Map Locations of contig_2551437 (7787 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_2551437

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38808 1 1454 bp MLOC_38808.1 Available Available LOC_Os02g35130.2, FRAME:+2, EVALUE:2e-162, 13102.m03811 protein AIG1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_38808






Contig Sequence (7787 bp)

>contig_2551437 7787 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCAGGTGACGCCCCATCCTCTAGTAACCCTACAACCATGAGAAAAAACCCTTTAGGCCTA
GTTTGGCAACACAGCTTTTGCAAAACCATGGTATTCCAAGACCTAAGTATTTCAATACAT
GGACAATAAATACTTCAATTTTTAAAAATCATAGTTTTTCTCAGTTTTGATAAAACTTCC
GCGGCGTTTGGCAAGTGACATTTTTTCTCACTTCTTTTTGGTTTGGATCGATTATTACGT
TGTTGCATGCATATTGTTTTGGCAGAATTGTTGCATGCATATTCAACTACATTCATGGAT
TAGCTTGTCCTAATAGCCACCATATACATTCAGCCTTGCACGAGCATGTTCTCTCCTAGA
TGACGGATCTGTAGTAGAGTCATCTTTTGTAATCAATCAAAGACCGAGATAGTTAAGACA
TGCACTAAAGGTTAACGTCTACAGCTCGTGGGTCCATGTGTTTTTAGCTGACGGCTAAGT
AGTCATTTGTACGTGTATGTCCGTCTCTAACCGGACAGATCGATGGGCTAGCTATCGATT
TATGTACCATAGGCGTTGATAGACCGGAAGATGGATACAAAAAGAACAAGCATCCAACGT
TTTTCGGTTTTAAAAAAAGAGGTCAAGGCCTTTTTTCATATACAACAAAAACACCACAGT
TTTAAAGATACCACGGTTTGTTAAACTGCGGTATTTTTTCCATCCAAACAACTCAAAGTA
TTGAATGCCAAGATTTTATCAAGAATCATGGTATTTCTAAAAAACCACAAGAATACTTTG
GCTCCCAAACGTAGCCTTATTCCCTAAAATAAAACACAATTTGCTTCATAAGATAGGAGC
GGATGGTATTCCAGTAACCCGCAAAAAAAAGTACTTATTTTTAATATATTGTAGTAAATC
AATTTCGTCGAACCATGGAATAAAATCAAAACCGAAGTGTGTTTATCTTCGAGCAGTTAT
AAGCTCAAGAAAAGAAAAACGTGTGGCAGCGGCGGGCGCCACAAAGAGGATGGATGGGGG
CGTCGGTGTCGGCGGCGGGCACCGTGGATAGGATAGATGGGGGCGCGGCGGCGCCGGCGG
AAGAACCCTCATGTTCTCATGACTTACATAGAGATTGCGGGTTGAATACCTAAAAGTGAA
GGGGCTTTTGTGCAAAAGTGCCGACGACGTACGACAGAAGCGATACGTGCTTTATTATTA
GAGAGAAATTAGGAGAGATTAGGAAAGATTGTAGTAAATCAGTTTCGTCGAACCATGGAA
TAAAATAAAAACCGAAGCGCAGTTAAAAGTTCAAGAAAAGAAAAACATGTGTTTTTTTTT
CGAGGTAGAAATATTTGCAGCCAAAGAGACGGGCCGTGGCCCTCACGCGTGCGATCTGGA
AACTCCGAAATACCGCAGCCTCGCCCTCGCGTGTGCGGCTTGGTTTCTTCTTCTTTCTTC
GTCTCTAAGAAAAAAAAAAGAGATTTGGGAACTCAGTTCCAAAATAAAAAGAAGCCCCGC
ACCTCCTCCTCCTCGCCAACACGCCAAGCGACCAAATCGCCGCCGCAGACGCAGCCGCCT
AGGGCTTCGCCGCCGTCGCAGATCCCTCCTTCCGCCTGCTGCTGCGGGTCCTCCGTGTTC
GTGACTGCTGTGTCGGCGCCGAGATAAATTTTCCTGCCGTCACTCAGGTATCGCTCCCAG
CACAGTCGCCTTTCGTTTTGGGGCCCGATCGAGTTTTCCCTTCTTGTCCGCCGGTTCGTG
CGGGCGCCGTGAGCGTGCTGGTGCTACTTTCGCGCTGGCTCTGCTGGTCGTAGGGCTCTC
GGCTGGGTTGAATTTCAGCACGGACCCTAGTTTTTTTTTTTTTTGCTCATCAAGAATCGA
TGAGCGTAACTGAAATAGTAGATTGATTGGAGCAAGCAACATCCGTTTGGTTCCAATCAA
AGGAATTAATCAGCTGGTGACTCAGTGTTTAGCATCGGCCTACAGTGCAAAATTTGTTAG
ATTTGTTTCCTGCGTAGAAGTTTATTTGTGCAGTAAGAATCGGATTAGTGCTGGTACCGA
GACGAACGACTCGCAAAGACTAGTGACATGGCCGTGCTGTTAATCAGTTTGGTGCATGCC
AAATAAGGAAATCCTATTTTTAGGAGACCTGATCTTGTGATTACTTTGGTGCCTGCCCAG
AATAGCTAGTGCGCTCGTAGTAGGTACAGTACACCAACTCTGGTGGCTTGCTTAGTACTG
GAAAAGGAATAAGCAGGTTGCGGGATTCCTACAAGCGTTGATCAAATTGGTGACATGTGC
TAGCTGGCTAGTAATAAAGATTCAGCTAAACAAATCTGGACATTACCATATCTGTATACA
CCTAATGTACATAGAAATATTATTTCTCTGGAGCCCTAAGAAACACGGATACTGCCAACG
AATCCGTATCCGATTCGGATACGGTATACATAGAAATATTTCTGTGGAGCCTTGAGCCTT
CCAAATTCGTTCAAACAATTGGTCCCCAATTGTGTCTATTCTGGAGAGCCCCAATTGTGA
CAATAAAGGATACCGAGGTTTTGTTTTCGTGTTCAGAGTTTACTGTCTAAATTTATGTTC
TTATGTATTTTTGTGTTTACAGAACTTAGACTGTGTTGGAATGAATTTGATGTTGGTGTG
TGCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTTGGGGCATGGTAATTTATAATAATTTTGTTTAAAAGG
TCACATAGCAATTTAGGAAGATAATTGATGTGATACATGGTTGCTGATTCCTGATATTTT
GAACAGATTTTGTGAGTGTTCGATATGGGTGGAAGCAACTATGATGACGACTGGGTGTTG
CCCAGTGCTGACATCACTCTTGTTCTTGTTGGAAAACTTGGCTATGGCAAGAGTGCAACT
GGCAATAGTATCCTTGGACGGGAAGCATTTGTATCAGAATACTCTCATGCTAGTGTGACA
AATACTTGTCAGATGGGAAGCACCATGCTGACGGATGGCCGCACCATCAATGTTATTGAT
ACACCAGGTACGAGTGTTTTGGATCTTTTGAATTTGCTTACTTTATTTTGTTTCTCCAAT
GAGGATGTTTTGAACCTGCGATATCTGTATAGTATGTTGCATCTTGTCTACGGAACGATC
TAACTTTTGTTTTCTGGTTATGCTAAGTTGTTTGATGTAGTATCTTTGGATGTTTGGACT
TCATCCACTCATCCTTCATTGAATAAAGAGCCATCCACTGCATTCATTCTTAACAAAATA
AAAGTACTGTAGCACCTTATTGTACGGTGATTGTCTGTTTGCCATCCCACTTCCTCCCAT
CCACAATTTCCTGAGTAATGATCCATGATATCCACTATTTTTTAGGGGTTGCAAAATATG
TCGTATTTTATTATGGTTTTGCTATTTATAGGTTGTGTTGTTTATTCTAATAATCCCATG
TCAATTTTTCTGGCCGTGGATTTGTACGGAGACTCATGCGCCACATGATTAGATTATCTT
CTTAGTTCTCGGCTAGTTGATCTTAAACTAGAAGATTTAAAGTTTTGCAATTACATGGTG
AATCAGATTAATGATTTTGTGAATTACAAAATTATCGCTCCTTGTTTTTGACTTCAAGTT
GTCGCAATTGGAGCGTTGGATGTTGAAATTGGGAACATTACTGAAATGTAGGGGAGCAAG
ATATTTGAATTGAACATGCATGTTTTATATTTTGCAGCTGTAACTTCACATGTCTTAACA
TGTTCATCCATCTTCCTTCATTTATTTCATGCATGGAGGTGAAAGCAGCTTTATAAAGAA
AACATTATTTTTTTTTCTAATTAAATATAAAGAAATGCTAATCGTATTTTTATGAAAACT
GTTCATGTATTTTTGTATATCACCAATGTGGAAACTAGGGAACCTGTAAATTTGTCTTCC
TTGCTGCAAAACTGATGCCATTATTTTTCCTTAGGTCGTCATGTTTATTATGTTTTGCTA
ATCATCTATTTCATTGACTTGGATAGGATTATTTGACATGACCGTAACCCCTGAGGATGC
TGGCAAAGAAATTGTTAAGTGCATGAACATGGCTAAAGATGGGATACATGCTGTGTTGAT
GGTTTTTTCTGCTACATCTCGATTTTCTCGAGAAGATTCTAGTACAATTGAGACCATTAA
AGTGTTTTTTGGAGAAAAAATCGTTGATCACTTGGTCTTAGTTTTCACTTATGGAGATTT
AGTTGGTGAAAATTTATTGAAGAACATGTTAAGTAATGCCCCAGAGTATCTACAGGTATA
TACTTTTTTACCTTTCGTTGCCAAACTTGAGATGTGCATGGCTCTTGAATCATGTGAGCT
TGGGTGCAAATAGTTACATTTGTATGTTCTGTCTACAGAAAGTTGTTCAGCTCTGCAAAA
ACAGAGTGGTTCTTTTCGATAACAAGACCAAGGACCCTAGGATTCAAGCTAAGCAGCTCG
AAACGTTGCTTGATGTGGTTGATTCTGTTAGTGCAAATAATGGAGGAAACCCATTTACAG
ATCAAATGCTCACTCGCCTTAAGGTAATGTTGTTGAAATGGAGTTTGAGATTCTCATCTC
TATCTTTTATTTTGTATTTCTTATGCTTATCTCATCTTGTAGGAGGTGCATGATAGAGAA
ATGGAGGTTCATGATGCTATGGGATATTCAGAGGACCAGATAACTGAATTGAAGAAGGAG
ATCCACAGAACTCGGGATGAACAGCTTGCAAACATTACTGCCATGGTAACAGATTCTATT
TTATCTCTAAATAAATCTCACATTTAGTTCTGTTACTTTCAATTAAAATTGTGTTCCAGA
AACCTATCCCCTTCTCTATATGGCATATTATCTACATATGTTCCACTACATATATTTTCT
AATGATGCTATATTAGTTGACAGTACTTTTAATGAAGTTATATTTGTAAAATATATCTAT
GATACTTCCCTTTTACAAAAAAAATAGAAAAGGAGGTTGAAACCTGCATTGCACACGGCC
ATGCTTCCCTTTCTACATAAGTTGATAACTTTACAAAACAGTTTTTTTGTTGTTGGAAAA
AAAGTACTAGGACTTACCTTCACTTCTGTTTACAAATCCAGCTTTTTTTGGACATTTTAG
AGATTGTTTTAAATCCCCAGAATTATCTAAATATCTGCCTATTTACATGTATGGGTTTCC
AAGTTAAAAACTCCATTGACTCTGTGACACCATGATAGGTGGAGGAAAAGCTGAATATCA
CGGTGGAGAAGCTGCAAGTTCAGCTCATGGAAGAACAGAATGCAAGGCTAGAAGCAGAGA
GGGTGGCGGCAGAGGCCAGGGTGAAATCCGACGAGGAGATCCGCAAGCTCAAGGAGAGGC
TCGAGAGGGCCCAGGAGGAAAACGAGGAGTTCCGGAGGCTGGCGGCGACCAACAAGTGCG
CTATTCTGTAAACAGCTCTCCCCTGGGAAAAAGTTACCGGATGTCTTGTTAATAGGGAGG
GGGTGAACTTGAGCCAGTCTAGTAGTAACAGATAATACTTTGGTTGCATCGTCTCGTATA
TTAGTAGATGTGTAGAACTTGAATGCCTGGGGAGTCGGGTAACTATATATTAGCTACAGT
TATACTTGGTTGCAATCGTCTCGTATATCAGTATCATCTGGCGATCTTTTTTGGTTTTGT
TTTTGGGCACTGCATCTCTATTAGAGATTGCTTTTTTTTTTTTGCAGCCAGTGACTTCTG
ACCCCGCATCCTCGTACTGGCGCCAGATTTTTTCAACTGCATGGCCCAGAGTTACCCTGT
TCCATTGAAAATATAAACATCCGTGCACCGCCCCTTCTCTGGAGTAAAGCGTAATTTCTG
CGGGAATGTTCTGCTTAATTGGCATAGATGCAATGATGTATTCAGTTTCTTATTGCCTAT
GTGCTTCTTTTATTTCCTACTCCCTCGGTTCTTAAATACTCCCTCCGTTTTTAAATATAA
GTCCTTGGTAAAGATTACATTATGGAGTACATATGGAACAAAATGAATGAATCTACACTC
TAAAATACATCTATATACATCGGATTACATACAGAGCAAAAGCAGTGATATACTTTAAAA
TATGTCTATATACATCAATATATAATTTATAATAAAATCTCTAAAATATCTTAGAAACGG
AGGAAGCACAGGTGCTTCGATGTCATACAAAAGGGAGGGGGAGCAAGCAGAAGACTGGCC
TCCCCAACGATCGACGAAATCTGAAGTATATAATGTATATTTGATTAATATGAACAAGTA
CATATGTATTTGTCACCCCTTCTAGTGTCATACGTGCCCTGTTTCCAACTTATGTCCTTT
ACACAACCATGGTAATGCTTTGGTAATAAGCAGTTGTCAGACTATGCTTGCGTTGGCTCG
CTGGCACATAAAATGCACAGTGCACATGTTTCACATGTAAACATAATGTGTTTCCTATAA
CATGGTATGTGCTTGTTCCTTACACTTACATTTTCATTCTTCAACCACAATCAAATTGTG
CTTCGTAATACAACGTGTGCTTCAGAGTAGAAAACAAACCATGACAATGCTTTGAGAAAA
AAATGCAAAACTATGAAGCATGGTTTGTAGGGCTGAAGCATGTTTACGGTATGAAGGAAT
GAAAGGAAGCATCATGCATGTATCATGTATGGAAACATATGTGATTATAGGGACCTCAAG
TGGATATCGGAAGCATATATACATGGAAGAGGTGTGATTAAATGAAGTTTGTAAATATTA
TGAAAACCCATTTTCTATTAAATTAAAGCAAACCAGATCGAAGCAAACTTTGGTAGCGTC
TGAGCAACAATGGAATTGAAACATGCTTCATGTCATAGAAAAATGAAGCAAATTTTTGTT
TCAATTAAAGCAAAACAAATTGTTACATTGGACATGACTTTTTATTAGATGGAAACAAGT
TTAGCATGTATTGGAACCAAATTTCAGTAGCTATAGAAACAAAAATTTGTCAAGTAAGAA
ATTGAAGAATATGGAAAAGAGAGAGTAGGAAACAAATAAATGTGTATAGGGCTGGCCACA
AGCCATCGGGGCGCGGACCCACCCGCAGGTCGTGCCTTGTTGGCTTGTGGGCCCCTCGGG
CATCGTCTTGCGTTGATTTCGACTCCCAAAATTCACATATGAGGGGTCACACAATCTTGT
AAAGTTTGTTGCCTCGCTTCCTCGGATCGCCATTTGTAACTTCTATCCCCTCACAACACC
CTTTGTATCCCGTTTAACATTTCTTTCAATTAATAAAGTGCGAGATTCCTAAAAAAACAA
AAAAAAACAAAGGATGCACAGCATATTACTGTTGGCGTGCAATACGGGTTACACATTTAT
TCTTTCCTTTGATAGAGTGAATTTATTGATTTAAAATGAAACATACAATAACAAAACACA
CACACACGCACGATAACTATGGAACATAGCTCAGTTGGCTTGGCGCTGGAGTTTGCAGCC
AGCCCGCCGGTGTTAGAGCCGAGGTGTTTACGGAGTTTTTTTCTATAATAAGATATCAAC
AGGCTAGTCTAGCCCGGGTTGGTCTCATTCATACTATGCTCATCTCGCGCGAGCCATTAT
AGACGGGACATCTCATCCGAGCTTAATGAAACCCATCCATCATCGATGCTTTTTGCAGCT
GGGCCCGCACGTGCCGTCGATGGTGGAGCGCATGTCGGCGCACCGGAACATCTTGACAGG
TCGCGCCCTCACCATGCGGTGTTGAAATTAGTGATGGGCCTTAGGCCCATAAGAGAATTT
CAGAAAAATCTCCAAGGGCCCATGTAGATGGTGGCATGACAAGGTGG