| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
| No map location |  |
 |
Predicted Genes from contig_2547923
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_37182 |
1 |
1282 bp |
AK369248 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_37182
Contig Sequence (5813 bp)
>contig_2547923 5813 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGACGTTCCCCAACAGCTAGATGGGAGGCTCAAAATTTGTGTTGTCTTCTCATACTAGG
TAGTTATGGATTATGAATTATGGCTCCAGTTTTCAGATAAACACGTGTTTGCATTGTTCA
GTGAGTTACACTCTACAAGTTGTTTTTGCTGTCTACTGCCCGACCAAATGATTCAGTGAG
TTAGGAGTTGTAGTGGACATGAAAGATTGATCATTCAGAACTACATATGATTTTTCACTG
ATTTTGTGATTTGTCTTCTCAAATTCTGATGTACAAACGATTCGAGATGTGGAGCTTAAG
TTTTGGATCGTATCAGGATGCAGATAATTGGAATCAATGAGCAAAGTTGTGTGACATTAT
GTTTTTCTAACTACTACAAGTCTGAAAATATACCTATTATGTTTACTGTGGATATACTCG
TAATGATAATACACACACACACACACAATTACTTTGCTTTAAAAACTACCTATTTAGGAA
GTCATGTACTAACAACCGTTCCATAAAAATGCAGGGACACCAGAGTTTATGGCATTAGAA
TTCTTCACTGGCAATCGTAACAAGTTTTTTTCTTAGAAAAGGGGCAATTATAACGAGTTG
TTGTGCATATATTTGTTTGGAATGTGCATGCCCAAAATGAAAAGTGAACCTCTGACCTGA
GATTTTCTTTGTCTTCCTACCAATTTCTTTTCTGTTGCTTGACTTCATGGTTAGAAAAAT
GACGAAGAAGATTTGGACCTTGCTGAATGCTTGGAACATCACCTTTCCAAACCATCCTTG
CTGCTGATGCCAAGAGAATTCCTGCAAGAGACTGGAACTATGTTTCTCCACAGTTCTCCA
TTTGAACATTTCTATGATTTGGGTAGCAATTTTTGATCTTTTCCTATGAGAGAGAACAAA
CATGACTCCAAGCACACCGAAGCTATTATTCTGAGGTTTTCAATGCTGATATTGATGGGC
TATCTTCCATCTATTAGAGATATGTTTTTCTTGTTGATGTTGCATTTGAATTGTTTGTGT
AGAGTTGAAGTTGTAAGAAGCCCAAGTGTCACATAATTCTAAAGACATATGGACTATCTC
CAACATCTTGAGCTTATGAAGAGATGGATACACAATTTGAGCTTTGTTCTAGCAAATTTG
TGCTGATGTCTAGTAATAGAATACATTTCCTATTGCGTAAGAGAAAGAGAGGAAGTAAAA
AAAAGGATAAGCCACAGTCTAGCCTAGAATCCCCGAAGGACTTGCAAGGTATTTGTCGCC
GGTCAACCTATCATTAATCCAGCGGTTAGTCGCTTGAACAATGCCATTCACTCGGAATGA
GTTTTGATTAAAAATCTGTGAATTATCATGCATGGAACATGTATATTTTGTAAACATTTT
CATTGTATTGTATTATGTAAAAGCGGCAAAGTAGTGTTCTTGTCATTGTCGTGGTAAAAC
ATACATATGATGTATGGCTGTGAAGTTGAATGAATTCTCAATGGTGAGTTTAAGACTTAT
AAGAAGTTCATATTTTGTTGTGTGTGTTTTGATTAAAATGTTAAAATTTGGCCTACCTCA
AATTGTCATATTGTGGACTCAGGGATATATGACCACCTCAATTTTGGAATACCACTAGTT
AGCCATTATCCGATATAGCTGTTAACCGGAATCTAGAGCTTCTCATTTATCTATTTTTAC
ATGTTCTCCAAAAACATATAACTTACATGACACAATTTCGATGCTACTTGTAAGTTGTAA
TGCCACATTTTTTGATGATTTGTGAAAGGACGATGGTGACAGGTAAGCGGGGGTACACTG
ACCAACGGAGAATGCAGCTATGGTAGGATGGGCTGAAGTCGCGCTGCTACGGGAGGGGAT
GAGGGCGGAGAGCGGGGCGATTTGTGCATGACTCCTCATTGGTGGTCCGTGGGGAAGTAC
GGTGTGCAGGATCTGATATTATAGGATAGGGCTCCAACAAGAAAAGTCCGGATTGTCGAG
CCTGTTGAATTTTAGGGAGCTTACTAGGCACGGGTTTGATATTCGAACATGTCGAGGCAT
ACGAGGAAGAAATGAGTTTTGACTTTGAAGATGACCTTAATTATTTATTTAATTTATTTA
TATACATTACAGCCCGTAGCAAAGCATTCTACTAGTTGAAGTTAGGATATCAAAATGACT
CAAGTTTAAGGACCATGAGTGAATTTTTCTCAAAATAAAAAATAAAAATCAAGGCGGATT
TGGCTCGGTCGGTTTATGCCTTTCCACCCTGCCCTTCTTCCCTTTTCCACTTCCCTCCCA
ACCCGCCCTTCTTCCCTTTTCCATTTCCCTCCCACACACGGACGTAGAATCCCGAATTCT
CTAGGGTTTGCTCTCCCCGCACCACCACATTCCCGTCTCATCCCTCCCGAATGGCGGAGA
CGTTGGCCTCCACGCGCCGCCCGGTAACCCTTCTCCCTCCACGCGGTCGCTGAGCAGCTG
GATCCCGCTAATTTTGGCCAGTATTTCTGATTTTATTTCGTGCGTGCGTTTGCAGAAGCG
TGGCCGCCCGCCGCGGCCGAGGGAGAGCGACTTCGTGACCGGCGAAGAGTTTGAGGACGA
GGAGGAGGGGGAGGACCACGCAGAGGCGGCCGATGGGCTCGCGCCACCCCGGTCTAAGCG
CAAGCGCGAGGCGTCCGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTCGAGGATTTGACCCTCATCGGTGA
GGGGCATGTCGCATTTTAAGCCGTTCTGGTTGGAGTGGGTTTGATGGGCGCCGCGTCTGG
GATTCTGGGAGCCTGGTGCTAGGGTTTAGCCCTTCCACATTATGGAAGTCTAGCTTTCCT
GCTGATGTGATTTTAGTCGGGATTTATGGCGCCATACATCACAATGATAGATTAACCCTG
GGGTGTTTCTGCACGGGTCCGCTTGGCGGGGTGGGGTGGGGATAGTTGGTTTCGAGGATT
TTTCTTACATATGTGTCAGCTGAAAATTGTGAATTCGTGTCTTTTTGATCCCAATGGAAC
TTTGGTCATCTATGAACTATCACAATTCACAATCCGGTTATTTGCCTCCAGTGGCGGTAT
TAGAAACTGTCGAGAAGCCGAGAACTGATAAGTGGCATGGATATGTAATATGTTACGTGT
AAGGACACATGGTAGGAATAATGATAGTAACACTTTCATGAACTCCATGGGATTTATGAT
TTACAAAGACTTTGGTGACCTTGTCCAGGAATATTTGACTCTAGACCATCATAACAGGAA
TGCGTCATCTCATACAAATCAATCTAGTTTTATTGATAGTTATTAATTAGATCTGCAAAA
TGCATGATCGTCCTCAATATGCATGACCCTTGCTTATTTCCACAGTTTACTCAACATGAT
GCCAGTGGCCTGTAGGAACAACAAGGCTTCATGTTAATTTAAGAAAATACGCCGACATGT
TCCTAGATTTAAAGCTTTACTTCAGTGTAACAAACAATATTCCATCTTTCATCTCCGTTC
GGTTTCTTTACAAACTCGCAACTTGCAGACATAGTCAAACATAATGGCAGGCTAATCAGC
CATGCTGCCAAAAGATTGGTCGAGGATTATGAATCAAACCCAAAGTCAGTGCTATTTCAG
ATATTAACAATGTTATTTGAGGTAACACTAACTTGATACGCTACTTTTTGTTCTGTTTAA
ATTATTGGTGCAACGTTATTTCATTAATCTGCAAATTTACAATGACAGGCCTGTGGCGCC
AGACATGATATATATGCAAGCGACCTTCATGAGGCAGCTGTGGATGACATTGTATTCAAA
CTAGCTGAACTAGCAAGAAAAGTATCCTATTGCGAGATTTTGGAAGAAGAATCACCATCT
TTAGCCATTTCAATTATCCAATGCACATAATCTATTTATCTATCCTATATTGTTCTGGCG
TTGTGCATATATGCTCTCTTCTGTTTGAGTTTTGTCAATCTTAACTTGAGAACAGGGTCT
GGTGGATGATAATTATAGCTCAAAAAGGAAGGACCTGAAGAACTTCAAAGAAAATCTCGT
TACTTTTTGGGATAGTTTGGTCCTTGAGTGTCAGAATGGTCCGTTATTTGATGATAACTT
ATTCACGACAATCAAGGATTACGTGGTTGCTATATCATGGTAATTAGGTCTCACCAGTCG
CCATCCTTATTTTTTCCTTAGTCTTGTATATGTGTATGTAAGGTACTAATTTGTTGTGCT
TCAGTACTCCCCCAAGGGTTTATCGTCAAGTAGCTTCATTGGTCGGGCTCCAGCTTGTGA
CATCCTTCATATCTGTCGCTAAGACTCTCAGTGGACAGCGTGAGACCACCCAAAGGCAGT
TGAATGCAGAGAAGAAGAAGAAGAGTGATGGACCAGCTGTTGAATCTCTCAACAAAAGGC
TATCTATTACTCATGAAAATATTACATATTTGGAGGAATCAATGCGTAAAATATTCAGCG
GGTGAGGCTTTCTATTAGAGACCACTTACCCAGACTTTTATTGTTTACTTAATTAAGTCT
TCTAATCTTTCTTATGTGATAGTATATTCATCGGTATCCAGAATCTTGCATGTGTCATGC
AATCTATACTTATCTTGGTCTAGCAGGCAACTAAACACTATTATTTTGCCACATGTAGGT
TATTCATGCACCGTTATCGGGATGTTGACCCTGAGATCCGAATGTTATGCATAAAATCCC
TAGGTATTTGGGTTGTCTCATATCCATCACTGTTCTTACAAGATATATATTTAAAGTATC
TTGGGTGGACACTGAATGACAAGGTAAAAAAGGTTTAATTCATTGATTAATTGTGCCCAT
TAATACCTTCTCTGTGATCAATGAGACCTGCAATCTTATTTTGTGCACTTCTTTGTTTAT
AGAATGCTGGAGTTAGAAGAACTTCTATTCTTGCCTTGCAAAGCCTGTATGATGTAGATG
ACAACATACCTTCTCTTGGTCTCTTTACGGAGAGGTTTTATAGCAGGATGATCCAACTTG
CTGATGATATTGATATTTCAGTAGCTGTGCCAGCTATAGGACTCATCAAGCAATTACTTC
GGTGAGCTCACTTTCTCATGGTCTCTTTACCGAGGTTTCACAGCAAAATCTTTTTGCGTG
CCCAGTCAGGGCAGCTACTGGGCAAGTTCACATATCTTGCCATAGCCTTCTTAAGATGTG
CTTAGAGTTGGGGATGCCTAGTTTTTGATATGAAAGCCTTCTTATGAGGTTTTATATGGA
CTAGTAAAATTCAATTTCAAGTAAGAAGTTTTGAATACTAATTTCTTGGATATCTGGCAT
AACATTGCTGTTGTCAAATGTTATACAAGGACTGATAATTCCATTTTGAAATACAGCTGT
GGTGTTTGTTCAAATGTTCTCATCATTCACTATCTGCACAGTGCACCGATTACATCAATT
TCTACGCTACCAGTTAAATTATTGCACTTTGAATGTTTGAATGACGATTGGTTCAAAGTT
ATTTCATGTAAACACAAGCTTAAACATACCTGCAATTGGCTAAGCCGTGGCACTGCAAGT
AGGAGTTATGTATTCAGAGCTGAAACTCACATGTACAAAGGCTACAAAGAATTTTATCAT
GTAGCTCAAATACTTGTTACACTGTTACAGGAGTTACAGATTCAGAGCTGAAACCTATGT
GCCGTTAGTCTCTTATATACTAAAAAATACATGATAGCTGTCCGTTTAATAATTCATGTA
CTGTGTCTCATGATACGCAACCAAGAAGCATAGTATTGTCAGTGTTGTTATTGGGTGCTA
TGTTCATTGTTTTTAAGGCGGTAAGGCAAGGCAAGGCGCTGGGGGGGGGGGGG