| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
| No map location |  |
 |
Predicted Genes from contig_2549881
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_38186 |
1 |
811 bp |
AK354651 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_38186
Contig Sequence (3443 bp)
>contig_2549881 3443 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGCAAATTTTTAGCTCAAATGGATGTTCCTAGGTGGTACTTGCTTTGCAAAGTATCACA
TTGGGCAGAAATATGTATGTTGAAGCTTGGCTCAAATGAATGAATGGATTGAGCTGAAAT
TTGGTGGATGATATTCATTTGGAAATAGGAAAGCACTGTAAAAAAAGTATACCATTTGGA
CATGTCAAAGTGACACTTCCTTCACAATGTGCCAATCTGGATAGAAAATGGTAATTGAAG
CTGGGCTCACATATTTGATTGGATTGAGCTCCACTTTGGAGGAGGATGATAATTTTGGCA
CATTAAGGCACTGTAAAATTTCATAAAATTTGGATAAATGAAAATTGTACTTCCTTTACA
ATGCTCTCCACTGAAGAAAAAAAAACGTTAGAAAAAATATTGCGGGAAATTGGCTAAATT
AAATGAGCTGAAATTTGGTGGAGGGAGGTTCTATGGTCAGTTTCATGTCGTGGTAATTTT
TCATAAACTATAAAGTAATATAAAATTTAGTTGTTTCACAAGCTAAAAAAATTACAGGAA
ACGAAGATTGGACGATGAGCTTACATGGATTGTTAGATGGGGTTCAAATTTTGTGGAGAG
TTAGGGTTTGGGCATATAGAATATGTGGCAAAAATTCAACTCATTAGGNNNNNNCTAGCT
AGTACTTCCTTCACAAAACTTCTAGTTGAACACAAACTTTGAAAATTTGTTGAGAAAGAT
TTAATAGGCAAATGAAGATGAATTTTTTCATGAGATAAAAAATTGTATAGGCAAGAGTGC
CCAAAAATTTTGAGGGCAATCAAGAAAACATAAATAACACTTCCTTCACAAAGTGCTATT
CTGACCAAAAATATTGATAACTATCTAAATTCTTGTATGCTACTAGATGATACCCGCACG
TTGCGGCCAGAAGTGGTTGCAATATATTCTAATGATATTGGTTGTATGGAGCATAAATAT
GTAAATTAATAACCCGTTCATGGTTGTATTGAGGTAAACATTTTTTCCCATGCATGGATG
GTTGCATGTGCATTAAGTATGTTACTCTCTTTGTTCCTAAATATTTGTTGTTGAAGAAAA
CCAGACTAGTTCTTCCCAACAATAAATATTATGGTACAAAGAGAGTAGTTGGGTAGATCA
TGCAATTAAGAAAGAGGAAAAAAAGTAACTAATGAGGTGGCATGTGTGGTGAGGTAACAT
ATGTGCATGTTGAGATAAATAAGATAATGAGGATCAACTTCTTATGTATATATATAGGAT
ATGTGTAAATAAATCCAATGTACATAATTATTTTGAGGGTGAGAGGGATGGAAGAGATGA
CATCTGTTTTTTACAAGTCTCTGTTCACTTTTGAGGGTGTGCATGCTATGCAAGGGTGCC
TGATCATGTTCCACAGAAGGTAACAGCTTCGATGCATGAAGCTTCGACTGCGGATTAACA
CTGGGAGTGTGAACTGCCGCGTGTCTCCACCGCTTGACAAGCGAGGTTTATATAGGAAGA
ATTTACCTGTATTAATTTTAGTTCTTGTCGAGGTTTATATAGGAAGAATTTACCTGTATT
AATTTTAAGTTTTGTTCTTGTCGATCTACTGAACTGAAATCTCCCGAGCGTCACCGAACC
ATTTCTCCCGCCTGGGAATTTGTTCTTCCATCTCATGTACGATTTCAACAGACTACAATT
AGCTTGTTACCTGTGGACAACTCAGTGTTTCATGCCTTGGTCTGGGATGTTGCTTCTGTT
CGGCTCACCAGCTCATTATTAGCTTAGGCAAAAAGGACTGACGAGCGTCGATAACTTTTT
TGCTGGTATGCAATATGGTAAGATGAAAGAGCATTTTTCTGTACGAAAGTAAAACTACAA
GTTTGAAATAGGGTGCGATCAGAGTGGGGCATATAATTGCAAAATTCACTTAAAGGAACA
AACCATGTGTACCAGCAAAAGTTCAGCGGCATACTGATAGTCTCTGTTGCTCCTTCCCGA
GTGAATATGTTCAAAGATTACAGCAAACATTGCTTTCTAAAAACACCTCGGTAAATAGAC
AGTGATCCTTTACAAGTTCATCCATTTAGGCAGTGATGCTAACACCATCCTTTTAAAAGG
TCATTCATTTATTTGTGTTATTTTCCATTTGTGTCGCTCAGGATGGTGCTTCGTCTTGTC
TCAACAATTTCTACTTTCTCATATAAAAATACAGGTTGTCGTTTCTCAGGTACACGGTAG
GTGGCACAAAACTTTCTGAATCGCGTCCTCTGGTGCTTAATTGTTTGCGAGCAGCTTACT
GGCTGTGCCAAATATAGGGGCTATATCAACGGGCACCTGAAAATGAGCATACATAAGAAC
AAGTAAAACTCCATTCAGCAACTTAACATATGATCATCATTCAGCGAGTAGATTATTAAG
AATTTAAATTTGCTATCGAAAACAGTAAAACTTGACTAGTACCTGCATATGTTCGATTTT
CTCCAATGCCACGCGCAACGGCTGTGTCAAGGTTGCACGGGACTGAAGGAGAGACTGCGC
AGCAGGCTTGTCGCCCTTTGCCTGTATCGTCATGATCTCTCTGCCAAGGCTTTCCACAGC
TTCCTCGACCTTTGAGGACACAGAATATAGTGAGTAGCAATAACCAAAGAAAAAAACAAT
AAGTACATATCCTGTTTTAATGAAATTACCTTTGTAAAGTCAATCGAGAATTTTCCGTCA
GAATGCAAGATAAAAGCTCCTTTGTCATACAACCAGTTAAACTGCAATGCCTGTCCCTTC
CTACATCCACGTAATAACAGTTAAATTATCACCTGAACCATGAGAAGTATGCTTTCAGTT
TTCGGTAGTTTGCTGTGGCCTAGGTGGGCAGATACACACTTACCCATGGGCTTCTTCCAG
GCCGAAGCGAATTGACCTAAAGCATCCAGCCAGGAAAGAGACGTACATAGATTTTGATAG
GCTCTTAGGAAGCAACCCCTGACATAACAGATGCAAATGAGAGATTATGTGATTCCATTT
CAAGTAGTCGAAATGATTGCATAAAAGGGATACAAGGAAATAAATAACATATTCCCTACA
GAAATAACAGGATTTGAATGTCTGGCTTGGGAGCCAGAACACTGGGCTCTAACACAAGTG
CCATGATGCTCTTCTGATAACTGATGAAGTAACTGACCTTGTTTATAAGAAAATTCAGCG
CCCACAGACCAACTATATCAGCCTTTGCCTCCTCCAATGCTGAATGACATTCTTGAAGTT
CCTGTACATTTATCAAAAAAGAAAGGAGAGTCAACAAGGGGCATCACATAGGATATACTC
CCTCCGTCACGGTTTAGAAGGCGCAGTTAAACTTGCGTGCATTTCCAAAATAGACAAGGT
TTAAGGCGCGAAAGCAATTACTCCTATTAATTAGTACTGGTACTACTCATGCATGTGCCC
TCCCAATTTGCTGCTCACACATT
