Map Locations of contig_2548102 (4671 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2548102

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37279 5 1334 bp AK368039 Available Available None
MLOC_37280 1 510 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_37279






CDS Structure of MLOC_37280






Contig Sequence (4671 bp)

>contig_2548102 4671 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCCCAAATGCCTTTCTAATACGCCGAACCCTTTACATTCAAGCACT
CTGTTTTTCTTGCTCAGTCCTTCGACTTTACTTTGTGCACAGTGCTATGTCTACTTGATG
TAGTTGTGGATTTGCCCTTGTTATTTCAGGTGCTGAATAAACCTCACATGATGAAAGTAC
GCGTCGTACGGTCAGAGACCGCCATGACAGATGTTATTCGGGAAGTGAGTAACAAGAGTA
TTTGTCTGTATAACACTTGTGAATTTGCGATTTTTTATGGTATGTGCAAAGTTCTCACGG
AAAATAGTCATGTGGGCTTGGAAGATATTAAGTTATTAACCCTATACATAACCTATCGCA
CATAAGTAAACCAAGCTGGTCATGCCCACTGATCACGCTCTGTTTAGCACATCTCAATAA
AAAACTCAAAATTGCTTGGTTTTCAGATATTGCTTTCTCTATGGACACCCATTATCACCA
CTTCATAGCATATGGAGAATGTGTCTGTCGTAGATCAAGAATGCATTTATCTGATAATTA
AGTTAACAATGACATATATGTGCAGTGCAGTTTTTACTGTGGGAGCAGTCGAGAACATCA
CTAATCCATTGCCCTGGCTACTGACAAGCACTTAGATGCCGCATTCTAAGTGCAATAGAA
TTGTTTTAGCATAATGCTTATTACGGAACACATGCATCTTTTGTTTATTTCGTAACTACA
TGTTCCTATTTTTCTTCACTTCAATTTCCATTGGCTGTATGATATTCATTGTGGAAGCTG
CATTCTAGCAAATTTTCCTTTAGGTGCTCCAAAGTATTAATAGATGGCCATTACCTCTAT
ATAGGTGCTCTGAAGATTCAATCATCTTTTTTGTTGCAGAAGCATGTGATTAGTAGCACT
AGCCAAATAGCATAAACTTGCATATACAATAATTTTACATGCGATAAAATGTGTTATTCA
GTTTCCGCTTTATTGCATTGGTAACAGGTATCCCTCATGAAAATGTTGAGTCATCCCAAT
ATCGTAAATCTCATTGAGGTGATTGATGATCCAAACTCAGATAAATTCTACATGGGTATT
TATTGACGCTCTCATTGTTTCGCTTTATTGTTCCAATAGGACGTTATTTTAGCAGGCTAG
TTGGCATATGTTAATATTTTATATGATTGCAATTTAGTCTTTTACCTTTTTATTGCCAGT
TCTTGAGTATGTGGAAGGAAAAATTGTGTGGGATAAAGGTTTAGGAGAAGCTACTTGCAG
AAAGTATTTGCGGGACATTATTTCTGGTGTTATATATCTTCACTCTCATGTAAGATTCGG
TTCTCTTAATTCTTGTCACTAATAACTGGTTCATGATGGTGAATTGTGTGCTAAAATAAT
TTAGTGTCTGTCATTACTCATTAGCATAACAATTTCAAAAAAGATATTTGAGGAGCTCTA
AATTTGCACGACAACACACAATTGTGTGAAGTAGATCAGCAAGATCACATACTTGAGCTT
CTTACGCCATGTTTGCTTTGGCTACTTATTGAGTTTTTCTGCCCTTGAGCCACCTGATTG
TACTGACAAACAGTAATGGCTTTGGTTTGTAAATCCATGCTCACCTCATGTTTTAGTAAG
GATCATAGGTTGTTCCAAAATGTTAGCATAACAAGAAATTTTAGTAAGGATCATAAGTAG
TTGCTTATTGATGTTTCTGGTTCCCCTATTTTCTCATATTTACATGTGCTTGCTATTCAT
GTCGTACATATTATTCATTTTTCACTGTGTTATATTGTTCCAGCTTGATAGAAACACCTA
ATTTCTTGTTTTTATACACAGAACATTATTCATAGTGATATCAAACCGGATAATCTCTTG
GTCACAAGTACCGGCAATGTGAAGATAGGGGACTTCAGTGTTAGCCAGATTTTCGAGGTG
GTTTATTTATCTTGTAATTTTTTGTATTCCAGTAATTTTGTTCTCACTGCCAGGTCAAAG
GTTATTTTAGTTGAATGAGCCCAAAATGGGGCAAGGCCTAGTGTTATTTTTTTGTTGCCC
TGTTCTAAAAAAGTACTACCTCCGTCTCAAAATATAAGACGTTTTTGTAGGCTAGTATAA
TACTGAGATTCAAAGTTTGTACCTTATAAAGCCAGGATTGCATACTTGAATAATATCTTC
ACTTCCTGCCTTCATGAGAATTTTGAAGATTACTCGACTAGGCATGAACTCTGATGATTC
AGTGTTTGACGCTACTTTACTGGGCCCACAGTTTTTTATAGAGGGCCTGTTACGTATTAT
ATTTCATTATCTTCAACCAAACAATATGCATGCCTAAAAATGTATGTGTTTTGAGGCAAA
TTTCTCAGGATTGTCGAGCCTCGCAGCACAGTGCTTTACTGATATTCCGTGCTTGACATT
GCAGGATGACGATGATATGCTTCGGAGATCTCCAGGCACTCCTGTTTTCACTGCACCCGA
GTGCTGTCAAGGTACAGTTACATGACTTCGATTTGTTTGTAAAAGCAGCATGCATAATCA
GCCAATTACCAAACTATCTACAGTATAACAGTCCGTGTTATTTTTTAATATTGGGTAGCA
TGGCACTTTAGATGTTCCACACCTAAATGATCGCACAAGTACAGATAAACAAACCCATAG
AAATGAAGCCACCACTAATAGTGTGCACTTGGATTCAGATTATGGTGCAACTGAAGCAAC
CACAGCTTGGGTTACGAGTGTGATGCCAAATGAATAAAAAATAAAAATGCAACAACTCTG
GTTCCTTTGTCATTGCTTCAAAGTACCAGATATTCCTTGACCATTGGTAGCAGCTGCTAA
ATATGATGAACCATTTTCTGTCTGTTCCGCTGCAGGTTCAGCTTACCATGGTAGATCGGC
TGATACATGGGCAGTCGGTGTTACTCTGTATTGTATGATTACTGGGTGTTATCCATTTCT
AGGAGAAACTTTGCAGGAAACATACGACAAGGTGCAAACATATATTCCTTCTTTCTCCTC
TTGATTTACCTACATGTTGCGTAAAACTCACCAAAGTCACTGCTGTCGAACAGATTGTCA
ATGATGCAGCGGATATACCTAGTGCCGTGAGCCCCCAACTTGTTGATTTGCTGGAAAGGC
TTCTCTGCAAAGGTTTCCCATTCATCCTATTGGTTTCCCCGTCTTCATCCTATTGGTTTT
GATATATTGGAGGATGTGCTCTATTAAAGGCGTTCCTTGTATTGATGCTGATTGTTTTGT
TGCAGATCCAGGAGACCGTATCACCCTGGAAGCTGCGGCTGCGCATCCTTGGGTTGCAGG
GGACGAGGGGCCAGTCCCCGAATACATGTGTAGATGTGGCTTTGGCCGCAGGAACAGAAA
TGGTTCACAAGCAGCAGTACAATAACAAAGAGCCGTTCTAGACCGATTGTTGGGTGGTGT
AGCGTAGTGTAGATAACTGATCAAAGCGAAAACAGGCGAGCCGGACGACGAGTGATGTGT
TTCTCTCTTTTCCTCTTTTTCTTGTTGAGTTGGTTTGGTGGCTTGGTGCTCGGCTGAATT
TTTTGGGTACATAAATAGAGTGCAATCTGGTTCCCCCTCTCAGTTCCTTCTTTCTATATG
TACGTACGATAAACATCATTGCAAAGCTTACATGCCTCATATGTTGTTGTGTGTATGTTA
CATGTGCAGTTTCTTGATTTCGGTATGGTGAACATTCAGAAGAGAGCAGCACATTGCATC
TTCCTTTGTGAAGGTGCTATGTTTTCATTTGGTGTGCAGATGGTGGCTATCATCCACGAG
GTTAGGAGGATACTATTTTTTATGTAATGTGACCTGGATGGCCAAAGGTTATGACATGTA
CAAGGTGGTGTAAAATCCATTCTGTAAAAACAAATCTCTCTTTGCCCTGAAGTCTGGGCA
TGGCTCGCGCGGACAAGCCATGGAGAAGGCAGAAAATCATGCTATACAATTACGCCGAGT
TCTCAATCATAATTGCAGTGACTGCAGAAATTGATTGACAGGCAAATGCCAAGTTCCGAC
AACAAGTGAAAATTGCGTGTGGTTTAACAGGGGGAATTCAGTAGTGTAACCACCCTTGAA
GCATCTCTAGTCCTTCCCTAAAAAAACTTGAACTTCCTAAATTTTCTGGTTTTGAGGAGT
TATTTTGGTGTTCGGTTAGAATGGAACAAGGTAGGATGGAATGGTTCTTAGGAGAAGAAC
GGATCCCTCTCTCCCCGCGGCGCACACAAACCAAGCGGCGGCGGCGCATGCGGATGAGCA
GCGACGGCGGACGAGCAGCTGCAGCGAACGAGGAGACGCAGCCGGTTTCGTGTGGTCCGC
TCGATTTGAAGAGACCGCGCGGAACGACATATTGAAGGAACATGTCGTTCCGTGGAATCA
ACTGGTTTCGGTTCCTCTATCAATCTAAGCACGTCAATGGGCCTTTGGGACGTAACCGAC
CCGTCCCGTTTCACTTGGTTCCACCAACTGAACACACCCTAAGAGCATCTCCAATCGCAA
TGCATGCCCCCCCCCCTCATTTGTCCACAGGCATCACACATGTTAGAGCATATTTCTCCG
TACGTGGTTTCGATAATTGATGACAATCCCTATGGACTAATAGTTGCCTTAAGTTATATT
CGAAGAATTTGTCCATAGACACTTCTTAAAGTCTATCTGTTGGTTTCAAGG