Map Locations of contig_243587 (4317 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_243587

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_34334 1 494 bp AK365135 Available Available None





CDS Structure of MLOC_34334






Contig Sequence (4317 bp)

>contig_243587 4317 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGAAGGCGGGGTTGTGGCGGCGGTGAGGGCCTCACTTTAAGGTGGACGATGGTGGATC
GCCCGCGGCGGAAGTGTCATGGTAGAAGGTTGTCGACGGCGTTGCAGGAGGAAAGAGGCG
GCGATGCTCAATCCGGTGGTAGGACGAGGCAGTTGGATCCGGTGACCGCTAGATGGGGTG
GTGCAGGCAACACACCCTGCGGAAACGGTGATGGGGGGCGGCGCGACAGTCTGATCCGTG
GATGGCGTGGGGGCGGGGTGGCGTGCGGTGAGCTTTGTGGCGGCAGCACAATCGGGGTGA
GGAGGAAGGTGCAGGAGGTTGGGGGAAGTTTTTTTTATTTGTGTACCACTTCAACGGTTC
GGTAGTTCAAGAACAACCCATCGGTCCCTATATAGGGCCGATGTGATCAAAATACTATTC
TGGTTTTGGGATCAAAATAGTTCTACCCTAAATAAACACACTATTGATCCGCAGATCGTG
TCCCCATACCTCCATGGACATGATACATGTGCCGGTCATCTAACTCTATACCTTAAATAC
CCGTCTTTACTAACACCTTCGGTGAAATATGTATGACTCATTGTAGTACAAATATGTATG
ACTCACTGTAGTACAAATCTATGTATTCGTAGCTTTCACCAAGCATGAAGAAAGGCTTCT
GTCAAAATAAGTCTGATTACTCAGAAGCTTTCACTAAAGGCCAAACACTTTCATGTATGC
ATGGCTTAAAATTTGCTTCCGACAAACACTTGTATTTGCTTTTACCAAACACTTGCATGA
CTACTAAGAAAGAAAATGAAAGAGAGTGGCTTCCGACAAATGCATGCTTTGCTAGTCAAA
AATGAACAAACCTTCCGCCATGAAATGCTAATTAGTGGCTTCCTTTCGCCAAATGTATGC
ATTGATTAGTCTGGTTGAATTAGTGAACTTTTCGTCAAATACATGATTTGCTAAGAGAAA
AGCTCAATGCTAATTACCAGCCTTCCATCATTTGGACAAAAAAATGATAAGTGGTGGCAA
TTGATTGGTCACGTGGATGTCCTAACTCCCGTAAAGCCGCCTTATTTGTTTCCGGTTTAC
GGAAACAAACATCCAATTGGTTCACAAACAAATGTGAAACATTGGATGGCTTTCAACATG
TGAACAATTAGGTCTAGAAGTTTGCAGTCTGTCTTGGAGATGGCCTAGCATCCTCAACCA
CCAACTATATTTGTCTATGATGAACCAACCTGTTGTTGGATGGATGGAAGGACGGTGTTA
TCCCTAGCCCATTGGGATTTAAATCTTGGTGCTCATATATTGTTGGATATATTTCAATAT
TTTCGGCGATGCGTGTTGTGTGGTAGGAGATGTTTCCGTCGATAACGAGACATCTATGAT
GATTTGGTCAATATCAAGATGAAATGCAAGCTCGCTCTCTCAAAAGTACTCACAGGAATA
GGATATGTGTGTGTACTTTCATAGAGATGAGTGTATGCGTGTAATCGTCCATTCTTTTTT
TTTTCAAGATTCTATGTTCTCCTTTTTTTTGTTGTTTCTTATTTTCTCATTGATTATTTA
TTTTATTTGTTTCCTTCTTCTTAAAGGGTAATAATAATCGACTAATTCAATCTACTTTAT
AAACTTCATTATTTTGATTTGTTTTATTTATTTTTCATTTTGTTTCTTCTTAAAGGGTAA
TACCAACCACTAATTTATTATTTCTTAGAAAATTTCATTCTTTTGATAATATTTTTGTTT
TGATATTATTTATTTCTTTTTAAAGGGTAATACCAATGCACTTAATTCATTCTTTCTTGG
AAAACTTTATTATTTGGGAAAATAGCTTTATTTCATTTTATTTCTTCTTATAGCGTAATA
CCAATCTACTAAGTCATTCTTTTCTACAAAACTTCATTGGTTAGATGATATTTTAGTTTC
TATTTTATTTTCTTTCTTCTTAAAGGGTAATAAATGCACTTAATTTATTTTCCATAAGAA
ACTTTACTATTTTAATTTATTAATTTTAATTTAATTTTATTTATTCTTAAGTGGGAATAC
CGAAACACTACTTCTTTCTTATAGAAAACTTCACTATGATTTTCATATTATTCTAGTTTT
CATTTACTTTCTTTTTTGTGGTAATACCAATGTCACTATTCATTCCTTCTTAGGAAACTT
ATTTTTGTGAATTTTTTACTACTATATAATTACTCTTGCATATTATAAAAATTACAAATC
TGTGTACATTGTGTGCAAATATCTCATCTTTTAATATTATTTTAATTTTCTCTCTTCTTA
AAATATAACATAAATGCCATTAATTAATTATTCTTTCAGAATCTTTATTATTTCGTTTTT
TATTCTTATTTTATTTTCTTTGCCCTTTAGTGGAAATAAAAATTTCAAGAATTTAGTCTT
CTTAAGAAACTTCATTTTAGTAAAATTATCATTGTTATATGCTTATAGTTGCATATTATA
CAAATACGCAATTTACATGTGTTGTCTGCGTTTTTTTTTATTATATGTTTAATCTTTTTC
TTGTTTTAAAAGGGTAATACATATATCCCTAATTTCTTCTTCATTAGAAAGCTTCATTAT
TTGGATTTTCTTAGTTTTTATTTTACTACATTTCTTCTTTAGAGGTAATATGAATGCGAC
TAATCTATTTCTCCCGAGGAAACTTCCTTTTTGCAAAAAATACTATTCTATGCTTATTCT
CGCATTTTATAAAAAACACAATTTTAGGGTAAATTCTGTGCTTATTTTGTAATTTCTTTC
CATTTTAGTTTTGTTCCATTTTTCATCTTAAAGGGTAATACTAATCCCAATAATTCATTA
TTCCCAAGAAACTTTATTATTTCTAATTATTATTAGTTTTTCCTTCATTTTATATAAGGG
TAATATCAATGCTACTAATTCATTTATTTTTCATAAAATTCTGTTTTGCCAAAATTTCAC
TATTATATGATTATTGTTGCATGTTACAAAAAATAAAAAATAAATTGTGTAAGTCATGTG
CCAATTTTGTCATTATTTATTTCATTTCATCTTCCTTCTTCTTAATGGATAATATCAAAG
CCACTAATTCATTATTTTTTTTAGAAAAGTTCAATATTTTGGTTTTTTTTTTCTCGAAAG
GGTAATGTCGGTGCCACCAATTGATTCTTCCTTAGAAGACTTCTTTTTACCAAAATTTCA
CTATTGTATGGTTATTCTTTCATATTATAAAAAAGGTGCAAGTTCTTTCTAAGTGATGTG
CAAATTTTATCATTATGTTCTTTTTTTTCTTCTTCTTAAAGGTTAATACGGATGCCACTA
ATTCATTCTTTCCTTCGGTAACTTATATTTTGCAAAATGGGAAACACTATTATGTTCCGT
CTTTCATATTATATGAAAACGCAATTTATGTGTAAACTGTGTGAATGTTTTTTACTGTTT
GTTTTACTTTAAATTTATTTTTATTTTTAATTTAAGGTTAATACTAATGCTACTAATCTA
TTCCTTTTTTGAAAACTTATTATTTTTTTGCAAAAGTTCCACTACATTATATGTTTATTC
TTGTATATTATATATGTTCTATTTACAATAATTCTGAATTTTTGACCGAACCTGGAGATT
ATCAGTATTACTCTTAATTCCTTTAGGAATAATCTATGCAAATTTACTACATGAGGTTGA
GCTTCTATGTTCAGAAACAGAATTTCTTTGTCAAATCTCAATGTGTATAGCTAGATTTGT
CAGGATACAAAGCCATCTAGCCTACAACGCAGCCATCTACCTATCCCTACTAATAAAGCA
CCGACGGCTTCTGTCGTACGTTGCGGAGTTTTTGCAAAAAAGCCCCTGAGGTTTATCGAA
ATCAACCCGCGGTCCTCCCTGAAGCTCGGGCTCGTCTGCCTACGCGCGTGCAGAAACAGA
GAGCTCGCAGATCTGTCCGACGATGTGAGCTTCGCAGCAGGGCTCCGGCGTGGCGAGGAG
GGCAAGGAAGTTCGGATCCACATGGCGGCGCGGGTCGGGGACGCCGCGGCGCTGCGTCGC
GCGCTGGACGAGGCGGCGCTGGTCATGGCGGCGGGGGAGGCAGGAGAGGGGCTGGAGACG
GTCCGCTGCGCCGTGGCCGCGGAGGCCAACGAGGCCGGGGAGACGCCGCTCCGGGCCGTC
GTGGATAAGGGCCTCCTCGAAGTGGTGGTGGAGCTGCTCCGGCACCTCGACGCCCAGGGC
GTCGCCGCAGAGGCCAACGAGGCCGGGAAGACGCCGCTCCTGGCCGCCGCGGAGAAGGGG
CCGCCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGCGGCGCGGCGCCGCCGCGCGGGCGGGCG