Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_244630 (6599 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_244630

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_34807 4 1378 bp MLOC_34807.2 Available Available LOC_Os02g58090.1, FRAME:-3, EVALUE:1e-50, 13102.m06725 protein PSP domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_34807






Contig Sequence (6599 bp)

>contig_244630 6599 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGACGGACCGGTGGAAGATGGCGGCGACAGCACACGAGTGCATCAGATCGGTTTTGTGC
CCTACACCCGGTATGTGGCAGATGGCTCGACCAGCTCTGCTGGGGCTCCCGGTTTTTTAT
GTTAGGATTAGGTAACTGGTCTGGGCATGTGGCCCAGCTAACACCCCTTCATCATATGGA
TAGAAGTAGCGACAGCTGTTGCGGAGTTGACGGATTCAGACATATTGTTGTAATACTTTG
TAAGGTCCTTGAGAATAATCAATAAAATGACCACATGCATCTTCCAGATGCAGAGGCCGG
GGGTCATCCTCCTTTTCTAAGAAAAACGTCCTGCAACTGGTACGCATGCTATAGTGTTAT
TAGTTGGTTTCAGAGCAGAAACACGCAACGCACGTACGTAGGGTAACAAACAACGTATGT
TGTTTTTGTTGCACGCACGCACGCAGGGTGATGAGATCTACGACGCCACCTTGAACCAGA
CCAACCTCGGAGGCAACAACAACAAGTTCTTCATCATCCAGGCCTTAGGTTTGTCCTCAT
ATCATATTATAATTCCAAGTTCAAATATTCGAGTTAAATTAGATATTCTTTGACCGATGA
GGCGGCCGGCGCGAACCCGTCCACAACACGCACATGAATTTTGAGTTCGTACGAATTTGG
ACACATGCATGCACCTTTTCGATGCCATGGAGTACTTCACTACTATCCTTTCTCAAACAT
TTATACGACATACATCGAAGCAATGTACCTTCACCGGTTAATTAAGGTTCATGTGTTCAG
TTTATGAGGGCATCACTAATAGTAGCATTACATAAAAGACTAATTACATATAGTCTGAAA
AGAAGACTAGTTACATAAAACACTAAATGTTGCACGCGTGTTCGTCGTAAGAGTCTGATG
ATGGTGCAAGCTGGATGGTCTACTGGAGATATGGGAGAGTAGGCCACCCAGGTCGGAGCG
AGCTGCGCGGTCCCACAACACGGGACCAAGCGGTCAATCTATTTGCATTCAAATTTAAGG
ATAAAACTGGCAATGATTGGTCCTATCGCAAGCAACTCAGTTGTCGTCCAGACTACTACG
CCTGGCTTGAAATGGACTCTGGTAAATGTGGCGAAGAAACGGTAGGATTTGCTTCAAGTT
TTCACTAGCAGTATCTCGCAAAGTTAGCATCTTTCTATGTTTTAACGCTTCGGTCTCGTA
AACAAAATCAGGGCGAGACTCAGAAGAAAGACTCCCTCGCCGATCAGATAAGAGAGACAA
AGCTTGAGACTCGAACTGCGCGTTTCATATCCATGATCTGCCATATTAGCATGATGAAGC
AGCAAATGATGGAAATTGGTAGGTTGTTCGATTGACGTTGCTCTTTGAATGCATTAGAGC
ATCATAATGTTAGCCTATTTGTGAGTATGGTAGATCCTATTATGTGTGTTTAAACTACCG
GGCTTAATTTTAATTTACTAAAAACAAGGGTCTGAACATAGTTCATGGCCAGAGAGGCAA
ATACTGACGATCTACTCAAATACAGGAGTATTGTTTTTAAAGTAGATTTCTATTTATTTT
TCATGCAGCATTTGCTTTTACTAATCCATTCATCTTTGACTAACTAATTAGGTTATAATG
CTGAAAAACTTCCTCTTGGAAAGATAAGCAAATCTACAATACTTAAGGTGAGCTTTTCTT
TGTTGGGGATTATCAATTCAGCGTGGACACAAGATTACATGTTGAATAACAATGTGCATA
AACAACTTGGACCTAATTATCTCCCAATCTAGCCAAAAAAAAAACTTACATAAGGTTGCA
TTTTATCATACTTAATTTCAAGTATTGACTTAAACCTGTAAATAAAAGTAAATGACTTAA
ATACAATATGCAGTCTAGAAGATCTATTGGGTGCACATTCAGTCTTGCATGCAGTAAAAG
TGTATCTTTCTCCAAACTTTCCACAGGGTTACGATGTTTTGAAGCGGATCTCTAATGCCC
TTCCAAAGGCTGACCCGATACAGCTGGAAGAATTGACTGGGTGAGTCATAATTTCCTTTT
TACTTTTGTAAATAGGGCAAAGAAGCATAGTGATAGTTGTGCAATGCATAATGGCATCCA
CCATCAGTGCAACACTTGCACTTTCTGACCTTTGAATATGTTGACGCTTGACGAATATTC
CTGATATTCCTGTACTACCACTGGGTTTCAGGGAATTCTACACCGTGATTCCTCACGACT
TTGGTTTCAAAAAGATGCGTAAGTTTCAAACTTCCTGCTTGGTTCATTCTACAGTCAGGA
CCTTCTAACGAAATTTATCTGGCAGGTGAATTTATCATTGACACTCCTGAGAAACTGAAA
GCTAAGCTGGAAATGGTAATAGGCCACTGTCTTTCGCTTTATTATAGCTTTAATTGATCG
GTTATGAAATATTGTATGCATTAAGAGCTAATGAAAACTTTCAAGGATAATTTAGAACAA
TGGTTCCTCTGAAGAGATTCAGAACCAGAGCCTCTTTTGGCCCTTTGTAAATATATGTAC
CTGCCATTCCTATCGAAGTTTGAAATGCATTGTAACTTAATATTCATATATTTTTTTCAA
GAACACTCATGTTCACGTCTAATATCACCACTTGTTTTGCTCTTTCGAAGGTTGAAGCCC
TTGGTGAGATTGAGATTGCAACCAGGCTTCTGGAAGACGATCAAAGCGATCGGGTAAGAC
ATTGGTAAAGAAATATGGTGTCCACACATGAACACTCTGGATTTATAAGTTCGTTTCATT
TGGCAATCTAGGACGATCCTTTGTATGCTCGATACAAGCAGCTTCATTGTGACTTTACAC
CTCTGGAAGTTGATTCAGAAAAATACTCCATGGTAATATTTCTACCAATAAACTATGGGT
TTATAACAACTTCAGTATGGGAATGCCATTTATTTTCTTGGCTAAAGAGATGTCAAATTT
CTTATGACCAAGAACTGAATTGGCATGGCAGAATGAGCTATGTTCCACTCTTCGCTTACA
CGATGTTCATGGCATTAACCGTGTATGAACATTCCTGCTGTTCAGATAAAAACTTATTTG
ACGAACACGCATGCCAAAAGACATTCGGGTTATACGGTCGACATAGAGCAGATATTTAAG
GTGACAAGGCAGGGCGAAACAGAGCGGTTTCAGAAGGTAAGTGGATCTTCCTAATCAGCT
ATGTGGCGCCCAAAAAAAGCTGCAGCACTTACTGCAATGAAGTTAGTTGTCAAATGACTA
ACTCCGAAAGTGTTTTCACAGTTCATCAGCACAGGAAACAGGATGCTTCTATGGCATGGC
TCTCGGTTGACCAACTGGACCGGGATATTTTCTCGGGGTACTATATACTGTAGACATCAA
ATTATGTCGGCTCTGACTAGATATGTCAATGCTAGTATCAGTTAACGCTGATCTTTCTCC
CAGGTTTGCAAATCGCTCCTCCTGAAGCGCCTAGCACCGGCTACATGTTTGGGAAAGGGG
TTTACTTTGCTGACATGTTCTCCAAGAGTGCAACCTACTGCTATCCTTCACAAGCATCTA
GATCTGGAGTGCTGCTTCTATGTGAGGTCTGTTTTGCCCAGCTATCATATGCTCACCGCA
TACCTTTACATGAAGTGCCTTTAGCCTACGCTTAAGTGTGTTTTTTTCTCCAGTTATGGT
GTCATATTGAGTTGTTTTCTGTAACTTATCATCTCAGGTTTCGCTTGGCGATATGAACGA
GCTACTAAATGGTGATATAAATGCTAATAACCTGCCCGAGGGTAAAGTAAGGTCGGTTGC
TGACGCGAGCCCTTTCTATAAAAGCCCTACACCCACTTACTGATTCAAAAGTAACCCTGA
ACCTATAATTTCTATTGAATTGTGTTGTTTTTATATGGCGTTGGTGGCAGTAATAGACTA
GTAGTAGTTCTTGTTAACAACACAGAGAGTAAATATACTTATATCGCAAAACTATATATG
TTGATGCAGCACGAAAGGGGTTGCGAAGACAGCGCCAGACATGGCGGAGTCCAAGATCAC
CGACGACGGCTTGGTTATTCCGCTCGGGAAACCTAAGAAGGTGTCCCGCGATAACGTATG
CGCAGTCCAATTCAACCCTGTGTAGTTTTTCCGGGCTTTTCTGCCTATCAGTTTCCTGTT
TGTGTGCTTTGCGTCATCTTGCTGTTCTCTTCTAATACAATAAGGCATGCATTGCAGGGC
GTCCTTTACTACAACGAGTACATAGTGTACAACTTGGACCAGATCAGGATGCGGTACGCT
CTACAAGTTTCCTTCAACTACAAGCAGTAGTGGATGGCCTCGTGCCAAGGGTGAAGAAGT
GCCAAGATCCTGACATCTCCTTTGTGGAATCCAATTTTCCATGGCACATTACTAGCAGCC
AATGGATGTGGAGGAAATTGCAGTTTTGATCCAGTTTGTGGAGAAAAATTGAATATCTCA
ATGTAGCATTAGGCAATGCAGATTCTTGTGGGGATAAAATATTATCTTGTTTCTACCTAA
TATTGTAATAGAAGTGATAAAGTGTTTGTGTTTCACTTCTTTTTTATGCACACACTCAGG
TTACAAATTTACACACACATGAAACCAACCATGTCATCATATGGTATTACAAACATGATA
GCATTGTCAAAAGCTTTAAAATGAAAAAAAATAGAGCAGATCACTCTTGTTGCTTCTGAC
AAGCTACAACAAAACCACAGGCAAAACAACACGTGTCAGGAGCATCAGGAGTGAGCAGCT
CCAGCACTCACCTCCTACCAGAGGCTCCCTCGTCAGACTGCCTCTGCTTCGCTGGAGGAA
ATAGCATCTCGTTGCGGTCACCGTTAGCGTTGGCCAAAGCTTCCCTCGGTCCAGCTGCTT
CTTGCATGGACAGGAAAAGCCAAAAGGATCTGGTTCAGCTTCAGGCCTAAAACTAAGATA
AACTCTACTTTCGAGAAAGGGAAACAAAAGCACACCTGACACTATCTGGCGTCGTGGATG
TGATTTAATCTTGGCAGAGCAAACAGAGGCGGTGGTGTTGAGTTTGGAAACACGACGTGA
TGACCATGGCCTGAGCCCCGGTGGCTTCAGTTGCACAACATGGTGGCTGCTGCTCCATGT
AGGACTTTTAGTCCTTTTTGGAAGATTTCACGTCCTCCTAGTGCTTCCTCTTCCTCTTGC
TCTTGCTCTGCAAATCGGAGAGGGAAAAAGGGTTCAGGTCCATTGAGTTGGTGTTTGCTT
CTAGTTCAACAGCTACATGAAACCGCTTGTACGAAACATAAAGACGTACGTACCTCCGCC
AACATGTCACTGAAGTCTTCCTTCTGGTTCCGTAGCTTCCCCTCCTCCCGGGCTGCTTCG
TACCTGTTTCATAGTTTTAGAAGGAATGTGTTAATGTTTCAACTCGTGGATTGGCAGGCA
GAGCTTGACAGACGCGAGGGAGAAGTGCTCTCACTTGGCTGCCAGAACATCATCCATAAC
TTCGAGCTCCTCAGGATGGATGGTGACATCCACTTTGTCGGACTTTTGATTCTTGAGAAG
ATCAAACTGCGAACGAGAACCCCGGAAATGTGTCAATGAATCATCAGAGCATGCACACTA
TGGGAATACTTGTAAAAGCTCACCCTTTTAACCCCAGCTTTATCTTGTGCCCCAACCACA
TACCTGCAAAAACAGCAAGATACAAAATGAGTTCTCCATATGATTGAAACAGGAATCCAT
CAGAGATTATTGATATATAAAATGAATTCTCCGTATGGTTGAAACAGAAAAATATTGTAG
AGATGACTAGGTTGTATTAGAGTTGCATACATATGGCTTGACCCATAAAGGGTTCCAGGT
ACCATTTTCTCCTCCTGCTCAAAACCTTCAGCTGAAAAAGAACAAATTGTTGGTTATGAA
CTGCAATAAGCCAAACTAAAGCTCTATAACAATAGTTGGCCTGAGATGCCACAAAACTGA
AGCGAAGCCCTTACCTGGTATAACTGCTTATCTGTTGGCCTTTCAGACTCTTTCCTCTGT
TGCTTCCAAAGATCAATTACTTCAGGTGTTTCCACGCCAGTGGGAGTGCTATTAACAGAA
CAAGAAGAAGCATCATAACATAGTTCCTTAGCGAAGAACCTAAGCTAGTCATCAATAATT
ATTATAGAACCTTGACATGGTGTCGACAGACTGCATGCCAGCTTCCATGTCTTCATCTTC
CATTAGTTCCTCTTCCTCCTATTCTTCCTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCCTCCAAGTC
TCCCCAATGCTTGCTGCAGTCAATAGGTTCCTCCTGGAATACAATGCAACACAACAGTCA
GCTAACTGGTAGAACTGCAGTTCAATTTCAAGGAAAATTAGGCGATCAACATACATCATA
CTCCCTCCATTTTTATATACAAGGCCACAAACCCATATTACAGGTATCAAGGCAAAAGTT
AATGCCTTCTAAGTCAATGTTGCAAGACAACTTGTCTCCTTNNNTACCGTGTAAATTAAT
GCGTATTTTTCTCTGTCATGCATATCAAGCCAATGATCTCACTCCTGTATGCATGCAAGG
GATAATTAATGTCCTCCTTTGTTAGTACTACGAGGCAAACACCATTAATATTGCATCGA