Map Locations of contig_2546959 (5566 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_2546959

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36548 1 273 bp None Available Available None
MLOC_36547 3 1572 bp AK250784.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_36548






CDS Structure of MLOC_36547






Contig Sequence (5566 bp)

>contig_2546959 5566 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAGCAACCAAGGAGATGGAGGCATTGAATGTTGGGCAAACCAAGGAAACAAATGTAACTG
TTGTGCTGCACATTTTTTTTAATTTTTTTTGCTCTTAATTGAACCGTGAATGTTCTTCCT
TTTTCACTTATGTTGTTCATTCATGGAAAAATGGTTTGGGATGAAGAAAAACCAAATAGG
CTATTGACTAATATTATTCTACTTTCCAGAACTGGTATTTACCACAAGTTGGTAACTACT
AGTTGTTTCTTGCCATAGTTGCTTTTTCATTGCCTCATTGGTAAAACTTGGTCAAACGGT
GTCCCCTGAATTCTCCTCGTAACTGTTTTGGAGCCTCTGACCACATGCCATCACTAGCCA
TGCCATGCCCGAGTTAGAAAGTGATATGTGATTACAACAGCCCTACAACTGATGCCAACT
ACTGTGGTCATGTGGATTGCTGAACCTCCCATGTCATCCTTCTCTCGAATGATCCTTGCG
CTGATGTATATCTTTCTTATGGTAAAATAAATAACCTTCCCATTTTTGCCGCAGGATATT
CTGAAAAATGCGTCAGATAGCAATGGTGGCGCCACGGGAGGAGCTCAGTCGTCACCACCA
GCAGATGATGATGATGCACAAGTGGATGGTCCATCTGAAGATGGAGCAGGAGGTGACAAT
TCTAATTTGCAAGATCTCATTTATGTGTTTCTCATAGAGCTGGACCGGTTGATCTCTTGC
TATTCTCAGTATATCCTGGCTAGCATTTGGAATCTGGGATATGAAACATGTGATTAATCT
AATTGTTGTGCCTCAAATGGATAGCTCCAGCGGCTGCGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAGCA
AGGCCAAGTGAGTTGTATTATTCAGTTGAACAATTGATGTTCTTGTTTGGTTGCTCTATT
GTACAAGCATTTCACTTGTTCTTGTAGAAAGAAGAAGGACTCCCTTCAGCAGACAGATCC
TCCATCAATCCCTGTGGATGAGCTTTTCCTTTCAGGAGATTTTCCTGAGGGAGAAATCCA
GCAATACAAGGATGAGTAAGTACTGAATTATAGGAATACGGTGTTTTTTATATCTCCATT
TGTCGCTGATGAAGGACTCTGCAAAATGTTAATTATCTTTTCTTTCGTAAATTAATCATG
TTACTGCTCTTCAGTAATTTATGGAGAACAACTAGCGAAGAAAAGAGGGAACTGGAGAGA
CTACAAAAACCGATGTACAATTCTGTTCGCCGAGCTGCAGAAGTCCATCGACAGGTTTAG
AATATTCTAGCCTACTAGCCTCTTTAATTTTTTGCAGCTTCGCAACCTGTATCTTTTGTT
GGTACATCTAAACAATGTAAATATGGCTTGCTAGGTACGAAAATACATGAGGAGCATTAT
AAAGCCTGGAATGCTAATGATGGAACTATGCGAGACTTTGGAAAACATGGTTCGGAAACT
TATTAAGGAGAATGGACTGCAAGCTGGTATTGCCTTTCCAACAGGATGCTCGTTGAATTG
GTATGGTATTGCTCTAGTGTACTTCCTAGTACTGCGTCCCCTTCTCACATTGACGGAAGA
ATTTTTTGCTTAGGGTCGCAGCTCACTGGACTCCAAATTCTGGTGATAAAACTGTGCTAC
AATATGATGATGTGATGAAGCTGGATTTTGGGACACATATAGATGGTATGTCTGTTTTAT
TACTTTGTTTGATTCTTTCTTCATTGAACTTTGGTGTATACTTATTGCTTTGTCCTTGTA
AGTACTCATGATATTAAGAATCTCATAAACTAACATGATAGTGTGATTATTCCCAGGGCA
CATAGTTGATTGTGCATTTACCGTTGCATTTAATCCCATGTTTGATCCATTGCTTCAAGC
AACGAAAGATGCCACAAATACTGGAATCAAGGTAATTCTACACATTTTGTTTACTCTTCC
AATGTTGTGGTACATTTTAACTCAAAATGTACTCAGATACTACCAAATGAATGCTTTCCG
TAAGCAGCTTTGCTCGTAGTATTTCTGATAGCAGCTCTACTTAGTGGAAGAACACGGTGA
TAGTTTTCGTTAAAGCCTGTGCTTTTGGTTACCTGCTGTAGTGTCTGTTTCAGCATGCTG
TCATTTCTCCAGCTTTTTATATAGTGTTTTGGTTGGATCTGATCTGAGTTTCGTTTTTCA
CCTGTTAATGGTCTGATCTATGGATGTTTGAAATCATATCCCCCAAGTCATGTCTATTCT
TTGTTTAATAATGCTTAATCCTCCATTCCAGGAAGCTGGAATAGATGCACGGCTTTGTGA
TGTCGGTGCTGCAATTCAAGAAGTCATGGAGTCATATGAGGTTGAAATTAATGGGAAAGT
TTTCCAAGGTATGTGTTGTCTTTTCTTTCCCATTCTGCACTAGTAGAATTGTAGTGACAG
CATGACGATTTAAATGGCTTCTTTGTTTTGCGGCAGTAAAAAGTGTGCGAAACCTCAATG
GACACAGCATTGGACCATACCAAATCCATGCTGGTAAATCAGTTCCGATTGTAAAAGGCG
GAGAGCAAACAAAAATGGAGGAGGGTGAATTTTATGCCATTGAAACTTTTGGGTCTACAG
GTATGTCATTATATAGCTTTAACTTGTAAGCCCAGATACACTAAGTCATTTTCATCACAT
TACTCACAGTTTTTATATCACTTTCTATAAGAGTATCTAACTAGCATGGCTTTTGGCTTT
ACAACTGATGTCTGTTTTCCCTACTTTTTTCAATTTTTGGACAGTTTTACAATTCATAAG
CGCCATTCTGTTTGTAGGAAAGGGATTTGTGAGGGAGGATTTGGAATGCAGTCATTACAT
GAAGAACTTTGATGTTGGGCATGTACCCTTGAGGGTAGCAAAAGCCAAGCAGCTACTGGG
GACAATCAACAACAACTTTGGTACACTTGCATTTTGCCGCCGGTACTTGGACCGCATCGG
CGAGACCAAATATCTCATGGCACTGAAAAATCTATGTGATGTTGGCATTGTTCAGGTATG
TGAAATAGAATATACCACCGTTTCCATCCGAATGCCTTATCATGGACATGGTCACTCACG
GTTTCCTGACCTGTTTTGCAGCCGTACCCTCCGCTGTGCGACGTGAGGGGAAGCTATGTG
TCCCAGTTTGAGCACACCATTTTGCTCCGGCCAACCTGTAAAGAAGTCATATCCAGAGGC
GACGACTACTGATTGGTGCTGCGTCTCCTCTTTGTACCTGCCGTTGCAAGCGATTAGTGT
TTTACTACCATCTTGGGTGACCTGTGTTCGTTATGGATCAAATGGCACATCAGAATCGGA
CAAATAATGCAGTTACATTGTACCCTTTTGTTTTCTGAGATTAAAATTTGTGGAAACTGG
TTTGTAAGAATTGCTACCGTGTTGTATTGCTTGATCCCTCTATGAAGAATACTTCCCGAA
GATTTTTATCATTAGCGTGGGACAGCTGAAAATGACACAATGGTTTCTGTGAAGCGCTAA
AGTGTTCTTTTAGCAACAAAAGCTGTTGGCAGGTTTTCTTCTCCCTGCGTCCCATATAAG
TGTATCTAGTCCCTCCGTTCCTTTTTGTAAGACGTTTTAGACAGTTGATTTTAAACTGTT
TTGGAAGCTGTCTGAACTATCTAAAAGTGAACAGACAGAGTATATCCATTTGAGCGGCTT
AGAGCTTGTTTGGGACTGCTCTGTTTCAGAAAAGATAAGCCAAACAGGATAGCTCCACGA
TATGTCGCTCTGCAAAAAAACTAGAATTTCAGGTACAACTTCAAAGTTTTTATGAAGGTC
CTGAGAGGGTGCTCCAAAAATCTAGCTAGAATTGGGGGAACTTACCCATCACTGTCACTA
GTAAGTGGATGCCCCTTTATTTCTTTCCCCTCAACCAATCAAATATATTCTTTTCACTAA
ATTTTCTATTCATGAAACTGGAGCTAGATGAAAGCCAAACATTTTTTTGATAATGCTATA
ACTTTTGTATAAAACTGTTCTAAAATGAATTTGATGAAGCGAGACTGATTTTGATGCATT
AAAGAAGCAGTCCTAAACAAGCCCTTAATATGGGGAATATGGGATGGAGGGAGTATAGTA
TACTTGTACTAATTTTGTCATGCTTATGCGTGGAGGGAGGAATATCATTTACCAGATGTA
GAAAAGGGAGAATCATCCCACGGCGCCACCCACGAATACTAATAATTTTTTATAGGAATT
AGAAACTATTTCTTCCGTCCCACAATGTAAGATTTTTTTTGTCATTACACTAGGGCGGAA
GTAGTTAGTTTAGCAATGTTTTTCAAAGTGCGGCGTTTCGATGCCCAGACTCATCTACAC
TTGTTTAGTAAAAAAAATTCAAAACAAATACTAATAAAGTGCGGCATTTCGGTGCCCAGG
CTCAGAAATGGATTTTCGTGTTTTTCATCCACAACATGGTCTACTTGTTTCTCTTCAAGC
TCAACATCATCTAGATTGGATAGTACTTCCTCGGTGTTAATATAAGATGTTACTACAACC
AAGTCAACGTTGTTTGTCACTTGTTAGTCCGTTCCCGATAAGTCAAATGCTTAATGTTGT
TTTTGTGATACCAATGTTGGATGTAAAGTGAATGTTGTATCTCTGGTTTACTTCGTGTCT
TGTGAAGTTATATTAATGTTGTTTTTATTGTGTTCAGTAAACTATGAAGTGTGATCACCA
GTGGCATGTCTTGTTCCTGATTGGTGATGCGGATTTAGTGTTTTGGACCATGAGATAAAT
GTCGGAAGGTGATGGTGGATTTTTGCTCTTCGATCAAACAAGATCAACAAAAAGGTCATT
CAAACAAGTTACTTAGTTTAGTTTTTTCTTAACACAGCATAGTTCAGATAGTTAAGTTTT
TTTTGGTGAAATCACCCCATCACGTTCATGTGTGCTATTTTTTCTGAATTTATTTGAGGC
TCTTTGATGATTTTCGTTCAATGAAAGAAGATGTTCTTAACGACTACAAAAGCACATGTG
ATGACTCCGGTAATATGAAGATATTGTGTCAGCTCAATACTCATATGTGCTCATAGGGAC
AAGGTGTGCATACATGTGTTCATGAAGATGAGCATATATGTGCATGTAAACACATCTACT
ATGTTAAAAAAACAGGTGTTAAGGGCCTGCCGTGTGGTGTGTGGCATCTTGTCCCGAATG
ACTCCATCGACATCCTTTTTATTCCAGCATGAACCAGAGAAGGCACGTTGCCACGTCATC
CTTTTGCAATCGTTCGAGCGGGATCATGAGCGACTCGACCACAACCCAAACCCCCTATCG
ATTCATTTTGACACCCACAACCACGCGCACACCCCCACACTATCGATTCACAGTAGCTGC
GGGGTGGAGGTGAGCATCGCCCGATAGTTTCAAACGTGTACCACAACAGGGAAGGCGGAA
GGGGGCGGCTAGGGTTAGAGATCCATCGCGTCTATTCGCCCTACCCTATGAACGACCGGG
GGGCTGGGGTCCCTGGCGCGGCTTGGCCTCCATGGTGGACACCGACGTGGGAGAGAGCTT
TGATGTCTACTACACAACATTCTTCTTGTAGACTCGTGTTTGGCCT