Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_226459 (4723 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_226459

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_32414 5 1478 bp None Available Available None
MLOC_32225 4 1153 bp MLOC_32225.1 Available Available LOC_Os03g62250.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-76, 13103.m06873 protein zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_32414






CDS Structure of MLOC_32225






Contig Sequence (4723 bp)

>contig_226459 4723 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTTTCCTCTTCACAGGTGGCTTTGAGTTACTAGCTTCCTTTTTCGAGGATTTCTGAAACA
AGGAGTTATTAAAGCAGTGGCTTGATACATGTATTTTGGTTCAGGTAAGTTTTTTTAGGG
ATACTGGCAGCGTAAATTTAGTTACCTCACGTTATACAAAATTGGTCCTTGAAATACAAT
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GCTGCAAGACCTACCATTTTTCATACGAAGACTGTTCAGAGAACTAATGGATCCCCAGAG
GACCCTCCCACTTGTCTTCAGGGCGAGGATGATTCTGATGGTACGTATGTTGTAGGCCAT
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CTTTAAAGTTGTGGCATAGTATTAATAGTGTTTGTGAGATGCTTTCGATGCGGTGGGGTT
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CAATCCCCTCCAAACATCTTCAAATCTAAAGGAACTGAACAAGCTGAATCCACATGCAAC
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ATTCTGTCCGTTTGGGGCGAGTGATGGGGTCGTGTTCGGGCATGTCCTGTGATGCGGTGG
TCGTACGCCCAACACGCGGACGCATCCTTCGACCGCATCCTGTCCGCCACGACCAATATG
CCCATATATTCATATTTATCAATGTTTTAAACAAGTTTGCACGTCCAAATATCAATTGTC
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