Map Locations of contig_2550660 (9560 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_2550660

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38530 1 1661 bp MLOC_38530.1 Available Available LOC_Os04g44240.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13104.m04407 protein cytokinin-O-glucosyltransferase 3, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_38530






Contig Sequence (9560 bp)

>contig_2550660 9560 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGGCTAGGGTTACGGGAGGAGGAGGAGGCGGCTAGTGTGACATATTAGACATCCACTCA
TATATCATGTGTGCCATAACTAGGAGGCAGCTCACACAGTCATGTGTGGGCGAAACATTC
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GCTAGGCGCGCCGCGGAGTCGTGCTCCAGTTCTTCGAAGCTGTTCACCACGATGCCGTCG
ACGGCCAACTCGAACTCGCGGAGCTCTTGCAGACTCTCCTCCCCGATCGAGCAGGACGGC
AGGAACTGCAGCGGCAGCTGCCTCCTCGCGAACTTGCACTCCAAGGGCGGCAGGACCGGG
AGGTCGAAGAGCTCTTCCGGCGACGCGACCGCCTCGTGCGGCTTGTGCGTGTGCAGGTAC
TCGCAGCACAGCAACGCGAACGCGGAGAAGCCTTGGAAGATATAGCAGGGCACGCCGAGC
TCGCGCGCGATGCCGCTCGCCCACGTGTTGCACATTCCGGCGATGATGCAGCTCGGACGC
CCCGGCGACGCCATGAGTCGGCAGTGCCGTGCCACCGCGTCGCCGAATCGCGTGGTGGCG
TCGAAGAAGCTGGGCACCATGTCGGGCGAAGGGACGTGGTCTAGCCTCTCGCACCCCTCC
GGCAGCCCGGCCTCGGCGGACGGGTACGGGATCACGGCGACCGTGATCCCGACAGATCCG
CCGTGGGCGCCGGCACGGTCCACGCGGCTCTGGACGAGCTGCGCGCTGGCCGGCGTCGTG
AGGATGGTGACCGCGGCGCCGTGCAGGGCGAGGAGGCAGCCGATGTCGACGATGGGGATG
ATGTGGCTAGTGGTTGGCCATGGGATGACAACGAAGTGGGGCTTTGGGGACATGGTCGCC
TCCATTTCCGATGCTTACAAGGATGCGCTTCGCCTAGCTCGTGTTGGTTAAGCCGCGTGA
TTGTGCCGGCCTGCTGCGGCCGTGCACCTCGTGCCTGCCCTGTATATATAGCCAGCTGCT
GACGATTTGCTACTGGTAAACTGTAATCATCGGAATAGTCCAGTATACTCCAGCCATTAA
TTAGAAGATCTTCAGATCAACCAAGTGTATACTGGTAGGGATCAACATTGTTGCAAGACA
AGCATATTACATGTGATGATTTATACTCCCTCCGTTTCTAAATATAAGTCTTTCTAGAGA
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TGCACTGGTTTGAAGAGATACGATCTTGTCATAAAATAGCCAAATCAATGTCTGCGATCA
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TGCCAAAAATTATACTGTATTGTAGTTGGGACCAACCATTTTCCTGGCGCAGCAAACGTG
TTTAGGGCCGGAAATGACTGGGATTACTATGTATGACATGTCAACCTCAGGAATTTGAAT
TTAGAGTTCGATTCCGATAAGTCATACAAGGCGGTTAAAGTTTTTTTCAGTGTACATTGA
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ATATGAGGGGTCCAGCTGAATCAATTTTTTATGACCGATCAATGACCAAACGGGTTGTCC
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AAAGATCGTGTTTATGGTTCAACATTGGATCCCATTTCTTAGTTTCATGCATGATAACAC
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GAGAAAGAAAGAATAAAAGAGCCACCGGAAGATCGAAAAAGAGCGAGGCTTTGAACAGTA
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TCTCACTGCTTTTGGCAAAAAAAAAAATGCTTCAAGTTCCTATTTCTGGAAACATTTTGG
AGCACCGATTTTCCACCAGAACTACGTGAATGTCATTCCGTCATGTAACTTAAGCATGTA
GACGAAACTGGTTGTCACAAATAATCATATTTTTAAACCTTCTATATTATTATTATTTTT
CCTTTTTACTGTTCATCCTGAGTGCATATCCGCCTTTTTTTAGTAAGCATGCGCATCCTG
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TGTTTGATTGAAGACTAATTTTATCAGATCAAAATGTGGCAAGTCATCAAAGTATAGCAA
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GATCCACAACAATTAAATGCGTATCACAAAATGCGTATCACAATATGCCAATCTGGTACG
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GTCTGTTTATCTTGATTCATGTAAAGACACCGTGACCTTTCATTGGACGTACTCCTTACA
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TCTTCTCATGGCTAATCATCCAAGACCGAGTGTGGACCGTCGATAGACTAGCCCGTAGGG
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TCATTTTTAAATGCCGCTACTTGGTCAGGATTTGGAACTCCATCAATGGATGGCTTGGAT
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ACGGTCTAACCAACGGCACACACAAAAAGGCTTTCAAATCTCCGATGATGCTAGTCTGTT
GGGCTATCTGGAACGAGAGGAATGCTAGGTTTTTTCAGAACAAGGCATCTTTGCCTTCCC
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TTGGGTGCATCATCCCAGGAGGTTAAGTATTTTGTATCTTTCATTTTGGCCTGTGTGGCC
ATGTAATCGCAATTCTGTGCTACCCTTTTCTTGATTAATGCATGAGGCAAATCTTTTGCC
TCCGTTTCAAAAAAAATTTAATGATTGAGGCTCACCCTGGTTGAAATCAAGGAGGAAAGA
AGAGTATTTAGTGAAGGGTAAATAAGTTTACGTAAGAACCTTACGTAGGTGTAGGATTAT
TGGTAGATCTTGGTAGGCGCTTACCGTGTGTAGTGGTGTAAGTGCGTGTGTGTGGTGTGT
GTATTTTGCACCTGACCTGGTCTATGACATGTATCCATGTAACTAGGGCTAGTGTATTTT
TTTCTAATTTAAGTGACAATATTATTTAGTTTTTTGGTCGTTAAAACACAAGGTAAGAGC
ATTGCTCGTTTGATTAATTAAGAACAAAATTGTTGCTTAATTAAGTAGTAAAAATGGAGG
AAACCAAGTGTCAAGCCCATTTCCAAATATCGAAACACAAGCAACCAAACCCACACTCGG
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CACCACATAGGACGCGGCCC