Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_2550223 (3480 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2550223

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_38339 2 1652 bp MLOC_38339.1 Available Available None
MLOC_38338 1 1223 bp MLOC_38338.1 Available Available LOC_Os05g45060.1, FRAME:+2, EVALUE:5e-45, 13105.m04781 protein RING-H2 finger protein ATL2M, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_38339






CDS Structure of MLOC_38338






Contig Sequence (3480 bp)

>contig_2550223 3480 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCCGCGCCGCCATGTCCCTCGCCGACGCGCTCGCCTCCATCGGCCTCGGCTACGCCAT
CGCCATCGCGCTCGGCTTCCTCGTGCTCCTCGCCGCCGTCCTCCTCGCCTTCCACTTCTG
CCGCCGCCGCCGCCAGGGCCACCACCACCACCACCACCACAACCAGGGCGCGCAGCAGCA
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CCTTAAATAGAGCTCTTGTTGTCGTTATTTGAGGTATTACCTGTGACCAATTGATGTGTC
CCACGTCAGCTTACGTCATCGGGTCGCAGGCACGTGAGCTCGGCCATGGCATCCATTGTT
GGCGCGGTGCCCTGTCGCGATATAAGCCATATACGCGTGTGTTTTGACGTTATTTATTGG
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GCTGACAACTTAAATCAAATGGATAACGAGTATTCTTTGAATATGCATTTTTTTTTGCTG
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GAACATTACATCTACTCCCTCCGTTCCTAAATACTTATAAGTCTTTCTAGAGGTTTCACT