Map Locations of contig_2547977 (9450 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2547977

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37207 1 1120 bp MLOC_37207.1 Available Available LOC_Os12g34890.1, FRAME:+2, EVALUE:9e-57, 13112.m03562 protein acyl carrier protein, putative, expressed
MLOC_37208 3 1078 bp MLOC_37208.2 Available Available LOC_Os12g34880.1, FRAME:+1, EVALUE:6e-58, 13112.m03561 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_37207






CDS Structure of MLOC_37208






Contig Sequence (9450 bp)

>contig_2547977 9450 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GTGGATTGAAGTCTCCATGAATGTGGACATACGATAGCACCACCTATCGGAACCACGCCA
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GATGAGGGCGCCATCACATGGGTTGGCAAACTCGTTGTGTGAGAATTGTAGCCATGTCTA
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GGTTAAAATAGGCGATAATTGTTAACAAGGACAGTAAAGAAAGCATTAAATATGGTCAAG
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CGAGGAAGAGTTCAACATCACTGTTGATGAAACAAGCGCGCAGGACATTGCAACCGTGCA
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TGTACTATTGTTATAGAAAAGCTAATGGATCTATGAAGATTGAAGAGTCGTTGCAGTTTT
TATCTTTTTGCATATCTGAGAAGTTATACAGCTGTGAATATATTATTTCTTTTCTTTCAT
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TCTCAGAACAACACACACACACACCACGCCTCACCTCTCCAGAAAAGGAGACATAGAAGA
AGAAAGAGAAAAAAGAAGAAGAAAAATGGCATCTTCTACCTCATCCTCCGCCCTTCTCCT
CCTTCCTGGCCTCGCTTCTGTTTCTCCCTCGAAGGCGCGAGTTTTCTTCGCTTCCCCCAT
CAGCCCCTCCTCCCCACTCTCGACCTCCACCTGCATCAACGCCTCCTCTCCACGGCGGTC
CTTGCCCCCTGCTCCTCGCGCCGCCGCCGGCGGCGGTGACAAGGACAACCGCGTGCAGGA
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TTCCACCTCCGCCATCTCATTTAATCTTGTAGCAGCACCTTCCTGGTGATTGTGTTGTTT
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AAAATGTCCTACGCACATGCAATACCTATC