Map Locations of contig_2551251 (3228 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_2551251

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38744 1 562 bp MLOC_38744.1 Available Available LOC_Os06g36160.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-69, 13106.m03735 protein 40S ribosomal protein S24, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_38744






Contig Sequence (3228 bp)

>contig_2551251 3228 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCACCCGCAAGTTCATGACCAACCGCCTGCTCGCCCGCAAGCAGTTCGTGCTCGAGGT
CATCCACCCCGGCCGCGCCAACGTCTCCAAGGTCGGAGATCTCGTCCCCATCCCCTCGTC
CCTTAGCTCTGTTACATTTTGTCGGCGATTCTGAAGCGTTCGTGTGCTTGTGCGCAGGCG
GAGCTCAAGGATAGGCTGTCCAAGGTGTACGAGGTCAAGGACCCCAACTGCATCTTCGTC
TTCAAGTTCCGCACCCACTTCGGAGGCGGCAAGTCCTCCGGATTCGGTCTCATCTACGAC
AACCTCGAAGCCGCCAAGAAGTTCGAGCCCAAGTACCGCCTCATCAGGGTATGGATCTTT
CGCCCTTGTTTCTTCTTTTCCCTGTCTCGTCTAGACGTGCGCCAGTATTTGGTTACGCGG
TGCTCACCCATGGGTTGAGATGTACTAGTAATTTGTATTGATCTAGCCATCGCTTCTTAG
TCTAGGTGAATTTTCATGCTGCTTACGTAGTCTGCTCTCGTCTAGATGTGCGCTAGTATT
TGGTTCCGCTGTGCTCACCAATGGGTTGAGATGTAGTAATTTGTGTTGATCTAGCCATGG
CTTCTTAGTCTAGGGGAGATTTCATGCTGCTCACGTAGTCTGCTGCGTTCGATTTGAGTT
AGATAACTAGGTCTGCTCTCATTTTATGTTTCGGAAGTAAGCTGATTTGCTTAAGTTGGT
TGCTTGCTAGGTTAAGTCAGTCAGCAGTAGAAAATTGGATTTTGGAATAACTAATTCTTT
GTGGCTTTCAACCTCTTTGGTTGGTTGTTTCAATCAGGTTTAGTTTACCCTGCCTCTACT
TAAAAAAAGCGTTTGGTATATGCCGCAAACCCACCTCATACCTTGAATCAAATAGGTTGG
TTTAGGATGGCACTATGATTGTAATACCGTCAGTTGCAAAGTTGTTTTGAGACAGTTTCT
GAACCAAAAGGTTTATAGGGTAGATGCATTAACATGCCTATCAGTTATGGTGGTGAATTC
AGAAATGAGCTGAGACCATACATGCCTGGTTTAACCAAAGGTTTGTCTCTGGACATTCCT
CTTTGTGGTTACCATAATGGTGCTGCAGACGAGCTTACTCTGAGACTGAACAAGTTAGTT
GATTGCCTTGTTAGCAGCGAGTCTTCTGAGTTGTTAATATTAATCCCCAAATGTATTGAT
AGATAATACTTGTTAAAGATAGTTCAAGTAACCTGTATTAATACATGGTACAACTAATTC
CCATACATTTTCTACTTTGTGTAATCCAGTCGTGTTTGTATATGCCTTTCCTATTAAGTG
TGGTAGGTTGGTACCTTTTTGTTTTGCTTATGTGCACTACGTGCTTGCATCTTCTGTGTC
AGTGTTACACTCAGTTATAGTCTGCTACAATTGGACTTTCAGCACAGCTTGTTATCATTC
TTGTTTCTTTTTAGTTGTGCTTGTTGTCCAGCTTACTCTGTTACTTTGCCCACTGCTTTC
ATAATAGATTCTTGCTTGCCACTGTATAGTGGTGCACAAGCTGGCTGTATTTACAATGTT
GTGATTGCGTGATTATTTTCATGCATCTTTCATGGCCGTATTTCCATAGTAGGTGCAACA
TGCATATTTCCATAGTATGTGCAACATGGCCGTATATATGGTTGCATGTCCTCTTATTAT
GTGTCTGGAGAGGCTAATATCTTTGCATTCTTGTCAGAACGGTCTTGCTACCAAGGTAGA
GAAGTCACGCAAGCAGATCAAGGAAAGGAAGAACAGAACAAAGAAGATCCGTGGTGTGAA
GAAGGTCAGTTTGGACACAGCAATTTTCACATCGATCTTAAGTTGCACTTGAATATGCTC
TGCTTGTTGATCCTGTGATTCATTCTATTTTCTCTGGGTCGTTTTGCAGACCAAGGCCGG
AGATGCCAAGAAGAAATAAGCACATTTCTGTCTTCATCCTTTCACCATCAGCCTTTGCTT
GGTTTAGCACCGTATCCCTGTGCCAATGTTGCTGAGTGCTTAATTATGACTAGAAAAGAC
TTTGCCATTTATGTCATCTCCTGGTATGTTAAAAGGCATTTTGTAGTATCTTATGCTAAG
ATTTTGAGGAAGTTGGTCGGACTATCATATTATACCTGTTGTCGTTGCTCTTGATTTTGG
CCATTGAGTAGTCAAATTGCATTGTGTGGTTTATTCTCCTCTCAAATGTTTCCATGTTGG
TGTGAATCTCAAAAGGAAATCGGCGCTAGGGCTGTTAATAACGGAATGATGTCTTGGAAG
CGACTTCAAGTTCCGGTCTTGAAATCCCTACTAAGAAAAGGGTGGCTGTAAAATAGTATT
ACAACTGACCCAAAACTGTGGCTCAACCGGTACAAGAAATCATTCGGTTATTAAGATTTT
ATGATACAGTAAAACTCTTGTACACAGGGACTATAGTTTTAGCGGTTTGGAATGACCACA
CAATTTTTGTCAACTCGAGTGACGTTTTTGCGGGGATGTGGTCTGTGGCTGGCGACTTTA
ACCTTTTTCTTAATCAGGAAGACATAGCATCTAAGCTATTAGGGGGCATCTTCAACGCTG
ACACGTAAGTACACCGCATCAGTCCGTGTACAGGGGTCAGGCTGTGACTAAAGTAAAATC
TGTCCGCAAGAAAGAGTGCCCTGGATTACATCATCGTTTGATCACAATAAAAAATGGGCA
AGAATGCTTAGTGTTTACATGCCTGATCGTGAAATAGTGAAATAATACCAGTCCGACAAT
TTGTGCTAGAAATTGGATTTTCTGTATTGCCGGGCCCGTAATCCGAGCCTTCATGCCGAA
CTTGTTGTCGCCGCCATCTTTGCTTACGCCCCTTTTTTTCAACTGGGCAACATCTTAAAA
CAGACGCGCCCGCCTTCTCCAACTTGGCATCATCTTAAAACTTTTCCATGTCGCTCGCAC
GGGTAATGCAACATTTTTGCAAATCTGTTTCACTTGTCAGTGGATGCAACATTTGTACCG
TGTAAATTTGCCGCAATTACTGTTTAATTTTGCTGCTACCGTTTTTTATTTGTTACATCT
GTCTACTAAAAAAGCTGCATTCATGGTTGGTTGCAACTCGAGTTCGTTGGATTTTTGTTA
TAACCGGCGTTTTGACTTTTGCTACAACCGTGTTAATTNNNNNNACAACCGGCATCATGT
TTTGCTGCAACCGTTCACTAAACAAGTTGCATACACGTTCACGTAGAT