Map Locations of contig_2548680 (11742 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2548680

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37586 2 6673 bp MLOC_37586.1 Available Available LOC_Os03g58910.2, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13103.m06469 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_37586






Contig Sequence (11742 bp)

>contig_2548680 11742 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCATCGCCCGCGTCGGCCCCGCCCCAGCAGCAGCAGCAGCCGGCCCCGCCGCGCAACCC
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GGGCCAGGGCGTCACCGGGTGGAAGGTGGCCCAGGCGGCGCTCGTGGCGCTCAAGGCGGA
CTCGTGGGGGTCCCTCGGCGTCCAGCTCCACGACGTGCCCCTCCTGCGCGAGCTCTTCGG
TATCGAGGGCAAGGTCAGTATCGGCTGAGACCCCCGTAGCTCGCACTGTACGCGACCATG
TGACCTCGCAAGCCTCGTACATGCTCTGTTTTGAATTTACAGTTATTTCATCTGCAATCA
CTCAAGCTGGGTTCGTTGATAAAAACGTCGTTAACCCTGCAAACTCTGCTTCTTCTGCGC
TCCAGTTCATAATTAAGCTGCCATGTGTTGGTAAACTGACAGGGGGCGGCGCTGACGTGT
GCTCTATGCCCTGCTTTTTTAGCTTTGGTATGCTTGTATAGGTCTTCGTCGCATGCCGGA
TATTGTGCAGTACTCTGTTCTGATTTCATTCGTAAACACACGTGGCGCTGAGATTGTTTG
CCCTGTGTTTGGTGAAGTTGTGAGTATGTTCGCACAGTGCACCGCACCCAGGCTTGTGCA
CGCTTCCATGCCTGCTTTGTTAATTTCGTTACATGTTCTCATCCTGTCAGATAATTTGAC
CTGTGCTAAACTCCGCAGCACCTTCTGTTCTGCTAGTATCTAGAAACACAAGAGCAAGAA
ACAGGAAACCTAACTAATATGCTCCCTTGTAGCATAGTATTGTAATTCACTATGTCTCTT
CTTGCAATAATTGAACCGTTGGGTAAATGATCAAAGTTAGTGTCATTTAATATTCCTGGG
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TCTATTCATGACCTGGAGGTTGAGATATGCAAAAACGAGGGTATTGGTCAGTTCGAAGAG
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CTCGATAATTCTAAGGAGAAAGTCACAGCGGAAAGCTTCTTGGATTATCTCGCGGAACAA
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TACTTTGAGATATAAATGACTTTCTTCAACCTTCTTGCTACTATTTTGTCTCATACTCTG
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CAGGCCAGAAGAAATGAAGTTGCTGCAATTAAACATCTAGGCAAGACCAGTGGTTCTCGT
GATAACACTTGTGGGAAGGATCTACCAAAACAGACAGACTTTCATTCGGGGAAGCAGGAG
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AGATACCAACAGAATACATAGCATGTGGGTCTACTCGATTTAAAGGAAGCGGTCCAACGT
TCCACCGAGGCACTGATTTCTCTCATGTTCCTCTTTTCTCCATCGATAAAAACAGTGCGG
CACAGCTGCAGCGGTTTCGGCGATTCGATGGCGAGAGCTAGATTTGGGGTGGGGGAGACC
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CGGGAAAAGCCAGATCCCCACCTTACTGTGCTTGGCTCTGGCCATCCCTCCTCATGCTTG
ATCCAGCCTGGTATTTGGATTATTGGTGGATGTCCATATATGCCATGGAAACCTGCAAGA
CTGTGTCTTGTCTTCCTGCTGATTGTTGGTTTTTATTTGTGTTTTTCTCTCTCTGTCGAT
GGTTTACATGCATGATTTTTCTCTCTTGGTCAGACAGATTGAACCGATATTTTCTTCCAA
CTGTTTCTATCCTAGTGTTCAAATCTTGGTGGCACATGTTAATTCTATTTGTGCTTGGTC
AGATCATGAGTCTTTTGGTGTTAAAAAGCAGTGCATATATTTTTGCTGGATGGACTGCAA
CTATTTTTTCCTTTACAATATGCTACTCACTCCATTCATAAATACTATAAGATGTTCTAA
CTTTTTTCTGAAGCGGATGTATATAGACACATTTTAGTGTGTTTGTTGATTTGTTCACTC
ATTTCAGTCTGTATGTAGTCATATTGAAATATCTAAAACATTTAATATTTGTGAACGGAA
GGAGTAGCTGTTATTGCATCTGAGAATTCTTCTAGACATTCTGTGATGATGCTGTGCTGA
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GTGCATTTCATGTTAGATTAGTGCAAATTTCTGCCATCTTGGGATGGACCAGGCATTTTA
TTTGGCAAATTGTGATGATTTATTGATTAATCATGACAAATCAAATTTAATCAAGTGCAT
TTCATGTTAGATTAGTGCCAATTTCTGCTAATAATCATGTATCAGTGTCTTTAGAATTAA
AATTTACATCTCCTGTGTGATATTGAAACTTTGAAATAACATTGGGGTTGTTAATTGTAA
CCTTAATCACAAGTTCACAACTATTCAGACAATGAAATGAATGAAGAAAAAGGTACTGAC
CCCGGGGATGCTATCAACGGGAAGCATGCTAATCTCACTACTAATTATGCATCTGTTTAA
AATAAAAAGTTGAATTTAGAAGGCGAAATATTATTCCATGGAAGGCGAAATATTGTTCCA
TGTGAGTGGTCAGCTTTTGTGTCAGAGATGAATTTACAGAAATGGGAAAGCTCAAATACA
CCAGAAATACAGCCCCAGATACGTGGATTGCACCGATCTTTATGACCAGCAGCCTATATA
ACAGGCTCACCATCGCTTCGCTTTTTTGCATCTATCTGTACTTAACTATAAGAAGCGCTT
GCATTTGTAATCTTGTACTCCCTCCATTGACAAATCTAAGATGTTTTGGATATTTCAGTA
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AATTCAGAAAAAGTTAGAACATCTTGTATTTGTGAACGGAGGGAGTACTTGTTAGCCCCC
CACTCCCTAGTTTCTATCATTTTTTTCTGATATTTTTCTTACTCTTTTGATGTTTTCTGC
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TGTAGGTGTTTTCAGTATCAGTAGGGCCTTTTACTATTTCCAAATCTAATGTATTTTGCA
CTTCTCATTGATGCAGGTTTTGGAATTGGTAGCAAATTACTATACAGAAACACCAGAAGA
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AGTGAGTTGGTTCCTTTTTCAACTAACTCTTACATTACAAGTGGATCTACTAAACCAGAT
ATGTTGTTTGCAAAACGGCTTCAATCTTTTTAGTTGCTACACATAGAATGCACTTCAAAG
TTAGGATAAGTTAGGCACGGTATCATAAATTTCCTGATGTGAGCCATTAGATCTGCAGGT
GTAGCATATGTGGCTTGTACTTGTATGATGAGGTGTGAATGCATCCGGTGCACCAATTCT
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AATTCAGCATGGAGAACAACATGTGTTTACCATGACACAAAAAATCACTCATTTGACCCA
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ATTTTGTGATCATATTTAATGTCCTGTGTCATCTATATGCAGGTTAGATCTATGGCCTGT
GGTCTGCTGGACAGTATTTATGATGCGATCAATGTCTTTAGTGAGAACAAATTGTCATCA
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CTCTCTTGTCTCAGTTGTTTCCACTCAATCAAATTCTGTGATATGGAACTGGAACCAACC
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GTGGAGTGTCTAGAGCTGGGGCTTTTAAAGGGGAAAATTTTATGTTCCTGAAGACACTTC
ATGGTTGTGAAATATGGGCCGCTACTCAATTTTCTGCCAATCAATTTACTTCTCTTGGCC
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GGGATAGTTTCCTTATGCTTCTCAAAAGGCAGTTCCCGACAATTAGTTTTGATATTACAC
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TGCTTCTTTGGTCACATTGGGATATGTTGTTTGCTCCTTCACTGGGTTCCTTCATACACT
GGCTGCTGAATGCAGGTCCAGTTCAACAGCTAGCTTGCATCGTGACCACAGATGGTAGAT
TTATAAGAGTAGATCCATCAGCCACGGTTGACCAATTTTTAGAAGCCATCATTCGATGCT
CACCATTTCAAGTGGCAGAGAAGCTGCTTTCATTGCTGCACATTTACAATGGTTCTATGA
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GCTCTCAGTTGTCTTCTGCAAGAACTGTCATGTCTGATATCTTAACAAACATTGACAGCA
CTGTTCATTTTGTTGCCAAATTTTTTCTTAATTGTCTTGGTCATCTGCCTTCTGAATTCC
GGAGTCTTGCAGCAGATATACTATTATCCGGACTTCGAACAGTTACCAAAAATTGCTATT
CAGTCATCTTACATGAAGCCACAGAAACTTGGCAGCTTTGCATGCTTCATGATGTTGGGT
TGTCACTTGGAATTTCTGAGTGGGTCGAAGATTATCGTGAATTCTGTTTAGCTGAAGAAG
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TGGCGGGAGAAATGAATCTCGAGGAAGCAGCTCTAGTTATTGAGACTATACGGCGTGATG
AGTTTGGTTTGGATCAGGCTCTAAGCTGCACCGAGAATAGTTTGTTGACGAAGCAGCATG
CTCGACTTGGCCGAGCACTGCATTGTCTTTCACAAGAATTATACTCTCAGGATTCTCACC
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TACTTATCTTGAGGATGTTGAACCCACATTAGCATTCGTTCTTCAGGATAATGGTATTGT
TGTTCTCAACAACGAGAGGGGCTTTTCTGCTGAGAACATTAGAGCTCTTTGTGATATTGG
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TCATTCGATGCTTTGTTACTACTTCATCATCTTGTAGAAATTTCGAGTTATGTGGAAAAT
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TGGCATGTGCTCCATTGCATCCATGTTTTCAGATCTCCACCCATCTCTGCTTCTGTTCCT
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AGGGGATTTCGTTTTACCTTCTTCCAGAGAGGAAGTGGATGCAGATAATGCATGGAATCA
GTGGTTGTTGTCTGAATTTCCCTCTTTGTTTGTCAGCGCACAAGAATCCTTTTGTTCCCT
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AGGTATTCACGATCATGGACCGAATGTTTTTATTGATATGGTATCATCAATTTGCCGAAG
TGAGGGTTGCATTGAGTCACTGGGGATGGAATGGTTATGTGCTTGGTTTGTAAATCTTCA
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TTTATGTGTTCTCAGGAAATTACCATGCATTCCGCTTTCAGATGGTTCATTTAGCTCTGT
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AGCTTGGTGTCTCACAAGCGGGACCAGTTGTGATGAAAACAAGGCAGTTGAGTCATCCTT
TATGAAATGTATCAGAAGCTTCAAATGGATAGCGTCAACTGTGGATTATGACCTTCATAA
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GCTAATCTCCATGTTTAGATGCGAAGCAACCGTAAATATTGCTAGTCTAAACACTACCAC
GTTTCCATTTTGATCTACACATGTGGTTGCTTAAAATGTGGGTATGTGCTTAAGAAATAA
TATGAACATTTACAGATCAACCCCACTGCCATGTTGTTTATTTACCGCAAATTTTTCTTT
TGTCAAGTAACTTCTAATGGCTGACCTACCCTTTTTTCAGTGTGGACCAGATGCGCAAAT
TCTATACCTTCATGTCAGAAGGTGCAGCTGATGCAAAGATTGACGTCAAACGGGAGTTTA
TCTCATGCTCATCTATATTTACACCATTACTCCGTGCTCGATCTAGTGAGGTTGTCCTTG
GTAAATTTTTACCCCCAAAAGACCTCTATTGGCATGACCCAACAGGTTGTTCTGAAACAA
CAGAGGAATTTGTTTTGGTAAAAAATAGAATGTTCCCAAGAAGGATGCTGTGTTCAACCT
ATCCAAACCTTTGTGAATTCTTCACTGAGGCATGTGGTGTACCAAAAGTTCCAACAACAC
CCGATTATGTAGAAATGCTCTTACGGCTATCTAATGTTGCACTGCCTTCACAAGTAGCCC
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CCTCAACTGCTGGTTGTACGCCTTTAAAATATGATCTCCCGTTTCCACATTGTACATAGG
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CTGCCGAGGACAAGCAAATTCTGTATGGAAGAGTTGCTGCATTGATGAAAAGCCTAGGTA
TCCCCGCGCTATCCAAGGTAATGTATTTCTTGTTTTATGGTATCTTTATTGACTTCTTTC
CTACATTCAGCAAAGTCTTCACTGGAAAGGTTGTATGTAATTCTTCATTTAGCTGCAAAG
TTGTGCAAAGTAAATATTGGTTAGAAGACTAGTAAAGTTTGCTATGTGCTATTGGCCTAA
TTTAGAGCATCTCCAACAGCCGCGCTACGCGCCGCGCCCAAAAAAGGCGTTTGCCGCGCG
CGCTTCGGCAGGTTTAGCGCGGGGATAGGCGCTGGCTCCAAC