| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
| No map location | No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_232548
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_32863 |
2 |
301 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_32863
Contig Sequence (5310 bp)
>contig_232548 5310 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCCAAGCATGATTGAAAATCTTGAGCAATGTGATGAGTTAGGATTGACATGCGCATTAAG
TAGGACAACCAACATGGTTGGTTAACATAAGACCATGATGAATACTACCATCACACCGAA
TATGTAAATGCTTGAGCCCAATTTAGGTTATCAACTTATAGTAGCAAAAAAGAACATAGT
GAAATTTGTCTGAAAGGTTCTTATGTTATGCACGAGTTCGACGTCTTCCTCTCCCATGCT
CTTCCGGTTCCTTTTCTCCTACCCACGTGTCTCCTTGCCAATCTGTCAAAAAAAGTAGCA
GCTTAGTGACGTGTCAAGAGCGGACATCAACCTTGAGGATGTACTCGTGAAGCTCAATAT
TGACTGATGCCCACCTTGATTGATGACGCAAGCTGTGAGAACATGTGACACACCCCGGCT
CATCAAATGTCTTTTCACCGCGGAAGAAGTTTCTCACACATCAAGACTTCAAAGACAAGA
ATGAATGTCATCAAAAATAAAAGAAGAGGGTACGCATATAAAAGTGTAAAAAGGCATAAG
TGGGGAAAGAATTGTGCAATAGCTCTACTGCTTTGATGAGTGCTTATGGCAGCACACTAC
CAAAATAAAATAGTATATGTGCAATTTGATTGTCAGAGAAGTTTATGTGCTCATAATGTA
CCCTTCAAAAGAAATGGAAATTGAGAGCTTACATTATTAAAAAAATAAACTATCACCCAC
CATATAGATACATAGGCCTGATAGCGCAGAGAGCACAATCAAATCCCCCAAAAAATAAAA
TTATTGTCGCCATAGGCAACATACAAAATGTCTAGAAAGAACATAGCAATGGTCATTTTG
ACAGAAATCAAAATATGACACATTATTCAGAAAACAATTATAAGCTCAATGCGGAGGCGA
AATGATACTAATTTATACATGCACTTTTGATATGCGCACAGAAGCCTCCATTTGAAAATA
AAGTACCCATTTTTACAATCCAGTTTCATCTACCAGATGGCTGAAAGCATCTGTGTTTGA
CACTCTACTATTGATTTACAAATTTTTAATAATACCTTCGGGGCCCTGTGATAAAAAGGA
GATGTTGAACGATTGGCATAGATTCAACCAGGCAAGAGCTTATCTAATTAGCATTTTGAT
TCTACAACAAAATGATCAAATTTTTAATACCGCCTCAATAAGTATTGCTTCGTCCCCAGA
AAGAACCTCAGATTTGCAAATAGCATATCCCTATGCGGAACTCTCTAGTGAAGCTTTGTC
TGCTGTCGTGCAAATTGTGTTGTCTCACCAGATTGCAGTCCTTCTGAATATGCAAATTCT
TTCTCGGACTGTAGATTTACTTCAACCACATACTTTAGAGTTCCGTAGGAAAAAAACCCT
CCAGAATACATAAGTTTGCATCATAGAAGTATAAAGCTATACGAAGCATCATTTAGTTTA
TACTCACTTCGAGCAAATTAACAGCCATTGTAATTCTTTCATGTTTCTCTAATGATATTA
CCATCCACGTAGTTCTGTTAGAATATACATAGTGGTCAGCAGTCCCACAATTAGTATTAA
GGTTCTATATACCATCTAAGAAAATGCAAGTATGTTTTTTTTCCTGTTGGTACTTGGTAG
CATGTTCAGTTGATTGTTCAAAATATATATCTGATGATGTTTGATTATATTTAGAAAATA
ATGCATCGTCCGAGATTGAGATTAATCATGCTGTTACATTGGCAAATACAGTGTGTACAT
TGGGAATTTTTTTCTAATAATAGCGACACTAAAAGATATTGTCGTGCAGCAATATCTAAA
GGATGAAGATTACCTTAATGGATAAACGAATCCAATTGATCTCCTTGGCATCCCCATATG
AGTTGACGTTGTTCATAACCTAGCTTTACCTGATGATACTCACCTCATGGGAGTCTACTT
ATCTTCCTAAGCCTTCTCGAGGACGGGATTCAGCGCCCAACGCCTTTTTGCCGATGTACA
GGTTGCCTTATATGCTAATTGAGCACCATACGGATGAAAATCCTATAATAGCAAATACTT
AATCCACATATGACGGATCCCTCGTGATAACTACCAATAATGGAATTGTCTAAACACAAT
TAAGTTAGAAGAGAAGACCAAACCTAAGGCTATAGCCTGTAGCGCGCGTCTGGAGACTCC
TCGCACACTCCACTGTTGGTCAATGATTGGTCGGTGCGTGCCTGAGCGATGGGAAGAGAG
GCCGACGGCAGAGCGCACCAGCACAGAGAAGCCCTTGTGGAGGATCGACTTCGCTGACGG
GAAGATCCAATCTGCTCCATAATCTCGTATTGATCCATCTGTGACTCCATGGTGCCCAAC
ATCATGCTACAGAAAAAATTAATCCCTAATACCCAAATCTTCCCATATCTTGTAGAGGAC
ACAGTTCCGATCAGCTCCACGTCCTAGGCGACTTCTGGAAGAAAAGCATATAAACAAGCA
TAAATCAGCCAAACATCAGCGAAAGCCTTGCGTTCGAATTTGATCAAAACCTACCCCCTT
CCATCCAATAGAAATATATATTTAATTTGCAGGGGAAATCATAAACACCTAATTAAAATC
AGACGGGAAAGAGTAAACAGCCAGTCACATAGTACAATCATCTAGAATATTTTATTTTCA
AATTCCCAGAGTTCAAGATTGGTTTTCCGATCTACATACTGATTGATCAGTACTTTATTT
TTGCGATCATTAGTTGTTTTCTGCATATAAAAAAGTACATATTAAGGAATATTTTGTGAG
TGATGCAACGCCTTTTGATAGTATGCAGAAATTTATGCCTATACTGTTCCATTTTCCTTA
CCTAAGATCGATGGCATAAAGGTACATCTGATTGATGCATTGATGCATGCATGTGACTGG
TTAACACCTGAACTTGATTCTCTACAACCCAATAGAAAATTCTGATTTGTTGTCTTCTAC
TCCCTTCGTTTTAAAATAAGTGTCGTTGATGTAGTATAAAATTTGTATTAACTTAGTACA
AATTTTGCAACACTTATTTTGGAACGGATGGAGTATTACTTTGTATTTACAACGTTTTCT
TTGTACACTTGCTTTTACAGTATCTCATGGATTATATGAAGACAGACTGAGACATTGTTC
GAGAGTAAAGGACTCTGCTAAGTTACACTAACACACAGTTACACTAACACACGATTCGTA
GGTGATGCACATATGCAAATTAAGAAAAAAATTAAGAGGCTACAGAATTACCTTCAACCC
ATCATGAACGAGAAACAATCTTATTTATCTTAGTCAACATTTATCAACTCTTCAGAGACG
TTGAGTCCCTCAAGAATATATTAACCTAAAGAAGCATAGAGCATAACTTCATTAACTAAA
GAAGCATAACACAAAGTCAAAACAAAACTTTATCGTCTCAGATTTATCTACATTTGACTT
CAATTAAGAAGACTCATCATGTAGCCTTCCCAGACGTGGAATCTTTTCAGCAAAGTGCTG
TGAACATTCATCATGTAGCCTTGTTGAGAACATTCATGTTTACCAATATTTGTTGTCTTC
TTGTTTTATGTACAATTATTCTGTCGATGAGGTAAGTCAAGCCTCCTCATTTGGACCCAT
TGCAGTTTAGCTGATATAACTAAGATATCAGGTAAGGAGCTTTATCCCCCCCCCCCAACT
AACAATAGCACCTATTCGGAAAACTAACATACATTTCTCTAGAAGTAGAAATACTGATTT
GTAGCATTACCAAGTCAAACATCTCAAGTGTTGTAAATATAAATAGATCAGTATATGTGC
ATATCTATAAACTTTGGCCAACAATATAATACAGAGCCTTGATGTTTTACTCCTGGGCTC
TCCTATTCCAATAATCGAATCCTTGCGTAAAGTAATGCAAGATAAAGGGATTAATTGCAC
TAAGCCTTCTTAAATATCTATGCCCAATTATCTACTATTCTAGTCGAAAGGAGATGAACA
CACAAGTTTTTCATTTAAAAACTATAAGAACACGCGTGATGTTCTCACCAGCAATTTTCT
CACGTGTTATGATATTTTCTGTAGGAAGTCAACAATAAGCTTCTTGTTCTCCAGCTACTT
ATTTTTCACGGCCATCTTCTTGTCCTTTCTTTGTAGAGTCCCCTTCTCCCTTATCCTTTC
CCCTTCTTATGATCCTCTAGTAGTATTCCTGCCATCAATTGCAACACTGATGAACTGTAT
GCTAATAAAAGAATATGTAAGGTACATAGGCGCTTGTATAGCAGAAAAAAGAAGCTTTAT
TTTTTGTAGATCCTGACAAGTACATTTATATGTTTCGGAGAAAGGCACTACACCAACATT
ATTATTTATCAGCATTTGCCTCATGCTTTGTTCTTAAAACTCCAGGGATAACAAAGAAAG
CACATTAGCATACAAAGTCCCTTGTATCCTAAACTGAGCACAACCGGGTAATTTGTTTTT
TGAATTTTGCACGGGCGGGAAGATTTCCCCACCTGAACGAGTAATTTATCATAGCAGGAA
AACATCTCTAAGAGAGTTTAAGAAGGATAGTACAAAATTAAATAACTAATGAAAGATTGC
CAAATAGGTTGATGGCAAGAGACACAGATGAATACATTCCTTAAAAAGAAATCGAGAAAT
CCAGGAAGAGGAGCTATATATACGCCCAAAGATAGCAATAGAGTAGATTGGTGAAGAATG
ACCTCACTACGACCCTGGTTCACCTATCTGGAGGCCATGACGCTGGACATGATCCGGATC
ATGTTTTATGCGAATTTTGGTTCATGGTGAACTCAAAGTATGTACGACAATGAATTACAT
GGTGAACTCGAAGAACTATATCAGTATACTGTGAGCACCACAATTCAAGCGAGGGATAAG
TCAGATTTTCCATGGGCCACAAGAGTGTGACATAGAATTCAAGTACAGATTAATGTGGTG
CCTAAAGAAAATGTTTCATCACAAGTGTATCTATCATGTCAATTTGAACAACTCCACCTC
ATAGTGCACATGGCATGCCAATTTAATATTACATACAACACCAGTTCAGAGCGTTTTTCA
TGTCAATTTAAAGTTACGTACAACTCCAGTTCTTAGTTGTTTCATTTAAATTTAAATACT
GATCCTAAAAGAACTACAAACAAGATTCAGAATTGACTCCGTCTAGCTAATCTCTGGGTT
AGTTCTTGAGGTTTTCGAGCTGCTATACGCCCTGCGAGGGCGTGGATTCCACAGGCTGAA
TCAAGCGCTGCTCACCTTGCTGCCGAAGCGCGCCGACGCCCACAGGCTGAATGACTATCG
GCCGATCTGCTTGATACATATCGTGGCGAA
