Map Locations of contig_2546973 (9616 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_2546973

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36561 3 2342 bp MLOC_36561.1 Available Available LOC_Os07g49260.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13107.m05292 protein importin subunit beta, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_36561






Contig Sequence (9616 bp)

>contig_2546973 9616 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTGCGGCTTGATTCAAATCCCGATCTGTGTCTGGAGTGTTCCCCACGAACGGCGGGTCG
CCGCCTTTTGTGCAGCCAACTGGCGGTGTCGTCACGGCTCTGGTGCCTGTTGCGTTTCCT
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GTTCTTAGCACCAAGTTTCTTGAAACATTACACATGCTCTTATAGCAATCTTGACCATCA
TCTTGGACAATGTCGGGGAACAAGTTTTCTTACTACTTGAAAGCATGAACGCTGTTCTCC
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ATGTCAACATGTTACAGTAAGTTCTATTTTCCCCCCTCACTTTCTTTTTTTTATCAATCT
AATCGTAGCTTTTGGGTGCAGCTCTTTCCTCAGGAAGCTCCACCTTTGATATCCAGCGCT
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CAGTGGCGATATTACAAGCTCTTCTTGGCTTGGCAATGATAATTCAGGTTATCTGAGCAA
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TTTAGATTATTAGGTTCTTCCTCTGACAATTCCCTTGACCAGGCAAAGGATTTAGATCCC
ATTAAACAAGCTTCGCTAGAGAACATACTTAGAGAGAACTTGAACGCATGTGCGGCCCAC
CACGGGGATTCGACTTTCAATGCTGCCATCAGCAGGATCCATCCATCATCATTTGCTCAG
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TCTCTTGAATACATTGAAGAACATCTGGCGCATCACGCGCCACCATTGCTTGGAGCGCAT
GGTGATCCCCACGCACCATGTAACTAATCACATTAATCGACACTCGATCAATAAGCTGCA
TGCTTTGATGGATTTAATGTTCATTTTTCTTTTCAGGTGCTGCCATTTGATACGCTGCTT
TTCGGTCCGGTGATGTACTGTCGAAGATGACGCCAATTCATCGTGTAGGTGTAGAGTGCG
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TCTATGTGTTAGGTCTTTCGTGTGGGTTTGACCACTCTAAAGAGACGGCTGGAGTTTTCA
TGGATATTATTGCGGGCTATTTTTCTGCAAATCTTTTTGTTATCTGTCGGGGTCGATTGG
GCTCTAGTCTTCAGGTTGGCAGAGGTTTTACTTCCCAGGTGGCTGACTTTACATGAGAAG
AGGCTGGCAGAGTTGATGAATGTAATTGTTTGTGCGAGATCAATATTATTGTGATAATGA
ATTGTTCTGAGACTCATTTGTTTTCCTTCACGCACCAACACATTTTTTGCTCGTTATTGG
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GTAGACGTATTACATTGAATTGTTTCGGAATGGAATCACATACTTGTGTGTGTGCTGTCG
TGTATTCACTCCACTCATAGACTAAAAGTATTCGCCTTCCTTCTGCTTGCTGCTCTTTTT
CTTTCACGCTTAGGCAGCTATGCCAAAGTTCTACTCCAAACTCCACTTTCCCTTTGCTGC
TCTGGTGGAGGGATGGGGAATCCTGGTGCCTCGCCTCATCTACATCCTCTGTTTACGTCT
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TGATGACGCCTTGATCCTTGGATTTGGTTGTCACGATGAAGTTACTCGCTGCTGTGGTGG
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CTTAGAGATATGTTCATGAAGACTTTTCGGCTGTCATCAGTAAAGTCAGGTTAGCTCCGG
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GTTGGAGACGCTCTTAGGCGTCGTTCTTGCCTTCATCTAGAAGCCCGGGTGGTGGGGATC
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CGTCCAATAAAAGTTTTAGCACGTCACTGTAATACTTTTAATGCGCGAGAACTGAAGCAT
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GCGCGTTGAACCTACTATAGCGCACACGATTTTTATGCGTCCGCTGGGGCAACCAGAATG
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AAAAAACATAATCTCCAATGATGATGACCACATTATGTTCACATATCATCGCTTGATTTA
GAAATTTTGTGCACAA