGATGCA
