Map Locations of contig_2551002 (12174 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2551002

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38646 1 921 bp MLOC_38646.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_38646






Contig Sequence (12174 bp)

>contig_2551002 12174 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCACACACACACACAAATAGTTTGAGGCAAAAGCCCAACAATGAAGCCATGGA
TCAACAACTTTGGAAAGCATCCTGGAAAAAGAATCTGCAATCAAGTTAAACAGTAAGGGA
GAGTGAGGATCACCATGTTTCATACCTTTACCTCACACAAAGTGGGGGCCATTTGTATCA
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TTGGCCCAACATGCCCTATTCCAACACCATAACAGAACAATTAGTTTTTGATAGTGGTCC
CTACACACCAGACCAGAGGTAGTACCATGAGATAGAAAATCATGAGGAGTAGCAACAGGA
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CCAAACTGAGCACTAGTGTATCTATGTGAATTTGTTAGATAATAATCATTTGGATATCAG
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GATAGCAGAAATTTACACTACATGCCCATAGCACCATCCATGGACAAATCTAAACAGTAG
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AATACATGCATTATAAATAGTTGTCAAGCTGATGTACATCACCTACAACCATCTATTTCT
TCCCTACACATCCTTCTATATACATTCAGTTCCACCTATATGTTGGATTCAAGAGAGTTT
GAAGCTTCTAGGTAGCCTTGCACCAATGACAACAACTACAACCTCTATATTCTTCTCCGC
CATTCTATTTAGTCTTCTTTCTGTTGCAATCACTGGTGAGACAATTGAGTCTGGCAGTGG
TGGGGCCCGGGTGACGAACCTCATTGTGGAAGCATGCAAGAACGCATCAGGCTATCGTCG
TGGTGTCACAAATTTCACACAGGAATTTTGCTTGTCAACCCTTCAGTCGGACAATAGGAC
TGTGGAGGCAAAGGATCACCTTGAACTGGTGGTCATTGCCATCGACATCCTTAAAGGCCG
CCTCACTACTGCTAATCACAACATTGATAAAATGCTACAAAATGCAAAGAAAGGCACAGT
GCCAATGCGCGATCTCAGTTGCTGCAAGGTGTACTATGATACAACAATGAGAATCATCAA
TATATGTGATTACATGATCACAGACTTCCGCGGACATAAGGGCAGGCTGAAGTCCTTGGA
GCTTCCTCGTTGTGTTGACAGAGCAGGCTACCCAGTCGACGACTGCTGGTCCGATCTTGA
GTACAATATGCCATGGGCCGATGCACTCATCAGAGAAAATCTCGAGATTGCCGTGCTGGT
CAGCCTCGACTATGCCTTGCTAGCACCATATGATGTCAGTGATTAATATAATGTTAGTTT
TATCTGTAATAAATGATGTCCTAGCTACATCAATCTTATTTTCTTTTTGAATAATGATAA
AAGTTTCACATTTGTTTTATTCCTACACTCTTTCGAATAATGATGCAGAATAAGTTATTC
CTCGGGTGAAGAATAACTTATTCAACATCATGGGTGATGAATAGACTTTATATATATACA
CCCTGGGTGATGTTCGAGTCACGCTATTCGTCACCCTGGGTGAGGAATATTTATTCTTCA
CCCTCCTCTATTTTTACATTAATACACCGTAATTTTATGTTTCTGAAATTTTAATCTTAT
CTCATACGTAAAATGGAATGTAGAAAAAAACATTGTCGCCGTAAAAAATATTTTATATCA
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CTTATGACCTATATTTTTGTTTTCTTATGTCAAATTCTTCGTAGTGAATCAATATAAATA
TATCTATTTGCATTTCAAATTTAATTTATTTATGAAATGGTCGTAAAATTACCACGGGTA
AGGAATAATTTAATCTGCACCCTGAGTGATGAATAGAGTTTCTATATATATGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTATAGAGAGAGAGAGAGAAACTATTCGTCACCCAGGGTGCAAAATAAG
TTATTCTTCACCCAGATAATCTTACGGCCGTTTCATAAATAAATTACATTTGGAATAACA
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TCATAAGACCAGAAAAATCGCATTTCATGTATATTTTAACTATGCTTTTATATGTTTGTA
ATTTTACGTGACATAAAATATTTTCACCCCCTATATTTTTGTATCAATGCACCATAATTT
TACGTTTTTTTTTCTTATTTCATACGTAAAAAGAGACGGTAAGAAAATATATAGTCATCA
TAAAAAATATTTGATGTCATGTAAAATTAAAAAAACAAAAACATATGGTAAATTATACAT
AAATGCGATTTTTCTGGTCTTATAATCTATATTATTGTTTTCTTATGTCAAGCTTTACAT
AGTGAATTATTATAAATGTAACAATTTGCATTTCAAATGTAATTTGTTTATGAAATGATC
TTAAGATTACCTCGGGTGAAGAATAACTTATTTTGTCCACAAATATATATCCCACAATTT
TGTCCTTAGTCCGAAGTGAAAAAAGATTGACAAATGTATGTCCCTCAAAGAGTCCTCGTA
CCGGAGGACCCCGCGTCTTCCCCGCTAGGTCAACTCTTTCGGCGCCCAAACACTAGCCAC
CGGGCGCGAGCACTCCCTCCTACACTACCTTCGCCTTCGTCGAAAGAAGTCGTCGAGCTA
CGATGGGGACCGACGGCGGTGGTGGAGGACTCCCCCTCTCCTGCTTCTCAGGGGCGGTAC
AGGCCCCTACCAGCGTGTAGGCTTGGTCAATCTAGTTGAGCGACGACGATGGATGCGGCG
ACGGCTGCTGCGGTCGGCCCAACCTCGGGCGACGGCGGTTGTAGGCGCATCGAGCATCCC
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CCGACAGGTGCTACGTTGTGTCATACCTGTTTGGCAGGTACTACACACGATAGATCTTCT
AGAGTCTCCGCATCAGGATGGACAAGCGCAGGGAGATGGCACTGTTGTGCATTGTGATGG
CATCGACGGATGGGCGGGCTGGCAAGGATGATGCGGATCTTTCTCCTGAAGAGGGGACAT
CGCTCGATGATGATGGCGGCTTTGAAAATGTGTGCATGTGGTGTATGCTTTAGGTCTGTT
GCACCTGTTGTTAGATCCGATGCATTATATGGATGGAACGATGACAACATCGGTTTTAGA
TATCGGAAGTGAGAGCACTCCACATTATCAAGATTGTAGGTGTGAGTGATGGCTTCGGAT
GGCTTGATGTATGTTCTCGTTAGACCTTCCTGAAATAATTAATAAAGATAGTGGTATGCA
TCGATTGATGCAGAGGCCGGGGATTTAACCTCACTTTTTACAAAAAATGTATGTCCCTAA
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TAAATATAACTCTTTAGGTCTTTTGACTCATATCTTGCTTTTCCTATGTCGAATTTCATG
TAGAGAACTAATATTAATGTAACTATTTGTACATCAAACATATTTGTTTATTAAAACGAT
CATAAAATTAATTCGGTTGCAAAATAACTTATTATACACCTTTGATGATGAATAGTGTTA
CTATATATATTTTTTTGTGGCGGAGGAGAGTGAAACTATTATCATTATTGAAAATTGACA
CTTTACTATCATTACTAAATAAGTAGATAGTAAAGAGTGACACTTCACTAGTAGAAGACA
AGCCTTTGGTTCGAAGCATTAGTCCCGATTGATTTTTGAACCGGAACTAATGTTGCCACT
AGTCCCGGTTTATAAGGCTAGGCTTTAGTCCCGGTGCATTAGGAACCTCTAGTCCCGATT
TGTGTTAACAACCGGGACTAAAGTGGTGGTGAAGGGTTGCATCAGGCTAGGGCCCATGCG
AGTGCCATTAGTCCCGGTTGGTAATACAAGCCGGGACTAGGGATAGAACGTTAGTCCCGA
TTTGTATCATCAACCGGGACTAAAAATATCATTATAAATAGTGCTTCGTCCATCCCGAGC
CCAATCTCTCTGTTTTCTCGTTTCTCTCCTCTATTATCTTCCCTTGCTCGAGTTCATCCT
CAATTTCTTCTGAGATTTGTCAAGATTTGAGGCACCCATCCATCCAAGTGTTCACAAAGG
ATAGCAACTTTGTCCTTTCATCTCTCATTGCTAGATTAGCTCGTGCATTATAGTGATTTG
TGGGTTTTAGTTTAAGAGTAATTATGTGGGAGTTTATTTTATTTATATGCAATTTGAGCT
CAAATTAACTTCTTAGTTGCATATGTGTAGGTGTAGTTTACTTAGTGCCTTCCCGTCTCC
GTCCTAACCACCGTTGATCGCCCGCACCGTCTTGTCGTCAGCACCACCTTGTTGACCCTC
TTGTTCTTATCTTTTTTATTTAAAAAAAATCTTCTCTTCTATCTATTATCTATTATATAG
TTAAAATGATAGAAAACTTAAAACGATAGAAAACGAGCTATGATGGTTTGACACTCGAAA
AATAAGGTGTATCAACGGTTAGGATTAGGCAATGACACGTTATATAATATTGCACGTTCA
TGTTAGGCAAGGACACGTATTTCACGTAAAGATTTGCATTAGGAAAGGACACGTTAGATT
ACAAAGTGTATCGTTACAAATAAGTTGACAGGTCATGTGTCACGTCCGAGGTATATAGAT
TATGCAAAATGTTACCGATTAGGTCTCTCACGTAGGGAAACACTATGGCGACGGTGAGGC
GATCGCAAGGCGGGGGTGGTGTAGATTCCGGTGGTGTCTCGGGCAGCGACGGCGCTCCCC
AGGGCACGGACCGGTGGTGACCCACTTCGCCAACAGGGGCTGATGCAGTGACTCCAAGAT
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AGCAAGCGGGGGATCTTCTAGGTCTCCGGCTGAGTGCAAAACTCCGGATCTAGCTGCGAG
CCTGTCCGCGAGGATGGGAGGTATGGTGCTGATGGACAAAGAGGAAGAAGGCCTGATTTT
CGAGACGGCTGATCAAGCTCGAACACGGAAGGGGGGATGGGCGGTGGTAGGGAAACCCTG
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GCATAAGGAGAAGAAATTCAGAGACCTTGGCCATAATGTTTTCGAGGTGCACTTCGGAAG
TGAGGGTGACTGGAAGCATGTACTCAATAATGGGCCGTGGCAGTATGATTTCAGTGTGTT
GATCATCAAGAATTATGAAGGCGGCACGAGGCCATCGGAGATAGTTTTTGATAAGATTGA
TGTATGGTTTTAGGTGCATGATCTACCCCCAGATATGAGAACTGAAGACCTCGGTAGAGC
CCTAGGAGATTGGCTGGGGGAGGTGGTTCATGTAGACGTGGATAAGGATGGATTAGCAAA
GGGAAACCAGCTACGCGTCCGAGCGATGATATCTGTTTTTGAACCCCTTGTGAGTTGATG
TTACCTGAAGTCCTCATGTGATGACAAAGACCGCACATGGTATAACTTTAGCTATGAAAA
AATACCCCACTTATGCTTTGAATGTGGGCGCCTTGTGCATGTGGATAGGATATGTGCTCC
GCCCGTCGACTCATCACAGCAGTGGGGCGGTTGGCTCCGGACATCCGGGTTCGGCGATAG
ATGGAAGCAACAGAGGTGCGGGTGGGAGTAGCTATAGCTTGGGGAGCAGCAGGACGGGTG
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AGGGTGTGAAAGCAAGTCCCAATGTGTATAGTGGCAAGGATGGCCCAAGGTGGGATAGAG
ATCTGAGAGATGAAATAGAGCAGCATAGGGAGAAGGAGCTGCGCAACAAACTATATGAGG
ATCAACATTCAAGTGGCAACAAGGGTGACCAATGGGTGAAGAAAAGGCATGAGAATCGAG
AGAATGTGCAGGTACCACTTGATGAGAAGCAGGAGCCGCCAAGCGTGGACACTAGTTCAC
GGTTCTTCGAGCCTAAGAATAGGAGAAGGGGACACTATTTAGGAAGCCACGACCAGATGA
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GCCGAAGCAGCTGTGGGTGGCAAAGGAGGATCCAGAATGACAAATTGTTCATGATACTTT
CATTCGTGCTACAAGGCACAAGACAGCTTCAGTGGTTGAGCGTATTTCAGAGGATAAAGA
GAGATCGGTGGACCGTGAGGTCCAGGGCCGCCGGACACAATGAATCTCTTAACCTGGAAT
TTTCAAGGCTTGGGGTTGGACTCGACAGTTGGCGAACTTCGAGACCTGATACGGTCTTAC
AACCCAACGGTGGTATTTCTTTGTGAGACAAAGAAGAAGGCCAGAGCTATGGAGAAACTT
CGATGGAGTTGTGGATTTACTGGGGTGACTGCAATGGGAGGAGTGGAGGCCTTGCGCTGT
GGTGGAGGCACCATCTTCAGGTTACAGTTTGACCGTGGTGCCAATATTTCATCGATGCGG
AGGTGGTCTGTGAGGGAAACACTTGTAGGATCACTGGATTCTATGGGGAACCACGTATGG
AGCTACGGAAAAAATCCTGGGACGCTTTATGATATCTTCGAGCACAGGATGATCTGCCAT
GGATTTGTCTGGGCGACTACAACGAGATTTTGTTCCAATCTGATCAGGTTGGGGGCAACA
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ATCTTGGTTTCTCGGGTTACCAATATACATAGGATAACAAGCGCGATGGGTTGGAGAATA
TTCAGGTGCGCTGGATCGGGCCACGTGCTCGGACAATTTTCTGCACATGTTTCCGGAAAC
AACGGTTGAACATATTATGACCGAGGAGTCTGACCATCAGGCGTTGTTGGTACGGGCGCT
GGAGACGGCTCCAAGCCATACTAGACCTGGGGATCGACCCTTCCGATATGAGGAGGCATG
GACTCGACATGAAAATTATCAAGCTTTGTTCGAGGAGGCCTGGGAGGCTGCAGCGACGGG
TGAACATGGACTTGCTGCGGTATGGCAGCGGATTGGGAGCACGACAAAGTCTATGCAGCG
ATGGGCGCGTAATGTGTTTGGGTCAATTAGACGCAAGATTGCCAGGTTGAAAGCCAACCT
GACGGAAGCGAAGGAGAGAGCACTACGATCCGGATGCTCACTGGAGGTCCGGGATGCGGA
AGCTCAGCTTAAGGAAATTTATCATCAGGAGGAGTTAATGTACAAACATAGATCGTGGGT
GGATTGGTTGAAGGCGGGTGACCAGAATACCAAATATTTTCAGAATCGGGCATCTCATAG
GAAGAGGAAAAACTCCATTAAGGGACTTCGTCGTGATGATGGCTCAAAATGCACAGTGGA
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GTCGGAAGCCAATTAGCTACTTCCGAATATCGAGCTGATGATCTCTCCGGAGATGAATGC
TGAGCTCACCTCCGCTATCACGGATGAGGAGATACATGTGGCGTTCTTCCAGATGGGGCC
GACGAAGGCTCCTGGTCCTGATGGGTTACCGACCTTATTCTACCAGCGACACTGGTCGCT
GGTAGGGGGGATGCTTGTCGAGCGGTGAGGGATTTCTTAAGTGGGGTCTCTGCTCCAGAG
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AGAGTGTTAATTTGCAGAAGTCCTCAATCTTCTTTGGGAAAGGTTGTCCGGATGATGTAA
AGGAGGAGCTCAAATAGGCCCTTGGGGTTCAGTCAGAGGCCCTGTGCGAGAAGTATCTTG
GGCTGCCAACACTGGCTGGGAGATCCAAGGATGGAACCTTTAAGTACGTCACCAAGAGCT
CCAAGACAAAAGTAGGTGGATGGAAGGGCCTAGGGTTGTCCAAATCTTCTAGGGAAGTTC
TGACTAAATCTGGACTTCAGGCTGTACCGACTTTTACCATGACTTGTTTTCAGCTCACAA
AGAAAATGTGCCAGAACTTGTCTTCGATTTCCTTGAAATTCTGGTGGGGTGCAACGAATG
GTAACAAGAAGGTGCATTGGGTAGCTTGGAAAAATATGTGTGGGGCAAAGAAGGATGGTG
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GGATATTGCAAGAACCGGCCTCTTTGTGCGCAAAGGTCCTGAAAGCACGTTATTTCAAGG
AGCATTCGATCATGTGAGCAACATGTCCGTCAAATGCCTCCTACACATATCGTAGCATCC
TGTACGGGAGAGATCTGCTACGGGAAGGGGTGATATGGCGCATAGGGGATGGATCAAGGA
TCAATATCCATCACGACAATTGGATCCCGAGGAGCGGAAGTATGAAGCCATTAGGGCAAC
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GAATGTCCAATTGGTGGACACTATGTTTTCGCCAGATGATGCGAGGGATATCAAACAAAT
CGCTGTTGGTGGTACAGGAGAGGAGGATTATATCGCATGGAACTTCACTAAAAATGGGTG
CTTTATTGTCAACTCAGCTTACCACCTAAATCAGGCTACTTGGAGATCGAGGACCAGACA
GTCGGAGTCCTCCAGTTCAGTGAACAAGCATAGAGGGTTTATGGCATTGTGGGATACCTT
CGCTCCCGCGAAAGCTAAGATACACATGTGGAGGATGATAAAAACGGTTTGGCAGTAGGT
TATGAGCTACATCGACGGCGAATTAAGCCAAGAGTTTTTTGTGTTGTGTGTGGCCGTGAA
GAAACCATTCACCACCGGTTCTGGACATGCCTACATTCTATGCGATTCTGGCAGTTTTTT
CACTCGGAGAAGGGAGTTTCGATGGCGATCCCACCGTGTACGGCGAGCTCCCAGAGTGCT
CTTGCTTGCTGGCTACTGGACTGGTTCGCTGGTGCTTCTGCTGGTGATAGGGAGGCGATG
GTGCAAGCTACCTACGGGGCTATGGCTGGCTAGGAATGACGCAAGGGATGGAAAACAGAT
CGCTCACCACATGAAACCATGAACTCTGTTGCTACACTTATCAATGATTGGCATGAGGTT
CATGGGCGGCAACCTTCAGAGCCGAGGCAAAAGGAAATGCAGAGATGGATGCCGCCTGAA
GAAGGATGGACCAAAGTAAATTCTGATGGGGCGGTCTCCAACCAGGGAGAGGGGGTTCTG
GGGGTGGAGTTGTGCTACACGATCACCATGGAGCGTTCCTGGCTGCCACTTGCCATCACT
TCCCCAACATCATTGATCCGGTTTCTGCTGAGATTCTAGCATGTAGAAGGGCACTTCAAG
TGGTGGCAGAGATAAATGCTACAAGGGTGCATGTCGAGCTAGATGCGAAAGAGGTGGTGG
ACATGTTGAATCATCCTGCAAGGAATCTCTCAACGATTGGACCGTGGATTCAGGAGATAA
AAACTGCAATTGGGATGTTTGATGGCGATAAGATTTCATGGGTTCATCGTTCGGCGAATG
TTGACGCACATAAATTAGCAATGGTTGGGATAGGAGATAAACTGAGTAAGGTGTGTGGTT
GGGGTTTCCCCAGACTTTGTTCTTGATGTATTTTTGCATGAAATTCCGAGGTTCTACGGT
TAAATAAAGCGGCAATATTTCCTTTAAGAAAAAGGCCTCTCACGTTGTTCTATTCAAAAA
GAAAAATATGTCATGCTGCCAAAACAAGATACATGGACTATCAATCAAAGAAAAAAAATG
AGGTAATTAAGAAACCAAATATACCACGTACATAGGCTGTCAGTTTTTAGTAATCTTTTT
TTAAGAAATCACGCTGGCTAATAAAAGTCCCGTAGGGCAGATTGCATGCGTGGATGGCAT
TGATGACATCAGCCAATCCACAGTTTTTAGGAAAAGCAAGACTTAGGTTTGCTCAATGTA
CGTACGCAGGCAAGTCAAAATCATTATGAGTCGAAAGGAAGGGGAAACGCAATGATTGTC
CAAATGGAAACAACATGCCCACACGGACATTAAGGCCTTGTTTGGTTTCTTAAAATTTAA
AGAGGTTTGTAGGAGATTGAAAGGGATTAAATCTCCTATAAATCAAAATCTACCTTAGTC
CCCTTTAATCCACTTCAATCCCTTTGTAAAAGGGATTAACCAAACAAGCCTTAAGGCTGC
TGGCAATCAAAGACGTAATGATTTTTCTAAATTGAAGCAACAAGCCAATGCGCATGTGAC
CACTTCATGCTCGACGCAATCTCCCCGGCACGCGGGTGCAACACCGACGACGATGAGGCT
GCTAGCATGCAACGTTGTCTATGGTTTAATAGAACACGTACTTGGTTGTGCACTTAGCTA
ACACGAGGAGGAACTGTTGGTGCAGCTGATTAAATCATCGTTTATTTAGCTACTAGCTAC
TCCCTTCATTCCGAAATATAAGACATTTTAAAGATTTTATTAAAAGACTACATACGAAGT
AAGATGAGTAAATCTACACTCTAAAATATGTCTATACACATTCGTATGTAATTTATAATG
TAATTTCTTAAATATCTTATATTTAGAAACGGAGGGAGTATATGTTTATGAATGTAGAGT
AAACATGTGCATTCACGATGACAGCGGCAAAGTCGCATGTTGCGGGAAAGGAAGATGTGG
ACGCTTGGTCGCTAACACTACATCGTGGCCGCGTGATGAAAATGAGTCAATGGGCAAACA
CATAAGTTACCATACTAAAGCGGGACTTTGATTTTTCTAAATGTTGATGAAAATGAAAAT
GAGGACTTTGATTTTTCTGGTTTTTTTACTTTTTTTTACTGCCATCAGATTTACCGCTGA
GGCAGAGACACCTCACAATTACGTAGCCTATGCTGCTGCGTTGCTGCTTAATTAGTTGGT
TCGGGATTGCCACGTAACCAAACTTTCTGGAGAGGACTTGCGTTACCTCTAACTAGCAAA
AGGGTCCGTGCGTTGCAACGGGAGAGAAGCAATTAAAATCTTCAATGGTGTTGATCATAT
TATGTCTTTAAAATTTTAGGACATTCCTTGAAATGCATGAACATTTTTTGAATT