Map Locations of contig_2548167 (4268 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2548167

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37317 1 504 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_37317






Contig Sequence (4268 bp)

>contig_2548167 4268 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCCCCTCGTGCGCCCACGCGCCCCACGTCGTCGGGTCGGTCAGCTGGTACGTGACGCTG
CCATTCGCCTGCACCACCATGTTATACATGTCCAGTTCCATGGTTGGCTGTCCTCCTTGA
TCACACACAGCAAACTCTCTAACAGATTCAAAACTAGAAATTCATCGACATTATATGTAG
CTAGGCCATGGTTGTGGCAAAATGTAGAGGATGAGGGGGATGTTTTAGACTAAAAATTCT
GGGCAATATATATATGTAGCTAGCTAGGCCATGGTTGCGAAAGAATATTGAGGATGGGAT
GATTTATACCAAAATCTTGAGGAAATATATGTAGCTAGGCCATGGCTGTGAATGAATGCT
GAGGATACGGGGGATGATTAATTTGGTTCTACAAACCATGCATGGTTGCGGTGTATGGAG
ATGTGTGATCTGCGTGTGCCCGGCGTGGGCATATGTAGCTTTAGGGGTGTAGTGATTTGC
ATTCGATGAGTCGGCTATTTTGTCTCGTACCCATTTCTTTTTGTTGTAAAGATAATAAAG
ATATCTAGGTGTTTGGACATTGAGTCTCTAGAAAGACTCCATAACTAACAACTAGATTTT
GGACCCTTGCTCACCTTAGAAAGAAGACTTTGTGTGAGGTGCTAACATATCCATCTTGTT
TTGTGCTGGCAGGGAGGAGCTATTTGTCCGGTGCCAATGTGATAAGATGAGTTGTGCATA
CCGTGGGTGTTTATGTAGCCCTTGGTGTGGTAGGCCATCTCGAGGGAGGGCGTGCTTTGG
TGCCTACACGAGCCATATGGTCTAAACCCATAAATAACATCTTTCGGCTAGCAAGTCCAA
TAGTAACTCCCTCACCACCACCCCCCTCCCCAGAGATGAGCTCAAGGGTTGCAAAATGCG
CAAATGCATGTTGAGTACACCCTATATGTCGGATGCAAAAATCATCCACTTCCGCCTTTA
CTCCCGACAATTGAAACTTATTTGACGTCCTCTGCCATTGCTATTTGTTCGTATTGTTGG
GGATTGTGGGCACGATGACTACATCAAATCGTAAACGAAAAATATAGATGTCGGTTTGCG
CTACTCAGAATTCCACGCATAAAATACCGCCCCTCTCTTGCTCTCGCAGAGAAGCCTCCT
TGGCCATTGACACCAGCACCCGAAGAAAAATTGTGTATTATTGACCTATTAACTCACATG
TGAAATTTGAATGAAGAGTTTTGTGCTAAATTGGATTTGACCTCTTTCGACGGGAGGGGG
AGGGCTATACTTTCTCAATTAGAAGGTTGGCTATTAGTGCCAGCCCTTCCGAGACAAATA
TTTAATGTGTACGCTAACACGGATACACTGTATAGGTTGCTTCATGGAAATTCATGTCTG
AGGTTGTGGTGTAATGATTTGTTGGAGAATACATAATGTGGTTAATATGAATGGATATTG
TGTGGGGGCTATATACATATACTCGTCTAGTGGATTCCCCTCTCATCTCTCAATATATAA
ATGGGAGAAGATATGGCAGTGGGAACCTGGTGTTAGGCAGTGGCGCCGGAAGACACGATG
GAAGCGATGGCTCATTCCTATATGACTGCCCACTATGCTCCTTCCACGGTCGGAGGTATG
GTAGCAGCTAGTGAGGTGAGTGGCGGTGTAAGGAAGTGAAATGTCGGTTGGGCCTAGGAT
AATTTGGCAGTGCTCGATGGCAACGCGAGGTGGCGGGAGGGGCTGGCCCTAGGATGACGT
GGAACTCCTCGATGGTAGCGCGAGGAGGCGGGATAGGTTGGGCCTAGGAGGATGCGACAC
TCCTCAACGGCCCAGCCATACATCTGGATCCGATGTCTCAAAGCCTCTTCACACTGGCTG
CAACATATGTTGATTAATATGGTGCGGGAGACAGTTTTTGGTTCGCCAAGCAGAATGGGA
TTTTGTTCTTCCATTCGATTTCTCCCGGACTTTATAACATCAAGTAGTGGGCGGCGTTGT
GTATTGTTTTGGTTTATTTTCTTCATGTGGACGAGAGTTAAGCAAGCCGATTGGTATTTC
TCAAGGGACAAGTTTGGAACATCACCCAACTTGTTGATTTTATTGATAATTTGAGAGAGT
CTTTGTTGCATCAACCTTTCGTAAGACATGCCTTGAAACTTATATTAGCCCAATGAATTT
TGTGAGAAATATATACCAATAATTAACCAAATGTAATTGTTGTTCTGTTTGTGAAATGCA
CGAGTAATATCTTTGAAATTTTGAAGACAAAAAAGGAATGAAAAGCCAATAAACTTTGTT
CGGTTTTGGATAGTGAGGAGGGATGTGTGTGGAGATACATGTATGTGAACGTTATTTAGT
AAATGTATAAAATGACATTGAACTTTATGCAGAATGTATCTTACATTAGGAAATGTGAAT
GCAATATGTTGAATTCTATCAAAAAATATAATGCATTGGAAATGGATTAAATTGTAATTG
AATTGATAAAAAAATATATGGTAAATGCTCTAAAGCTTCTCTAAAATCAATCTAGAATGG
TTCTTTGGAATTGACCTAAAAGGTGTTTGAAATCTGAAATTTTAGGTTTTGCAAATTATT
CCTAAAATACGAGGAATCATGATTAACATGTGTTTTTGAAATCGAGTGAATATCTCCCGA
AATGACTTTGAAATCATGACTGGATCATGAATGCATAATGGCTTAAATGCGCTCAGATTT
TGAATTCGGGTAAAAATTGTGACTTCATAGAAAGAGTTAAAATGAGTTTAGAAAGTTTCT
TGAACAAATATTTTTTACTTCAATTTGTATGAATTTGAAATTAAATTCTATCTAGCTAGA
ATGCATTTGAAATGTTCAAATATTGGAAAAGCATGAAACTTTCATAAATGCATTTCTAAC
TTACCGTGGAGGGATTTCCATTGGGTCCTAACGTTGCTACAGAAGTGTGTGGATTTGTAG
TCATGGGGATGTCACGTCACGATATCATTAGGTGAATACATGTAAAAGGGGCATACACAA
TTTACCCAGGTTTAGCCCCCCAATGCGGGTAAAACCCCCGCTTTGTGCCTTCCACTTTAC
TACATATATATATGGGAGTACATAGGATTAGGCTAAAACTAGGAAAAAGCGGAGTCCATC
TCTATGGTACAAATAGGTGCGATTGTTACTAAATATTGTAGTGGTTTTCCTTATATGTTA
TCTGTTTGTATGGAAAGTCTCCTCGCCGGCCCATAAGAGATGGCATCAAGTGTTAGAAAA
TGCACAAGTATATATATACTCCCTCTGTACCTAAATAATTGTAGTTGGGGAGAATTAGTC
TAGTTCTTCCAAACTACAATTATTGAAGTACAGAGGGAGTAATTTGTAAGATCCGTAGGA
TTGATGAAATCCACCCTCTCCTCTCATTCTTTCAATTCCTAGATGACAAATACACACATA
TATATGTCAATTTGAACTAATCATAAATTTGTTTACAAAATACCACCCTTCTCATTTTGG
CTATTTCACGCCGATGAAATTGTGTTGGAACCCTGAATTTGATACCAACTGATGTTGGGA
AACTTCTAGTACCCGTGGACACTGTCCGTATTACCTTCTTGCTTGCTGTCACTTCCTGGA
TATCGGCGCCAACTCCCCAAGAAGACATTATGTATATTTGAATGAGGATTGTTGTGCTAA
ACAGAGCAATGCAATGTCGGTTCTAACCTCATAGGAGGGATGCTATAGTTTCTCAAATAG
AAGGTTGGTTATTAGTATAATCTCTTTTGAGAAATTCTATAACATTTTTGCCAACACAAA
TTCATAATAGGTTTCTTTATTGACATTCATGCATGAGATTGTTGTATAATGAAATGTAAG
GAACCAGACAAAGTGGTTAAGAGGGATACACAATGCATGGGGCCCATACAAATAAAACAC
ATAAACTGGAGAAGAGACAATGGTGTGAGCATACTGTTGGGTTGTGGCAGCGGAGGACAC
ACTAGCAACTATTGTTCTTTCCTTTGTGAGTTCCACTATATTATTTGCATGATTTGGGTG
TAGTAACATGCCAAAAAGTGAAGTGGCAGCACGAGGGGCAAGAAGGGCTGGTTGTGGGAG
AATGTAGTGCTCCTCAACGACCCAATCATAGCATCTAGAGCATGTGCCCCAAAGCCTCCT
CGTTGTAGGGAACAACATAACCCGGTGCGGATTATGCTTAAGATGGCTTTGTGGTTGGCC
AAGTGGTGTGGTTGTTTTCCTTGTGAAAGTGCGTTATATCGACTAGAGGGGCTGAATAGG
AGATTTTT