Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_2550417 (3494 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2550417

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38412 3 1230 bp AK373023 Available Available None





CDS Structure of MLOC_38412






Contig Sequence (3494 bp)

>contig_2550417 3494 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCACGCGGCTGGCGGCGTTGGCCGCGACCGACGGGTTACGGGACGCAGCCGACAGGGGTT
GGATGCGGCTGACGGGCGACGGGACACCGCCGACAGGGTTGGACGCGGCCGGCGTAACCG
GCGCGGCCGAATGGAGGAAGGGACAGTGGCCGCCGGACCGAAGGAAGAAGCTCTTTATTC
AGTTTTACAGTTTATTTTACAATATCTGTTTGGCCGTTGTTAAAATGGACTTTAAAATGT
TTTTTTATTTGTATTCTAATTTTACAGTTTGTATTTTTACGGGGTCTGCTAGAGATACTC
TTAGCACGTACGGTTTCCCACATTATGCTAGGTGAATATTTATTCCTTGACTCGTACCCT
TATATAAAGAGACGAGGAGCAATCATTTGTAATAGAGATCAATCATTAATAAAGATAGTT
TTCTTCCTATTTTGCCGTGGTCATCTATTTTTTGCTTGTTTGATTACTTCGTCTACGACA
TTCGTTCTCGCTCCGCCAACCTTGAATCGGACGCAGTACGAAATCGTTCTCTTTTGATAA
CGGGTAGTATATTAATGGATCAACCATGAGCAGGATACAGCTAACCTCGTTTGGTTGGAA
TAGCATTTACTGTGTGGGTTGAAGCCGTACGCAGTACGCTAATACTAGTAGCAGTACAAA
AAGAGACATTTTGATACTCCTCATCACGTATGGCTCAATGCTCGTGACATTTCAATCTAC
CGATGGACCGATGCCAATGGCATGATGTAACAACGGAACCACCTCCTGAAACAAGCCCAC
GCTCCCTTTCTTCCCTTTCCCACCAGTCAATTCTCCACCGGGGAAAACGTGAGAGGAAGA
GAAATTTTTCTAAACGTTGACAAGAAAATACTTCTCTCGATTTGGGTGTTATACGCACGT
TGCCTACCGCGAGCCAGGCTCTCCCGTTCCCCTCAGAAATTCCATGTTTCCCCATCTTCC
TCCTCCGCTGCTCCAGGAATAGAAGCGGCGAACAGAAGGGGGGTCGAAGCTATCCCAGCT
TTCCAAACCCCACTCTAGCTAGACCCGTGCTGATTGATTTCTGGCTGAAATTCTGTCCAA
GATGAGCTCCGAGTCCAGGGGGCTGCTCGGAATCGACCCCAACGAGCTCCGCTTCGCCTG
TACGTTTCTCTCCCCTGCGTTTCTTTTTTGTCCTGATGACAGTTGCTTCGATTTTGTTTG
TTATTTCGACAGTTTAGGTGGGTTTCCGCGTAAAAAAAAAAACTGCTTCCAAGTTCTTGA
CATGAGTCTTTCTTGTGGGGCTGATTTTGATGTTTCCCCTCTCTTGTTTTTCCTGACTTT
GAGGCTCTCTTTTCAGTACTTTTTTTTTTTGGGTGTTTCGATCGTATTTGTTCGCTCGCT
TCGCTAACTTTCCTCGTTCCTCTGTTTTATTCGACCGTGCAGTCGAGTTAAAGAAGCAAA
TCTCGTGTTCACTGCATCTAACAAACACAACGGACCAATACATCGCCTTCAAGGTAATCT
AATCATTCTGATTGCCGTTTATTTGTTCCCCTCAAAACCGGAGTAAATTCTACAGTTGTC
ATTTATCTAAGAAAAATCTCACAGCTCTACCAAAATACTAATTGTATTGTAGACTTGTTG
TAGTACTTACTCCTACTAAATTAGTGCACCCTTAGGTCTGTAGGTTAAGACAACGAGCCC
AAAGAAGTACTGCGTCCGGCCAAACAACGGCATTGTGCCACCGCGATCAACATTCGATGT
TCTAGGTAAGTTGATGGACCGCATCAGTCAATCACTATGCATGTTTTTTTTCTTGAAGCG
TCAGCTTTCTATGCTAAGGCCTTGTGTTGTGCTCTCTGAATTGTTGTTTTCAGTAACAAT
GCAAGCGCAGCGGGAGGCGCCACCGGATATGCAATGCAGGGACAAGTTCCTTGTGCAGAG
CGCCGTGGTGAGCCAGGACATCGCACCAAAGGATATCAGCGGAGACATGGTACTCCATGT
TATATTGGGCTGACTTCTGTGTTTCGGAGTTTGGACTACGGCAGTACTGTAGCATATATT
GTCAGTTTACCTTGAATAACCCTAGTGAGGTATTTTTTGGTAGTTCACCAAAGAATCGGG
CAACGTGGTGGACGAGGTGAAGCTGCAGGTTGTTTACGCTCCACCATCGAAACCGACATC
CATAAATGAGGGTTCTGATCAGGAAAGTCTGGGAAGTTGGAGTTATCAAGAGGTAAAATC
TTGATCTTCAGTGGTCGCTACGGCTGTAAAAACATCAGCCAAGTTTTCTTACTACTGTCA
ACTATATTCCTCTACCAGATAATAACCCACGGTCATTCTGTGTTAGCCCTGTACTGACTA
AATTGTGACCTTGCCACTGATCCCATCATCCTATGGTTGAGAGCTGTTCTTTCTTTGCAG
ACAACAAGGGAACTTTCAGAACCAGAAACAATACCTTCTGAGGTGAGTTCCCTTGAAACA
TTCAACAAGCTATGTCTAACTTTTTATTCTAAAGCGGTATAAGCTATATTAAAAAGTTCA
GTTTTTTAATCTAATATGAAAGATTCAAAAGGCTGAACTAATTCCTATTGGCCACTACTA
GAGAGGATTTTGGTGTTTATAAGAACACTAAGGTTGTTACTTTTAAGAGTTCACAATGGT
GTATACAGTTTTGGTCTTCCAATATATCTTAGCATTCTTGATGAAATCTGTGATGCAATT
ATTTTCTTCCACTGCATTTTCTCATAACTCATAACGTTTTTATTCAACATTGTATTGGCC
TATTTATGTCTTATCTTATACCATATCATTTTGCACTATCATGCAGATGTTGTCCATGCT
CAGTTATCACTCAATATATGTATTGAGAACTTTTCATTTCTGAGTTCAACCATGTTCTTT
TCGATCCTTCCAAGTTCCAACCTCACCTGCTATACGAATTTATTGATATTTGATTAAGTT
TTGTGAATCAACATCTGTGACCTTTGTATTTATTGTGGTCTTTCTTTCCTATTTAGCTAG
TCATATTTTTTCCTTATTAATTGGAATGCAATTTTCTATGTACCTTGTGTAGCTGCTTGA
ATTCGGGGGGTGGTATTATTTATGTTCGAACTGCAATTTTCTATGTACCAAGTTCTCTTT
AGCATTTCTGTAACTGCACCTTATGTACAATATATACCAGCCGAATTGCATTTCCGTATA
TACCATCCTTATGTTGCCTGGTGATGCCAAAGAATAACACATTGATCTCGTTTATGTATA
TCTTTGCAGCCCTTGGCTTTAATTTCGAAGTTGATGAAGGAGGAGAAGAATTTTGCTATT
CAAGAGAACAATAAGCTTCGAGAGGAACTGGTTAGTAGGTTCTACCTGCTTATGCAAACG
TTTTTTTCTTGTATTATTAATTGAACCTTGGATTCAATATTCAATAAGACCCGAGTTTCT
TGCTTATTCTATAAACAAAAAAGACCGAGGGGCCAGCATTAGATTCAAAGGTTTTTTTTT
TTTTTTTGGGGGGG