Map Locations of contig_2546871 (9379 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_2546871

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36491 4 2086 bp AK372132 Available Available None





CDS Structure of MLOC_36491






Contig Sequence (9379 bp)

>contig_2546871 9379 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGCGTTCGCCGTGCAAGGGGATGTCGTCGTGTTCTCCAATTACAGCGACCAGCGCCTGT
ACAAGCAAACCATTGGAGGTGCGCCTGCATCTCGCTGTTGATTGCTTGCTTTTGCAGTGG
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ACAGCCTAATACTAGCTAACAATTTATACATTTGTTGACCAGATTGCTGACTTGGCTTCA
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GTTGCTTTGGTTGAGTATGAAGGGGAACAACATGGTTTCCGCAAGGTTAACAATTATTAT
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TCTTGGAGCAGGCCGAGAACATCAGGTTTACCTTGGAGCAGCAGATGATGTTCTTTGCAA
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CTGCTTAAGCATCAACTAGTGAACTTTTTCTTTCGGCATGATACACCTCTGGACCAAATT
TCAGTAGTGACGAGAGTGGCGGCATTATGATTTATTATCACTGTCCTATTTAGATTCTGG
GTTTGGCAAAGTAACTCACCAACGAAGATGAAAACACATTAAAACCAATCGAGGGTCAAA
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TTGCTCCCTACATGGCATAAAATTGCCTAGTTGACTTTGTTTCCTCGAACCTCCGGTGTT
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TTTTTCTTTATTAATAATCTATTGTTGCTACGCAACCTTTTGATAACAATTTGGTTCCAC
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GTTTTCGTCTCATATCGCCTCGCTGATATATTGCCAAGGTAATAAATTAACAGAACAGAA
ATCACACTCATTTTTGACTTTTCATCAAAATTTCTTTAGATGCTTACTCTAAACAATATT
TATTTCAAACAAAATTACTTATCATCAACTCATACTATGTTTCATAAACTTCGTCATGTT
CTTGACACATCAAATTATTTGTTAAGAGTTCCTGCAGCAATGCATGGAGTATCATCTAGT
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ACCCAAAAGAAAGGATGAGGCCACACCATCTGGCTATGCTATTTGGCTACCTTGGCATAA
GAAAAGCGAAAACAAACAAAGGAAGCTTAGCGGGAGAGAGATATGTAGACAAGATAGGTA
TGAGAGGACTCATGAGCTCGCATGGACTGTTTAGTCTTCTTTTACTTCCTCTTGCTCCTG
CCCCGTTTAGAGTTGATGTCGGCACCTTGGCTTCATCCCGCTTCTCCTCGAGTAGCCTCA
TTGATCGGAGTAGAGATGGCAGAGGTGGTCGACTCCAAGTTGTAGATAGTAGGACTAGGA
CAAGGTTTAGGTTAGGGTTTGCTTTAAGGGCTTTTGGTGTCATCCTATTAGAGCTTCTCA
CCAGCTTGTGAGCTTCATACGGTGACTGCCATTCGCTGGCTAAGACCATTTTCCATGGTG
AAAGGCAACCGCTGGAGGTGAACCTAGCATAGCTCATGGAAGAATCTCATGTGGATTCTA
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GGGTGGAGCTATGACACCCCTCGTCGCCTTCTGGCTCTGGTAGTTGACTGGTGGCCTCAA
CTTTTCAACCGCTGACTCTGCGTACTAAAGGGTGGCCCTTTGGAGGGGCAGACCCTTGGC
ACATCTTGAGATTGATAAAGTCACCATGGGCGTATCATTGCCAACAGGAAAATTGTATCT
CACTGAACGAACATCACTGAAAGGTCTAATATAAATTTTGAGTAATGGGAGCATCAATGC
CAGGTCTAGGATTTGAACCTTGGTGGGTTGGTTCCACCACAAGGAATTTGACCATCTAAG
CTAAGCTTAGTCTGTAGGTCCATTCGTAGTTTGTGCCTAGTTGTACTATTTCTTTTTTTT
GGTCTTTGGGTTAGACCTGTGGGGATGTTAAATTATTGAAGTTTCTCTAGGTCCACCTGA
GTGTTGGAACACGCAGTACGCTACGCTAGCGCCAAATGAAAATCTCTGCTATGCACCCAA
GAACATGTTACTCGAAATAAATCACAAGATCGGGTTTACCACTAGACGCACAATCATCAC
AACGGAAGTAGAGTTGGTGATGAGTGTAGTTGATTAGTCGAGTTGTCTACTCCTCCTATA
GCCGATTTCCCATGTGTAGTGATCTCCCACGAAGAGCTCCTCACGGATCCCTCGAACGGT
TCGTCCAAGCACCACAAATGCGATGCCTCCAAGGTATCCACACATATGGGGGCAGCGTCA
GGCAGCAGAGTGTTATGTCCGATCGCACGACATGGTGGCATGGGGGTGGCCGTGGTTGTC
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AGGTGGGCTCAACACTTGAGGCCCACGGCGAGTCTAGTCTCATTTTCCATTCGGATCCAA
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GGCCCGAGGCGATAGTCGATAGCGGCTCCCAGCAGAATGGGCCCACTCCCATGTGTGTGT
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ATCAACCTTTGTTGGAGGAAGAATTATTACAGACAACATAATATCTGCCTATGAATGTCT
GCACTTTATGAAACGAAGCAAGTCGAAGAGGAATGGATTATGTGCCTTGAAACTGGACAT
GATGAAAGCATATGACCATTTGGAATGGACATACCTGAGCGCTATGATGACCATACTGGG
TTTTGCACCAGATTGGGTTGATCTTATCATGAGAATGGTGAGCTCAGTTACATTTTCGGT
CTTATTTAACGGGAAGAAACTGAATCAATTCACTCCTATGAGAGGGATTCGACAGGGAGA
TCCACTATCACCCTANNNNTTCTTGTTGGCAGCAGAGGGCCTCTCGTGCCTCCTCAAAAA
CCACAATGAGTCATCACCTATTCACGGAATTAAAGTGGCACCAACGGCTCCGCTGGTAAG
TCACTTACTGTTTGCTGAT