| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_2548850
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_37672 |
1 |
1171 bp |
MLOC_37672.1 |
Available |
Available |
LOC_Os08g06474.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-84, 13108.m00660 protein ribosomal protein L13, putative |
| MLOC_37671 |
2 |
1720 bp |
MLOC_37671.2 |
Available |
Available |
LOC_Os02g57260.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13102.m06589 protein 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal precursor, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_37672
CDS Structure of MLOC_37671
Contig Sequence (9738 bp)
>contig_2548850 9738 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCGCGATTTCTTTCCCCCTCTTCCTCTTCCCGCGATCCTCTTCTTTCTACGCGG
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GGGACAGCGCCGCCTACCAGAGGACCTCCTGCTTCGGGGACGACGTCGTCATCGTCGCGT
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TCCATCACGCCCCTCGAGCTCTTGGGTAGCCGCTTCATCATGGATGTGGGCTCAAGGTCG
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AAAAACACCAATGGATTGAATATTTGTTTTTACAACAGAAATTTGCAGGTACCTGTTGGA
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GTGCCCGTTGGCAGTAACCCGCCAGTCCCCATTTTGCTTTGTCCACAATCATAGTCGTGT
ATGCCCGTACCCAAATCCATACAATGCATGCAACAACATACATCAACACCACAATAGATC
GAACGAGAAATATAGATATATTCTGGATTGAGCATAGTTCATCGGACACACTTCATCGGA
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CCCGCCCCCGCCACCACGCCTTCTCTCCCGCTTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCCCCCAGAA
GGTCCCGCCGGCCGCCTCCCCTCCCTCGTCCTCCTCGCCCGGCGCCGCTCCCGGATCAGC
TGCGCCGCCGGCCTACACCGGAAACCTGAAGGTGAGTCACGTCTCTGCACACTACCTCTC
TTTCGAGGCGCCGATCTTCCTGATTAATCACTAGCTTGATTGGCAAATCAAACATTCATT
ATTGGTTGCTGTGAACGATTACTAGTAGAAGACTTATTCATTATTCTCGGTTGCTAGCAT
TAATCCAGGGCGAATCATGCCCTGACAGTGGCAAGCCAACTACTGTCCATGACTGATCTG
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ATCTTTATCATGAAGCGGCAGAACGATCGGGCTATCTCTAACTATCAAAGCTCAAGAACA
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TGTAAGATTAATAACCTCTCAATGTTTGATTATATATCATATTTTTCTTCAGCTCAACTT
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GATCAGACCTGTACCTTGAAAACCGGCTTCTTGCGCTCCTCCCTTGCCGGATTCTTGTCC
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GACTTCTCTGCTGACTTCTGTGAAATGATATTTCATATATGGTACTCTGGAGTTAAAATG
AGATATGAGTTTGTGAGTGCACTCATTTCACCACTGAATTCGCAGTACATATTTAGTAAC
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GAACTTCCATATATTGTTTTGGAACAGTATGTTATCGTTGGTCAAAGGTTATATTGGATT
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CAAATAACTACCCAGTATGAATCTTTCCTGCATCCAGCCTATAGTTTGAACAGCATGAAT
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TTCTGTTTTGAACTGCGCAGAAAGCACTTGCAGGGTTGAGGAGAATTGATTTAGAAGGGT
TGCGGTGGCGTGTTTTTGATGCAAAGGGCCAGGTCAGAATTCTTCTGTTTGTTTCAGTTG
TGAGGATTTGCCCAGGTCAAAATATTTGTTTATGCAGTAAGTTGCTTTGAATATGTGATA
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AAAGCTGCGGTCGCTGCATAAGTCACCTTCAGATGTGTGTGGACTATGGAGACCGATGAT
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TCTTTGATGACATGTAGTCTTTTGTGTTGGATTTCATAGACAGGGTGCACTAGAATCTTA
TCAAGCTTTGTTAAGGCGGCAAGATTGCTGAGAAGCCTGTTGAGTTGAGTTAAGAGGCAC
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ACTTCGTATAGATTTTTTTTCACAAAAATGCTCCTCCTTTTGCTCTCTGCATCTCTGGCG
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AATAAGCTAAGTATGCCGTAGAACACTAGGGAAAACTTGCCGTTGACGTCATCAAGGATG
TGAATCATGGAGGTTGCTAGGGGCGGGTTCACTTCTCACTAGGGAAAACTTACCGTTGAC
GTCATCAAGGATGTGAAT
