Map Locations of contig_2550910 (5051 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_2550910

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38621 1 284 bp AK377022 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_38621






Contig Sequence (5051 bp)

>contig_2550910 5051 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGGTGTGGGGAAAAGCCCCGGGAGGGGGGAACCGCCGAGAGTGGGGGGGCGCATGTGGG
TGTGCGGGGTCGCTGGAGAGCTTCCCGGCGGCGGCTGCTGCGGGCGTGGCTGACCGGGGG
TGGGGTTGGGGTTGCCGCCGGTGGCCATGACGGCGGTGGGGCGGGGAAGTCAAGATCAGA
TCTCGGTGGGAAGGCGATTTGGGAGCTAGGGTTTGGAGAGGAAGAAGCTGGAGACGAGAC
GACTGACAAGGTTTCCAGTGGGACTAATATTTGGGCCTTGTTCATGGGCTGGACTGATCT
GTGCAGGCTTTAACCTTGTTTTAAGGGTTCGTTTGGTTGGGCCTACCAAATCCAATACAT
AGCATTTTCTCAACAACAACAACAAAATAGTAGCATATCTATTAAAAAATAGTACTCCCT
CCAATCGACGTGAATAGTTGTTGCTTTAGTATACTATAAAAGAAGCGACAGTTAATTTTG
ATCAGATGGAGTAGCATGAAATGTATTTATAGCCATCAAACTTATCAAGGAGTTGTAACT
GAGTCCCTCGACTTATAACGTGTTCCATTTTGACCGCAAACATGCTAAAAGGGTATGCAT
ATGATATAGGTTATTTGCATGTTTCATATCCTTGGGCTCGCATGGGGAATGTGTTCCATC
CATCATGGCGCATCAACATTGATGATGATTTCTTTCACATGCATTAGTGTGTCCCCTCTC
GCATCTTGCATTATCCAATGGCAATAATCTCACCCCTTTCACGCCTTAGGATACTTCCAA
TGCATCGGTGGTAAGATAACGTGATAAGCACATTAAAGGACTTAGCAACTAAAGCCCCCA
ATGCATAGGTGTGTAACTTGTTGTTGTTAAACATCCTCCATTTAATGATTTAGCAACTAA
AGCCTTTCATGTATTGTTGGGTTTCTTTCATTTAAGTGTTTTGTCTAGGTTCATGCGTTT
GGCATTGTTTTTTGCTGAGGTTACCACACTCATCTCTCTCTCCTCTTAGTTAGCTTGTCA
CATCAGGTTTTTAGCCAATCTTAGCACATGTACAAGGTCGACCATTGGGAGAAGCTTTAG
AGCATAATGTTGGTTTTCTTGTGGAACTTGCATTATTAATTTGAACCTTAAAACCTCATA
TGAATAGGGAAAGACATATACTATGATGAACTCGTGTTTTTTTATGAATGCCTTTATTAT
AACTTTTAATATTGTTATTAGATGAATGGGTTAGGTTGAGTGGTGTCTTACTTGGTACTT
CCTATTTGTTCATGGATATTTCATGCCCTCGATGTTGAATCTCTAGTCTAGGCGTTTCAA
TTCTAGATTTTAGACTTGGATAACCTTGCTTAGCTTACTTTTAATTACAAAATGTTTTAT
CCTTAAATGGAAAATAGCCAAGAAGGAAACACTTCTTTCACAATGCTAAGTATTGCCTCG
CTCTACTCTTGGATTTTAACTTATTTTGTCCATCTTAGTTAGTACACATTCTTTTATAAT
ACACTTATATCAAATATGACACTACTTTCGGGTATTAAAGTTTAGAGCAACCAACCACTC
TAATGACCATAGATTTGATTTACTAAGAGTGCAAATCTCATGAAGAGAGGGACTCAAATC
TTGGTTAAGCGCAGAAAGCTCGGTGGAGTGGCAACACTATCTGATGCAAAACAATTGGTT
CAACCCGGTGATGGAGTTATGTGCAAGGCAGCACAGGCCACAACCCCGAGCCTTCAGTCA
TTTTTTGAAGAAATTATTCGAGGGGACTGAGATTGAAACAATATGGTATTTTGCCCTCTA
AAACTTGGTGTTTTATCTTTGCTCACCAATCATGATGGTCTAGCTCCCTAGTGGTTTAAC
TTCATTGTGATCTCGATTGCTCCACAAATGTCCGACATAAGTTGGCACTCAGAGACCTCT
TGAACCAACATGCTCTATTCTACCCCCTTTAGCGGACAAAGAAATATGTTCTTTAACAAT
GTCGAGTAACCTAGATAGCCATTGGAAGTTTGACACTCTAAGGGCCTATATGAGACTGCT
CTACTTCATCAAAATTAGTTCCGCTCCACCATATTCACTTTGGAGCAGTTTCATGTAGAA
GTTGTAACTCTTTCAAAGAAAATGTTTGGCTTTCATCTAGCCCCAACCTCAGAAATGAGA
ATTTTGGTGAAAATGATATATCTTATTGGATGAGTGGGCACAAACGAAGGGGTATCCACT
TACTACTGGGAGTGGTGGGTAATTTCCTTCCAACTCCAACTTCTATATATTTTGGAGCAC
CTCCTAAAGAGTTCACATAAAACTTGAAGTTGTACCCTAGATTCCTTTTTTAGGAGCGAC
ATCTCATGGAGCTAATCTGTTTGGCTTGTATTCTCAAGAGCACAACAGAGTTTCTAGGAG
CGGGGTAGTCACAAACAGGCCCTAATTTGAGAAGTGGAAGCTTGATTCAAAAGAACCAGT
CGAATGCTCATTTATATTTGGTTATAATAGTTTATTGTTTAGATTTTAAAATACCTTGAT
TAGACCATTAATCACTATTCATGTAATCCAGTGATGTTTATTATGAAACTTTGTTGTTAT
AGACTTTGTTGGACCTCCAAGTGTAGAGTTTTGTAGGACAACAACAAATTTCACTCGAGT
GACCTAAGGTTTATAGAATGAAGGTGGTTCTCTCTCAAACAATCCTGCAATCAAATACAA
GTAGACTCTTTCTTTCTCCAACACATCTAATACAATTGTCGGTTGTGTATGTGCACAAGT
TAGCGAAGAGATGATGATATATGTGTAATGTGGATGGTAAAAATAGCCTTCTGTCATTCT
GAAATCTGAAGAAATAAAAACAGTAAGATAACAAAAGTGAGTAAAAACGGTGTCTCAATG
CTTGTAAACAAGGCACACGGTTCATACTTTTGCTATGCCAACTCTCAACATTATCAACAT
AACTGAGCCATATGATAATCCCTTAAAGTGCAGCTAATAATCACTCCAAGGTTTCTATTT
CTATCGGATAAAGTAGGATGAAATGACGTATTGTCTTTCCATTCTTGCTTTGCTGAACCA
CCCACAAAGTGTCACGAATAGTCCTAGAAATCGTACTATGAAAACACATATGATAATAAC
CGTTCAACCTTTCTGCTAAGAGTACCCCAATGTCATCATTGATATCCGCAAGTTACACTA
CAAAATTTGCTCTAGTTTGTGACACTTCACTTGTGTCATGTATAACCATCTTTGTCATGG
AAAATACCCAGACGACGCTTTTCTGGATGTAACCCCCGCCATCATCGAAGCGACGCCATA
AAATATAAAATCTTGACGGTACCACTTCCTCCATCATACATGATCATTTCTTAGGTGACA
AATCAAAAAACATCATTGAAACTATCTTCTACGACAGCCATCCAGAACTGTCACCGTATA
CTAACACGTGTCACATATCATATTTTTCGGTGATGATACATCCAATACTAACAACTGACC
AACCATGTTTCACCAGTCAACGTTTCTAACATGTGGGGCCCATAATTTGCTTATGTGGCA
CATATATTTGGGCGTTGTCGAGGTTTTATCATCGACGATGCCCATTAGTAATAAGTCGAG
CGTTAGTTTTGACCAGCCAACATTGTTGACATATCGGCCCATAAATTGCTGATGTGGCTG
TTTACATGTCGGTCCATACACTAGTGATGGTATCGATAACTGTCCTGGTTTGTAGACTCC
GATAATTTGTTTGATATTTAAATTTGCAGCTAGATTAGAATAAACTTATTATTTGCTCCC
AAATATTTGATTCATGATTGGCGACATTAAAATAAAGCATCATGGGAGAAGTATGGCACA
ATAAAATATGACACTTGATAGCTTCACCTGCATCCTGGTCTCTCAATTTGCCTTGATGAC
AACTTTAGTTCTTCCTGCAGGTCTAATAGGGCATTACAACTTCATTATTGTAGTCTACCA
AAGCCATTTAGAAACCTTCAAATTCATCCTTGAGCACTTATTGGGCCTTATTAACATATT
CAAGTTCTTTGCTCCTGCTCTACGAGGGTCGTCTTGATAGCTTCAAGTTCTTCCTTCTCC
TTTGCTAGGGCCTTCTTGACAACTTCAAGGACTCCCTTTTCTCAAGTGGTTCCTCCTCGC
AATATTCAAGCTCTTCTTTCTGCTCACTCAGGGCCTTGTTAACAACTTCAAGGTCTTCCT
GCTGCTCTGGCAGGGCCTCCTTGCGAGTTTCAGGCTCTTTATGCTCCTCGGCCACGACCT
CCATGCCAGTTCCTGCCTCCTCATGCACCTCTGTTAGGGCCTCCTTGACAGGTTTAGCCT
CTTCATCGTAATATGTTACGCCCCCCTTGACAGCTTTAGTCTCTTCATGTTGATTTGATA
GGGTCTCCTTGACAACAATAGGCTCATGATCCCCTGCCAAAGCATTCTTGACTACTTCAG
GTTGTTCGTGTTGCATCTTCATAGGTCCAATTTCTTCATGCTGGCCTCCTCGACATGCAT
TCATCCCAATATATGTGAATTCCAACTATCCCTACAAAAATTATATACCTAGGTTATCGA
TGTGGTTTAATATTTAGGTATTGCAAAATTACAAAATATTAATGCATTTGCAGCAATATG
AAGTGGTAAAGGAAACAAATACAATATATGGATTTAAAAATCCTTTTGAAATAAGTGTTT
AGAGGGTAAAAAGTACACCGACTAACCGGTTCATCCCGCTTTCACTTGGACGCGCCCGAG
CTTTACGTAATAGTCATCTCTCCTTCCTTTTTTGCCTTGGAAAAATGCCCGTTAAGATGT
AATTCAACATAAAGATTATACTTTACATTTAGTAGTACCTGTTTGAATGTCAGCATGTTG
CCATCAGAGTTGTAGGGTGTACGTCCATTTTGCATCATGCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNGGCTGTTAATACACATTATGGTAGAATACTTATGCCTTTTCTCNNNNNNNNNN
NNNNNNNNACATGAAGAGGGAGAATGCGGGCAGGTGGAATTCTGGACCTGAAAAGGAGCA
AATCTGAGAGA