Map Locations of contig_2547137 (11845 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2547137

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36658 1 779 bp MLOC_36658.1 Not available Available None
MLOC_36659 1 1837 bp AK252222.1 Available Available None
MLOC_36657 3 1209 bp AK354853 Available Available None





CDS Structure of MLOC_36658






CDS Structure of MLOC_36659






CDS Structure of MLOC_36657






Contig Sequence (11845 bp)

>contig_2547137 11845 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGAGGAAGGTGAATCAGCTTATTACTGTATGGATGGAGACCACATGC
CATCATGTTCACATTTTTGAACTGAGATAATTATTTGATCGCTTATATTTTTATATTCCT
TACATTTTTATATTCCGTGGCAACGCACGGGCATTAAACTAGTTTATCATAGCGACACAA
TGCCTAGCCCTCCCCGCATTTTTTTTACCATGCATAAAACATAATTAATACGTTAGCCGG
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AACCTTGTCAATTATATTTATGATCTGCCATGTAATTAGTTGTGCAGATTATTGAGAAAG
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TTGCTCTACCCTAACTGCATAGTTTGAATAATCTGAGCTTGTTGTCCAACTTAATCATCT
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AGTTGCGCTATGGGCCTGCTTTGGATGCATGCGTTTTAATTAAGCTAACTAATCAAGCTG
AGCCCACCGTGAAAAAGCCTAGAAATTAAGCGCACGCACGCGTGCACGTGGTTCAATACT
ATTTTGGAGCTTCTAGGCCCTTTGATTTTTCAGCTGCCGCCTGTATTTTCTACCTTTATT
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ACCAATCTGCAACGCTCCCTACACACAAACACACACACATAAAAAGGAAGGAAGGTTCGT
CTCTGCTCCGGCTCTCCAACAGTGTCACGAGAATGGTCAAATCAAGCTGAGCCCACTCGT
GCGCATTCGGTATCGATCCATCCAACCATGCAACCTGCAGTCCTTTTTACTATTCCTTGT
GCAATTCACTCCCTTGGCACCAATCTGCGTGTCGTCTACGACAACACCCGGCTCCAAGAA
TCCTCTCTCTTGAGATCTCTCTCTCTCCCTCTCTTTCTCTATAGATCTCTCTCTCTCTCA
TGAGTCATGACGCATGCATGTGATCCGTGGTTACATGTAAGGCGGAGGAAGCCGCCTTGA
GCAGACTACGGGTCAAAGTGAGGCTAGATTATCCTAGCCTACTATATAACCCTGGGTGTA
ACTTGTAAAACTCTTTTCAGCTACTTCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCTCCCCCT
CTAGCAGCCATGGAGAATTATCCCATTCTGTTTGGGACGCAGCCCTCATCTTCCACCTCC
AACTCATACCACTTCGTGGCAGGAGCGAGCAGCCATCACCATGGTCAAGCAGCTGGCAAT
AACACCGGCGGCGGCCTCTTCTCGGCGTCCAAGCAGGAGGAGCCCTCCGACGGTGGTGGT
GGCGATGATGGTGCAGGAAGCAGCTCGCAGGGCGGCGGCGGCGAGGCCGACGTCGTCGTC
GTCGGGAAGAAGAAAGGCGAGAAGAGGGAGCGGCGGCCACGGTTCGCGTTCCAGACGCGC
AGCCAGGTCGACATCCTCGACGACGGCTACCGGTGGAGGAAGTACGGGCAGAAGGCCGTC
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ATGCGATCGACACCCTCATCAATTGCTGATCCTGACTGATCGACGATCAGATAGATTGTT
GTGATGCTTGCTTGATATACTTCTGGATGTTGTTTGGGATTTTCTGGCTGCTGATCGTTT
CTCCTTTTGGGTTCTCCTTTTTTCATCTGTTTGGCGTGCAATTCCATGTTTTTGATGGGC
ATGAAGAAGAAAGTAGGTGAGATGATGGAGTCCCGGTGAATCTTCCAAGCTATGGTAGTG
GTTGCTTACATGGGATAACGACATGTCTCATCCTCATCATCTACTAGTCTAGTCTAGACG
GACGAAAAAGCTAGCTAAGTTCCACGTGATTTTGATGGGCATCGCCAATAAATAGAGAGC
TGATGGCGATCGTATTTGACTAGGAATAATTTGAACCACCAATTAGATAGAGGTGGATCG
AATTGAACGCTCCACATTATCTACTCCTTATGTCTATATAGATAGATTATTATCCTAACT
AAGTCACCATATTAGCATGCCACCTGGAGCACAAAACACAGCATCTTTGCTGTCTGGCCT
TTTCCCCTCTAGGGGCCTGGGTTATGCATATATATTACTACAGGAGTACTAGGCAACCAG
GGGGACTGGCCCGTACATTTCCGTGGCTAGCTAGATTTCTTGCATAGCACTTCCTCTGTA
AACTAATATAAACGTGTTTAGATCACTATTTTAGTGATCTAAATGCTCTTATATTAGTTT
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AAGAATAAAATTACTCCTTTTTTATATAAAACCCTTATATATATGTTAATCGATGGGTGG
TGTCAGAAAAGTTCGGTCACCCAGATACCTCCAAAGCAAAATATATAACGATATAATTAA
CATTATTTGTTGCTTGCAACATTTTTCATCAATATTCTCTCTCAGTTCCTATTATCATTT
TTTTTTCTCTGATGATGGACATTAATTATATTGTTTTACTTATTCACTTGCTCATCTATG
TCAACATAGTTATCGATAGGGAAGCAAGAATAAGTCACATGGGAGTGCTAGATCTTCAGT
GTCATCATCTCGGGCGAAGACACGCATGTACTAGAACCTAAGTTCATAATTATTAATTCG
ATGGCCTCGTTTCCTAGAAACAAATATAATTATCAGTTTATATTGAGTGGGAATTTCTAT
ATATAATACGCAATTTCATTTTGCTCAGCTTCCCCTATCCTGACTTACATTTATAGCATA
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TTTAACTTCATTCGTATGATATGCCACTTCACATGTATCCCACATTCAAAACAATCTTAC
TCTTTGCATGTCTTGCACGTGGTCCTCATATACGCGTACACTACTGGATTCTTCAAAATC
TACCCTTTCAACCACAGCTCCAATTGCCATAAACTTTGAAAGTGATTGACAATTCGAGCA
TTACCAAGCTTGATTCTTTAATACTGAAGTAAAATGTCGTTTCCATATAGTTGAATCCAC
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ATGTTGATCCTTGGTCACTACAGACTCCATGCTATTGAATGGAAATCAATTGTTTGAATA
TAATTATCAATAATATTTGTATGGAAACTTTTCATAACATACTGCTTTCCCTTGCTTTGT
AATGTGTGACTAATGCTTTTCAACATAACCGAATCAACTTTACTACATGCTTGGCATGAT
TTTTTTTTCTTCTTCCAAATTTTGTTGTTGCAGAACAACAATATTTAGCTTCTAGGTCTA
GTACAATCTTATCTGTTTAATTCTCAAATGTACTATTTTATTATTGGTTACAACTATCGT
GAACTTTGCCAATGACCTGCAATTTAGGCATACCTTAGTTCGCACTTCTGCACTCATGTT
AATATCGTTTCCTACATAGTTAAATCCATGCATGTTGATCCTTCTAACTAATCCATACAT
ATTGACACATCTAAGACATGATGAGTTTGGTGTTGGTCCTCTATCACTGCAAACTACATG
ATACCAAATGTAAATCAAATAGTTTATTTTAGCTTTGTTCCACATTTTCAATTTAATTTG
ATTGTACATATAAATCCATCCATTCATGGTACAAATTTATTGTGCTTACCCATTTTTACC
ATAATAATGGAGTATGAAATCAATTGCATATATTTTATTCCTGACAAACTAATCCGTGCC
TATTGGGACATATAAGACATGTTGTGTTTGGTGTTGGTCCTCTGTCATTGCAAACTACAT
GACTACATGATACCAAATCTAAATAGAAATTGGTTCTACATTTTCAGTTTTAGCCTAATT
GTACATATACATCCTATCACTCGGATTAAACAATTAAATGTGTTTAGCTATATGTGACTA
TAATAATGGAGTACAAATATCAAATTTAGCTATGTATGTGAAAAGAGTTCTATATTTTTA
CCTACTTTTCATATATACTACTCTTCTATCAACAAGTTCGTTCATAAATTTAGCTATTTG
TGACCCTAATACTAATAACCATATATCTCTACCCATTATTTTGCATGAATTGAGAGAAAA
GTACAATAAATATCTCTGAGTCGTTGCCAATATTAATTCTTGCTGGCGTTAGAGGTGATG
TTATCCATGTTCTACCATTCGCATACCCAATGTGCTGGTTTGTGATTGATTTGATATAAC
AACCCTTGTATGAGATATTGATGTGTATGTCTAGTTGTTATTTAATTTTAAATCAAGGAC
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GCTTTTGTTTTAATAATAATAATAATATAGATAGATAGATAGATAGATANNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGATAGATAGACAGATAGAT
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AACATATACCAATTCATAATTCTTGGATAACTTTTGTGGGCCTCCTTGGGTTGTAAAAGT
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CTTTAAAAGAGTACTAACTTTTTTTCACATGCAGGAGCTACTACCGGTGCACACATCAAG
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CATATGAGGGCACCCACACGCACCCAATTGAGAAGTCTAATGACAACTTTGAGCACATAC
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ACATGTTTCAATGAACATCGCATGCATGGCTGAACAATGCCTATGCATGCTCGTAGAGAT
TATGTTGATTTGTACATTAACCCTAGACATGTACGTGAAAGAGTAATAAAGCGTGATTTC
ATAGCTGGATAGATGCAGCTGGTTACTCACACGAGTTTTTTCGTTTATTTGTTGATGGTT
TTTTTTCAATTGTAGATGAACTATTATAGACTAATCGATCAATACAAACACATAAATTGT
TATCGCCTTGGGGGCATTGTACAATACTGTTGTACAGCTGCTCGTCATCCATTCCAGATA
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TAACTTGGTAGACTTTTACACGGGGTCAAGGGAGGGGCGGACCCCCCGAGGGCTAGACCG
GGTGTGGATGTTGGTCGGGGATGTTTAGTTTCAAAGGTAGCCTCATCGGTCTTTATCACC
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GTTGTGGTGATCGAGTGGGCTTTTGGTCCTACTACAGAATTACTTGTGGTTATCTGGAAA
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ACATGATGATGTGCTCCCGTGGGCGTTCACATCTCGATTTTTTTTCTTTTACTTTTTCGT
TTCGTTTTCTCCATTCTTTGAGGTGAAAATACGCAATTTCGGAATAGGGATAGATGAGCA
CTTATTTTTGAAAATTAATTATATGCAAAAAGGTTTCATTGTATTTTGTTTTATGAATAT
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TGTTCGTTGTGTTTCCCAAAACAGTGTTCACCAGGAAGCGGAAACTCCACAAACATCGGA
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GAATGCCTGATAAACACCTTTTGTATTACATGCTGAACATTTTTTAAATATGCGATGAAT
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TGAAAAACTCCCTGAACATACTTGCATGATGAACAAAAAAGAATGATAAAGAAAATAAAA
GAAACAATATGAGAACATAAAGGGTAAAAAGGAAATATGGAAAAGAAACGAAAATAAATA
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TTCTAACAACTGTCTAAAAAACATTGGGTGTGAGACTATATTGATGCATAATGTGACGAC
GATGAGTGTTCTTCACAACTTTCTAAAAAGATGCATGTATTGGTGGTACATCGATTGCTT
GAGATGCATCCAGGAAACCAGAACATGATGACAAGTGAACTGATCAACGCGACAAACCGC
GGAGCACAACTACTGAGCTACCGATGATCAACCGAGTGCGGCAAATAAGTAGATGAGCGA
CCTGAACCCTAATGAATGTCCAATCCTCTACCAGATGAAATACATTCAGACGCCATCGTG
CAGTAGTATAAGACTTGCAGGTGCAACTGCCTTCTCATCCCAGGAACTGGCAGGGACGGT
GTTCAGAGGTTAATTAGGTCATCTTTCTTCGTGTCCTGCTTTTGAGCCCCATCCACATCC
TCCTGGGAGGAGCTGCCCCCTCCCTTCTTGCCGAATATCATCTCGTCGAGGTCATCGAGC
ACACCTTCATCTTCCCCAGGCTTTGCTCGAGTACCGGCCGGTTTTCTGACCAGGGCCTCT
TCGCTCCCGGCGCCGGTGGGGTCCTCATGTTCTGCTTCTGCGGGGATCGGTATGGCCAAC
GGCTCTTGCTCCGCGTGCGCTGGCGCCACGGGTGTCTTCATCTCTTCGTATCTGGATAGC
ACTTTCTGGATCTCGTCGTTCACGGTCAGGGCCTCGAAGAGCATGGCCTCGTTGTCCCCA
GCCGTCTCGATGAATCTCTGGATGGTGTGTTGGGATTGGTAGCATTGTTGCACAAGGGTG
GTCGTCAAGTCATCCTGTGCAAGTAACAGAACTAGTCAAAACATAATACTAGCTCGTCAC
CATTGTAACAAAAATCTACCTCAAACCAGTAAAATAAACATGTACTGTAAAACATAGTCT
GATTACTGAAGTAAGTAGTCCATGTTGCATGATATTTTGAACGCACACCTTGCTTTCACA
CAAGTTCAAATATCTCTCTCAGTGAATGCAATCGCTATCAAGGGACATCATATCATGCGA
AATTCAGCATTGAAGGGTGTCTTCTCAATGCTGATTTATAGTTAAATAACTGCCAAATAA
ATAAACAGTTTTTGTAATGTATCTCAAACTTGCTCCGTTACGACTTGTGATAGACTGATA
GCTCAGAAAATTGCAGTAATGTTGTCTCGGAATGGTAGATGATATGCATTTAGAAACAAA
ATTGGAATGCTAGAATAGCACATTCAGGAACAGAGTGGAACTTCAGAGTTCAGAGTATCT
CATAAGCAGAGTACTACGAGCATGCAATAGAATAAAATAGCCAAAGCACTGGCAGCAGAA
CCAAAATAATAATTATGTGCTACATGTATTATTTTTAAATGTTCACCGGAAATACTCCAT
GAAAAAACAGCCCACCTACTGTGTGTAGTGAATTAGTGTAATCCAGTCAAAAGGTATTTA
TGCGAACTTGGAGAAAGCCACACAAAGTCCGGTTACCTGCAAAGCATCCTGCTGAGGGGA
AGATGAAAGAACAGTTGAAAGAAGCTCTATGCTATTACGCGCAACATCAAAAGCTTCCTT
TGTTTCTTCGGCAGTATATGTATGCATATGCACATCTTGAAAGGTCTGTTGCGTGAAGTT
TGCACCAGCTTCAGCTTCAGCAACTGAGCGTGGTGGAGTAAATATGGGGGCCAAGCTCTC
ATTGTCGCGTCCAGGAAACCGCACTCCTCTTGATTTCAGGCTCTACAGAAAATATATTAG
CTAGTTGGTCACTCCACTGCCTTGGTTAACAAAGCATGATATATTTTTCGCTGCAAGTTA
AATCATATGGATTTACAGTGCTGCCATCAAACAGGACACCGAAGCAACAGATTATTTGAC
TAAAAAATTTCTTGAGTACGTAGATGTCAATGCTGCTGCGAAAATTTGTTCACTACAATT
TCTTCAACCATTAAGCCGTGAATTTAAGCACTGGCGGCATAAAAAGTATGACCACCGCAA
ATTATCACTCTTCACTTCTACAACACAAAAGTATGAAACATATTAAATCACAAAAGTGAG
AAGTGTAAAGTAATAAAGCACTGAGCTTATTGCATACTACTGTATTTTCTTACTTACAGG
TATTAAGGGGGTGGTATAGTATAGGGAATGACCAAATGATATATGCACCGTGATGGACCC
AGTTTTATCGTCTGTAATTCAAACAGCGATTTCATTCTGAAGTTGTTTCATCTCATGATA
ATTCGAGATAAAACTGGGTGCTTCCCTCTATCTTCGATCTTTGAAAAGCACCAACTAATT
GATGGCGTGTGGTTCTACTTAACTGTTGCTTCCACATTATCACTCCATCATCAAAATTTA
AGATGAAGTTCAGGTTTTTTTTCTGAATTTAATGACTCCTATTTGTTCATGTTGACTACA
GCATGCCAGTTTCAGAAATGACTGCTTCAGTACCCCCTAGGTTCCACACCTGTACATTCA
GTAATGTTTCTTTGCCAAAAATGACTCCAAACGTCAAGCGACCCCTTCCTTTATAACAGT
AGTTGTGGACTTAAATTACTTGTATAACATGTTGTTGATGTTCTGGTAGAATATAATTTA
GTTATTCTCTATAAGGTTTGCTTCTTTTTTTTCTGAAATAGTCACGACATCTAGTTTTCA
GGAGACAACCAAAAGGGGTTGTCAC