Map Locations of contig_2548448 (10576 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2548448

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37457 3 2446 bp MLOC_37457.3 Available Available LOC_Os04g55960.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13104.m05813 protein NADPH reductase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_37457






Contig Sequence (10576 bp)

>contig_2548448 10576 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCCCGCCGCCCGTCAAGGTCGACGCCGACGACGCCGACGACGGCCGCAAGCGCGTCAC
CATCTTCTTCGGCACCCAGACCGGCACCGCCGAGGGCTTCGCCAAGGTCCGTCCGCCCGT
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TAAAATAACGATGTTTTGATAAACACTGACCAACCCATCCAAAGGCCACCAGGACACACC
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TGATCATACCACTTTAATTTCACTATCATTTGTTACCGTGTATAAAGTGGTACTGCACAA
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TGATCCAAAATCTGTAAAATTTCTCAATTGCTTGTCCATGCGGTTCCATTTTAGACTATT
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CATTTGTTTTTCCTTGTGTAGTTTTGATCTTTTATTTCAACTTAAATAAATGCAAGTATA
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TGCAAGATTGACCCGCAAGGTTGTAAAGCTCTTGTTTATTTCATGGGGGTAAATACACTT
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CTTAAATGTGCCACTGCAGGTTGGCTCCCTCTAGAATTCATGTAACGTGTGCATTAGTTT
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GTTTCTCTGACCAATTTCAGTTTTCTCAACGCAAGAGTTTCTTACAGTACGATTTATTCA
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CATCATGATTGGTCCTGGGACTGGACTAGCACCTTTTAGGGGCTTTTTGCAGGTTTGTTT
TTGAAAGGAATCTGCATTCTCTTCACTTTATATTTTACATGGCCCTCATAACCTTATCTG
TTCCTTCTTTCGCAGGAAAGACTAGCTCTAAAAGAATCTGGAGTTGAATTGGGCAGTTCA
GTGCTCTTCTTTGGATGCAGGAACCGCGACATGGTACTGTTAAAAAACTAGCAATGAGAC
GGACCCATTTTATGGGTGTTGATAATTTGTGATTGATGGAATTCTAACTGAATGGACATA
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GTTCTAATATTTATTGTATGGATGGATGGTTGAAAGAATAAGTGCTGTTGTAGATTATTA
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GATGAGATGAGGACATATCATGTATACATTAAAGACCGCCCGCCAAAAAACAAATTTTGC
ATCTGGTTATAGAACAAGTGTCTAGGGCGCCATCATGGTGTTTGTGGTGGCTTTCTTTCA
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TTATGTGTCGAGTTATCGAATTGATTATCTATGTATTAGGTCATCATCAGTTTTTGAAAG
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CTTCATGTCAAACAAACAACCATGAGGTAGTTGTTGCCCTGGACTTTAGACTTATCAAAC
AGACAGACGAACAAAAACAACCTTGCCGTATATAGTCCCTAATGGAATCTTTAAAAAAAT
ATGGAAATGAGGAAGTAGCTGTAGCTTATATGTGGCTTCGCCACTTAGTAGCATGCATGC
CGCAGGCCCGCTACGTTAACTGTTGTGCTGCCTCCCCCTTGTGAACTGTGATCAAAGTGA
TACTACTTGTCTAGTTTGCTGACACACATCTGTTGACAGTGGGTTGGAGTATAGCTTCAA
GGGTCGACAGTGCTACTAGCATGTTGAGAGCTCACCAACACGTAGCCTTTCTGCCTTCCG
TTGTCTAGACAGTTCCATTACCATCACATAATAAACGATAAAACGAACCGCCAGGGTGTA
CGCTAACACTCGCAGCCCGTCCTCCTCCCGCTTAAACAAAATCATTGTCCCCTTCCCCTA
CATGACCTCCGTCTCCACTCTCCTCCAACTCCCAAAACAAATGCATGTGCAAACCTCTCC
AGCTGGCCGGATCCCCTCACAACGTCACGTCGTCGCCCCTCCGCACGCCGGCCTGCAGGC
CATGAAACGTGGTGCACTGACGACGAGACAGGCAGGCGAGCGCATCCATCGGTTCCGCAC
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GCCGCTCTGATCGTCACGGCGTATGGTCAACGATCCGCAAATCCGCCACCGTATATCGAA
GATCAACACGCCTGCGTTGTTTTGTTCTAGGGGAAACACGCCTGCGGTGTTGGGTCCCTT
GCAAGTTCTTCCATTTGTGTTCTTTTTCATGTCTTGCCGTCTTAGCCGACCAACTTTCAC
AAACACTGGACTTTGAGCTTTGGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCATACTGTGCACTTCG
GAACTCCTCCCACGCGCGCTGAGAAAATCGGATTGGGCGGCAAGTGGAGCAGCCGACAGC
GCCATTGTGACTCCACTGACGGCGAGCGCATAGGTTCCACAAAACTAACCACAGTCTGAC
CAGAGGATGCCAGCAGCAGTACAGCAGTATATTTTTCTTGGCGGTAAATTACAGGCAACT
CGATGGAGCATTGATTTGACTGGGACGCATCCATGTCAAACATGCGCCATATATAGGGCC
TGATTTATGACTAACTTTGACACAACTAACCTTGGATAAAATATGGTTGTCACAAAAAGT
GTGGTTAACAAAATGAACATCATAAATGTGTCAAGATTTGACAAAAAATTGAGTGTATGA
CATGTGGATCATATAAATAGAAAAGTGTGGCAAGCCATAAGTATGACAATGAACCAAACA
CATGCCAAAGGTATTGTGACATGACTAAGGTGAACTAGGTTGTAGCCTAGTGGCAAGGGA
GCGCAGTGGCGTCTTCAGCAACCAGGGTTCGATCCACGTCGGGGACGAATTTCTGGTTTC
TCATTAGGGATGCTTCTTCTATATCAATAAACCATGGGTGCTAGTGCCCATGGAGTTTCT
TTTTTTTTTTTTTTTT