Map Locations of contig_2546804 (8623 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_2546804

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36439 1 397 bp MLOC_36439.1 Available Available LOC_Os10g40720.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-67, 13110.m03775 protein expansin precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_36439






Contig Sequence (8623 bp)

>contig_2546804 8623 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCCGACGGGCTCGTCGACGAGAGCCTGGAAGATGCTCTCCCCCCTTCCACCTTCTCCGT
CACTGGATAAGATCAGAAAGGAGCGTGGGCCGGATTATTAGATAGTGTAGGGGTTAATTT
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GCTGCTTTTGTCTCTTCCATTGCAGCGCCTATCCCTCCAATGCGATACACTAAGAGGTGT
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GTGCTACCAGAAAACAGAAAGTTGAATTCACTCCACAACACCGTGGTGAAGAGAAAAAGG
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CCTTTGGGAAAAGCTTCTGGGCACCCGGTGGATCCGTCTATGCGCATCTATCGCCTCTCT
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TGTAACTGATCCATTGTTGCAATCTTCTTTCCCACAATAAGTAGTTTGTTGCAAGATTTC
GGCAGGCTACGTGCGCCACCGGACGTGTCAGCATCACGACGAGCAAGCTTTGCTCCGTTG
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ATTCGAATCCGGATCGACCAGCTCGGTGCGCGCGCTCCTTGCCACTACCCTACACACATT
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TGATCGAACCTTCAGTAACATCAACTGCAGTTAAACAAAACACAGTAACATCAGTAAAAA
GCTGGTGATGCAAACACTAATCTGGAGTACACACTCATAACTGACCTGGTGTACATTAGA
ATTGTCTGGCCCAGGTGGATTTTTGGTGGTTTTTTAGAAAAAGAGGAATATGTACGGCCT
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CAAATACAATCTTCTAAAAAAGTTGTGAAATAATTTCAAAATGAAAGAAATGCTACAACC
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TATGGCGCTGCTGCTAAGCCGCTCTATTGGTAAGTATTTTCAAGCGCTACTGCTAATATT
TCTGCTTTCACAGATTTGCACCCTCTACGTATTTGTGATGTAT