Map Locations of contig_2546567 (6906 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_2546567

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_36305 2 1968 bp MLOC_36305.2 Available Available LOC_Os01g13870.1, FRAME:+2, EVALUE:2e-77, 13101.m01527 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_36305






Contig Sequence (6906 bp)

>contig_2546567 6906 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGAAGGGGCGACGCGAGGGGGAGGGGATCCTGTTTATTTCGATCTTCCCAGCCGATAA
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GACGCTGAATGATCCGGAGGCCAAGGAGTGGGTGCTGGAGTACAAGAAGGTGAGCTTTCA
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CGGCGTGGACCTGCGCGCCAAGAGGGTTGTGGAGTGCAGCGTGTACGAGATGGTGGTGCC
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TTCGGCAGGTAACCACCCATCACACCTTACATGGTTTCTACCCTCTACGCTGTTGAACAC
TGGGTGTTATTTGCACTGGAATATCACTAGACACACGTGCAAGCAATCACATTTCTATCT
CTCCCCTCGTTTGTTAACGTTTTGGACTGACTTCGCCTAATTCAATCAAAGTTCATCTGT
GGGATTAGTATTCACATGTGCTAAGTTGTTTTGCTGTTGCTCACGCGCGTATGACTATGA
TGCAGTCCTTAATTAAGCGTTGTATTGACATTAATTCTACAGTCCTGCTAAGTCTCAGTG
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GTCATCCTCTACAGTAGTTACTTGGTTGTATCTTTCTCTTGTATTTCCTTTTTTGGCACT
TGTTCATCTATTTAAATTAGTAGGTACTAGACAGCACAATTAATGTTTATTCGGCTCCTA
TGCTCTGTTTGCTTCGAATTGAAATTGTTCCAAAAAAAAGACCATACATGTGTTCACGTC
TGATTGATCTTCTAGTAAGCCACAGCTATATTGCCTGCATGTGCCTGAAACGATAGAGAA
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TGTGCAAACACGATTGAATTAACTTTACCGGAATCACATCAGCACTGGCACACACATCCA
GCAGCATGGACATTTCGTGGCAGATCTGGAAGTTGAATATGCACTCTCACATCTAAACTC
TGTTTTGGCATAGGATGTTGCATCATAAATTGGAATAGTATAGAGCTCATATGGTTCGTG
TTGCTCCTTGAGAAGGGTTTATGCTGTTTGTTATTTGGGGTCACAAACTCGCAATGCATA
CGCAATTTATCTTGTAGGCTGTTAAACTTGTCATTCTGCAGACGGATAGTAGTGGTCACA
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CCTTCTTATGGCACTGTAATTGACATCCAATTGTTCTTAGCATATCTACAGGTGTACAAA
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TTTCATATGCAATTACTGTATTTCTAACTGGATATATAAAGCATTGATATATTTCAAAGT
TAGTTATTTTAAGCATTCACGTCAATTTAGTTATTATATCCATATATTGGTGGCAATCCC
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CATTGGCATCATCTGTTTCCCAGGTGAGCGTCATCAGAGATCTGTTATTCATGTTGATCA
CCACACAGATATTTGTCTTCCACAACAACGATGATGACAACGGTTTTCTGCTGTGTTCTC
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AGGCAGCATATACCTCATCTGATCAACAAGGCAATGGATCTCCATGAAGAGATAACTTAT
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TCTATCTACGTACCTTGCTAATTTCTTAGTTGTAACTTTCAACAGGATGTGATGTGAGCA
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CCACTGGATGACTTGTGATTATATCCTCTAGGGAAGATGCTCGTAATGTGATTCTGAATT
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TGTCTACACGTGTGGCATGAGACAACATGTTTCACATGCCTTTGAAAGGACATGGATGTC
ACCTGGGGGGAATAGGCGCTTTAAAATTAACGTTTAATTTGTCAAGCACANNNNNNNNNN
NNNNNNNGCTCAACTATGTGCACCAATAACTTATGCTAAACAAGATAAACAACTAACTGA
CAGCAA