Map Locations of contig_2551775 (5116 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2551775

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38919 2 596 bp MLOC_38919.2 Available Available LOC_Os03g04460.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-20, 13103.m00456 protein outer mitochondrial membrane porin, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_38919






Contig Sequence (5116 bp)

>contig_2551775 5116 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCTCATTCTTGGTTCCCAAGTTTCTGTCTGGTCCAAAAAAATCTCAGTAAAGTTTCAAG
GCAATTGGACCTCATCTGAAATGGATTTTCGGCAAAGGAAAAAAAGAAAAAAAATAGCAA
CTGGCACTAGGCAGTATGTCAATAGGTTAGTCCCAAAAAATAATATAAAATTGCTATAAA
ATGATTATAAAACATCAAAATGATTATAAAACATCGAGGAATGAAAAACATCGAGGAATG
ATAATATAACAGCATAGAATAATTAAATATTATAAATACCTTGGAGACGTATCAATAACC
TCCTCGCTGTATGAATCTCTCGGCTTGGCCTCAAGGTGCAAATCGACAACCATGACAACT
CCATCATGTGCATAGTTTGCTACATCGGCAACATTAGTCTCGCGCTCTAGATTTCTAGTT
AGTATGAACCTGTTAGGTACTTCCACCGTTCCATAATATAAGAGAGTTTTTGATCCTACA
CTGGTATAAAAATATTCTAATATTATGGGACGGCGGGAGTAGTTTGTTGTGATGGTCTGA
ACTTATGTTGTGAAACTGATACTATTTTGGCTAGGGATCAACACCGTGTATGAAGCAGAG
GCATGTAATGCCTTTGTTGTCTTAAACCTTAACCCATACTAGTATTATGCATGCGTATTA
GCGCTTCTATATCTTCTGTTGTGTTGTTAACTAGGTAGTATGTTCTTATGGTCTACCTAT
TGTGTTGTTCTACAAATGTGGTGGTAAGGTCATCACACTTCAAAGGGTATAGGAGAACAC
CAACATGCACGTAGCCAAATAGTTGTGTTGTGCATATGCTGACCTTGAAGGACATATGTG
TGCAACCAAATAGTCGGCCCTAAAATGACCACTGATTCAATACAGACAACCAAACAACAT
GCACATATTGGTTTTTGACATGTTTTTGCTCAGCTAGGATGAACTAAGAAAAGTATGCCA
TAGGCATTATTTGAGATGATAACCGAAGACGCCCAAGATGTTTGGACATTTCAGCATGAG
AAGTAGTTACTTCCTCGTAGATCTTATGGGTAAAGGTCAGTGGATTTCTAAGTGCTTGTT
AGTTGCCTATCATAAGACACATCATCTGATGAATTTGACATATGATTTGTCACATCTACA
ATATTCATGACAAGTTTGAACTAGAAATTGTCACATATAACAAAGTGAAATGAGACAATA
TTTATTAAATAAAATAAAACAGTTGTTGTTATGCTACCTACAATGAAATTACTATGATAA
AAATAATAAAATTGGCATGGCCTAATAATAAATTTATTATGGTCTAATTAATAAAATTGC
ATGCTACCTATAATAAAACTAGCATGGCCTAATTAATAAAAATTGACATGGTATAATTAA
TAAAATTTCCATGGAATTTTATATAAAACAACCATGATCTATAAGGTAAAACTGTCATGG
ATATGTGCTAAAAAATCACAAAGCTTGCCATGCGATCATAATAAAAAGACCGGAAACTTG
CCATGTTTGGAAGAAAAAAATGTTATCAATCTGCAATGTGACCATGAGAAAATAATTATA
GTTTTTTCATGTATATAATAAATTTTACGTGTGAACATTAGAAAAAAGGTTTAAATTTTC
CATGTAACAAGTTTCAAAATTCCTAATGTTGCCATGTGGTCATCAATGAAAATAATAAAA
TGTGACATGTTTACAAAACAAAAATGATATGCCTAATTTGCTAGACATGTTAACCTAAAT
TTAAAATTGAAACACGATAAAAAAATTACATCTGTGAAAGACAAAAATTGTCATTCATCA
TGAATAGAAAATTTCCATCCCATGTAAACCATAAAATTGCTAGACTAGTTGTAGCATGGC
GGAAAGTATAAAACAATTATGCATTAAACTTGTAGGAATAGAACATAAATATTCCCATGG
AAAATTTGTTTTTATGAGAAATATGTAATCATATACTACTTTCCATGATGCTCTTGAACA
AAAACTCATGGTAAGTGCGATTTGAATTTACTACGACACTACTTCCATGATCTTGAGAAA
GACACATCATAGATGCATATACGTTTTTTCCATGATGCATACACAAAAACGTGCCATCAT
TCTTTCACAAAAACTATACATAATGGTAAAATTTTAAAAAGAATGTTCTTTGCAAAACAT
TACTTTTTAAGGAAATTACCATGGCCAAATGGCAAAAAATAGGAAATTTGTTTTCTTAAA
GACATGGAAAATTTCCAAATTTGCCATTCGAGAGAAGAGGAATTGGCCACATCTGCATTA
GTTGCCAAGGTATCTACAATAAAAATACATGGTAAAAGTTATACAATAATAATTTCTCGT
GCTATCTATAATAAAAATGATGTGGTCGTATACTATATATTTCAAGAATTGCCATGCTTT
ACAAAAATATTGTTTCAACAATTGTCACGAGACAAGTATAAATATATTTAAAGAATTGTC
ATGAAATCGAAAAACATAATTCATCAAAAAAATTTGTGACCATTAAAATTTCCCTAAATT
TCACTTGCTTGGAAACATAATGTTTTGAGTTTGTAGTGGACCACTATAGAACAAAAATCA
AGCTTACCATGTTAAATTCCCTCAACTACATTCTTATGCCAAGGGGAAGGACATCTTAGC
GAGGAGGGCATATGAATACACATAGAGAAACATCTATAACATGTTTCCTCTTTCACTATC
TACTATTGCCCTCCAGCAATGTCAAGACCTTCACATGACCATTAGTGACATAAGCATGGT
CCTTACTCCTGATATTTAGAAATACCAAGGACATGGTACCTAATTTTCGAACAACAATGT
CCATAACACAATCATTGGTAATACTCGAAAAGCCTGTGCTAGTTTTTATTGGATTTGAAA
ATCCTCTATTCTCCATAAATAGGAGTTCTTTATCTCGCTCCTCATTCGAGAGGGATTAAG
CACCAGAGATCTTCCCACTACACCACAACACCATAATGACGACATGAATCTATTGATATA
AGTGAACATTACTCACACTTTATCTGTTGTAACAATATCGACACACTAATGGTCGATGAT
GTCCTAGTCTTTTTTTGTCTATATATCGGTAATGGATGACCGGTTTGTGGACATACTATG
TGTCAGTATAAGTTTTTTGTTGTTAAATTATGTGTCGCTGTTATTTTGCAATACAAAGAG
TGTCGGGGTATGTTTGGGCCTACCCGACTTATTTCGGGCCACGCGGGACAAGGTGCACGC
GAGAGACTAAAAAACTGCAATTTTTTTGCTAAGACTCCCTTTCCCCTCAATCCCTCACCC
TACCTTATCTCTTTCTCCCACACCGCACTTCAACCAAAACCTAGGTCACCTGTCGCCGCC
ATCGCCAACTGACATGCCTCCTCTCCCATCAACGGTGGCGCATCCCGAAGCTTCCTTCTA
CCATGTGGTGCTTCCCCATGATCCAAGCCGGAGGTGACGCCTTATCGCCCACAGCAGTGG
AGTCGATCGCCGCAGAACAACCCCGTCATACTTCCTCAAGAACTAGGCCCCTATAGGTAG
GATTCAGGCCGATATGCAAACTCGTCTAATTATCTGGTATCTTCTCCTCCTCATCCACAC
TCGAGGTGACGAGCTCATGCGACATAAGACTTTTACTCTCCATTTGCTACCCCTCTGCTC
GAGCAGGCGGATCCCTGTCATGGCACCTTCTCTTTCTCTCCCTCCCCTCCCATGGTGCCC
CTCCCTCCATTTGCATGGCACGCCTCCCTCTCCCCCCTTCTTCCCACGTAGCCTCCTCAT
TCCTCTCCATTGTGGTATTTGTCCCTTTCTCTCCATTAACCCTAGAACACAAGCAGGTTA
ATGTTAGTTCAATTTTCCAAATCTGCAGCAATCAAATCCTAACCCCTTTCCTACTATTTC
AGCTTCATAGTAGTTCATTTTTGCAAGTTGCACTAGTCAATTACAAAGAAGGTAATACCA
ATTCTATGTGATATGGCATTTTTCGATGATTTTTCCGTATTTTCCTTCAATATTCGGTTC
ACCATTTAACCGTTTTCCCTTCAATATTCATTTATCATCTGAATCTATGACTGTGCTCCA
ATAACTCATCTCATATGTTTTGTCTCTATAGATATCTTGTACAAGGACTACAATTTTTAC
CAGAATTTCTCATGGTCAAGAACTAGCGAATCTAGTTTGGTAAGACACTCGCCATTTACC
CCATTGCAGTTTTTCCCTAACTACTTGCTTGTTAGCTAAAATTATATTGCCTTTATTTTG
TTATTGCAGAGTGTGCCAGCTGCTAGTGTGAAGTTCGATGAAATTTTATTGGTGACATAT
GGACACAATATAAAAGTGGTAGAATTATTATTGTTATCACAACAGATTATGTTTCCAAGG
TAAGACCCTTGTAAAATTTGGTTCTCTAGTATTTATTACATGCCTCTATTTGTGCACAAA
GACTTCAGGGTTGTGTTGCTTATACTTTCTCAAATTGGTTCTGCTATTTTGGCCCCATTA
AAGCCTCATAAATGTATATGATAAGATATTAGTAAGTAACATGCATAGCCAAAATGAGTA
GGGCATAGGTTTTAATTTGGCTTTTGTTAGACACCTCAAATTGATGAATATTAGTGTTGG
ATGACCTTTCGTTTTGAGTCTATGAAGAATTTGCTAACATAGCCAGCTTTTTGATGTTTG
AATGTGAGCCTTAGATAGTCATATCTATGCAAGTGTATTACTTAGTCTTTCATTTCTGAA
AACTAGATATTTGTTAGTTTATGATCTTCCTAACTTGTGGCATGTTAGAGTTAAACATTG
TCTATCTATGTATCTTACTAGAGTGTTTGCTCGTGCAGGTGTCAACCGTTGTCACTTTTG
ATGAAGTAGTCATTGGTTTGAACACTTCATTTAGCTTCAAGGTTCCTGATCAAAAGTCAG
GTAAGGTGGGTATATTTTGCTTTGGAGGGACAATCAATTTTATTGAAAACATGGGAAGTT
GGTGTTGTAGCAAACTAGTAATTTTTGGAAATATGCCCTAGAGNNNNNNATAAAATAGTT
ATTATTATATTCCATGTTTCAAGATAATCGTTTATATCCATGCTATAATTGTATTGAATG
GAAACACAAATGTATG