Map Locations of contig_2548144 (3116 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2548144

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37307 3 1168 bp AK249053.1 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_37307






Contig Sequence (3116 bp)

>contig_2548144 3116 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCAGTGCTAGAAGCTCCCACACCAGCAGGGTGGGGGTCTGGGGAAGGAGTATACGAGGC
AAGCCTTGCCCCTGCACATTTCAAGACTCTAACTAATAAATAGAAATTTAAATGCCGTCC
ACGTCCTTGGGGACAAAATTGGACTTTTCTTGAAACACAACAAATCTTAACAAACTGTAA
GAGATGGCAGGTCACTCTAGGTCACTTCCCATTGACAAGCCTTGGTCTCCGAAAGCAGAA
TGCTCAAACATAGATCATGTAAACGAGGTCAGAGCAACAACTGAAATATGACGAGTACAA
TTCAATACTGCTATTGTGTTCAATAAACAATAACCAACACTACCGAAAAAAAGCAGAGAG
GCCAGGCTCATTGCTTTTGCTGAACTTTTTTGCTAACCACTTCTGTCTTCCTCTTCTATA
TTGACTGCAACCCACCCTCGCTAGCCTGCCTTGTGAACAAGCAGATTCCTACCTCTTTCC
TCTTCTGTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTGACGAACATGCTGTATGAAATA
AACTATGCATATATACAGCTAATAGCCCCAAAAAGGTGGCACATGATCGAGCCGTGGCCG
ACTTTCGGGAGAATCTGGGGAAAGAAAGCTACTCTAACAAGCTTTCCGCCGTTGATGCGC
CGCCCAGGGACCAAAATTCCCCGCGGCTAAATCAAGAAACGAACCTGCTTGAGGAGCGCG
ACCGATCTCTGGGTGTCGGGGTCCGCCAGGCTGATGCAATTCAGTCTCGTCCTCGATGTC
GAGCTCTCCATGCCGCCGCCGCCGCCGCGCTTTCCCCGCCCCCACCGCTTAATTAATCCC
CTGCCTGCAGCTGGTGATGTGATCGGCCGCTAGCGTAGACTGGGCGCGACTCCCTCCTTT
GTTTGGATGCGCCCAGGGTCAGAGGTGGCTGGCTCGGTGGGTCGCCGAATTGGCGCCGGC
GGGGCGATTTATAGGGCGGAGGCTGGAGGTTGGTGGAATTTGGAAGAAGGTTTGCCAGGG
CAAAAAAAGCGAGGCCACCTTTCTCTTGGTGGCTGCGGAGGGCCAAGAAAAAAACAATGC
GATTCCTTTTGTATGGACAACTATTTGTTTTTCATTTGAGCACTTTATATGCTTTTGCTG
ATGCTGATGCTGATGCTGATGCTGACTCATTGATGTCATCCGAATCTAATCGCCTCGTCG
AGTGGACGGATGGGTCGCGTTTGATGGAAGGGAATTTTCCCTGGTCTTTCCTTCGCTCGA
TCGAAGAGGACGGGTCAAAGAGAATCACAAAAGAGTCGGCAATCATCTTCGTGTTCGCCT
TGACAATATTCACATCTGAATTTGTCCTTTTGGTTTCTCAATGTATATTTACATTTTTTT
TTCCAGAATTTTGGAAACAATTAAAATTGATTGAAGCATAGGGAGCATATCAAGGATGGA
AACACCTGATATTTTCCATGTACGCTCATTTTCTATAAACATGAAGCATCTCAAGGATGG
GAACACTTGATATTTTTCATGTACACTCATTTTTTATAAACGCATACACGCACATTCTAT
TGTATAAGATATTTGAGCGGCCAAGTCGATATATTATCTTAAAATTAACGAATTCAGTAC
ATACGCCGTTGTAGTTAACGGAAACGTCTTCTCTCGCTGAATGCACATTACCGGAAGGAC
CAGAATAAATTCAGTTAATTGCATGGAGGTATCAAAAATGGGACAATACGTGTAGATTGG
TACCAATACTTGTAATCTTCATATGTCAGTACCAACTTTGGGACAGCCTGTTGCAAAAAA
CGCTAAACTCGTTGTTTATATGTATTGACGCCCTTTTTGACCGATTAGGCCCGGCAGTCA
GGTGCCACGCTGGCGTATCGGCGCGTGCCCTCGCACTGACGAGGACGAGTCCGGCCCGGT
CACTCTTAGCCAGGTTCGGTCGAACCGTTTCGTCTAGCCCCCTCGCACCCGCACCTCTCC
CCTCAAACCTTATCTCTCCCGATAGGCAATGGCGTCCGCGACTCCGACACGTGACGGCCA
TGGCGTCAGCGACTGTGGCACACTGCGGCGACGAAGACCTCCCGCTTCGGTTATGGTGCA
TCAGGGGGAATCGACGGCGGTGGCGACGATGACGACTCCAACTCTGTGTACACGACCGAC
GACGACGATTTTTCGAAGCCGGCGCTGTCGACGAGCAGCGGTTGCGGATGGCGAACCCTA
GCTGCAGCCAAGATTGGACACATGGAATCGGCGTGTACTGTAAGTGTTCCTAATCTTCCC
CTCTTTTCTGATTTTAAATAGGGGATTAGGGTTTGTCATTCCAATTAGGCTTTCGAAATT
ATGTTTTGTGATCCTAAATTGTGCATTAGGCCTAGGGCTGATTAACTAATTTTTTACTAA
CTAGGTTAACTAAAATTAGGTTTATTGAAATTATTAACAAAATTTCTTAACTATGAACAT
ACTTATAGTTAAATGAAATTGTTTAGTGTGAACATAATTTTAAAATTTAATGCTTGTGTT
CTGTCAAGCCATAATGTGAGTTAGGGTACTCAATACTAGCATTTTCCTTTGTTTTGCATA
TGGTATTATTACCTAAAATTGTGTAGTAGGCCAACCTTTAAATTCTTTAATTTTCTGTGA
TACTAAACTTTGATATTTCTTGGGTTTCTAGTTTAAATGAAGACATTTGGGAGGTTAGGA
TCCATTTTGATGCTCAAGAAGCTTTGGTTAGGAAGCTCAACACTTCAGATGTTACTTATC
TTAACATAGTTGCACTGATGCAAACAAAGGGATTTAATGTATATGATTTACTGTATAACA
TTGAGAACCTAGGTTTAGGAGAGCAAGGATCAAAATTGCTATAGAGTAATGTTGAATTAC
AATTGATAAAGAGGCAGAATAAGAATACTTTGATGCTCAATTTGCTAGTTAGGGCATGTC
CACCCCGTGTTAGTGAATTTGAGAGGCAAGAACTTCATAAACCAAACTTGTCCCCAATGT
CGTCGTTTTCTCACGACAGATGCCATGGATAGGCTTATCGAGAGTGGTTGGGACCGAAGG
GACACCGACGGGCTTCGAGAACGGGATTGGTAACTAGCGATGCAAGATGCACGATG