| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_2548144
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_37307 |
3 |
1168 bp |
AK249053.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_37307
Contig Sequence (3116 bp)
>contig_2548144 3116 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCAGTGCTAGAAGCTCCCACACCAGCAGGGTGGGGGTCTGGGGAAGGAGTATACGAGGC
AAGCCTTGCCCCTGCACATTTCAAGACTCTAACTAATAAATAGAAATTTAAATGCCGTCC
ACGTCCTTGGGGACAAAATTGGACTTTTCTTGAAACACAACAAATCTTAACAAACTGTAA
GAGATGGCAGGTCACTCTAGGTCACTTCCCATTGACAAGCCTTGGTCTCCGAAAGCAGAA
TGCTCAAACATAGATCATGTAAACGAGGTCAGAGCAACAACTGAAATATGACGAGTACAA
TTCAATACTGCTATTGTGTTCAATAAACAATAACCAACACTACCGAAAAAAAGCAGAGAG
GCCAGGCTCATTGCTTTTGCTGAACTTTTTTGCTAACCACTTCTGTCTTCCTCTTCTATA
TTGACTGCAACCCACCCTCGCTAGCCTGCCTTGTGAACAAGCAGATTCCTACCTCTTTCC
TCTTCTGTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTGACGAACATGCTGTATGAAATA
AACTATGCATATATACAGCTAATAGCCCCAAAAAGGTGGCACATGATCGAGCCGTGGCCG
ACTTTCGGGAGAATCTGGGGAAAGAAAGCTACTCTAACAAGCTTTCCGCCGTTGATGCGC
CGCCCAGGGACCAAAATTCCCCGCGGCTAAATCAAGAAACGAACCTGCTTGAGGAGCGCG
ACCGATCTCTGGGTGTCGGGGTCCGCCAGGCTGATGCAATTCAGTCTCGTCCTCGATGTC
GAGCTCTCCATGCCGCCGCCGCCGCCGCGCTTTCCCCGCCCCCACCGCTTAATTAATCCC
CTGCCTGCAGCTGGTGATGTGATCGGCCGCTAGCGTAGACTGGGCGCGACTCCCTCCTTT
GTTTGGATGCGCCCAGGGTCAGAGGTGGCTGGCTCGGTGGGTCGCCGAATTGGCGCCGGC
GGGGCGATTTATAGGGCGGAGGCTGGAGGTTGGTGGAATTTGGAAGAAGGTTTGCCAGGG
CAAAAAAAGCGAGGCCACCTTTCTCTTGGTGGCTGCGGAGGGCCAAGAAAAAAACAATGC
GATTCCTTTTGTATGGACAACTATTTGTTTTTCATTTGAGCACTTTATATGCTTTTGCTG
ATGCTGATGCTGATGCTGATGCTGACTCATTGATGTCATCCGAATCTAATCGCCTCGTCG
AGTGGACGGATGGGTCGCGTTTGATGGAAGGGAATTTTCCCTGGTCTTTCCTTCGCTCGA
TCGAAGAGGACGGGTCAAAGAGAATCACAAAAGAGTCGGCAATCATCTTCGTGTTCGCCT
TGACAATATTCACATCTGAATTTGTCCTTTTGGTTTCTCAATGTATATTTACATTTTTTT
TTCCAGAATTTTGGAAACAATTAAAATTGATTGAAGCATAGGGAGCATATCAAGGATGGA
AACACCTGATATTTTCCATGTACGCTCATTTTCTATAAACATGAAGCATCTCAAGGATGG
GAACACTTGATATTTTTCATGTACACTCATTTTTTATAAACGCATACACGCACATTCTAT
TGTATAAGATATTTGAGCGGCCAAGTCGATATATTATCTTAAAATTAACGAATTCAGTAC
ATACGCCGTTGTAGTTAACGGAAACGTCTTCTCTCGCTGAATGCACATTACCGGAAGGAC
CAGAATAAATTCAGTTAATTGCATGGAGGTATCAAAAATGGGACAATACGTGTAGATTGG
TACCAATACTTGTAATCTTCATATGTCAGTACCAACTTTGGGACAGCCTGTTGCAAAAAA
CGCTAAACTCGTTGTTTATATGTATTGACGCCCTTTTTGACCGATTAGGCCCGGCAGTCA
GGTGCCACGCTGGCGTATCGGCGCGTGCCCTCGCACTGACGAGGACGAGTCCGGCCCGGT
CACTCTTAGCCAGGTTCGGTCGAACCGTTTCGTCTAGCCCCCTCGCACCCGCACCTCTCC
CCTCAAACCTTATCTCTCCCGATAGGCAATGGCGTCCGCGACTCCGACACGTGACGGCCA
TGGCGTCAGCGACTGTGGCACACTGCGGCGACGAAGACCTCCCGCTTCGGTTATGGTGCA
TCAGGGGGAATCGACGGCGGTGGCGACGATGACGACTCCAACTCTGTGTACACGACCGAC
GACGACGATTTTTCGAAGCCGGCGCTGTCGACGAGCAGCGGTTGCGGATGGCGAACCCTA
GCTGCAGCCAAGATTGGACACATGGAATCGGCGTGTACTGTAAGTGTTCCTAATCTTCCC
CTCTTTTCTGATTTTAAATAGGGGATTAGGGTTTGTCATTCCAATTAGGCTTTCGAAATT
ATGTTTTGTGATCCTAAATTGTGCATTAGGCCTAGGGCTGATTAACTAATTTTTTACTAA
CTAGGTTAACTAAAATTAGGTTTATTGAAATTATTAACAAAATTTCTTAACTATGAACAT
ACTTATAGTTAAATGAAATTGTTTAGTGTGAACATAATTTTAAAATTTAATGCTTGTGTT
CTGTCAAGCCATAATGTGAGTTAGGGTACTCAATACTAGCATTTTCCTTTGTTTTGCATA
TGGTATTATTACCTAAAATTGTGTAGTAGGCCAACCTTTAAATTCTTTAATTTTCTGTGA
TACTAAACTTTGATATTTCTTGGGTTTCTAGTTTAAATGAAGACATTTGGGAGGTTAGGA
TCCATTTTGATGCTCAAGAAGCTTTGGTTAGGAAGCTCAACACTTCAGATGTTACTTATC
TTAACATAGTTGCACTGATGCAAACAAAGGGATTTAATGTATATGATTTACTGTATAACA
TTGAGAACCTAGGTTTAGGAGAGCAAGGATCAAAATTGCTATAGAGTAATGTTGAATTAC
AATTGATAAAGAGGCAGAATAAGAATACTTTGATGCTCAATTTGCTAGTTAGGGCATGTC
CACCCCGTGTTAGTGAATTTGAGAGGCAAGAACTTCATAAACCAAACTTGTCCCCAATGT
CGTCGTTTTCTCACGACAGATGCCATGGATAGGCTTATCGAGAGTGGTTGGGACCGAAGG
GACACCGACGGGCTTCGAGAACGGGATTGGTAACTAGCGATGCAAGATGCACGATG