Map Locations of contig_2547622 (10094 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2547622

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36997 2 2427 bp MLOC_36997.2 Available Available LOC_Os02g58090.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13102.m06725 protein PSP domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_36997






Contig Sequence (10094 bp)

>contig_2547622 10094 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGGAAGCAGAAGAAGAATAAGGCGCCCGCGTCCGACGCTGCTG
CCTCGGACGCCGACGCGGCCGCAGATGCCGACGAGGAGAAGCCCGACTCCAAGCCCCCGG
TAAGTGGACGCGCGCCTGGCGCCCCTAGGATTTCTTCGGGTGGGGCTGGCGACGGTCTCT
CTGACGCTCGCTTGGTTGTGCGCGCAGGTGGAGATCGAGGTGGAGTACGTGCCGGAGGAG
CCGGACCTCGCCGACGGCCTCCTCGCCGACTTCAAGAGCATCTTCGACAAGTTCACCTTC
AAGGAGCCCCCCGCCGCCGAGGTACGGGAGCCCGTCGATTAGCAAAGCAAAACCCTACCT
ATGTATCTCTCTCTAGTTCTAGGCGCTCCACAGTGCAATCTGAATTATTCTGACGAGTAG
GGTTGCTGGTGTTGTGCTGGCAGGATGGGGAGAAGAAGGACGAGGCCGCCGATGCGGCGA
AGAAGGGGTCGGGGTCTGACTCGGACGACGACGAGCAGGAGACCCAGCAGAAGAAGAAGG
AAGGGGGCATCTCCAACAAGAAGAAAAAGGTTTGCCTCTCTCTCTCTCTCTATGTGTCTC
TGCGTGATTGTTGAATTACCTGTTCTTTCATGAGCTGTTGTTGTGGTTTCGTACAAGGCG
CTAAGCGTGAATTTTGCTGTTTTGGTTTGTGCTTTGTAGCTGGAGCAAAGGATGAAGATT
GCGGAGCTGAAGCAGATATGCAACAGGCCCGACGTTGTCGAAGTAAGCCACCCCCCTCCT
TTTCTTTTGTTGTGAACCAGGTGTGCTGGCAGTCTGGTGTCCCCGGATTACTTTGAAAGG
ATGTATTGCACAGCATCCTATCCCACCGCACTTGCCCGTCTAGTGTTTTGCATTGCCATA
GGTTGGCAATGCTAATGTGATCTGACCACTACCAATGATCTCTAGTTGATATAACTCAAA
TTGCACTCGGAACTTGTTTAAAGTCGCGTACCATTGTTATCTGGTCATGCAACTCTAAAA
GGTTATGTTAGGCTGGATTCCTAGAGAACTGCTCTAGCAACTTATACCATTACCTTATAT
TGATATAACTAAAATTACATTGAAGAATTTGTTTCAAGTCATGTATCATTCTGTTCTGGT
CATGCAGTTTCCATTGGCTGCAGCACTTTGTTAGCGAGGATGTGTTTGAAATTATGTAAG
CTTCCTGTTTTATCCGAGTAAATAATCCGTAGTAAGGTTCACGGCAACTTAGGAACTTTA
TCTTAGGCTTGGTTGCTAGAAAAATGTGCCAGCAATGTACTCCCTCTGTAAAGAAATATA
AGAGCGTTTAGGTCACTATAAAGTATTACTCTTACACTGTAAAGAAATATTGAGGGAGTA
TTTCTCTTATTAAAGGCCATGACAGCTTGTGTTGGTGGTGTGAACATAAGATGAGATAAT
GTCACTAAACTATTTGTTGTGTGCAATATTCTTTAACTCATTGCCATTAGCAGTGTTAAA
TTGTTTATGGATTAGCTTCAACTGATGCAATTATGCTCCTCCTGCCAGGTTTGGGATGCG
ACTGCATCAGACCCCAAGTTACTTGTCTATCTGAAGTCTTACAGGAACACAGTACCTGTC
CCAAGGCACTGGTCTCAAAAGAGGAAATTCTTGCAGGTTTGTAATACATGTACCATGAAT
AATCTTGTTCTGCATAATTTCGTAATGAGTACTTGGATGCACCTCTGAGAAATAAACCAC
ACAATCATAATAGTGTTGTTAGTAGTGGAGTGGTAGGCAGATGCAAACAGACCATCAGTT
TTCTGCGAATAAAAGTGTTGGAGCATCTCCCTCAATTAATATCTGTCATTGAACAAACAC
TGCATGATTTCATGTCTTGTTACAGATTTTTTTTTCCAAACAAACATAAGGGCAAAGGGA
CAGACTTAATATGCCAGGCCCGAATTCACTTAATGTCGAGCACACTTGGGGTTTATCCTT
GCATCATCGAAAAGTGTAAGCCCATAACTGCAACTGTTCGGGCCAGCACGGATATGCTAG
TGTAACTCATTGCAAAGTGCCATGGCAGTACCATGGGGTGGGTCTTATTAGGAGAGGGGA
GGGAGCATAAAGTCGATAAGGTTTTTCCCCTCCCTCTTATACAGATAATTAATTCTTGCA
GGGATGCTGCAACTTCCTGGGAGCAAGGTCTTGGTGGTACCGAACTTGAGTGACTACTGT
AGTATAAATGCTAAAGTTATTTCATCTAGTTGATTCATGCTAGGCATCTCCTTGAAGGAG
ATTTTGGTCTATCTAGGATCTTTGACTTTGGTCCTCCTTTGTTTGCGTATACAAGTATAT
CACTTGCCTTGCAGTTTTTTTATATCTCCAATACATGAAATTATGCTTTGCTTCATATTA
TCTATATCTTGTCGAATAGATTTGACATCACCATGCTGTTTCTTTCAGGGCAAGAGAGGT
ATTGAAAAACAACCGTTCCAACTTCCTGACTTCATTGCTGCGACTGGAATAGAAAAAATA
AGACAGGTATCTTAATATCTTGGTCCTTTGTAGCAATGATATGGACATTGTATCTCCGTT
GTCAACTTGGTAACTTTGGGAGTTAGTTTTGTTGGCACTATAATTTTTATTCCGCAAATG
GGCAAGATGGACCAACCGTAAGTAACTTTCCAAATGCATTTTCAGGCATATATCGAGAAA
GAGGATAGCAAAAAGTTGAAGCAGAAGCAGCGGGAGCGTATGCAGCCAAAAATGGGCAAG
ATGGATATAGATTATCAGGTCAGTTAATTTCTGTTGAGGCCAATCTGAGTTGCACGTAGA
AGCACACGCATATATATTTGTGTTTTCTACATAATGTGCAAGATGGATACAGAGCACTTC
TCTACATGCATATCTGGTTTGCCAGGTGCTTTATTAACTGCCACTTAGGCACTAATATTG
ATAGTGTACACGTGAAAATATCATAGCTGATAAATACGATGTGTTTCTTCCATATGTTCA
AATTTTAGACATGAGTTAACTTCTGAATGTGCAGGAATGCAAGTCTCACTGTAATTTTCT
TGTGTGCAGGTTTTACATGACGCCTTCTTCAAATATCAAACAAAACCCAAATTGACTAGT
CATGGTGACCTTTACTACGAAGGGAAAGAGTTTGAGGTATTTTTTTTTGCTTCGTTCTAT
TCTTAATGTCAGAAACAGAGATAATTGATAATTGATAATTGTCTGGGACATCCATATGTC
TGTTCTCAAACCTCGCTCACCAAGAATAATACATGTATGAACTCAACAGGTCAAGCTTAG
GGAAATGAAACCAGGTATGCTATCCCGAGAACTTAAAGAAGCTCTTGGTATGCCAGAAGG
TGCACCGCCTCCATGGCTTATAAACATGCAGGTATTGTTCTTTTTAAGAAGAAAAAACTA
CAGGCAGCTGGTCTTCTGCTTGATTGATCTCTTGTTGTTGGCCAACTGTATCAACTGACA
TCAAATAATTTTTGGCAGAGATATGGTCCTCCACCCTCCTACCCTTCGCTAAAGATTCCT
GGTCTGAATGCCCCAATTCCTCCTGGTGCTACTTTTGGTTACCGGCCCGGGGAATGGGGA
AAGCCTCCTGTGGATGAGGTAATTTACAACAAATATGCTTTCCATGGGCTTGGCTGTAGT
TAAATGCGGCTTCTGTGATGAAGATAAATTTCTTTCCTGATCTAATTTATTTGTTTTGGC
TAACAGCATGGACGCCCCCTCTACGGAGATGTTTTTGGTATCCTACAGCTGGATGAACCT
AATTATGATGTATGTTTGATCACCTAATTTTCCTTGAAATTGAACTGCAGCTCTACCAGT
TAGTTAACTGTTGTGTTTCATTGTATTCTAGGAGGAGCCTGTTGACCGCAGCAAGCATTG
GGGAGACTTGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAAGATGACGACGAGGAAGAGGAAGAGGA
GCTAATGGAAGATGAAGACATGGAAGCTGGCATGCAGTCTGTCGACACCATGTCAAGGTT
CTTTCTATAATAATTATTTGATGACTAGCTTAGGTTCTTCTCTAAAAGAACTATTTTATG
ACTCCTCTTCTTTTTCTGTTGATAGCACTCCCACTGGCGTGGAAACACCTGATGTCATTG
ATCTCCGGAAGCAACAGAGGAAAGAGTCTGAAAGGCCAACAGATAAGCAGTTATACCAGG
TAAGGGCTTAGCTTCAGTTTTGTGGCATTTCAGGCCAAGTATTGTTATGTGGATCTTTAG
TTTGTCTTATTGCAGTTCATAACCAACAATTTGTTCTTTTTCATCTGAAGGTTCTTGAGC
AGAAGGAGGAGAAAATCGCACCAGGAACCCTCTATGGATCAAGCCATACGTATGCAACTA
TAATACAACATAGTCACCTCTACAATATTTTTTGCAATGGATTCCTGTTTCAGCCATACG
GAGAACTCATTTTATATCAATAATTTCTGATGGATTCCTGTTTCAATCATATGTGGAACT
CATTTTGTATGTTGCTATTTTTGCAGGTATGTGGTTGGGGCACAGGATAAAGCTGGGGTT
AAAAGGGTGAGCTTTTACATTCCTTGCACCAAGTATACAAGCATTTCCATACCGTGCATG
CTCGATGATTCATTGACACACCTCTGTGGTCCTCGTTTGCAGGTTGATCTTCTCAAGAAT
CAAAAGTCTGACAAAGTGGACGTCACCATACATCCCGAAGAGCTCGAAGTTATGGACGAT
GTTCTGGCAGCCAAGTAAGATCACTTCTCCCTCGCGTCTTCCAAGCTTTGCCTGTCAGTA
GCAAACGTTAACGCCTTCCCTTTAAAATGATGAAACAGGTACGAAGAAGCCCGTGAGGAG
GAGAAGCTACGGAACCAGAAGGAAGATTTCAGCGACATGGTGGCGGAGGTACGTTAACGA
GCAGTCTTCTGTGTCTGTTGAGCTAGAAGCAAATACCAACTTTCATCGAGCTGAACCCTG
TTTTCCTCCCATTTCTGCAGAACGCGAGCAAGAGGAAGAGGAAGCACGAGAAGGACGGGA
AATCTTCCAAAAAGAAGGACTTCAAGTTCTAGACGGCCTCGTTTTGTTACGGTTACTCTT
CCGTTTTCCCAGGAGGAGGATGTTTCCATTTCTTCCTGTAGCCTGTACTCTAAATTAAGC
TGTGTATGTATACTTAGCCTCTGGCAAATGTTGAAGTGCTGGATGAGAAGACCAGATGAA
AAAGGAAGTGAAGCTGTGGTCCATGCATGAGAACAACTTGTGATGTTAAATGTAACAGCT
AGCATTAATCCTTTGCTGTCATGAAGAGTAATGATAAGTTAAGTGCTGAATTGCACATTC
TGAAACCTGCAGGTGAAGCTGTATCATTGAATCACTGTTTTGTACTAGTACTCATCTGAG
AAGAGAGCTATGAGTGTTGGGGAATAAGATGCTTTAGGGCATAGTTTTCCTGGACAAATG
AGGCTCTTGTTGTGAGAGATGAAGGTGCCATCATATTTTTAAGCGCTCACAAGAAAATGC
TATAATTGATATGTTCTGATGTGTCTAAATAATATTGCTTGTATGGCTAGGCTGTAAAAA
ATGCTTGAGATCAAGTTCGATTCCGTCTTGGCTCAAATAATGTTTGACATGGAAAAAAAT
GAGTTGAGTTGCCCATAATAGTTGGGTCGAAAAAGGCTGGGTTTGGGCCAAGTCTACCTT
GCTAGACTAACATTGGAAATTGCTTTCGGATTTCAGGATCCATGGAGCCCTGATTTAAAA
AAATAAATACAATTATCATATTTCCAAGTTCTAAAAACTGACACAAGAATCTAGGGATGT
ATATTACATCTCCGTAAATTTGCATGTAAAATGACAAAAAGGATTCATGTCATTTTATAT
TTTTTACAGTTCACACCAAAGCATATTTGATCATGAAACTTTAGATAAATGTAGTGTACA
TCTCAATTTCATGTATATTTTCCTAGAGTTTTTTGAAACATCATAATATGATTTATTTTT
TTCATTCTTCATTTAGAAAAACGATGCTCCATGGAGCTTGGGGGCAATAAATCCACTCTT
GTCTAACGTGTGTAACTGGCTGGATACATTTGTACTCCCTCCATTTTTAAATATAAGTCT
TTTAAAAGCTTTTACAAGGGGATTACATACGAATGTATATAGATATACTTTGAAGTATAG
ATTCACTTATTTTGCTTCGTATGTAGCCCTTAGTATAAAATATCTAAAAAAACATATATT
TAGGAACGGTGGAAGTATCTTTCTAGCATGGACAAGTCAAACTACCGCTATGTCGGCTTA
GAGATAGTTATTTCTTGCTGATAATGAAAACGGTGCAACTAAGCTATTTTCATCTCCTTT
GTGCCTCCACCAATCTCATGCTTAAATCGAATGCTTTTAGTGGTGACTAGTCATCGCTGT
CGCTGAAACGGTCTATTGCCATTCGAAGGAGTGACTTGTCAACTATAGTTGAAATGCACT
CTATCGTCGCTGTCAAGTCGATTCAAGCTTCGGATCTTGATAGATCAATTTATTCTTCTA
TAGTTAGAGAGATTAGACACTTTTATGTCTCTTCATGATTCCTGTGTTACCCATGTAAAT
CACAATCAAAATAAGGTTGGCGATAGCTTAGCTAAATTTGTTAGACTAGATGGTAGCTTG
CTTAGGACGATGACCTGGATTGGTACTGGCCCGATAGATTCTTTACCACATGTGGTATTG
GTAAATTTTTTGTCATGTAATGTTAGTAATTCTCCTCCCCGCAATAGTACCGCTACTCTC
GTCTACCTATTTTAAAGGTGAGTCAAAATTCAGTGGTCGTAACTATCAACTCTGAAATGT
TTCTATAATATTCTTTTGCTATGCCATCTGTTGTCATCCTTCCAGGAGAAACTCTTCCGG
AGATGTGCATGAAATACATGTGTGAAATTCTGAGAAAGAATTCATTCTATGGTTTTGCGA
CAAATCATTTCATTGTCTTCGTTGTTCTTATTTCAACTCTTTCAAAGGCTAACTTGCAGG
AACCAAACTCCTTAGAATTCACTGAGTCTTCTTTATCATTTTTCTTCGATCGAATAATAT
ATCAGTGAAAATCTCTCTCTCCTGAAGATTTATTTCACCCCACTTTTTTACACTAACACA
TGCAGGATATTAGGACTTACAAATTCATCAGTTTAATGCATACACTCAGGGGACTGCGTA
ATTAATCTTCGGTTATGATATTAGACTTTATCTTCCACATTCTATCGGTTACCCTTTATC
TACTCCTTGGCGCTTTCTATTTTTTCAACAATCATCCGAAAGGGGGAGATTATTGGTGCA
ATATCTTGCCCCCTTGTGTTTTGGAGATTATTGACAATAATAGTAAGGGACTCGTTTGTT
TGCTAGTGCACACAGAGAGAAATAGTTCCTAGAGTACAAAGAAGAATGCTATATCCTATC
ATGAAGTTCGAAAGACTTCACCAACTTATATCCACGTTGCAAAGAAGAAAGATATACAAT
TTAAAAAGAAATTGTACCAAGAATAATGTTTCGAAGAGTTAACCCCTTCAAATTATTGCT
GATGCAAAGCAATATTCATTCCGATGTCCGAAGAAGAATGATTGCAATCGAGGAGATTTG
AGACGAAGCAGAGGTGTGGCATTGGTTTCACTGTTCTTTCCTATTTTTAAGTCATAGGAT
CATTGTAATGTTAAGAGGGGGTATTGGTTCTCGATGCTTAAATTTGTTGTGATGCTTAGC
CAAAACCTATGAAAGTTTGAGAAAAATTTCTTTGTGCTCCGAAAGATTACTCGATAACCA
TGGACAATGTTCTTCTGGGCCGTGAGAGACATCTCTCAGACCGAGGAGTTAACATTCTGT
GTTCCTCAAGAAATGTTATCGTTGCGCTCAAATTCCGAATGTTGGAAATGTGTCGGTTAG
CCATTGGCCGGACCGCGTGTCCTAAATGATCATTTCCCATCTAGGAAGGTCGCGGCTATA
AATAGCCATCCCGCTTTTGTTGGCTGCTTCGCTTAAGATTCTAAGAAGATTGATTGATAA
CCCCTCTCGAGAGGTTTGAGTTTAAGATTCACCGAGAGAAAATCAAAAGCCTAAACTTAG
ATAGTGGTTGAGAATCACCATAGATCTAAGTTAGTGTTCTTGTACTTATTACTCTTGAGA
GTTACAAACTCTCTAGACAGATATGTGTCGACTTGAGTGTCGAAGAGTAATTATCTTCAC
CAAGAAAGTCTTAAACAACTAAGAGTAATCGAGGTTCACGAAAAAGTCTGTCGAAGGTTT
GGAGATCACGATAAGTATCTATCCCGAGTGAAATCAACCCAAGTCTAATCAACTAATTCA
TGTTGAAGGAGAATAGGACAGAGATAGGTTTTCTCCCGTGTTCAATCATAAGAGCCTCCA
ACTAGACGTAGCTCCTTCACAGAAGAGTGAATTGGTCCACAAAATCATGTGTCGCCATCG
AGCACCACCGGTTCATTTTATTCAACTGCATTTCCTTCAGTAATTTACTTTCGTGCTCTG
CGTTCTCATAGTTTTCTTTGATCAGCTATCTATCTGTTATTGCCTATCTGTTAGTCTATC
TGTGTCGTGTCAAAGTATGGTTATTCATTGTCCTTATATGTTGTTCATCGTGCTTTCCTT
CTGTACTACTATTTTTATTTTGAAAGATGTGTGCTATTATACTCGGAAGATTATCATTTC
CTTTTTTGAAAGGCTTGATTGATCTTCGCCTCCACGAGCTTCCTCGTGCATAATCCTATA
TATTCTCCTTCGGTAGTACTCATATATCTTTTCGGCTGCATTGCTTGGGTCAGGTCTAAA
GTTTCGGATTATTTTTTAACTGTCCCATTCACCCCTCCGATCGATATACTCTCGGTCCTA
ACACTCTGATATGTCTCCAACATTTCTATAATTTTTTATTGTTCCATACTATAGGATGTT
TATGGTGGGTTACGCCACCAATCACAGTTGAAATTCTTGAAAGTTGAAATTGTTAGAAAT
TCTTCGAATTTTCAAATTCCTCAAAGTTTGCAAATTTCTCAGAAGTTCAAATTCTTCAAA
CTTTTTCAACATGTGTTCTTCATTGACTATATACTTATATATGTTTATATGTGAGCTTTC
AAAGTCCACAACATTCACTTATTGCTATAAGTCTTCAAACTGGGTTTTCTTCCAAGTGAA
TGTGATCGGACCCGTTCCCCCTCTCAAATTCTTCATATGCATTCTAATTGAACTCGTTCA
AAGTCTTCACCGAGTCCTTGTCAGCTGAAGAATTTGCGGACAAGATCTTTAAAAATATAT
TATCAATTTTTTTCGGCCATTGCCGCTCAAACCGCTCCCACTTTCCATGACTCGATAACC
CACGATCCCTCACTAACTCCACATCTTTATACGTGCATGACAGATGTCGCATGGAGAAGA
AGATTCAGGGGAAATTTGGTCCAAAAACTTCAGACGGGACCGTTTTCACCTCGGCTATAA
ATACGTCTTCACCCCCTTACATTAACTCTCTTCCTCTCGATCTCATTCTTCACCGCTCGA
AGCTCAAACCTAGCGCCGATGCTAGAAATCATTGCCACCGGAGAGGAAGAATTTCATTGC
CTCGACCTCCCTGTCGTCGTACTCCCGCTGGTCGCGTGCATCTTCACTCCTCCGCCGCCA
TAGGTGTCTTCTGTCACCGAGTTAGGGAGCAGAAGATCTAAACTAACGAACTTCTCCTCC
ACTTCTTCGTGTTCGTCGTGTTTCGTGTTCTTTCTTCAGCGCAAGGGTAATTAAAATCTA
ATTTTGATGCCCTTGTAGATCTTTGTGTTTTCATAAAATCTTCAAAAAGTGCTTATTCCT
CAACAGATTCATCATATGAACACCTCCTACGCTTAGTTCGCTTGATTTATTTCACTTCAT
ATTTTTCTTCAAAAAATTCCTCAACTGTGTGAATTTTTGGATCTACACAACTGTGGAACC
TAAGTCAAGAACACTTAGCGAAATTCTTCAAGACAATCTCTATAAGTCGTCGAGGAGTTT
GAGTTATTCGAAGAATATCGACCCCTAGAAATGAATGTCTTCAACTGAAGACTTTGATAC
TTTCCTGAAGATTT