Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_225323 (1228 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_225323

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_32109 3 290 bp AK248906.1 Not available Available None
MLOC_32110 1 175 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_32109






CDS Structure of MLOC_32110






Contig Sequence (1228 bp)

>contig_225323 1228 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAATTTATATTGGTTGAGTTTGTGGTACCTACAGTTTATACTGGAATTTTCTCTCGAGCT
TAGGATTCCATGCCCTTTTCTCTTTAACTGATCTGGTGCTTATAATATCTGATGGGTCAT
GCATTGTTTTGGTTCTGAAATTTATATTGTTTTATAATGACCTTAGAAGCCCTGACTTAT
ACATAGACAGTTGGCAATGGAAAACCCAGCAGCAGCCACCACCTACTCCTCGTCTCCGGT
GAGCCACCCACCGGCGATGGGTAGCAGCCGCCGGCGGGGTGACCGTCAGCTCCTGCACTG
CCTCCTCGCGCTCTCCTCGCTGCTCCTGCTCGCCTCCGGGGTTTGCCTTCTCATCCCTTA
GAAGTTTTTGTTTAATTGATGATGTTGATGGTTTGGGCGCTAATCAAATAAACTCTTGTT
TGTCGCTACCTTAATTCTACATACCGTCTAATCCATGTACTCTATTCGCGTATTCCAGGC
ATTCAAACAACGATAGATGCTAGGCATTTTGCTATCTCATCCAAGATACCGGAGTTCAGT
AACAAGGGCCGAACATTGGTGGTCCAGTGCTCCATAAAGTTTGAGCAGGAAATTGAGTGT
GGCGGCGGCTATATTAAGCTAATGTCTGGTTATGTCAACCACAAGAAATATAGCGGAGAC
ACTCCATACAGGTATGTTATTGCCTACTTATGTCCCGTGGAACAAAGGTCCACCATTGCT
GTTAGTAAGCTCCTAAGCAGACCCTGTCACTCTTTCGACCATGTGATTGGATTGGAATGC
TTGTATAGTAGATGAGCAAAGGTCTACCTCACATAATTTGTTACATTGTATAAGTCCACC
TAGATGTTATGGCTTGCGAATGTACATCCATGATTAAGGGGAAATGAATAAATATAAACT
GCTTACTTGTTGAGGTTTACTAGTCTACTGTTGAGTTATGCTGATAGCTTTCTTTGTTCT
CTTACGCAGCTTGATGTTTGGGCGAGATATATGCGGGTTATGCTGAGTTATGTCCATCTT
GTAGGTTGCCACGTGGATGCTCTTTGGACTACGATATGGACATGAAGGCATTTGTTTTAG
TGCCAAATATTACGTACTAATGCCGGCAAAGTATCATTGTGTATTATATTTGCTATGGAG
CTATGTATGTATGGATGCTATGGAACTATATGTATATATGGATGCTATGGAATTTTCGAT
GTATGGATGCTATGGAATTTTGATATAT