Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_2550647 (2952 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2550647

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38516 1 1010 bp AK355641 Available Available None





CDS Structure of MLOC_38516






Contig Sequence (2952 bp)

>contig_2550647 2952 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCCCCACACGTTGATTTTCAGCTACCATGAAAGCAAACTAATTTGACAATAAAATAAT
ACTCTGAATGCAATATAATCAAAAATAAATTGAGCTTGTTCAAATTATTAATATTTTGGC
AATACCCGGACGTGGCTTTATTTTAATAAGTTAAATAATTATTAAGAAGTTTGGTCCGAG
TTTTTCTCAATATGTGTAAAAAAATCAAAAAATATAATATTAATAATACCAAAATAATCA
AAATTATTAATGATTCGGGTTTTGGGATGATTTAGGTATCACGAGAGGTCCTTTCACTTG
GCGAAATAATTGGCATGGTGTCAGTGGTTACACGACGACTGATTTGATAGGGTTGTTGCA
AATGTGGCGTGGAGGACTATGTTTCCTCTTTACCAAGTTATCCTCTATAACACTATGCTC
TTTAGTTTTAAAGAGCCCAGATTCAATTGAGGTCAACAATTGGAATTGGGTCACCTGATT
TTAGACCGAGTGAACAATTTCTCTTAGCTCTGTCATTTAGTTCTATTATACTATATACCA
TGCTTCCTAATTTTTAAGACCTCACAATTAATTGAGGTCTTCAATTTAGAATTGGGTAAA
CTAATTTTTATCGGGTAAACAATTTCTCAAGGACCTCTCTCATCCAATTTTTTATTTTCA
CATGTTCTCTAAATATGAAGCTCTTTCTTTCCATTACGGTATTCAATTTAAAATTTGTTT
ACGATTTTTACTGGGCCAACAAATTTTTAAGTCAGTCAACAGCAACCGGCCTAAAAAATT
ATATCAACCTCGTGTGCCCTCCCACCACCTAGAAAAAAGAAGTGCCATCATACGATGTTG
TAACACCAATATGGTACATCCAGTCACCTATGCCGAAATTTCCCCACATAATATACGTTA
GTTAGCGAATAGCACAAATCCGCACCACGGAAGGTCCATCAAATCACCGTATTATAAATA
AAAATAAAACACACTCCATCATATCACCACCCACCAAACTAAATATTCTATCATTCCGGA
ATATAAGGGGTATTAGTTTTTTGCAAAGTCAAATTTCTTTAACTTTGAGCAAGTTTAGAG
CAAAAAATATCGAGATATACAATATTAAAAGAAAGGTATGAAAATTCATTTCATGATGAA
TCTAATCATTACGATTTGATATATCTTTGTACAAATTTGATCAAACTTAAAAAGTTTGAC
TGTTGAAAAAAGTAACACACCTTATATTTTGAAATAGAGTGAGTAATTTCTTTTAAGAAA
GCCAACAACACTAAAGGTCTAGCAAAGCGCGTTCAACCCTTCTTGTTCACCTTATATTTT
GATGCGAAATTGGTAGGTAAGCTAAAGTGAAATTGGTTCGGAAGCTACACAAGTTAAGGT
GATTGATTATCGTACGGGAATGACTTGTTTTACGTAAAGTAGAGATTACGTAGTGCATGC
AGAATGCAGTTTACTACCTGTGGCTGTGGTCGACCTGGCTGCAATATCTGTGACATGTAG
GAGGTGATGAGACGCGTGTTCTTGCCATGTGCGTAGGATCGCTTGCCGACCTCGGTGAAG
GCGATCCTCTGCACCACCTTGGTGGCACAGAGCACCCAAAAGATGCCGAACACTGCCTTG
CGGCCGACTCTCTTGAGGTTGAAGAAGACGAGGCTGCCGAGCCAGACGACGCGGCCGGCA
CGCTGGATGGTGCCGGAGTAGCCGCGCATGCGGATCTCGTCCACCTTCTTGCGGAGGAGC
TCCACCAGGAGCATCCAGAGGAGGATCAAGCCGGCCTGCAGCGAAAGGTCTGGCTCCTCG
CGGGGGCCAACCCCCGCGGCGGCCACCTTGCCGGCGTTCTTGGCCTCGGAGAAGAGGTAG
GACATGACCGGGAGGAAGAGGGAGAGCAAAGAGGAGAGGAAGACCCGGACCTTGGGGTCG
AGGATGGCGCTGACGTCAGAGAAGCGGCTGAAGAGGTTGAGGTTGAAGAAGATGCCGGCC
AGAGCGAACATGATGACGGAGGCGGCCACCATGGACGACTCATTGCTCGTGTCAGTGTAC
GAGTCCGTGATGTTGCGCACGTACGTGTCCACGCTCGCCGACGTGTAGGGGTCGCAGAAG
CGGCGCATGAGCTGGTCGCCGGTGGAGTTGGGCGCGAAGCCGATCATGGCGTTTCAATCC
TGTCTAGTACGTGCGTGGATACTTAGCATGCATATATGCATGCAGCTCAAGGTTTTGTAC
TAGTTGGCTGGCGCGACGCAAAAGCTGGTGACGTTGCATGCACGCGAGAATACGTACCTG
TGATGGGCATCGCGTGCTCGAATGGCAAGGTTTTGATTCGCTCGTTTCAAAGCTAGATCA
GCTACGTAATGTGCATGACACAATTGCCTGCCGATGCTCTAGATAACATAGCATCCCTGC
TTTCGTCTCTGGCACGATAACAATTCTCCTTTCTCTCTAAGATGGATCCAGTGATGGAGT
GATTGTCTAGATCAACAATTTGGATACTGAATGGACATTTTTCCACCCACATGTTTGAGA
TGAAATTTACACTTAAATTTTGAATTAAACTATTTCACCAGCTAGTAACTCAGGGGTACC
TTAGGTATTGGATTCATACTGTCCAGAAAACTGATAGTAACTCAGTGGAATGAAAAAGTG
CGAGGACGGGACTCAAACCAGTGAGCACTGGATGCGGAATAGGTACACTTATCAGTATAC
CATGACTTAGTATCTTGATTAAAAAAAAGATGCTATGATATTTAACTGTACTTTCAGAGT
TTACGTTCAAAATTTTCAAGAAACTTGTTATTTTTTGCTATGCATATGTGTTTATCGTTG
GGTGGTGAAAAACCCGCTTATCGATGGCAAAGGAATTAGGCCCTGTTTGGAACCATAANN
NNNNNNNNTAATCTGGATTATGAAGATAGATTATANNNNNNNNTTTATAAAAATAATCTA
GGTGGACATGTT