Map Locations of contig_244047 (9680 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_244047

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_34498 5 1863 bp MLOC_34498.4 Available Available LOC_Os01g01070.2, FRAME:+2, EVALUE:3e-137, 13101.m00013 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_34498






Contig Sequence (9680 bp)

>contig_244047 9680 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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TTTTTATACCGGCTGAAGCAAAACCATTCTCTTGCAGGCGCTGGTGCTTATGGTTTAACT
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CTTCTCTTGAAGCTAACTTGCTAATTTACAGGGATGGAAAATTTCTGATATGATGTTTGT
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GCGTGACATTTCCAGATGACAGGTGCAAGGATGCCATAGTGCTGTCACTACAAAATGTAT
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CTTTGTGTTCAATACAACCAGTTCGAATAATCTCTTACTCTTCTGCAGGAGACAAAGCTT
GGACGCCTTGCATATACTCAAGTAAGTAGAAAGTCCTAGCCCACAGTTTGTTTTTCTATA
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TCATTTTCATGATGCGTCTATGACATGAGGCCTGTTGGTCGAATGTCGTGTTCTCTGTGA
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TAATTTTTATCTTCACAGGCTGACCCTTTTCTCTTTCTTACTACAGACTGCTTCTGTGCC
GTCAGGCTCGGAACCCGTGTCTCCTGTAGCTCAATCACCTAGAGCAGATCCACCTATGGT
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GGCTTCTTATAGTCTGTTGACACTTTCCACTTGAAGAAGATAGTGCGATCTGCCTAATGA
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TGTAGCATTACATTTTGAACCTAATTTTGTTCTGCTAACTCTAGTTTGCTCTTCCATGTT
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GGCTGTAGAAAAGAATAACTTCAAGAAAGTGTACTTTGTGGATGTTGTACTATATGGTTA
AATCCAAACGCGCCCTATGTTGTGGAACTTTGACCTGGCCATCTTTTTGACATGGTAGCT
TGGACTGTCCATTTGTAGTATTGATATAATATGTTGTACGATTCTATGCTGTTGTTAGTA
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GCTGTTTAATCTCTAGGCTGTGATCAACCGGGCAACTTCGATGAAGGAAGGAGTGCCGGC
CCCGGAGGCGCCAAAGGACACTTCAAGCTCAGCAGCAACCCTCAAGAGACCTGTTTCGAG
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GGTAAGGTAAGGTAGAAAACATGGCAGTTGGCAAAGGAAGGGGAATTTGCTTTGCCAAAC
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GCTACTGTAGCGGGCAAGCAAGAATGTGGACCTGGTGGCTGGTGGTCTTGCTCTACCACC
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ATGAAGATTTTGGATTGTTCTTGTGGTCAATCTAGAAACTGTTATTTCTCGGTTGTCTAA
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TACCATTGTAGATCGTTAAGAGGGAAGCGTTAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
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GCACCTCAGCGTTCAGCTCACGTACAACTCGATGACGATTTCCGCCTCCTTGATACAGTA
CAACGGCATGGTTGCGGTGGTGGTGAACTAATCCGACAGGGCTTCGCCAAGCTCTACTGA
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GGCCCACGTGCCCACCGGGG