Map Locations of contig_2548881 (10043 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2548881

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37686 4 3890 bp MLOC_37686.4 Available Available LOC_Os08g40830.3, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13108.m04373 protein pumilio domain-containing protein PPD1, putative, expressed
MLOC_37687 2 1537 bp AK360950 Available Available None





CDS Structure of MLOC_37686






CDS Structure of MLOC_37687






Contig Sequence (10043 bp)

>contig_2548881 10043 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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TTCCGCGCGAGACGAACGCTTGATCAGGTGGCGAATTTACCGCCCCTGGCTGTTTTTGCG
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TTTCGTACGTGTTATTTCTGGTAAATTGTTTAAGCAAAGGCCATGACACTTGCATCATTG
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GGGTGCTTTTACGGTGTTAACAGACTGACCTTGTCCCCTTACAAATCTATCCCCTTGAAT
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TGCAGTTAGTACTTGAAGGCAGTGTTGAATCCTTTACCTGTCAGAGCTCCTATAATTAGT
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CTAGGATAAGTCACTCGATCCACGGTCAGCCGATCCTGCCATAGAACATAAAGAATATGA
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TGACCTCATGCCCCTTTTCACATACTCAAATGTTCCAAGCTCAATTGCTTGAGTGGGAAT
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TCTACACTTTTAGGTTAAACAGAGGCCGGCAGTTAGAGTAATACAGTGAGAAATTGCATA
GAAAAACACAAGTTGTTCTTTTTAAAGTACACTTTTAAGTCCAATAGCCAACTCAGCAGC
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GTTCTTCCATGTTATCTTTTGAGTTTAGAGATTTAGTACTCAGTTTCCAGTAAACTTCCT
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GCGCAAGTGAAGATGGTTACCTGATAGTCTCAAGGGGAGCAAGAACAGCTTTAGACATAG
CACCAGCTAACGCCCCACTGGCAAATTCTCTAATCTCTCTGCTTCTAAAAAATGTCTGCA
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CCGCCGCTCCTGCACCCCTTCCG