Map Locations of contig_2546912 (7356 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2546912

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36518 4 2599 bp MLOC_36518.2 Available Available LOC_Os07g28850.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13107.m02893 protein retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed





CDS Structure of MLOC_36518






Contig Sequence (7356 bp)

>contig_2546912 7356 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGCCTGCACCAATACGACGTACGCTTCCCTCGATCATCACTAGTCTCTAGTCTGTACTG
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TTTTATTCCACTTTGAAATCATTTGTCATCTTCACAGTGTGGGGGGAGGAACTCGGTATT
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TAAGTGAGGGTCAGTTCAGAATGGTTTTGGAGAATGAGATCCCGGAGATAGAAAAGGTGC
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TTAATCGTAACTCCTTGTGTCAGGCATGGAAGGCGTTATACAATGTGAAGCCGCCAATTA
CCTTCATAGTGGTGCAGAAGAGGCACCATACAAGACTGTTCCCAAGTGATGGCAAATATC
AGGACGACAGTGGAAATGTTATGCCAGGTTATTTCACAAATTGCATCAGCAAAATGTCTG
ATTTTTCCGAGATTTTTTTTCTCACATGTTCCTGTAAAATTCCAGGCACAGTGGTTGATA
GGCAGATCTGCCACCCAACAGAGTTTGATTTCTTCCTCTGTAGCCATGCTGGGATCAAGG
TAATGCTAGCGCAGCATTCATCAGTGTACTCCCTCAGTTCCAAAATAAGTGACTCAACTT
TGTACTAACTCTAGAAGGGAGTGGTAGTTTCTTCTTGATGGTATTTATATCATCTTAATG
AATTATGAACTTGTCGAACGCAGGGAACAAGCCGTCCTGCGCATTACCACGTGCTGCGAG
ATGACAACAACTTCAGTGCTGATGACCTGCAGTCTCTTACAAACAACCTGTGCTACACGT
AAGGGTGCTCATACCCTTGATATTGTGTATTTTTTTGCATGTTTTTTCTGTTCAATAATG
TGACTTTTTGCTCTTCTCAGGTATGCAAGCTGCACTCGCTCCGTGTCGACTGGTATAGCA
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TGGTCCCCGATCAATGTTAACTTGTAGTTCTACTGTTCTAGTTATGGGTTACAATATTGG
CTGTGTAGTTAGTAGTTTCTACTATCATCTTATTCTCAATTTGACTGATGTTTGTTACTA
CTTTCACATGTTCTAACATGTTTGGCTGTGTAGTTAGTAGTTTCTACTATCATCTTATTC
TCAATTTGACTGATGTTTGTTACTACTTTCACATGTTCTAACATGTTTGGCTTGTATTTT
GGCAGCTCCTCCTGCGTACTACGCTCATAAGCTTGCGTTTCGTGCGCGATTCTACCTAGC
CCAAGTCCCAGACATGGCGTCGGAGATAAGCGCCGGCAGTGCAGCTTCTTCATTGACGCT
TCCTGCTATAAAAGATGAGCTCAAAAGCCACATGTTCTACTGCTAGTCCCTACAGACATG
AACGAAGCCTGAAGCCTGGAGAAGAACATTTAAGATTTTATTTTGTTTCTGTTGGTTTAA
TGAACATGGGACAATCTCTAGTGTCTTTAATATTTCCAGTGACTGAGAATTATTCGTTTA
TGCAAGGATATGAATGGAAATTTTATATGTCCTGCTATTTCAAGTGATTCAGCATCTTGG
GGTTCATGTTTAGCATATAAGTTTGAGTTAATTTAAACTTTCCTAGTTAAAACCCTGATT
TTGCCCACCATACCGCCGTGCTTACTCACAAAAAGATTAATATTTTCAAAATAAGTTGCA
GTTACCGCAACTAAAGTTATTCCCTTATTTTGTGGAAATATCTTTGTGTAAACACTTCAG
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TCATTGTGTGCTTAAGGAAAGGCCGGTTCATTTTTGTTAAGAGTAAAATGAGATTGAAAA
TGAATGGACGATTAGTCATGTTCTATTGATGTATATATATACTTTTGAAAGAGATGGGAA
GGAAAGGTACCCGTTGCTGAACGCACCCCTTGCTAATGACGGTTCATTAATTAGCATGTG
CTAATTAACAATAGACATGTGCTAATTTATTCCCAACAGTCCCCCTTGTAAAACACAGCT
TCTTGATCATCATTGAAGGTTTCTTGAACATCATTGAAGGTGTCTTCTATATTCATCTTC
CATCTTGAGAAATCCTTTGTACAATGTTGAGTCTCCCCAAAAAACCTTTAAGAAAAATAT
GAGGGGAATAGTGATTTTATGTTGCTAAAACTCCTTTAAACCTAGTGGAAAAAATAATAA
GGAAAAAATGATGTAACATATTATGATTACTGTATCCTTGATAACTCATATGAGAAAAAA
ACTATGAAAAAGGAAAAAACTGATTTGAGTTTGAAAACAATAAATATTCTATATATACTT
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TATGAGAAACTTCAAGAGAAATCTCATAAGGGAAAAGAGTATGATCTAATATGCCATTGA
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ATTGTCACTTTTAACTCAATATGAGATAATCGATAGAGTTTAGAAGGCAATAAATATGTC
GTGTATACTTCTACAAAAGCCCCGGTGGGGAAAACAGAAAGTATGGCATATGATCTCATA
TTAATATTACCTCATTAAAAACCTTTATGAGAATTTGTATAGTAAACTCATGATGGGAAA
AGAGTATAATATGATGCTTTGAACAGGGACAATTCAGGAATATACCCCTTTGATTCTTGC
AAATTCCGAAGCCGTCACATACCAATTCAATTGACATATTTCTAGAATGTAGAAGTTGGT
AGAGACTTGGTGAACAAATGAGTGGCGTGATTTGACTTGCAAGAAATGCAATATAGAGAT
ATTACTTATTACATAACATGTTTGCAACCGGACAACACAAGCAACATTATCTCAAGTAAT
GTTTGGTGGATGTAGCCACTGTTGGGGAACGTCGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNAGACCTTTCATGGTGATGTCCATCTCCGAG