Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_2548356 (5337 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_2548356

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37417 1 440 bp MLOC_37417.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_37417






Contig Sequence (5337 bp)

>contig_2548356 5337 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCAAGTGATGAGAACTGTGTTGAGCAGACACTCGGTGAGGAGAGACGAAGATGGCATGGG
CGATGGAAGATGGGATGGTGGTGGCAGNGGAGGCGGTGGCAGGGGCGGCGATGGCTGGGG
AGGCGGTGGCAGGGGAGGTAAACCCACCAACTGGAAGTATGGCAAGTGATGCATGTGTTG
GCACGGCGTGTTCGGGCGTCGCCGAGTCATTTTGTATGCCATGCCTGGCCGAACGAAGAT
GGTGTCTGTTAGCAACTGTCAAACCATTCGGGGGGAAGGCAAGATAATGTCTGTTTAACT
GTCGGTTCGGAATTTAAGTAAATGCAAATTATCATCCTGTGTGTTGAGGGAAAAAAGTAA
TTATACACGGGGTGCAAAAACAACCATGTAACGGAAACAATCAAACACATCATGATATGG
CCGTATTTCTACAAAAAACCTGAGTTCTGGTTTTATAGCACAGTGAAACAAACATCCTAA
ATCATAAAGAACTCACGCTAGATAATTTGTGATTTCGAGCAAGAATTGCGACGAGCGTTT
GCTTGCTAACACACATAGTGAATGAATCGTTCATCTTTCATTTCACAAATTATCTCTCAT
TCGACAATAATCCCCATTGACCTCGATCACCATCCTTGATGATGGTGCATCACCATACCA
TTATGTTTCTGAGCTATCTCGCTCATCTTTCATTTCACAAATTATCTCTCATTCGACAAT
AATCCTCATTGACCTCGATCACCATCCTTGATGATGGTGCATCACCATACCATTATGTTT
CTGAGCTATCTACGTCGACGGGGAAGCGCGGCGAGCTCTCTCCCATCTACTCCACATCAC
GGATGTTTGAACTCTTCCCTCTGTTCGGCATGTTTCCATCCATGGCACACCCGTGTTGCA
TGGGCTGCTACGACTTGGTTTAGGCGGTGCTTGGTGGTCGATGTGTCGCACAAGCGGTGG
TGCGGGGGAGGTTGTTGCCCCCTTTGTAGGGCGTCTTTGGCGATAAGGTGTGGCCGAACT
GGTCCCCCTCATTGGTGGGCGGGTGTTGCCTCCCGTTGAATTTGGTCGGGAGGCTTTAGG
GGTGGTGGTGTGTGGGAAGGTTATGGGAGAGATGGGTGGTCTGGACACCTGTCGCCGTGT
GTAGGGGGGCGCCGGTTGGGAGCATGATCCGCTCCTTTTCCTCCCCTTTTTCCTGACCTG
TTGCTTCATGGTTCTGGATCGGGCGATGATAGGGGCAGGCCGACTGCTGGCGGCTCCGCC
GGTGGTAGGGGTCTACTGGTCGGTGCAAAGTCCATTCCTTGGTTGGTCTCTAGGGTGTGT
CTGGTTCCTGGGAAGCTTCCCCGATGGTGGGAGCAGCGGTGCTCGTGGCTCAGGCGATGG
TAGCTGCCATGGCCGCACATGTGGTGTGGTGGCTGGTGTTCAACTATCTACGACGGTGGT
GCGACAAGTGTCCTTGTGACTAACATTACCCTGATTTAGAGGCACGATGTTGTGGGTGTG
AAAACCTCGTCTTGTGGGCTTCGCTCCCTTCTTGAAGGCACCATTACGATGTCCCTTTGT
TCTTCATTATGTTCCAGGTGAAAACCTAGGACAATGGTGACGCTCCGGTGTTTGTTCTTC
CTAAAGGTGTCGCTTTGGAGTTCATGGTTAATCGTTGTCCAAGTTCATCTCTTCGCGGTG
GCTCGTTCATGGTCAAGAACTTCGACTCTAACTGTGCTGAATCTTTTCACTTGTCGTTTG
CTTTGAGTTGTATATGGTGTGGTGTTGATGTTCATCAACTTTTTTGTATTTTGCCTGTTT
GTGTGTTATCATGGGTGTGCATGCGGTTTATCGTATGGTGGTTGTTTCTTTATATTCACT
CCTTCCGGAATTACTTTATCACAAAAATGTATAAAAATAAATGTATCTAAAACTAAGATA
TGTCTATATATATTCTTTTTTTCTAACAACTAATTTCCGACGAGGGAATATATAATAAAT
AGAAGCGAAAGCCGTTTTAGCTAGGTACAATGCATCATTTGGGTGGAGCAGGGACTGGTT
TGGAGTCACTATATAAAACAAACTTGTTAACATATGTCAGTGAGGGAGAAGAGCCCGTGT
CGTTGTGCTCAAACTTGACTTGGCCAAAGCCTTTGATTCTATCAACTAGGAGAGCCTTCG
TATGATCATGGATGCCCGTGGGTTCCCTGCCCTCTGGTGTGACTGGATTGATGCTATTCT
TCATTCTTCGCGCTCAGCACTTCTTCTTAATGGAGTGCAGGGGAAGTGGCTCAAGGTAAA
ATGCGGGTCTGCGTCCAGGAGACCCGATCTCCCCCTATCTGTTCCTGATTGTTGCTAATG
TGTTGCAGCAACTGATTCGACAAGATGACGTGTTGAGACATCCGCTGCTCCCGGATGCCC
CTGCAGTTGTGCTCCAATACTAGCACCGATGACACTCTGATCATCCTGCACGCTTGTGAG
GAGGGGGCTGTTCGTCTTCGTCTAATTCTGGATCAATTTGCGGAGGCGACGGGGCCTCGG
ATTAACTTCACCAAAAGCACGCTGGCGCCGGTCCATGTCGTGCCGGCGGTCCATGAGCTA
GTTGTTCGCGCACTAGGATGTGCTGTTGGATCCTTCCCCCAGCCCTACCTCGGCTTGCCC
TTGTCTTGGGAGAAGTTGAGGTTCTCCCAATATGGTTGCTAAGTTGGACAAAGTATATGG
TTGGTTGGGCGTCACGTCTCCTCTCGCCTGCGGGCGCCTTGTGCCGATAAATGCCGCTCT
GGACGCCTTACCCACGTATGCCATGGCGGCTCTGCTTCTTCCGCCGGCTCTGACGCGCCT
ATGGAATGTGGCTGAGAGGGTTTCTGGAGCTCAATGTTTAGTGGTGTGGTATCGTGTGTG
ACGTGCCAGGTCGGAGGGTGGTCTGGGTGTGCGCAACCTTGCTACTCAGAACGAGTGTCT
CCTACTGAAAATGATCCATCGTCTGCACTCTGCTCCTTGTTCAAGCGTTGCCGAGGGGAT
CTTGCCACGCCTTTCCCTGCTCTCTTCTGGCACTCCACGGACGCCGAGGCTACGGTGTGG
TAGGTGCGTGCCGAGGGGCTGGGCCGCTTCCTCGTCCCGTGGCTCACGGGCATGGGGGAG
TGCGAGCTTGCTGCTGTCTCTGCGCTTCTTGTGACGACGCCTATCTGGGCGGGGGACGAC
GAGTGGAGGATGCTCCACGTCTCCGCCTCCCGTGGCCGTACGTCGGCCAGCTCGGCGTAT
AAACTGGCACGGTTTGGTGGCGTTGCCCCCTATGTTGCGTACATCTGGGGGCCGCGAGGG
TGAAGTTCTTCTGCTGGCTCATGGTGCAGTGCCGTATTCACACGCGTGATGTGTTGCTTA
GGAAGTACATTGTTGCTGCGAACATCGCAGGGTGTCCCATTTGCTCGGCAACGCTGGAGA
GCGCGGATCATCTGGTCTTCTCATGCCCCTTTGCTGCCAGCTTCTCGAGGGCGGTCGGGG
TTCCGGTCGCAGGCGCGTCTGTGGACTGTCTGGAATCACTGGTCCGATCAGCTGGTTATG
TGGTGTAGTCTGCGGCTGAATCCTTCATGCTCTGCTGCTCGCAAGTATGGAAACACCGGA
ATGCTGTCGTGTTTCACGGACAGCTTCCCTCTCTTGTTCGGGCCCTTAGTTGCTGCCGTG
AAGATGCACTGTTGTGGGGGGGTCGGCTGCACGAAGACTGTCAATTCCATGTTGAAACTT
GGTTGATGGCTCTCTCGTTTTAGTTTCGTTTCGGGGGTTCATTATCCTCCGCCCCTCTCC
CACTCCATGTATTTCTTTGTGGTACCCTTGGATGCTTGTAATTACCTAGGTTTTGGCCCG
TCTGGTTAATATATTCAGGTGGGACCCTCCCTCGGAAAATTAATAAAAAAACATATGTCA
GTGAGTGGGGTGTTACATTCTGACGAATCCATGGAAGACAATATCAAGGTGGCAAGGTGA
TTGACTGGGTCGTACGTACATAACATACACTCCAGCTAATTAACACGTGGTGATCTTTAA
TCTCAATAAAACTCTACATTGACGGAAACAAGAAAGCAGAAGGAAGGAACGGAAGAAAGA
AGGAGAAGGTTCATATGGAAATGGAACCATCCTGTGCATGTTGGCATCTGGCGACTGGCG
AGGTGCAATGCATCCATGCATGCAGGTCCCGCCTAATCAACGGCTATGCTTGCTTGGAAA
TTTCCCATAGATGCCAAACCTGCATGCATGCATGGTGACAATAATATCCACTAAGCACAG
ATTAAAATGACGTGCTGGTGAGGTTGAAATGCGTATTGACTCACGTGCGGATTCATCACG
TACCATTTGCATTTGCTGTGACATAATTAATCGTCTCACTCAGCTCACCCCACATTACAT
AGCTATACAGTGGATGGAGTGTATACCGGTGTTACCACACTACTGTAGTTTTTTTTGCAA
ACAAGCTAGCCATCTACGTAGGCGAGGTGCAATGCATCCATTCATGTCTGGCCTTTATTA
AACTGTACGAATTATGCCTGGGAATCTCAGGCAGACGCCCGACGACGAATGGTGGTGTGG
TGGTAATAATATACGGTCTATGTGTGCCACTGCCTAATCCAGAGTCAATACATTTGAGAA
GGCCAGGTGCAATGGACCTCAGCATTGACGCACGTGCGCGCGGCTAAGCTTGCGCGCCAT
TTAGATTCAAGTGCAGTGGAGTGTAATCCAGCGCTACCACTACTTCCACTTGATTAAGTA
GGATAGCTCTGCTACGCACGGCATAGCGATTAATCTCACCACTATGAATTTTCATGATCA
CGGATGAATCTTGTTTCCCAATCACCACCTGGTGCAGCAAAATCTATGGTCTGATTTTGC
TCTAGTGCGCATTTTGTGGAGTTTTCTCTCTCCATATTTTGCTCGAATTTGCCTGAATTT
GTCTCAGACTATTAAAACTCTGCCAATTCAAAAAAATGTATCATAAATACTGTAGAAGGG
CGCATCGCATCAGCATCACAGTATGAATTATTACCTCTGCCCCAGCGAGCAAAAGCAAGG
CAAGTAGGCAAAGGCACCCAGAAACAGTTCGGAAACCAGGAGACAGAGCATCTCTTTTTA
TGTAATACCAGTAATACCCTCCCCTGCTCTGCTTCATTCTAATCCAACCAACTCCTGTCA
CCGGTGGTACGTATAAACTAGCCCTATAAAACCATGGAGGCGCGCTTCCAGACGTTTCAA
CTCGACGTCAGACGAACATTCCATGGGGTCGTCTGATCCAAGCAGCACGTGCACGGCCTC
TTCCTCTCCTTCCACGTCGCCGCGGCTCACCGCCGGCGTCGTCAACTTCTTGGCACG