Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_2547594 (3349 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2547594

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36980 5 3046 bp MLOC_36980.3 Available Available LOC_Os07g32230.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13107.m03259 protein domain of unknown function domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_36980






Contig Sequence (3349 bp)

>contig_2547594 3349 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGCCGCGATGTGGGGGGGGGTGCGCGAGGTGTGGGTGGGGGATGTCCGCCGTGGACATC
GTTGCCGGGGCTTGGTTGCTGCGGTCCCGGGGGGTGGGGGGATGCGAGCGGGCGGGGGGC
GTCGGGGAGGCCGTGGGGGAAGGAGAGGGGGCGTGGGCATGGCGCCAAATCCGGAGAGGG
GATCTTTAGGAGTGACTCCAAATGAGCATTTGGAGATTCGGTTCTATTCCCTACTTGGTT
ACTTGCTCTTAACTATCTTGAAAATGATCACACATGCCTTCACGCTCTCGGTGTTCTGTT
CTTCCCATGCTACCTTTTTTCTGAATAATCATTAGCTTAAGTTCATATCCATGATGAATA
AGCATGAACATCTTTATCTTCAGGCACCATGTCCATGTTCCCAGGGATGGACCTTACCAA
AATGGACCCTCCAACACTTACCCTCCTTGGAGCAGCCTGTTGTGTAATGTTATCGATGCA
TTTCACAGTGCAGTTGGTATCACAACATCTTTTCTATTGGAAAAATCCCAAAGAGCAGAA
GGCTATACTCATCATTGTGCTAATGGCTCCACTCTATGCTATAACTTCCTTTGTTGGCCT
TCTGGATATTAAGGGAAGCAAAACGTTTTTTACATGCTTGGAGTCTGTTAAAGGATGCTA
TGAGGCACTGGTGAGTCCTCTCTGGTCAATGATGACATTTTTCACCTGAAGTTTTCGATT
TCGTTCACTTTTCCTTATATTATTTCCTTTCAATTGTGCAGGTTATTGCTAAGTTTCTGG
CATTGATGTACAGCTACTTGAATATATCTATTAGCAAAAACATTGTACCTGATGAAATCA
AAGGGAGGGCTCTTCATCATTCTTTCCCTGTCTCTCTTTTCCTGGTATCTTCTTACACCC
TCGCATACTCTTATAGGAAGTTCGATGAATGTTGCTGTAATCTACTATTGAACTTTGGTA
TTGCAACCTGCACTATAGTAAGGGGGCATACCCATACAGCCATACTGAATCTTTACATAT
TTGAAGGATGCTGCATTGTTCAGTAGTACTAAAATGATTCGCGGTCTTAACAAAAAGGCT
TATATACTCCATTAATAAAGTACCTATTCATATAGTAATATCTGGTTAATTGGAGCATGT
ACATATGAGTAGTCATTGTTCAGTAATATTAAAATGATTTGCGGTCTTAACAAAAAGGTT
TATATACTCCATTAATAAAGTACTTATTCAGATAGTAATATCTGCTTGCCAAAACGTTTT
ATATTTTGGAATGGAGGTAGCATACGAGTAGTCATGCTTGAGTTATGATTTTAACTTCGA
TTCTCCATGGCTTGTCCGCTATGTTTGCCTATATGCGTTTAAATGTTGTCCTGCATGTAT
AGTCTGGAAGCTATTAGCAGTACTGTTAGTTAAGGCTTTTCACCCTGTTCATAGTTTTAC
TTTGTGTGTACTGAAAGTAACCAAACGCTTCTGGCTCTGTGCTTTGGCAGCCCCGCAATG
TTCGGTTGGAGCACAAGACACTAAAGCTTCTGAAGTACTGGACCTGGCAATTTGTTGTTG
TTAGGCCTGTATGCTCCATTCTGATTATCGCACTTCAGCTTATTGGGCTGTACCCCAGCT
GGGTCAGTTGGACGTTCACAATTATACTGAACTTGTCAGTCTCCATGGCACTGTATGCCT
TGGTCATTTTCTATCACTTGTTTGCCAAGGAGTTGGCACCTCACAAGCCTCTTGCGAAGT
TCTTGTGCATCAAAGGGATTGTCTTCTTCTCTTTCTGGCAGGTAAATCACTTGCTCTCCT
GGCTGGAAGGGTTCGAATATTCTTATAAATATCTTTGGGGATAGTTTTTTTGTGTGTCTG
AATGCTATTGATGTAATTGTACGCCAGTTTGTCTTCATGGTTGCATCTGAACATTTGTTG
AGGTGGCGATATTGGTTTAGTAATGTTGATAGTTAAGAACTTCTATTCTTGCCATGTTAT
CTGGGAGGATTTTGCATGAAGCTTCTTCTCTCACTCACTCTTTGGATTTTGTCCAGCATG
TTATTTAATTACCTTGATGGCTATCAATCTAGGAGGGTCGTCTGCAATTTAACTTTCCAT
GCATTCCCATGTAAATATTCAAGTTCAGCCATTTTTTTTAATAAAGGTCGCAAAGAAACA
ACTATACACAGCCCCCCTTGTCGTGAAAAAAGAAGCTAGAGATAAGTGTGAAACGAGTTT
ATGAGCATAAATCAGTTAAATTATTTGACCTTTCAATGCGCAACTTTGTTGTAGACATTC
CCAGTGGACCTCTTGTTGTGAGTGAACCACCCTGTTGTCTACTATGGGTGCTTGAGGCAG
ACATTCTAACTTGCAACCCTTGGCTGTAGGAAACTAAATAGCTAAACACGGCACCCGTTC
CATTTTGTAACAGAGTTTATTTTTAGCAAATCAAATCTTATCAAACTCCTGCTTCTTGAA
TGCTATTATCTGTCCGCAGGGCTGTGCGCTGGATGTTTTGGCTGCTGTAGGGGTGATTCA
GTCTCACCATTTCTGGCTGGACGTGGAGCACATCCAGGAGGCAATCCAGAATGTCTTGAT
TATCCTGGAAATGGTCATCTTCTCGGTACTCCAGCAGTATGCGTACCATGTCGCTCCGTA
CAGCGGCGCTGACAAGGCGAAATCTGTGAAGAAGAACGAATGATCCAGGGCTTCGTGCCA
AGCGACATCTGCAGCTGGTTCTTGTATGGTTTTGTGTGTATGTGCTGGGAGTATTGATTC
AAGATGTTATAGGACATGTGCATTTCCTTGTGGACACGTGTAGAGTGAGTCGTCGTTATA
CCTTGAACACTAGAGAAACGACATGATCAGGATCAACACATAGGAAAGCTGTTGTTGTTA
CCGTGCTGTGAGATTGTGTAATGCCTGAATAAGGGGAATTCTGGGGGTTCCCCGCCCTGA
ATTTCGTCCGGAATAAATGGCGGTTTCGTGTCGCCCAAATCATCGCGTGTCGCTGTATGA
TTGTTCCAAAACTTGTCTGAGCTTATCACAGTGCTATGCGTCCAGGTGTGGTTTGGATGG
CCATTGTTGTTGCAATTTTTTAGACTGCGCAAGTAAAGAAAATAGAGTGGAACATGCATG
TGATTGGTTCCCGTCCAGTCTGTCTACTAGTATACATTTATTTTTGAGTCGCTTTTTTAA
ATGGTACAGACGCACACCCTATTTTTGACCCTGTTTGGATACTCTAACTTAGCTAGAGGT
TAGAGTTAGTTTCTAGCTCATGACTAACCTTAAACTAACTCTAGCCAAAGAAGTGTTTGG
ATGATAGGGTTAGATTGACAATAGTTGTACTTGATGGAGAGAGGAAAGT