Map Locations of contig_2550732 (5764 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2550732

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38557 8 3202 bp MLOC_38557.8 Available Available LOC_Os10g36250.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13110.m03276 protein tetratricopeptide repeat, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_38557






Contig Sequence (5764 bp)

>contig_2550732 5764 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGGGCGTGGGACTCGCGGCGGCGGGTGGCCTCGCGCTGGAGCTGGTCCTGGCGGGCGGC
CTCGGCTTCGTCGACGCGGACCTTCTCCTGGTTGTCGAACCTGTAGACGTTCCACCGCTT
CTGCGGCAGGATGTTGAGACCACCGTGCCCGCCCATCTCCGCCTACCGGAGCAGGTTCCT
CGCCGACGACCGAGGCTGTTGGATCGGTCGGGTGCTCCGGCGACTGGGAGATTGGGGATT
GCAGCTTCGTTCCCCACGGGTTCCTTTATTATTATTTTTTTTGGGCTCACGGGTTGCGGT
TTTGCTTTGCGGTGCGCTCGCGCCGGATATTCCTCAGTACATTGGGCCGCATTTGCTGCC
AGATTCGAGATTCTTAGCCCAACAGCCCAACTGACCGTCCAGGGGTTCAAGGCTGTGACG
TCAGCCGCTCACTTCCGCCCCCCGCTTTTTTGTTTCCATGGAGCGGCTGAAATCGGCGGT
GCCGGCCGATATCCGGCGAGCCGTCGGCGAGGGCACGACCGGCGACCTCCCTACCACAAC
CTCTCTCCTTCTCGGATTCCTCGACGGCCTTCCTCTATTCCACCAGGTAACCACCCAGCC
CGCCGCTAGCCGCTTCACTGCTATTCTGTGCTCCTGGCCGGGGCACTAGCCACCAGCGTA
GCTAGGTCGCTGATATCGGTGATTGTTTCGTGCCGTATCTCAGGTCATCGGCGAGCTGAC
CGACCCGGGGCTTGCGCTGTGCCGCAAGGACAAGGGGAGGGCGGCGGAGCTCAAGGGCCG
GGGCAATGCCTGCTTCTCCAGGAGGGAGTTCGACCAAGCGCTTGGGTTCTATTCGCAGGT
AATTCTAGACCGTAAACTTTTCGGCTCATGATTTAATCCTTGCATCTGCTCTGGAAAAAA
AAGAGAGTTTTGTTCCAAACCATGTGCAGAAGTAATTCGGTCGTTCAGCAGTGAAGTCTC
TGGGCTTGTTCACTTGTTTGGTTGTTAAAATGGTCTCAACTTGATTTAGAATAATCGAAG
CCGTTTCCTTTTAGTGACGTTTTTTAATTGCTGATAATAGGCTTTCTTTTTTTCCTTCGT
ACTTCTGCAGGCGCTGCGTTACGTCCCGATCAGTTCTGATGGCACTGATGATATCTTGGT
ACCTGCATTATATGTCAACCGTGCCTCCACCATGCATGTGAGTTTTTGAGATATCTGTTT
GAAGAATCTGGACAGTTTTGGTGCCGTTTTCTAATACTATAACTTTTTTTTCCCTTCAAA
AATAGCGAGCATCTTCGGAGACAGCTACTAAACTTGTTCCTTGCTATATTTAAGTTACAA
AAATTGCAAAAAAAATTGATTTATTTTGTCCTGTTTCCTGAGGTGTCCTTGCGTATTCTA
ATGGATTTTCTGAATTTTTCAGAAATTGGGCCTCCTGGAAGAGTGTCTGCGGGATTGCGA
CAGGGCCATCTCTATTTCACCTACTTATGCCAAGGTAGTAGGAGTTTGACAGTTTTAACC
ATGCATCTTATGTACTCCCTCTGTACCACAATACTTGTTGTTGGGGGAACTTGTACTGGT
TTTCCCCAACGACAAGTATTTAGGTACAGATGGAGTACTTTGTTTTTAATTATTTGTTGA
GGATTCAAGCTGCAGCATGGAAGCAAAATCACTGTTTTAGTTTCACCTGTTTCTGTGTTT
CAGGCATGGTACAGGAGGGGAATGGTAAATGCATCGTTGAAGAATTATTCATCTGCCAGG
CATGATCTAGAGGTTGCATTGAGCATGGAAGTGACTTCTTCTGGGAAGAGCAACATAGAA
CAAGAGTTGAAGTTGATATTGTTAAAGCCTCAATGTGTGAACGAAGTTGGGAGATCAAGC
AGTGATTGCAAGGATGCAGGATTGCCGCATACAGGTTGGAACTTTTGGTACGCATACAAC
TTTTTTCGGATTTGTACTTAATACGAATTGACAGATAATATTTGGCTAACTGGCAGCAGA
ACCACATAAGGTTGTCCTAGAGTGTATCGCAACACCTAACAAAGGTAGAGGAATGACATC
TCCAAATGACATTTCACCGGCCTCCTTGATTCATGTCGAGGATCCTCTTGCTGCGGTATG
ATATAGGCTTATCTCTTCAACTGTATACACCAAATGTTGTGTCTCAACCTTCCTGTTGTC
CTATTTATTCCTGGAGGCCATATCAAGTTGCCAAATTCTTTTGCATAGTTCACATATGAA
TTGATTAAGTTATGTGTTTATTTGAGGTACATACAAAACAAGATTGTTTTATGGAGCCAG
GCATTTAACTAAACTCTATGTGCTTTGTGTGCAATAAATGATTATTGGTTGTATATGTTT
TTCGCAAAATTTTCAATAATGTTAAACTGAAGTTCTTTATGCCTCTTACTTGCAACAGTT
GTATGCAGATTATCCTGAAATCTTGCCGGGAGACTTACTGCCATTATTGCTTTAGTGAAG
CACCTGCAGATGTTGTGTTCTGCCCCTTGTGTACAATACCAGTTTATTGTTCAAGAAAGT
GCCAAGAGGAAGCTGTAGGCGGAGTCTCTTGGAATCAAGACACTTATCTTGAATCTAACA
GTAATGCAGTTGATCTTGGAACACTGAGCCTAACTTCTACAGGGTGCAAGGCTGCAAACT
CTAAACAGATTGCTGAACATAGGCACGAATGTGGAGGTGCCCATTGGGCAGCTGTTTTGC
CAGCTGATATAGTTTTAGCTGGGCGACTAATGGCACAATACATAGACAACAGAATGCTGA
CTGGAAAGAGCTCCGCCATCTCTGGTCCAAATTTGGTAAAAAAATTATATTTTCATACGA
GCTTACCATTTTCTGGTGCTGTTAGCCTTAGATAGTATACCATAAGTATCTCTCGAAAAC
AAGATGTATAGCACAAGTATTCTAAGTACTATCAGGTTGGGACTAATGAGCTAAAATGGC
TATTGCAGGATCTCATTCAGCACTATGATGTGGATTCTCCTACTAGTAAGTTGGAATCAC
ATATATATGCGATTGTCTTGTTGTTATGCCTCCAAAAGTATTATAGATCAGATCTTTCGT
GGAAAGAGGAAACTTTATCTCAGGTATATATGACTTACTTTTTGAGTTTCCCCTTATGTA
CATGGGTATTGCTTTGATATGTCAGCAGGGGTTAATAAGCATTCTTTGATCTTATACAGC
TAGTTCTTTTGATATGTCAAGTTAAAGTCAATTCAATTGCTATTGTTTGTATGAAATCCA
TGGATGGAGGCCAGGGACTGACAGAGAATAAAGGGTATTCTGCAGCTGATGATGGAGTTA
TGTGTAGTGTGGAGCAGGTTTGTCTTCTACTCCCTTTTCTTTTCTGGGATCAATACACCA
TCCAATAAAAATTGAGGAATATCTATTGCCTACTATTCAGTATGATGTGTCTTATTATTG
AGTTATCCTCCGACCTTTAGATATTAGTACACTTCTTAAGCACGTGGTTATCCTGAAAGT
AAAAAAAGCTTGATAAAATTCAGGAAAAAAATTGATAAGATGTTTAAATTCATAACCTTG
AGAAAATGTGTGGAGTGTTGAAGTTATAGCTTGTTATGTCAAGTAGGTACCTCTAAATCA
CACTACATGACATTGTTGGGTTGGTATAGAAAGCATGGCGTTGTCTACCTTGCTTTATGT
GGCTTCTGCACCTGATGCTCATTTTAGTCTCTTTACCATCTGTAACCTGTGTTTGTTTTG
CTTACTGCTAGGTCAAGGTTGCTCAAGCTATTTACATGTCTGGTAGCCTCTTTAATCACT
CGTGCCGGCCAAACGTACATACGTATTTTCATTCGCGCACTCTCTTTCTAAGATCTACCG
CATTTATAAAATCAGGGAGCCCAATCGAGCTATCATATGGTCCACAGGTCTCTCTCATCC
TTCCTCTCTTGTATGTGTATGTGTGACATACTTAAAAGTAACTATGAATTTATGCTTTGC
ACTGTTTGTGCTTCTCATTTCTAGGCTGGTGAGATGAATCTTGTGAAGAGACAACAGTCA
CTTCAGGAGAATTACAAGTTTACTTGCCAGTGTTCAAGTTGTTCAGAGCTACATCTATCG
GACCTTGTCGTTGATTCATTCTGTTGTCCACAAAGTAACTGTCTTGGTGCCGTATCAGAA
TCAACTTGCTACAAATCCGAAGAGAATTGTGTGCATGTTTCCGTAGATGAATCTGATGTC
TGCAAACTATCATTGCCTGTAAGATGATTTTTCCCTCGAGAAATATTCTAATAGCTAGTT
TGGTGGCATCAACCTGAAATTCTTTTTGTTCAGCATGTTTCGAAGGTTGATGAAGATATA
GAGAAGATTGGCAAATTGTTTTTCAGAAATAATGTTGATTTGAAGATAAATCCTGGATAT
TGCATGAGCTGTAGATCACAAATTAACCTGTCTTCTGCTGTTGCTACATCAGAGAAGGCA
GCGTCAAAGATCAATAGGTATGTTACACACTATTGCATGTGGCATATCTGAATTTGGCTG
CATCTTTCATCAGTGAAATTTTGTTCATAGCAAAGTTTGATAACAATTCAATTCACAGGT
TTAAGGAACTTGCAGTTATAAACAAAATCTCTGAAATTCCCATCACATCTGCATTACAAT
CCCTACAACAGATAAAGAAGTTGAGGCACCCATATAGCAAGGCTCTTGCCCAGGTTAGTG
CGCTCATGTTACTCGCCTTGATAGAAGTTTGGCTCCAAATTCTCCTGGCACTCATTGTTG
AAAAATATGCTTCGAAATTGATACATGCAGGCAGAAGATGCGATTGCAGAAGGCTTTGCA
AAGATAGGAGATCAAGAACAAGCAAGAAAGCACTGCGAAGCATCAATTAAGGTAGTCACC
TCAATTATCGCTCAAATCTCTAACTCGTTTACTGAGAAATACAAGGGGAGAAATGTACTT
TGATTTTGAGCCCTCGTATTCTCGGGATGCATAGTGCTCCCTTCTTCGACAAGCAGCAGT
CAAATTATCAGCTAGGCTTTACAAAGATAGGAGATGATGATATTATTACAATTTTGGACT
TCATCACTTAACTTGTCATGAGAGGAAGCCTCTGGAAAATTGTTTGATCCCTAGATCAAC
GGCTAAATTCATGCTAAGAAGTGTTTGTCGATTACAGCTTCATAAAATCTACTTTTGAAA
TTTCCATTTTGTCTCAAGTGCTCTTGTGATAATGCAGATCCTTGAGAAGCTGTACCACCC
CAAACACATAACCATTGCGCATGAGTTGATCAAGCTTGTTTCCATCGAGCTGTCTCTGGG
GGACAGGGCAAGCGCAGCAGCTACATTCGCCCAGGCAGAGGTGATATTCTCACTTTATTA
TGGACCTGATGTTGAGAGGATTTTACCTTATGTTGATGCCCTTAAAAGAACTGTTATTGG
AGGGTTCATCGGTGTACTGTGACAATCACGGGAGCAGACGATCCTCACAGATATGTGCAC
CTCTTCGTTGAGAATGGATGAGCTGATGCTTATCAGTCAGTATACAATATTACTTGGTGC
AGTCTGGTTATTTGGATGAAGATACAAAGCTAGGACAGGCAGATTAGTCGACCCGTTGTG
TCACAATCCTGTCACTGCAATGTACAATTACAAGCTTTCTGAATCTCTGATATGATTTCC
CGTGATTTACAGTTCATGGATTTTACCGTGTACTTGTATGAAGAGCAATTTTAACATAGT
CTGGTAGAGGCTAGGGTTCTACCAGGTCTCGGACGTAGGTTGTAGGGGTGGAAGTGCGGG
CTGC