Map Locations of contig_230099 (5800 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_230099

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_32593 2 2522 bp MLOC_32593.1 Available Available LOC_Os10g40780.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13110.m03782 protein CCR4-Not complex component, Not1domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_32593






Contig Sequence (5800 bp)

>contig_230099 5800 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCGGCGCTCGGCGCGACTCCAGGGTCGCCGCGGCTAGATAAGAAAC
CCTCAATCCCCACCCCGATGTAGTCGAAAAATAACCTATGAACCCTAGTAGTCGTCGATG
CAGATCGATTGATGGCAATCCTACACCCCCGATGTGTTCAATCCCCTCCCTAACTCTTCA
ATCGATTGCTCTAATCTAATCTAGCCAGAGTCGAAAGGACTGAATGTACAGAGAGGACGA
GGTCTTACCGCCATGGCCGATGCGCTCCGGTGGAGGTCTGCACTCGCTCTGGTGGTTGCC
GCCGCCGTCTTGGATCGATTCGCAATAGAGCTCAGATTGTCGCCGTCGTTGCCGCAGTTG
GTGTGAGTGGGGAAGAGGGGAGAGAGCGGTGAGGAAGGGAGGTGAGGGTAATTATTGATC
GACGCGTCTGGAAACAACGCGACATCTCGAGACCGCACCCACGCGTGCAACCGGCCACAC
CCACGTGCCTAGGGTTGCACCGCGCGGGTCTGGCTCCACAAAAACGGCCGATTTGAGAGT
TCCTCTGGATGTAGGCCCAGAGGTGCTTTAGTCTTCGTGCTATGCAGGCCCAACAGTGAA
TGCGGGTAACCAAACGGGCCTTTTTCTTCCCGCGCGGGCCTGGCTGAGGTATATGCGACC
AACCAAACACGCCCTAGACAAACTAAACTGGTTGTTTGTGATAAACCGCAGATATAGGCC
TTCAATATAAGTAGGTTGATAGACATAGCGAGCACTTTCAGTCAAGATAGGTCAAGTTTT
GGGAAAGCTGCAAGTAATCCTTTGATCCTTCTTTGAGACATGTGAACAATTCAACATAAA
AGGAAATGTTAACATACATTAAACTATGTGGCCAAGTGTCGATGCAGTACCTGTTGACTG
CACGCCCAAGATATTTTTGGTTCATCTGCTGATAGCTTGTCACAGTAACTTTACTTACTG
TTCTTTTTACAATCTTCAGTATGGCGTGGATTTAGGACCAAACAAAGGCAGCCTTCTTCC
GAAGGTCAGTGTTTACCCTTTAGCTCTTTAGGGAATTTGAGCCTACTAAGGGGCCTATTC
GCTAAAAGATTTTCTTTTCACCGCTCCGCAGATTCTCTCCATAACAACTAGGATCATTCA
GAAAGATGCTGAAGAAAAGAAAGTTTCTTTCAACCCTCGGCCATATTTTAGATTATTTAT
AAATTTGCTAAGTGAGCTTAGCACTGCTGACCTTCATGATGGTGCTAGTTTTCAGGTATA
TGCTATGTATATTTAACTTCTTTGCGCAAATTATATATGTTTAGCATAATATCAGATTTG
CATGGCTTGCTTGCACTATGTTTTCCTGACAATGGATTTATGCACCAGGTTTTGACTGCA
TTTGCAAATGCTTTCCATGTGCTTCAACCCTTGAGAGTTCCTGCATGGAGGTTTGCCATC
TCGTCAATTTTCTTAATATTTGTGATTGCCTTCTATGTTTTTTCTTTCATGCTTCATGGG
GCACAAAATAGTGTTCTCCTTCCAATACCTAGTGTTGCAACTGAAGCTCTCAAATATATA
ATCTCAAAAGCCATCTATGTATGCTCTTTTCCACAAATTGATAAACATCCATGCTTGCTG
AAAACAATGAGTTGTTAGGTGTAAATATATTTGGGTGTAAAGGTGGGTCTTGTCCTAGAA
TCATCTGATCCTTGTTCACCTTATTATTTTGTTTTGACATATATATGAATTTGACCATCA
CCATGCCATTCAAACTTCCCCATGGTCTCAATTCGATTAGAATATGAGGAATCAGGCCCC
TTGCAACAATTTTTTTGAGGTACCAACCATCTTATTAAGGCGATTACCGACAGGCTCTAA
ATTGATTCAAGATCTGTAAATTGTGTAAGAAAAAAAAAGGTTATGACAATTAAATGATAA
AATGTTCAAAATTGTTGTTATATGCATGATAATCTTTCTCTCCCTAAGTATGAATCCCAT
CCCTGTATCTTTTATCAAAAATATTGAAGTTATGAAATTAGCCTGTTAGTTTTTTTAAAA
TAATTGAAGTACTCCCTCCGATCCATGTACTTTTGTTACTTGCCAACTAAATGCTTTTTC
CACTGTAGTTTTGCTTGGCTTGAATTGGTAAGCCATAGAAGCTTCATGCCGAAGTTATTG
CTGTGCAATTCACAAAAGGGCTGGCCATTCTTCCAGAGGCTGCTTGGTGATTTGTTCAAA
TTTATGGAACCATATCTAAGAAACGCTGAGCTGGGACAGCCCGTAAGTTCTATCCCCGCA
CCTTCGGTTGCAGCTGTCTTATATACAGTATGTGTTGCACTTTGATGTACTCTGTACCTT
TTCTTTTTTGTAGATTCAGCTTTTATACAAAGGAACTTTGAGAGTGCTGCTTGTTCTACT
CCATGACTTCCCTGAGTTCCTCTGTGACTACCACTTCAGTTTCTGTGATGTGATTCCCCC
AAGCTGCATTCAAATGCGTAATGTTATTCTTAGTGCTTTTCCACGCAATATGAGACTTCC
TGACCCCTCTACTCCTAATCTGAAGGTATTTACTGACTGCTAGAACATGCTACCTACAAA
CTACCCCTTGGTTTTGTATTTTTTAATGAGCTCCAGCTGTTTCTTGTAATACAGATTGAC
CTGCTAGCTGAAATTTCAGTAGCTCCAAGAATCATGTCTGATGTGGAAGGTGCTTTGAAG
GCAAAGCAAATGAAGACCCAGGTTGACGAGTACCTCAAGGTAAATCATGCCTGCATTCTC
TGATGTAACGGCGGCTTGCAGTCTAGACAATTCTTTAAGCTGGTTTGAGTCATTCATATA
GTATATTGTTTAAACCTTTAAAAGAAATGGTATACATAATGTTTGTTCTTTCTCTCATTT
GCATTCTTGCAGAGACCAGAAGGTTCGTCCTTATTAACTGATTTGAAGCAGAAGTTATTG
CTGCCTCCAAATGAAGCGAACGTTGCTGGGACTCGTTATAATGTTCCCTTAATTAATTCT
CTTATCGTCTATGTTGGCATCCAGGTCAGTTTCTATATGTTTGCGTGCGATTGGTTTTTC
CATTACAATGTTAGAAATGCTTTTTATACCCTAATATTGCGTCCAAATATAGATACCATC
ATTTTTTATCAGCATTTTTTCATAGTATTTCAGCATTGGTTGACATAGGTTTGGAGTGTA
TTTAGTCTTCTGTTTGTGTGTTTTCAGACATATAGCAAGTTTATGACTGGTTTGGTTTGT
GCCCAATTTTAGGATCTGAAAAACAGCCAAATTAGCTGCCCATGTTTCTTTTGTCAAGTT
TGGGTTCAGAAATAGTTACAAAAACTACTTTCCAAACTTTTCTCGCTGAACCGAACGGCA
ACCTGTTTTTTTCCGAAGTGACCAAACTTTGGCTCTCGGTGGCATTAAACCAAACAGCCA
TGTCATGTTTTGAATCTGCATTGACCCTATGGGTCTCTACAGTTACAGTATGAAGTACCT
TTATCTCTACCTTCTTTGCTTGTTATTGATCACTTTTCTTGGCATGCATGAACACTCTAT
AATGGTGTCTAAATTGTAAATGTAGGCTGTGCAACAATTGCAGCATAACAAGGCGAATGC
ATCAGCATCAGCGCAGCAAATGAACCAAAGTCCTCAGGTGGATGTTTTTCAGATTGAAAC
AGCCACTGAGGTCTTCAGAAATCTTATAGTGAATATGGATACCGAAGGCCGCTACCTCCT
CCTGAACGCGATTGCTAACCAGCTACGCTATCCAAACAATCATACTCACTACTTCTCCTT
CATCATTTTGTACTTGTTTGCTGAGGCAACACAGGTAACTTGATGAGTTCCCTCTTTTCG
GGTTTCATGGTTTTGGTGTGATACCCATATGCATCTATGAAATACCTTCCTCCTGACATC
GTCCAATTGAAACTTGCAACTTGCAGGATATTGTACAGGAGCAGATAACAAGAGTTCTTT
TAGAGCGCCTAATAGTTAATCGTCCTCATCCCTGGGGATTACTTATTACTTTCATTGAGC
TCATAAAGGTATGCTGCCATGACCACTTGAATTTTTTTTTGTCATGGAATAGGTCTAACA
CAGGGCTGCCTTCTGTAGAATCCACGCTATAGCTTTTGGGCTCGATCCTTTACACGCTGT
GCGCCGGAGATTGAGAGGCTGTTTGAGTCTGTTGCAAGGTCTTGTGGAGGTAAAGCAGCG
GAAGAGGGAGTTCTTGCTGATGGTGGCCATTAGAGAATGTTTTATGCATACTGTGAGCTG
TTTGTATTATGAGTGTTAGGATTCTTTGGGACAGGCTGTTTTTGTGCAGTTTTGCTGTAA
ATTTTTGTGAACTCGCTCTTGTCATGTCGAGCACTTCAGGTTTACAGGGTAATATTTGTA
TCTAGCGGTAGTATGCATGTCAGCCGATATATAATGCTGTTCTGAAGGGTGACCATTCTC
AGTGAGATAATTGTGACATACAAAGGTTTTTACCTGAGACATCCTGTCTAGTACTCGAAC
TTGAGTTCCATGAATATTTAGGGTGTTAAGTATGCCAAAGCTTGTCGGCCGGCTGGATCC
CACAACCATGTGTACCCGGACTGGCAGTTGATATCCCAGGTCTGAAATGTCGTGCCAGAA
CAGAAACATCTATAGCAGATCATGCAAACCGGGTCATCCTGTAAAATGACCGCTGGTTTG
TGGGATAGATCTCGTAAACCTGGTCTAAATTGATCTCCAAAATTGTTTGGGCAATGCTAC
GTCGGCCGATGGGTGATAAGTTTTTTTTGCAACAAGAGTGATGTTACAGAAGGCTCTTTG
CAACAACTAGCTTGATGCAACCATTTGAGCACAGCTCTTTGCAACAACCAAGCTTGGTGC
AATCACTCGAGCATGTGCTTTTTTATCTTCTGCAACAAATGACTTATTACAAAAGAAAAT
CATAATATAAATCTTGTTGTAGAATTTTTATTTTTTATCTTTTGCAACAAAAAACTTAAT
GTAGAATATAAAATAACCGATTATAAAATCCTTATGTAATAGGGGTTATGTTGCAGAAAT
TTTTGCAACAAAGAACTTATTACAGAAAGTTAAGTCATAGAGGACATGCGTCATGCATGG
GAAGCAGCCGACAAAACGACGTGATCCATCCGGTGATTAGAAGAGTTTTCCAATTTTTTG
GGGTTCCTCCATTTGCTAGCCAGTTTCATCCATAAGATTTCACCCTCCTATTACAACATC
CTCTATTCTTGCTGGGAGGAAAATATCAGCCCAAACGCTTCCCTCGCATGTGGCGCCACG
ACCTTCTCAACTCTATTTCAGGCAAATCTCGTTGTAGCCCCGCCGAATTCGAGTTATCGC
CGCTGTCACTCGTGAGTTGCTGCCGCCATCGCCGTGAGGCTGTTGGAGCTCAAATTCATC
TCTCGTGGGCCGTGCAAGGTCCGCCATGGATGTGGTTGGTGCCTCCGTGCCAGGAGCTCC
GCCATGGATGCAACGCAACGCAACACATCCACGAAGGACTAGTCTCACTCGGGGTANNNN
TTCACGAAGTAGGCGATCTCCCTGTCCTTACAAACTTCTTGGTTCAACTTCACAGGAAGT
TGAAGGCTCCCAAGCGACACCCAACCAATCTCCAAAAGGTAATATATATGGTAGTATGAT
TAACTCCTTGCTCTTGTGCTTTAAAAGATAGTCTTCTCAACACTATTTCACTCTCTCATA
GATTTGGCTTGGNTAGAAGAGATTGATTGGGTGGAAATCCACTTGGGGAGGCTAGAAATC
AAGATTCATGGTAGGAATAGAATATCTTGATCTCAACACA