Map Locations of contig_2548684 (4657 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2548684

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37588 1 2246 bp None Available Available None
MLOC_37589 1 869 bp None Available Available None
MLOC_37587 1 677 bp AK356141 Available Available None





CDS Structure of MLOC_37588






CDS Structure of MLOC_37589






CDS Structure of MLOC_37587






Contig Sequence (4657 bp)

>contig_2548684 4657 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCGGGTGGGAGTGGCACGTGGGCGCGGGCCGGGGGGGGGCGGGCGGAGCTCGACGCCCT
CCGCCGCGCCGCGCAGCGCCTCAGCGCCTCCCTCGCGATCCTCGGCGGGACGCACCTCGC
CGCGGGAGCGTGGATCGCCTCCGGGGCCGCGCCCGTCGGGGTCGAGTCGGCCGCGTTGGT
GCAGGGCGTGGCGGCGTTCGCGTTCCCCTTCACGGCCGCTCTTGTGCTTCGCCGTCTCAT
CAAGCCCGTCGCCTTCTTCCAGAAGATGGAGGCCAACGGGAGGCTGCAGGTGCTCACGCT
TTGCCTCCAGGCCACGAAGAACGTTAACCTCATGATGCTAAGGACGCGGGTGGTCGCCAT
CTCTTGCGCCCTCGGAGTGTCGGTCGGGTCGGTGGCTACGATCTTGATGCGGTAAGCTTG
TGCTAGGCTCTGCCCAGGAAGGATGGTTAGTGTCAGTTTTAGAGGAGGAATAAGACTGAA
ATGGAGATATGAGATTCGACCTTGAAACTCTGAAAAATTGGTGCTTTTGGATGTTGAAGT
GTGCTTAGTTTTGGTACTTGTATGATTTACATATTACATGGGTACGAAAGGAGTCTTTAA
AGTGACGGTTTGGACTGTTGCTATTACAATGATATTCCTCTAATGTTAGATGGATGGATC
AACCAGTTGCTGAATCTTATTATCTTAAGTAGATTTATGTTGAACCAGCTCCATTTCTTA
GTTGATAACTTGTTTATGAATTACTCCCTCCGTAAAGAAATGTAAGAATGTTTAGATAAC
TAAATTGTCGATCTAAACACTCTTATATTTGTTTACATAGGGAGTACTCACTACGTCCCA
AATTATAAGAGTGCTTTTGACACTACAATAGTGCCAAAAATGCTCTTATATTATGGGACG
GAGGGACTAGGTGATTATTACCTGTATTTTCTATCCCTGCTGTCCACTGAGGTGCTCTCG
TATTGCTGAACTAATTTTTGGAGTTTTCATGCTTTGGCAACTTGGATAAGATCATCTGAC
ATTAAACAGTTATTTTTAATGCTAGGGTATTTTGGTCATTATGTGTGAGTGTGCTTACAA
GTTGCTTGTCTAGTTATGGCTTCGTGCCATCTGAAAAATCATGCCTTCAGAGTTCAATTT
AAACTGTAGGGTTTTTACCGGTTTTTCCACTAGTTGTGGCACACTACTCAATTTTGCCAC
TAGAAGTTTCAACTACTCAAAAATTCCATCCTTTCATTAAGTGTGTGCTAAAAAATGCCA
CTCGGCACATTGACTGTCTGATCAAAGGCCATTAGCCTAGGTGAAGTGACCAAAATACCC
TTGGACCCCACTTGTTAGCGTTCCCTCTACAACTGACTGTAATTTTTGGGCCCTTGTTTC
GGCATACACAAAATGAAACTAGAATCAAAAATAGTTTAGCTCGCAGGTGATCGAATCCCG
AGTGTCGTTCTTTTTTCTTCTATCTCTATGCTGAGAATTTGGACCGACAGGTTATAGGGG
AGCACTGAGAAGTGGGGTCCAGGGGTATTCTGGTCATTTCACCCCCGGTCAATAGCCTTT
GACCGCACGATAATGGTGAAAAGTGGCATTTTCAGCACACGCTTAACGAAAGGATGTCAT
TTTTTAGTAGTTGAAACTTCTAGTGGCAAAATTGAAAAGTGTGACACAATTAGTGGCAAA
ACCCTAAACTTTAAAGCTCACTTTTGAAAATTAACTGGTTAACTGGTTTTATTAAGTGTG
GTTTGTGAGATGTCTAGTGAGTTATGCTTTACAAGATCTCAATGAAATTGGTAATAAGAG
TGCATCGATAAAAGGTGGAGAAATTTGAGGTGGTATGCCCACATATATATCTCTACATAG
TACATATTTTTTTGAATATTTGAATCTACCCTCATCTCACTTGTCTCACCGTCCGCCTGA
AGAATGAATTCATGTATAGCCGTCCAAGCTATTGGATCGAACAGCTCATGTCACATGGAT
TCGCCACCTACAGTCGCCCCGCCAACCTAAAAACCAATCATTCCTTCTGGAGAACTCCAC
AAAGCACGGTCAGCTCAGGCAAATCGATTGCTTCCAAACCTCCCTTCGCCTGGATGGGTG
GATGTGGATGCGTGGAGCAAATTGATTGCCAAGCCCAATCATGGTATAACAGTGCTTGCG
GATGTATGCTGCGTGTGGGGTGTGGCCATGGCTGCCGGACGCAAACGCCACCGTGCCTGC
AGAGGAATACTAGATGTGTGCAGAGGAATACTAGATGTGTGCCGGATGGAGAGGTCGTGT
GTTGTGTCGGCGTTCGGCCGGCACAGGCATGGCCTCACCGGGTCTCTCTCTCTCTCTCTG
AGATGATAAGATCTTTCGGAAGCACTCCAGTTGACTCGGCGGGCCACGGGGGGCTGCTTC
TGGGCACGCTCCTGCGCAGGTCGGTGGGCGGAGAAAGTAAGTGGCGGGCAGAGCAGCGAA
CAGGCAGAGCGCCCGGCCCGCGGGCGTCAGAATGGTTGCTCCGGTGTCCGAGTGACCGGC
GAGGCGACGCATCAGGCGCTCAGCTGGCGGCAAAGAGGCAGTGTCTGCGTCGGTCGGGTG
CCTGTGCGCTGTTTCGTGCGGCCTTCTTTCCTCCCCCCAGCCCATAGCCATACAGGCCAG
CCCAATATTACAGGGTGGAGCGCGGCCTACCCTGTTGCTCCACCACTGGGTATGGGATTT
GATGATTCTCCCCCCAAAAAAAAGGTATGGGATTTGATGATTCTAAAAAAAGGTATGGGG
TTGACGACATTGGTTACCCCTAAAAAAACTTGACGGCATTGGCGGCGTTGGCGCTCTTGT
TGAAAGTCAGAGGTAGCACCTTGTGGCCTGGTTTCTGAAAACACGCCAACACTAGGCTAA
CATGATGTTAGCCCTTTCTGAACTGGATCGAGTGGCTACAACTAGCTCAGCCTCTGGTTG
CATTCCATCTACGTCAAGTGATAAGAATGCATCGAGATGATCATTTCTGAACAAAATACG
ATCCCATGACCTGAGTTGTCACTGTGAATATTGACTGCAGGTTTGTAAAGTACTCGCTAC
TAACCAAAATTTCTTGTAATATTTTGGCAATGTAAGAAGGGTGAAACTTTATCAAGACAT
TTTAACTTGGCATGAGGTTGGAAAGCAAAAACAACTCACATAAAAAGTGCTCAGTTTGTA
TATATTTTTTTCCTATTCATGTGAAAATTGTACTCAAGAATGCACAAGTTTGGCATTCGA
CTAGTATTAAATGTAAATATTTCTCAGTAGCGGTTGTTGTCTCCGTACTAGTAGTTACAT
GGCAATCTACATCCATTTTTAGCAGTACCATGTTTTTCTTTTTATTTTCGCTTGTCTTAT
TTACTGTGTCCAAGGATGGTACAATTTGTTTTGCCTTCCTCATTGACAAGTAAATTTTCA
GAAAACTTACATAGATCAGCTTGGAACATACTCCCCCCGTAAAGAAATATAAGAGCGCTT
ATAGATCACTAAAGTAGTGATCTGAACACTCTTATATTTCTTTACAGAGGGAGTAGCTTG
GAAAAATGTCTTATATTGTGGGACGGAGGGGGTGCTTCTTTTGGTTTACCTTGCCTTACT
GCATGCTCTTGGTGACAAGTTCTGTTAGGGAATCTTGATCATTTCGTGGGTTAGATCCAG
TCACACCAAACTGAATTGGTCTCTGTTGTTTATGAGGTACTTATAAGAGATGAACTGTAA
AGTTGCTGTCTTGTCCACTATGACCTGCGCAATCAGCAGAGATGCCTTGACTTATTCCTA
ATGTTCTCTATAAACACTATTGTAGGTGGAACAGCTTGAATTGATTGATAGGTTGTTGAG
TATTCTTGCCTGTCCACAGCTTGAAACTTTTCTGAAATCAATGATGCAGTGTTGAGTTTT
TAACCTGTAGTGGGATTTAATTTTTGCAGCCTTAATTGTTTTTAGTATCTCCTGATAAGT
ATAGTTGAGAGTTGAGGCTTCCCATTCTCCAGTCTTGACCTGATGCATTATGAAGCAAGG
TTTAGCTTATGTGCTTCAATAATACTCCCCCTTCCAAAATTTGAACTAAAACCACGACAA
TAATTTTGAAACGGAGGGAGTATATCACAGTCTAACCTAATGGTTACCATCGTATCAAAT
AAACCGTGTATTTGTTAACACTTCTGAAGAGTGTCATTTCTGTTTGGACTTGAAGAGCTA
TAGTTCAAGTAGACGCATGGAACACAGTATAGACCATAGAGGCCTGAGCAAAGATTTTGA
CTTGACTACAGTTTGATAACCTTTTATTTTACAGACCTGTTGGTACGTGAGCAGTTAAGA
TGTACAGTACATCAGACAAGTGCTCTAATATCTAAAGAAATAGAAAAAAACTGGTTAATG
TATAACAAGCCATTATAAATAATACCTTTGGGATAATAAAGCTGATGAAGCGATGGAGAT
ACCTGGTCTTTCATGAAAGTCTGTGTATACACCATGTTGCCCTCTATTAAGTTGCAGTGT
AGTATAGGTCCAAATGGCAATGTGTTGTACACAAGACACATCAGGCATCCCCTGTTATTT
ATGCTCTGGGCTGCAATGTTGTTGTAATCATGTAATAACATGTTCTGGGCATTATTGCCA
CTGACAGATTCCAAGAAGGCATTGCCAAATTAGTTCT