Map Locations of contig_2550848 (5416 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2550848

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38595 1 925 bp AK361722 Available Available None





CDS Structure of MLOC_38595






Contig Sequence (5416 bp)

>contig_2550848 5416 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGAGGCGGCGGTTCTGGGAGAGTGCGCTCGCGCGGGGGTTCTGGGGCGCGGGGGACTTCT
ACGTGGGGAGCATCACGGGGTGCGCGCGCTACGTGCCCGCCGACGCGGCCTTCGGCGCCT
ACCCGGTGCTCGTGCCGGCGCCGCTGCCCAGGAGCCAGAGCTGCGGCTCCGGCGCCGGCT
GGGACGGCGGCGAGGAGGACCTCCGGGAGCTCATCCGCGCCGCGTCGCAGAGGCGCGACG
GCGAGCAGCAGCGGCAGGCCGCCCATCTCCATGCCGTGCCCAGGAGCCAGAGCGTGGCGG
GGGCGGCGTCCATGGCGCGGATCGATGAGGACGCGCCGTGCGAGTTCGCCTCCGGCGCCG
CGCTCTACTCCCGCAGCCAGAGCTACGCCGGCGGCGCCTTGGGGGCCAGGAAGTCTCTCT
GCCACAGCAAGGTGGCGGTCCTGGGCTGAGCTAGCTGCCATGCCACTGCCGTGCCGGCTG
CTCCTCGGCTCCTCTCGTGTGTGATCGTTTCATGCTTGTCAAAATTGTTCATGCTGCTCG
GATCCAACTAAAATTGGGACTCTGAGCTTGTAAATACGATACAGGGAGGAATTCATGCAC
GTGTAATTTTGCTTGTTTGGTTTTAGTCTTGATCATGACTAAAAAATCGTGAGCTCCACG
GTCCTTCTCTACTATCTTGCTTGCATTGAAATGTCGGAATGATCATGCTTGTACAGTATA
CAGTAGATAATTTCCAGCTTGTATCACCCACCGCTCGGTCACGGGTCACATTAGAGATTG
AGTCCTACGGTGGGCGCCGCCACGAGGGCTGTGCCGTTTTGTAGCGGGCGCACAATGAAT
GGTGACATGATTTTCCAGTACGTGGACCATGTCACATGTGCAAACATCAGTTGTCTTGAC
ATTCGTACTGCCAGCCCGAGGGCATTCGATATTCCAGTCCAGTTTACTCACCAGCATTTG
CATTAGTTTACAACGCAGCTAGCCTGCTACCACTAAATTTCGTAAGTCGATTTTTTTAGC
TTAGATCAAGTCCACAACAAACGTTTCAAACCTGACTATTTTTCTCGCCTTTTACTCCGT
ACCATATGATAGCAAACAACACCCCAAGCAGAATTTGATACTCATAATTGTGAGGGAGCT
ACTAGATCACCGTGGCGATTGGGGCTTATACAAAGTTCCAGTCCTTCTTTCTTAGAAGGG
ACATTTGTGAGATTAGGAAGATCATGTCTTCACCTCGGCCCGGGAGGGTTTTATTGCTTG
GGCTCTGGAAAAGATCGGGATCTTAGCCTGAGATGAGACTTGATAAAACTTTAAATTTGC
TGCAAGGCAGCTATCAAAAGTCCGTTGTAGTTATTTTGGGGGTGTTTGTTTTCAGGGATT
TTTTGGTGTAGGGCTAAAAGGGTGAAACAAACACGAGAGACTTTTATGGACTAAAAGGGG
TATTTGGGACTAAAGAAAGAAGTCTCTATGGAAGGGTCTTTTTGTAATTTTTTTGACATT
TTTCAACAGTACCCCTACTTTTAGCATGTCATTNNNNNNNNTCTAGTATATTACTAGGGG
TAACATGTTTTTTTTACATGTCATTTAATGACCTCTAGTCCATGTTTAGTCCATGAAAAC
AAACGGATAGGGACTAGGGACTTTTTAGTTGAGACTAAAAAAAAGTTTTGGAACTTCTGA
AACAAGCAGGGCCTTTGGTTGTAGTTGAGAGTTGTGAAACGTTGATGTTTGTCTAGGCTT
TTTGATTAAAGTTGGGGCAAGAGAAAACCCTTTTATAGAGCGGGACCTTCACTGTTGGAA
GAGCATATAATGTCGCATGCGATGTAAAAATAATAATATAATCTTGCTGGAAGGAAGTTT
ATAATTCACATATTATTTTGCTATCTGTCGAGGAGGAGGGTACGTGGCTCTAGTTATTGC
GTAATAAGTACATATAAACGAAGACCCTTGCGCATGTCACGGTGCAACCAAATGATTTTT
TATTTTTTTTGGAAATGGCTAATGCGAACGAAAATAGCTTTCTACAATAGGCAGGGCCGT
CTCTAGAAATTTAGGGCCCCGGTGCGAAATGCAGAGAGAGCCCTAAAATCTGAAGAAAAA
ATATCTATAAACTAAAGCTTATTCTCATACCCCAGAAAAAAACATACTCACTTAATTTAT
ATAATTTGTAATACCTGTTATTTCATACGCTATTTCGAAAATGTATCAATACTACTAATT
GTCTTCCAAATAATTTAACCATTGAGCAATGAACATATAGCAATTTGTTCATTAGTTGAA
AAACTGATGCACATGTTCAGTATACTCATTAGTCACTAAATTGTTGAAGAAGTAAAAAGA
AAAATCTGCTCTGGCCTGGATGTACCTGATGTGGACAGGGACTAGACGGTAATGCCTAAA
TTAAATCTCCCAATTGATCAAACCTTAGCCTTGGCACTCAACCAGCAGATGTCTTCCGTT
TTGCTTGGTGGCATGGGCCCCCGCTAGGTAAACGATGATTTCTCATCTGCGTTAGCCTTG
CGCTGTCTTCTGCTTTCCTTGATGCTGTTGGCTGGCCCCTGCCCTACTGCTACTTGTGTT
CGTGCCGCCGGCAAGCAGATCCGATCAAATCAGGAAGACTCGGAAGATTGGTAGCGAAGC
TACGACCTAAAAAAATATCGGAAGCAGGTCCTGATCGAAAGAGACCTCAAGGAAAACCTT
GAGCGATCAGACCAGGCCAGATGGCCCAGTCAATGAGAACAATGAAAAATACTCTACTAA
GGAATATAACAAGGCCCAAAACTGGGGCCCCTTGAATTTGGGGGCCCTGTGCGGCCGAAC
AGCTCGCACACGCCCCTGGACGGCCCTGACAATAGGACAAAAATTATCGTGGAGGATGGT
AACACGACTATATTTTGAAAAGATACATAGCAAGGGGAAACACAACTAGCCATGCAATAT
CCAAAAGTATATACTATATTGTACAACGTAAGGACGATTCTGTAAGTACAATATTAGGAT
CAATGCCATTAACCATTGAGTTCGAAGGTCCTTGACAGAGGACAGATGGATAGATAGTTA
CATCTTGTGCGTAGGTTGACGATAGTCAACCTTTCTAATGAGCCAGATAAATTCACTGGA
AACTCTTGGTGTCAGGAGTCTTCTCGATGAAGTCTATGTATCTAGATTTGATTGGCACTG
GTCAAATCCCGAAATAATTTCATATTCGAAAGATTAAGGTGCCTTTAAAGATAAAATATT
TATGTGGTTCATGCATAAGGAAGTCATTTTAACTAAGGACAACTTGGCAAAGCGCATATG
TGAAGATAGTAAACGATGTTGTTTATGCGATCGACATGAAACTATCAAGCATCTTTATTC
TCGAATGCCCATTAGCCAAGCTTTTATGACGTACGAAACATGTGGCCTTCAATGTCGGTC
CTCTAATAGTACTGCCATGTTATTTGGGACATGGCTAGATGGAGTAGAGGCTAAGATAGC
ACCGAAGGTACTCCATCTCCTGCCGATCCAGCGTACCTGAGTGCAGGCGAGTCTTCTCCT
CCAGGCCGAGTCGGGTGTGTGCATTAATTTGGGTTATATGAAATTGCTGGAATGATATGA
TTTTTTAACAAACAAACAATTGCAAAAAAATGCAAGTTATTTATCGAGCAACTGGGTGGA
TCCGTATGTGGTCGTCACTCCGTCATGCAAAAGCCAAGGAACATATGGCTTTTGGGTGCA
ACCGTTGGGAGATAGTAGCACCAGATACTTACAGCCGATTTGGATGAGGGTCCAATAATA
GAATAGGTGCTTAGTAATCTTGCCCTATTTTTGCCGGTTGTGGCACTTTACTTATTTCGT
TCCATCTCCTTTTGTGAGCTTGCATAATATTATGAACTTAGTGTTTACTTTTATAATAAT
ATGGCTACATGCATCATGCTAATGCAGAGGCTGAGGGGAATCCTCCTTTAAAAAAACACT
TCGCATAATGAACACCCCTGATGGCCAATGTGATGGTTGGTGTGCTCTCTGGTCAAGCCA
GTCTTCTTCAAAGATAGGGCTTGTTTGGATTTTGCCCATGCCCGCCTTGCCAACTATAGG
CATGCCAATATTTTGATGAATGATTTGACCGCCAGCGTTTAGCGCATAAACTGAAGAGGG
GACCAAAAAATTGGCGTGGCGTTAGAAATCTAGCCTCAATCCAAAGAATAGCACCTGCTA
CGAGTCAACGCCAAAATATTGGCAATGCAAATCATGGCTAATATCCAAACAACTTCATAC
TATCCTTCTCTTAGGGTTTGGGATGAACTCTCCGCAACTTGGAGTAAGAGCATGATTAAT
AATGCAACCAACAAATAGCTATGAGGAGTTGTCATGTCATCTAGAGCAAATCTAAGGCTG
GTCGTAGTGGGAGCATCATGCATATGATATTAGTATACGATACTACCTCTCTAAAGCATA
GTATCATATATATGTTAGTATCATATAGTACTTATTTATTGCCATGCATGACGCATAGTA
GCATAACATTTATTATGCTATGGTATCATGATATGATACTTAACTTCCTCTTTCTTCATT
TCATTGTGTGAACTTCATTAAAATTGCCTAGTTGACATGCATGTAGTAGCTATGATACTC
CTATTATGATTACACTAATAGAGGACATGTCCAACAATTTTTTTAAACGAGTAGTACCTA
AATAATTGGCCGATCTAACAATTACACAAAGTATCTTTGGGCTCGTGCTACAGCTAGGAC
TACCTTCGTCCTAGTTTAGGTCCCGTTAGTAACATGCACGTGTATGATTTTACAAGGCCC
TGCAAGGAATGCCCTTTTACTTTCTCTTTGAATTAATATCACATGTAGAATTAATGTGTG
GGAAGTTAGAGCATGGTTAACAATATAGCTAGCCACGGACTTCACTATACGGGATACCCA
TCGGTACTTGAAGGGTATAGTGATGCGAACTGGATCTCTGATGCTGATGAGATGAAGGTC
ACTACTGGGTATATGTTTACTCTTGGAGGTGGTGTTGTTTCCTGGAAGTCTTGCAAGCAA
ACGATATTAACAAGATTGACAATGGAAGCGGAATTAAAAGTATTAAACACATCTCGTGTC
GAAGCAAAATTTCTTCGAGATCTTTTGATGGACTTGCGTGTGGTTGAGAAACCAGTTCCG
GCTATCCTTATGAACTGNNNNNNNNNNNNNNTTCTTGTCAAAGTGAAGAGTTCAAAGCAC
ATCATGAAGTCCAACAAACATATAAGAATGAGATTAAAGTCTGTCACACGTTTAAGAAAC
TCTGGAAGGATAGCATTGGATTACATCCAGATGGTTAAGAATCTGGCAGATCCCTTTACT
AAAGGGCTATCACGTGTTGTGATATATAGTTCATCGAGGGAGATGGGTATGAGACCCACA
TGAGTTGCCATGGTAG