Map Locations of contig_2547213 (11846 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_2547213

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36702 4 3315 bp MLOC_36702.1 Available Available LOC_Os03g40010.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13103.m04335 protein DEK C terminal domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_36702






Contig Sequence (11846 bp)

>contig_2547213 11846 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGGAGATATATGCTCTAACAATAGCACGACTCGTGGATGACACAGAAGTTCCCCGTGTC
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AGTTTTTCTAGCGGACGCATACATGAATAGTAACCATTTATTTTTACTCTAGCTTCCGCT
GCCAACCTACCACTACATGCTTCTCTTTTTTGTTACTTCGTGCCATGCTTGCGTTAACAA
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TATTGAAATAGCTTTTTATGGTGAAATAGCAATTCAAGTAGGATTGGTAAAAATTCATAA
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AATGTAGAAATTAACCTCCCTATCTATTTTTCTACAAACACTGGATATATTTACGAAACA
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AGGGTACATATATACTAATACACAAGGTACTATCGAATAGATTGTACTACCTGATGACTT
ATTTTCTTCTATCACCTTTTCAGAGCTTGGAGTACGCTTTGATATAATGGGTTTCTTCTT
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TGATGTTTTGCCTGCAGTCTTGCTTGCTGTCCTTGGCGGACTTGTCCTATGGGTGCTCCC
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GGCACCATACCTTCTTAGACCTCTTGGGAGTGATATCCGAAGTCTTGCTTGAACTACCAC
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TTATGTTAGTGTAGTATAATCTACTTGTGTATATGTATATTATTGTGGATGCACTCCGTC
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CTGGCTTGGTCTCAGCCTCTGTCATCTTGACATGCTCACGTCCTGCTATGTTGGAACTGT
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CCTTGGCGTTATTATCTTCCTTTGCATCAATATCCTCCACGGTGCCCATTTTGACATCCT
CGTGTTCCACTACCTTGGTGCCATTATCTTCCTTTGAATCTGCAGCATCCACATCAACCA
TTTTGGCATCCTCATGTTCTGCTGCATTGGCATCTTCATCTTCCTTCATATCTGCATTAT
CTACAGAATTCATTTTGGCATCCTTGCATTCTTCAGCCCTGGCACCATTGTATTCATTTG
CATCTGCATCCTCCACACCACCTGTTCTGTGATCCTTGTGTTCTGCTGCCACACCACCTG
TTCTGTGATCATCGTGTTCTGCAGCCTTGGCTTTCTCATCTTCCATTGCATCTGCATCCT
CTAAAATAACCATTTTGGAGTCCTTGTGTTCTGCTGACTTTGTGTTGGCATCTTCCTTTG
CAGCTACATCCTCAATACCAGCCGTTTTGGAATCCTCGTGTTCTGCTGCCTTGGCTTTGT
CATCTTCCTTTGCATCTGTATCCTCTACAATAACCATTTTGAAGTCCTTGTGTTCTGCTG
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ATATGACATCCTCTAAACCCGCCTGCTTTACAGCACCCACATCATCTTCCTTTGCATCTT
GAGCCTCCTCCATCTTGGCATCATCATGAGATGAGCCCTCAGTGTCGTTTTCTGAGGCTT
TATTCTGTTGGTTGGCATTGGTATTCGCTACTGCAACATCCTTGCTCTTGCCAGCCTCTT
CCATCTTGGTATTATCCTTCTTATCAGAAGCAACAACGTCAGTGGATGTTCCTCCATTTG
CCACAGCCATCAACTCCATTACTGGTGCCAGGTCTGCCCCGGTCATCCGGGTGACCCTTA
TTGCTCCAGCTGCGGAAAAATAGTTCGGCCAAGTGCGTAAAGTCAAATACGTAAGAAGCT
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AAAAGAAAGCAGGAAACATGTAAAATGAACAACAGAAGTGTCTTCCCTCGCAAAACCATA
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AGAAAAGGACAATGCTACAGATAAAACCCTAACCAGTATCTGGAAAATTAGGTTCCACGA
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TCCACCCAAATCGAGCCTAATATCTGGGGGCGGGGCTCGTAGCTGTCCGCAACCCAAACC
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CTCCCGCAGCAGCAACGCGTCGAACCTAGCCCGGAAATCCGACGTGAAGCAGCAGCAATC
ACGAACAAGCAGCGGAAAATTTTGGTGTCGCTGTTGGTGTTACCTGGAGGAGAGCGGTGA
TTCGCGCGGAAGAGTGTGGAGTCGCGTCGCGTCGCGTCGCGTCCCCCCCGTCGCCTCCTG
GTTTCCTCCAACTCGAGAGAGAGAGGAGAAATGTTGTAAGTTTATTTTCCATTTTTCTAT
TAAATGGTTGGGCTAGTCGGGCTCGGAGCAGTGTGGTCTGTGCGCCGGACGGCCGGACCC
CAAACCTGCAATCCAATCCAGTTTTATATTTCGGCATAAACGTTTCGGATCGGGCGACTG
ATTGCAACTTTCACAAACACGATTTCATCCCGCTTTATACATCTTTACCTCTTTATCTTT
ACCTAATATATATATATATAATATATATATATATAATAATAAAGACCTATCGCTCCCGTC
GGAAAACTCACCGAGATGATTTTATAAAAAAGCTCTTACTTGGCATTAAACTCGTAGTAT
ATATATTAAATATTTTTTTAAATACTCATATCTTTTAAACCGTAACTTCAAATTTAACAT
ATTATACATGGAATTTGATTAGAAAA