Map Locations of contig_2546850 (8893 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_2546850

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36464 3 3142 bp AK354470 Available Available None





CDS Structure of MLOC_36464






Contig Sequence (8893 bp)

>contig_2546850 8893 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGGGCGGGCTCCCCCCTCGATGCGCGATTGGAGGCCGGTTCCTCGCCGCTAGGGTTCT
TAGGAGGTTCTCGCCGATGCGGAGTGATTCGTCAGTCCGTGCAGCCACGGCCGCGCCCCG
GTCCCCTACCGACTAGCTGGAACCAGACGAGCCCCTTCGGTCTTCCTTTCGGGCTTCGCG
CGGATTACTGGCGACATAGCTGTTCATTAGGTTTGTTTGACTTAGGAGTTCAGTTGTCGT
GGCCTCGTTCAAATCATGGCCCTTTTCTACATTTTTAGGGTTCCTGTTTAGACCGCCTGC
TGAATGCAATTAATGGCCGGCGCTTCCCGTTTTGGGCCTAGAGGGTAGGCTGGTTCCGTT
TGTTTTCTGTTGTTCGTACTTTCGTTTTGTTGTTGTTGTTGTATATGGGGAGGGGAATCG
GGGAGCATGGGTCTTCGGGAGAAAGGGGATAACTGGTATCTTTGATGGGCCGATTTAGCA
ACGAGGTTACGAAAAGGGTGCTGTGATAGATATGGCTCCTGGTCTGGATGCATTTAGATT
GGGAAAATAGATGGATGCCTGTCTTGCTGGCCAAACTTTGAAAAGTGAAAGCGAAAACAC
TTTTCATGTGCTTGTTTTATATCCGGTTTGCTTGTCTGAAATCGGTTAGGTGTTGCTATA
TCGATTGGGGAATGGTCATTTTCGTTATACCTCTATTGTACAGCGGGAGGAAAAGTGGCA
CAGTCAGATTTGCTACTTTTGTAAACTTGAGTAGCTTGGGTGCTCATCTTAGAGAAGGGA
TTTTGGTCTTCATTTTATTACTAGTTTCTGTTTGCCTGTGTATACTGTATTCTTTAAGTT
CCACAGAAACATCCCATGCATATATTTTAGAATTATCTTTCTCTTCTCCCCTTGGTTGAC
GGTTGCTTAGTTTGATCTTTTATAATTTGGCAGATGATGTATTCTTTGTAAACACCATTG
GTCTGCTATAATGTGTTGTTGCTAACTGTATGAGGGTTAGTGAATGGATAAGGAGTGGGA
TCTGTAATTGTATAATCTCTTCTGTGTGGCATGTGAAGGTCGTAAAATACATTCTTGAAC
TTACCTGACATTGTCAGAATGGTGTGGTTTTGGAATTTTATGATTATTACAGACTCCTAC
TCAGTGTTTAAGTGAGTACTTGCGTGCACACTTGCATAGTTTGTGAACGTAGACATGTTT
TCAATTCTTACCATACGAATTTGTTCTCAGTTCCTACGTTTGCTTTGCAATTTATGATCT
TATTAGATTGCATTAGTTTTTTTTTCCATTGCCAGCTTACATTATCATTATGTTGTGGTA
ACCATAGATTATGTCAATTAGCTACCAGTTGAAGTAGTGTAAATATCTCATTTACCACTG
TTTTTTTTTTCAGATACCTTTCAAGAGGTAAAGAGCAAGCGTGACAAGAAAAAAGAGGTC
AGTCAACCATGTTCCTCAAATATATGTGCCCTGTATTCGTTTGGTGTTCAGTTTGTCTCA
TGACTGGTGATAGGGTATTACCTGGTTGCTAATGAATTGTTGCTAACCTTTTTCTCATGG
TCGTTCTTCATTACCATGAGCATCCAAGTACCCATACAGAAGATACTTTGTCCATGCAAT
AGTTATTTTGCTCTGTTTGATTTTTTCTGCTTAATAGTTAGCATGTTGAGTCATTCCTTT
GGTTCTTTTTTAGAAATACGAGTAATGATGAAAATAACAGATAGGTATGTGTGCTTGCAG
GTTAAAGAGACTCCTGAGCCAAGGTCTCGAGCGGCAAATAATGCTACCAGTCGGGGTGTA
AGAGGTGGCCCAGATCGAGGTGGGCGAAACAATTCTGCTTACAACAGCTCCATTGGTAAT
AGAAAAACCACCACATGCCGTCTTTGAAGCTGTTCTTGTTTATAATTCTTTTTTCACCAT
TTACTTACATTTGTTTTTCAGACAACATGACTTCAAGGTCATCGGTCTCAGGATCTGGTA
TGCCATCAACCAATTCCACCCAGAAGCAAACAGTTCCAAGGTAAGGATAAATACATTTGC
TTCTTACCTTAAGGGCAACTGCTTGGCCTGCTTTAGTAGATGCAGTTATGATTAGAAACC
TATTGTGCCTTTTCCGTGCAACCCTCATCTGTTGTCCCCCGAGGTGCATTGTGTTACTAA
TGATGCCCCTGCGATGTTCAAACAATTATTTTGTTGGAAGATTGGAACAGCCTAGTTTTT
TTAGCAGGCGCAGTTATGATAATAAATCTATTGTACCTTTTCCCTGCAACCCTCATCTGT
TGTGCCCTGATGGCATTGTGTTATTTTTGACGCCCATGCGATATTGTTCAAACCGCACGA
GTTCATACAATCAATTGTTTTGTTAGAAGATTGGTACACAATAGTTCTTCTGTCTTGTAG
AGAGATAAGGGGCAGCTATCTTAGAGGTACAATGTAATTTTGATAAATAAGAAAGAGTAA
CCCTAGAGATAGAGATTGAATTGATCAGCATACTTTTAATTAGACATATATTACGTACGT
GTCAAGTAGGTCCTCACATATAAGGGGCATTTTGTATCCATCTATCGATCAATCAATGAA
TGATCAGTTTGGTCTATCAGTGTACATCCTTGCCTGCCCTCATGGTTGTAGCTGTGTGCT
TTCTCTAGTTTTTTGTTGAGGAGAATTGTTTGATTACATTAAAAAATGCAATGTTATTAA
ATCTGAGTGAAACAATGTGCTCATCAGTTTTGGATGACTGCACAGCACCAAAATCATACA
AATTGTCTGATGTATTGGTGATTTCAGATTGTTTTCTTTTCACCTGTTTTAATATACATG
TTCTGTTTTGTCTTTTGTAGTTCCTCTGTGAACAAAAATCTGGTTGCTGATGCACCATCA
GTACCACCGCAAACATCATCTGGGTTTCAGCATGGTTGGTCTGGGACGCCAGGTCAGTTG
TCAATGGCCGATATTGTGAAGATGGGTGGCAGGCCGCAGGCTCAGGGGAAGCCTTCTACC
AAGCCTGTGGTCACAGCGGACAAAGGATATGCCGGACAATACCCATCTTTGCCCACCACT
GTAAACCAGATTACAAAACAATCTGTGAGCACAGTTGCACCAACAGAGCTTGACCAGGGG
TTACCTTCTGCGCAAGACTCTGTTCTGGTTAAGGACCACAGTCACACAGCTGCTGATAAC
AAGCAGAAATATGATAATGATTGGGCTCCACAAGATGACCCACCAGTAGGGAATCAATCC
TCCCTCCCTGAGACATCCGGGGACCCATCATTATACGATGCACCATTACATCCATCGTCG
CTTGTTGCTGATGCGGTTTACTTGCATGAAAATTCTTATTTGGATGATAACATCTCTGCT
GCAATGAGATCAGGAAATGCTTCTGAGAGACACTTGGATCACTATGGAGGAAGTTCTGAA
TATAGTGACGGATTATTGCAGAACTCGAGTACCTATCTGGCTCAGACGCATCCTCACATA
GAGGACCAAGGTGAGTGCTAAACTAAGTTCAAAGTATCTAGTTCTTTGCTGGTTATACTT
TGGAGGTCCAACATTTGTTTTTGAAACACCCATGCATTATCATTCCATGTGAGAATCTTG
TATATCTGCTGTGAACTGCTTTGAATAGGCAACACAACATCATTTATGAACTATTGTTTT
CACATCTCATGAAAAGATACTGTGTGTGTATCCAGTATTCATGCTTAATCATAACCATTG
TAAAATTGTTTGAGCTATATTTTTTATATGATAGAACAAATTAACCTTTGTAGAGATGAA
AAACAAATTGCTTTGTCTAATTGATACAATATTAGCCACTTCTATCTTACTTCGCCTGTA
TGCATCTGTGTTATGATAGAGTTTATGGTTGGAAAGGTACCAGCAACATATGCAGATGAA
TCCACAGATGAGGACCGTCACTCAGTGCTATTTAAAAAAATAGACATCTTAATGCATATT
TTAGACGAACCAGAAAGCACACTGCCCATTTCTGTCTGAATAAACTTCATGACTGACAAT
TTTGAAAGAAGTAGATTGCCACAGCAGATTGAAAGAACCCAGATAGAATGTTTCTTTCTG
AATATACGTCACTCTGGCATGTTCAGTGCTTCCAGTTTTGCTGAATATACTTCAGATTGA
CATGTTCAGTGCATCCGGTTTTGTATCATGATTTGCTTAACATGTGCGTTTGCACAATTA
TATTTGTGAACCATTTTTCGTCTAGTTGGTTGGTTTTTGTTCTGGAGGTCGCATAAGTTT
TTTTTTGGGCATGACCTGCACATGAATGTATAATTTCTCTCTTGTTCTATATGGTTTGCA
TCCCATGTTCTTATTCTGGATTTTTTTTTTGCAGCTGAGGAGTCCAACGCTGACGTATCC
GCAGCAGCAAACTTTCAGGGTCTGAGCCTACATGATGAAGAGTTAGCTGCCACAAAGTTT
GCCGAAGATAACCCAGCAGTTATAATTCCAGACCATCTGCAAGTTGCCAACACAGGTTGT
GCTGGATTGAGCTTTGGCAGTTTTGGATCTGGTGCATTTTCTGGGCTCCTCCCGCCGCCA
AAGAGCACTGAAAACAATGTGGAGTTGCCTATTGTGGAGGAATCTGAACCTATAGATCAT
ACAGATACAAGGTTAAGCGTTTTCCTGCTTCTTTATTTTGCTGGACAGGTCTCATCTTGT
GAACTCGTGACATGACTGGAATGACCTTTTCTTTCAGGGATCAAGATTTCTATGAAATTC
CTGCGAATTCGCCACCAAATGAGAACCTTGAGGAAATTATGGGAGCTAACACAGAGAATC
TTGATGTACCTTCTGTTCAACAGCCTGATGTCCTGAGGCAAGAAATACTGGATGATCCTT
CAGGTGTTCAATATAATCTGCCATCAGTCTCGAGCCACACGTATGCGAACCCAGCACAGC
CAAATGCAATGGATGCAATGCAAGGAAGTAACCAAGCGCACACTCTTTCACACCTGTCAA
GCTTGCTGGTACAGTGTTTCTCCCTTCTCATCTTTCTAGTAAAATAACTCCTTTTCATGT
TTCTTGCATCTAGTAAAATAACACCTTTTCAAGAGCTTCTACTAAAAATTGTAATGCACA
TATCTGGATTTGAATTCAGCTCATAGGTGCCTACACAACACATATAGGAAAGCCAGATTG
CACTTCCATATGGTCATGTTTCTAGTCATCACATGTTAATACACTTACCCTGTCCTGTTC
AGGCTAGTGTTTTAGTATCCGTATTGAAACAAGTCTCACTCCTGCATGGTTTGTTAAATA
CTTGTCTCCATAATTCACAACTAGCAACAGACATAACCTACGTACCTGTATATCTTGGCA
TTATATGATTTATCAAAATTGATGCAATTTTTGGACTATGATATAAGTAAGTGCCAGATT
GTGAGAAGGCATCAGAACCTTGATGGTTTCAATGTAGTGTTGCAGTAGTTACTAATTTAC
CAAACAACAAACGGTGACCTTGTTATTGTAAATTATTATTGGTTGTGTATACCAGTTTTC
TAGCTGATGAACATGATTGGTTCTTTTGGGCATCCAACACTTCTACATTTGGTTGCATTC
TATTTTCAAAAGTGCTCGTTGCTCCTTTTTCTTTTCTTAATAGATTATTATATCTTCAGA
AAAAACTGCATGAGCCCTCTTGATTATGCCACTTAGCCTTGGATGTTTCGTGTTACCCTT
TTCCATGCTTAGTTAGGCTGGCCATAGTGGGAAGTAACTTAGGGTAGTAACGTGCGTGGT
ATCATGCAAGCCTTCATTTATTTAGATGTAGACTCATTTTGCCTTGGGGTATGTTATTTA
TATTATGTTACCACAAACACCTCTCTCCTTATTAACTAACTTGCCACATAAGCCAACTTA
CCTTGGGATGCGTTATGTTACTAGCTCTCCCACTAGTCAGCCTTATGACTGACAATGGGA
GCATGCAAAGAGAGGTCTATTTGAAAGGAACACTTGATGCTAAGTTATCTTAAAATGGTC
CAGTAACTTAAATTGGAATAGTTATTCTGCCTAGATCATGTTTTGTATAAAAATTCCTGT
CAGTCTTAAAATAAGAATCCTCTGGACTGACTGGAATTTTCTGCCTTTTCTTTTTCCGTA
CCCCGTTCCAATTGATGGTAAACTTCTTTATTGAAGAGGTTTACGATGAATTTATCATCT
TCCTTATACTTATTTATTTAATCCAGCCTGTAGAACTTTGGCATAATTTTTTCCAAATGT
TTTCTCCAGCAATCAAATACGTTACAACAGCACAACCTGTTGGGCTCAAATATGGCACCT
CTTCGGGACCTGGACTTTGGTTTATCGCCTTTGTTGGCAGCACAAGCACAATCAATGGGT
GCAAGATATAACTCAGCTGCACCAACTACTACTGGCATGCAGGAGGTAGTTTGAACCTTC
TAATGCATTTATCTTTCAGTGCTTCATTCAAATTCATATTTCATCCGTTTAAAAACAAGA
TTCCTATTTTACAGAGTAAGTTTGGAAGCTACAAAAAACGCTGCATTCTTTGTTGTATGT
AAACTTGAAATATGTATGTAGGTGTGCTAGCGTTGAGAAAAAACTCTTCTCATGTGAGAT
CATCCAGCTATATACAGTATACATCGAACTTTCCTTGTTAATTTTTATGTGGGGTTGGTA
ATTTTCTAACTTATAATCCTTGAATATTATCGACATCATGGTGCTCATAATTTGTTGTTG
CATATACTGCTTTGTTCGACTTACCTTTCATTGACATTATACTTATATGTAAATTTTGCA
GCCAATGAAGCCAGGAGTTTTCTCGAACACTCAATCCACACAAAATCTTCCGAGTACCAG
CATTCATATGGCTCCCTCTCTTCCTCAGCAATTAGTCCATCCTTACTCACAGCCCACTTT
ACCTATTGCACCTTTTGCAAATATGATTGGCGCAAATATGATTGGCTATAATCCATACTT
GGCACAAAACTACCCTGCATACCTACCATCAACCGCCTTCCAGCAAGCGTACTCGAGTAA
TGGACAGTTCCATCAGTCTGCCGCTGCTGTACCTGGAGCTGGCATGAAGTACTCAATGCC
ACAATACAAGAACAACATGTCAGCCGCAAATTTGCAACAGCAACAACAACCTTCGTCAGT
CATATCTGGTTATGCAGGCTTTGGGAGCTCAAGTAATCTTCCAGGAAATTTTGCCCTTAA
CCAGAATGCTGCTCCTGCATCGGCCAATCTTGGGTTTGATGAAGCATTGAGTGCTCAATA
CAAAGAGGCCAATCAATATATGGCTCTCCAGCAGCAGGTAACCATTGCGAGCAACCCTTT
GTGTATATTTCTGAATTTTGTGTTGATTGCTGTTTACATGGTAGAGAAAAAGTGTTTGAT
TTTGTTATTCTTGGCAAGGGCGATAACTCTGCGATGTGGCTTCATGGCGCTGGTTCAAGA
ACAGCGTCAGCACTTCCTCCTACCCAGTTCTACGGCTACCAGGGACAGAGTCAGCAGCAG
GGCGCCTTCCGCCAGGCGCAGCAGCCCCAGCAGCCTTCTCAATATGGGGGCCATGGATAC
CCAGCATTCTACCATAACCAGGGAGGCTTGGCGCAGGAGCACCACCCTCAGAACCCGGCG
GACGGAACCCTGAACGGCTACCAGGCGGCAGCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATCT
CACCAGAGCTGGCAGCAGCACACCAGCTACTGAGCCGCCCGCACTCTTGTTGCGGTGCTG
GCTCACTGTGGCTGCGGAGTAAAGCAGCTCAGAGTAGCTGAGCTTGTGGCTCGCTGAGGA
GAGGGTCGGCGTCGTCTTGGCAGAGCGTTTTAACGTGTTGCGTGTCACATGTCGGTGTTG
TCGGACTGATGTGTTTGTTTTTCGGTCGTTATATGCGCGGAGCAGAACAGTCTTGTAACT
CCTTGGAGACATAGTTTACCTAACAGGTGCTTTTTTCTGATTTCTGAAAGTTTCGTCTTA
CGTCACCTTTTAGCTGTTGAGTGTTCTTTCCGTCAGTCTTCTTTCAAACTCTGGTTTTAC
GAGTTCTCCTGTGGATAGCAATTCATCCTCCCAAAGTAACCTTCTGCTCCCAAAGTAAAA
GCGATTTTAAAAAAAAGGAAAATTCAAAAAATTCTGAACATTTAAAAAAAATTGATACTC
CGAAAATGCGCTTTTCACAGCATCGGTTTTGTTTTTTTGCGAAACCTTGTAGGAATGTTA
TTTCATGCTAAATTTTTCATGCATTTAAAACTTTTGTCAATGTTGGTCTCAAAACAATTT
TGAAATATATTCTTTTTTTTTTGTTCATCAGTCTCCTACGAACTCGGGAACACAAACTTT
GCGTACTCCATCCTCTCGTTTTTCCACGTTTGCCAATGGCCGGTGTGTATAGAGACCATT
GAGGCCTCATTTGGTGCTGGTGTTTTTCCACCCCTAAGGCCTTGTTTGGTGCGTTGGGTT
TGGTCGGGTTTCTAGGGGATTATCCCCGAGGCCGAGGGGTTCAGAAACCCCATGATTCCC
TGCATGTCCATTTGGCGGACAGGGTTTGTGATGAGCAAACCCCTTCAATCCACTGAAATC
CACCTCAAATCAAGTGGTTTTAAAGCATCGAGGGGGGCTAGTGGAACTCGTGTAATGGGG
ATTCAAGAGGATTGGGTGGAAGAGAGGGATTCACCAAATCCCTAGAATCCCCACCTCCTT
GGGGCTTGAAAACCACTTATGCCAAACATGCCTTAGGCTTTGTTTGGTACTAGTGTTTTT
AAGGAGATTGGTGGAGATAATCCCCCAAGGTCTCGTTCGGCAGCGGTGTATTTGCAGGCT
TCAACGGGTATTTTACCGATCGGTATAGTAATCCCGAAAATTCCTATCAGGCCCACTCGG
TACCACGGTATTG