Map Locations of contig_244974 (3215 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_244974

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_34926 1 196 bp AK360697 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_34926






Contig Sequence (3215 bp)

>contig_244974 3215 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATCATCCGCCAATAAGGTCGGGCAGCCATGTCTGGGCGGTCGCATCATGGAGACTTGTC
TTCTTAGGCGATCTTTAAATCTTCTCGTCAATGAGGCATCAGCCCCCGAGGCTGGCTTAA
TTTTTCTGTAATGACCCGGTGTTCTTGAATTATTCATCCTAGTTGAGTCTACCGAGCCAT
GTCCATGTAGCCCTCTAGTCTTAAGTCGACTCAAGGAGGCAGGTTGAGAGTCTCCATACT
TGATTGGGACATAAGCCGGCATACAGTTGATGGTGAATAATGGACTTCAATCAATAATCC
ATTGCGGTTTCATTTTGAAACCGAGTGGAAGAGCCCCAAACTACTTTGCGGACAGCTCCG
AAGCGCCGGAGACACCACAAGGTGTTTTTCACTTGACCAATTAAACGTCAACCGATTTGG
GGGCTACTGATGGGGTTACCTACCAGGGGTACGGTCATGGACCAGTCATCCAGGGCCCAC
CTGGGGCCCCACACGGTTAATTAAAGTTCGAGGACTACCGATGCAACTCAGGTTTCACTC
GGACCCCACAAGGTCACTCGGACTCCACAAGGTCACTCGGACCCCACAAGGACACGCGCC
AGCACTCGGACATAGAGGAGGCATGGACAACGTGAGAGCTGTAGCGGCCGATTGACTTAA
CATCTTACATAAAGCGCAGTGCAGACCGGCGTTACGTGTAATGTTGTAGTTAGACATGTT
GTTACTAGTAATTTCCGTAGTTAGTAGCCTTAAATGCCCTTGTAATGGGACGCCACGGGT
CCGCGAACTCTATATAAGCCGCCCCGGAGCTCCTGTACAAGGGTTCAACATCGTGTGTAT
TCACACCTCCCATAAGCAAACACTAGTGTCTCGGCTCGAGATGTAGGTTTTTTACCTCTT
CCGAGAGGGGCCTGAACTCGTACATCCGAGTGTTATACTTACGTCATAGTTAGGCTCCGC
TTCATCATTCGTACGCGTGGTACTATTGTCACGCTCGTTCCCTTGATATCAGACGCTATT
CAAAACGGTTAGATGAGTAATAATGTTTCGCTCACAGTTTATTTTGTGAATTCCTTTCGT
CTTGAGGTCATTTTTATCCATTTTGCCGGTGTGTGACAGGGGAGGGGGAGGCTTTGTCGT
TCTCAAAATCTCCAATAGATCTTTTTTTTGCGGGGCCCCAATAAATCATTGTTTCTCATA
TTGAATCACAATCTTGCTAAAGCACACACAATTATTGCAATACCCTAGTTTAAAAATCCC
CTAGTGCGTCCATAACTTCTGATACCGTTTTGTCGACAACTCGCTTTTCTCTTCAGCAAG
AGATTTGGTGTGGATTTTTTCTGCGTTTCTCTTCAGCTACCGCTACCTGAAAAAACAGCA
TAGACTAGAGAATCATTTGGCTATTTTTCTTATTGAGGTAAATTAACGTAGCGTGCACAG
CTAAAGTAGGATTGAGTTCGACAAAAGGCGTGAACCTAGTCGACGAGGGAGGAAAAGATA
GCACGGGAAAGGGCACACTGACAGCCAGGTGACGAGACGTGTATGATGACTACTACGACT
CGCAAACCATCGGCCCTTTCTCTCCTCAAGTCTAACCTGCAGTGAATCACGAAAATATCT
TGATCGCCGCCCCCGCCAATGCGATCAGTCGATCACGCCGCGGCCACGGCGCCCCGTCTC
GCGGCCCTTTCGGCGCTGCGGAGAGCCGGGTGGGATGCGGGGTGCCGTCCTTTCATGGCC
TGCCTGCCCGCGATTGCAGGTCGCCGCTGCCTTGGCATGGCCTGCTTGTCCCCGGGCAAT
GTGTGGTGCCTGAGTGCTCCGCCATCCTTGTCTCGTGGCCAAGCTTTCGTCTGCGGCATA
CAGTGACGACCCCGTCTTCCGTTTCGCGGCTGCGCGTATTATCATCGGCAGGGCCGGCAG
GAGGAATCTGACGTCTATGCGTTGGGACCGGCGAGCTGAAAGGACTCTTGGATGAGATGA
TACCACAGATTCGAGGTGTCGCTGAGCATTTATTTGAGAGGTAATAGCACCACAGATCCT
TCAACTTATAGTGGATGTGATAATTTGATCCGAAGTTGTAAAATGATCCTATCTAGTCCC
AAAACTTGCAACTCCTGTAAATTTAGTCCACAGCCAATCAAAACGTGCCAACTGGACAGG
GTGGGTCAGCTCCGGTTGTTTTGCACACAGCCCCTTGCATTTGACACTAATTAATATAGC
TGCAGACAGTTTCAAAAAGCACCTGAATTAATTAAGCTCCGGTTATTAAGACAGACCCTC
CATATTCTTTCCAAGAAAACTTGAACAACACCAGAACCTTAATTTGATGTGCTTTTCTAG
CTTTGTTATATGTTACCTATCATTACATTATGGTCACATTGAAATGTTTTGCAAACTATT
TGACCAGTGTATACCATATTTGAATCTCATTTGCATCTGCCGATATGAAACAACGCATTC
AGAAAAGTTATAGTTCCAACTGAGAGATCCAACCAGTTCTATCTGATTGCTGACAAACAG
ATTCAGGATGTACGTTTGACGAAGACTATTGAAACATGTAATTGCTAACCAAAATGATAT
TTCAAATTTATTTTAAATATTTACCTCCACTGCAGCATTTTAATATGAAGAATGTAATTT
TTACTTATGCTAGTAACACTTGTTGCAGTGACATAATTTATTTTTAAATTACGAAAATTC
AAGTTCGCTACACAGAACAATCCTTCCTGATTAATGCCCCTGGTGGTCAATGTTGTTAAA
GTCTCTTTTGTTCATTTCCGAATTAACTCAGCCTATTTATAGCATTTCTACGATTGTTCC
TTCCTGATCTACTCAAAGTTAGTAATGTGATTGTTATCTGCTTGTGCAGGGAAACTGGTG
TCACGAATATAGGAAACTGAAGGCGAAGGTTGAGACAATACAGAAATGTCAAAAGTAATT
TGTAACGATTTTGGTTGATTTCAAGTATGCTGTATGCTCTGTGAAGATAAATGGGACTGA
ATTCTACCTCCTGCACCTGCAGGCATCTCATGGGAGAGGATCTTGAATCTTTGAATCTCA
AGGAGTTGCAGCAACTGGAGCAGCAGCTGGAAAGCTCACTGAAAGATATCAGATCCAGGA
AGGTAGTGATTTAAATGAATTGATACAGCAGCACAATTTATATAAAAAAAACAAGAAAAA
CACTTGCAGAGAAGTTCAGCGAAGTATATCTGAAA