| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_2547719
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_37061 |
1 |
321 bp |
MLOC_37061.1 |
Available |
Available |
None |
| MLOC_37063 |
1 |
311 bp |
MLOC_37063.1 |
Available |
Available |
None |
| MLOC_37062 |
1 |
116 bp |
None |
Available |
Available |
None |
| MLOC_37064 |
1 |
408 bp |
MLOC_37064.1 |
Available |
Available |
None |
| MLOC_37060 |
2 |
3636 bp |
MLOC_37060.1 |
Available |
Available |
LOC_Os12g07300.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13112.m00762 protein N-acetyltransferase 10, putative, expressed |
| MLOC_37059 |
1 |
780 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os03g05240.1, FRAME:-1, EVALUE:7e-12, 13103.m00549 protein retrotransposon protein, putative, unclassified |
CDS Structure of MLOC_37061
CDS Structure of MLOC_37063
CDS Structure of MLOC_37062
CDS Structure of MLOC_37064
CDS Structure of MLOC_37060
CDS Structure of MLOC_37059
Contig Sequence (13836 bp)
>contig_2547719 13836 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACAACGGGATCAGCCGAGCCAAGACCCCCCCCCCCCCTCTGCTCGCCCAGCGCACGGTC
ACCACGCGGCAGAAGAGAGTGACCGTCCGCGACAGCCCAGACCCAGGCTGCCCACCTTGA
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GAAACTCTTATTTTCTCAGTCAATACTTCTGGGATACTCCCGAATACCTCTATGACGTGT
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CTGCTCCCTCCCAAATCCCAGATCTTAGCGGAGCTGAAAGCCCACAGTATAGAGCCCCTC
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GTTTTTTGTGTTGGCAGGAAGAGCTTGGCATAGAAAGGGAACAAGTTCTATCTAATTTCA
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AGGTTTTTACCAACTTCATTGTTTGACCTGTTTGTGCTATGTTTTTGTTGTATTCAGATT
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GGCCAATTGGAATTGCAACGATGATTTTGATGTATCGCCTGTCTTGTTGGAATATGCTTT
CGCAGTTCTCTAGACTGTACAGCATTTTATTTTGTTGGGAAATTTGTTGATTAAAGTGAT
GGACATCTGAAAATACCGACAACGTTTATATAAAGATCCTAAAAGGAACAAAACGCAGAT
GCTTGGGGTCACGGCCTCCTCCTGTCTGTTTGCATCATGATCTGTGCCATATGCGTCTGC
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CGGTGCGTTCGTCGTTCACCGCCGACCGGAACATCCACAGGCAAATGTTATTCGCACGCA
TTTCAGTAGGTCTGTAGGTGCTACCAACAACCAGCACACTGGTAGATGCTCATCACTTTT
ATTTATACGCTTGAAGCAAGCACAGACACAAGCCAGATTACTCGTAGCATTCCCACAGAG
CGGGTTGAGCATTCCAGGGCGCCATCCATCTTGCGGTTGCTGTCCAGGCACGCTGCCACG
GCCTCGCCCACCGTGAGGAAGATCCATTCTTCCCCGACCCCGTCGACGAGCCGCGCCAGC
TTCATCTTGTGGATGGCCTGCCATCCCGGGCTGGCGATGGCCATCTGCACATGAACATGC
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TCTCTATAAACTAGTAGAACAAACTAGAGTTTAGCATCTTATTTGCTGGTGTATCTTGTG
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AGCTGCTAGTGGAAACACTGTCAACATTTCAAGGTCAGAACTCAAACTGTTGATGATTTG
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CAAATGATAAACATTACATACCACCGATACTTCTCAGCCTACAAAGTAATGAAGGAACAT
TTAGGAGGAGCTCTATGTTTTACTAATAGAGAAGAAATAGGAACCTATATTCAAGCTTAC
CGAAAAAGGTTCCCCCCCGCTTTATATCCAAAGCAACCAACACCGTACATAGAACATTGC
TGGGGCGAGCAGCACATCAAGCCCCCCCCCCCCCCC
