Map Locations of contig_2547819 (6392 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_2547819

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_37128 1 280 bp None Available Available None
MLOC_37127 3 1067 bp AK376454 Available Available None





CDS Structure of MLOC_37128






CDS Structure of MLOC_37127






Contig Sequence (6392 bp)

>contig_2547819 6392 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGACCGCGGGTTAATTAACTAAAAGACCAAGGGCTTTTTTGAAAAAACGCTGCGACGTAC
GGCAGAAGCAGTAGCTGCTTTATTATCAGGGAAAGATCTAGATTAAATAGGTACTTTTCT
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TTATTGCGGCCTCAGGTTTACTCTGATGTGACATGGGCATGATCACTCTGATTGCAATGC
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TTATATTTACATGTATAAACTTAATCTGAAGTCTAAGCTGGTAGCTATACTTCTAAACTC
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CTGTTAGCTTATATTGATGAACTTATGGTATAGTGTGTAAGCCTGTATGTATGCACTGAT
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ATTCCACAGTAGTTCTGGGCTCACCTCACAAAAAATAGAATGACCTTTACTTTAATAGTT
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CTGATCCCTCATCGGTAGCAATATTTTTTAGACTTATATTCCACTGTAGTTCTTGGCTCA
CTTAAAAAAATTGGAATGACCTTTACTTTAATAGTTTAATTACCAATTCACACTAGGTAT
GAAATGTTTCTGCAAACCCAAACCTAAAGTAAATGTTTTAGAGTTTTAGTTCAACTAAAT
ATTTAAGAAACTTTATCTTCACCTATTATCTAGCAGCATTGCTTCATTTTCCTTTCTAAA
ACATTTGTTATGTCTATCAATTATTAAGTTCCTACCTTTGTCAATACACAGATGGAAATG
GCTTTAAGACAAGCACAATGAGACTTGGTGCTGATGCAATTGTTTTTACTCGTGCAATCC
GTGGGAGGTAGATAATCTTCATTCCAGTCATTATTGATTTTTTCTAAATTTTATGGCATT
TGTTGGATTCTGTGTATTTATCAGTGATTAACACAATCTTCTTTCTCCTCAGTAATGTTA
CCTTGAGTGTTGGCTTGCTCTCATACACTTTCTTGAGGAGAACAATGAAGGATGACATAG
TTGTCCCTGTGGTATGTCATGTTAGATTAGTACTTTAGTGGTGTATCGTTCTTGCAGCTT
TCTCTCAGGAGCTGACATTTTCTATCACTGTTACAGCTCGATTTTCAAATCCAAGATGGC
CACATTGTGCCTTTGGTGTATGGTTCACAAGGTGATTGGGATAGTAGCTTGAAGATAATA
CTTGATTGGTCCCCCTTTTCTTCAATGGAAGAACTGCTACAGCAGGTGGCATTCGTCCCA
GACAGTATTTTACTATTTAGCCCATTCTGCAGTCGTATTTTGAGATCAAGTAGTGAGTCT
TCACAACCAGTATGTTTGATCTTTCATGAACGAGTTAGCCAAATGTTTTTAGGTGCAAAG
GCATGATATTAAAGGTGCAAATTTTCTTTCATGAACGAGTGTCTCCTCTTGTTCAGCTCA
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TGTTGTGTTGAACTCTTCTTGACATACTTATAGTTATCTATTTTTATTTTGATGGAACTT
CCATCATTTAGCATATATATTCAAGAAAGCTGAAAATATATAGAAGAAATAGAGTTCTTT
TTTTGGAAATTTAGATGCAAAGCAGCAATCGAGCATCTTAGTGCGCTGTATATATGTTTT
AGAAGCCTCCAAGCTCTCCCTCAAAACAAATCCATGTTGGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAG
GGTGGTTAAGTGGACCAAAGATGTATTGGTATTCGTATAATCCAGATTGGCACGCTGGAG
CTGATACATAGACATTTTCCATAAGCAGTGTGCTCTTGTTTAGGCAACATCTAACTCAGC
ATATTGTCTAGAGCAAACTAACAACAAATAGAATATTTCTAGTTTTGCAGTTCTAGTCTT
AATTTCTTTATTCCAAAATGGCACCGTGAATGATTTTTAATGCTATATAACACTTAGGCT
TTACTTAGTTGGTGTTCTTTAATGGATAGTTTAGTCGGTTATCACATTTTCTGAATCTAT
ACCATTATGACCATAACAATTGCACAGTGATATATTCTTTACCTAGGCAACCGACTCTTT
ATATGTGCACATATTGATAAATTCCTTGTCTGTTCAGTTCAAGGATATTGAGAGCCATGG
AACTAAGGTGGTGATATATGATCTATGGATGAATGATGATGGCCTTTTAGAACTTGACTT
CGATGATGACGATGAGGTAAATATTCCTGCAGTTTATGTTTCAAGTACAACACATTACCT
TCATTCTTGTAGAGAATATTTAAACAAGCATTTGAATTTGTTTTATGAAGCAAACATCGT
TGCTGATGGGAATCCTGTGATTTTAGATAATTATCAACGCCATCTTTATCCAGTTAGCAC
CACAAACTAGGGGAGACTAGAGCAGAACTATTTTCCCATTTCAACACTCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCGCGCTCATCCCCCCCCCCCTAACC